质谱技术在蛋白质组学研究中的应用

随着蛋白质组学研究的迅速发展,质谱技术已成为应用于蛋白质组学研究中的强有力工具和核心技术。质谱技术的先进性在于为蛋白质组学研究提供的通量和分子信息。笔者重点概述了基于质谱路线的蛋白质组学研究,介绍了基于质谱的定量蛋白质组学﹑翻译后修饰蛋白质组学、定向蛋白质组学、功能蛋白质组学以及基于串联质谱技术的蛋白质组学数据解析的研究进展。     

国内科技期刊亮点

什么样的颅内动脉瘤容易破裂？蛛网膜下腔出血是最常见的脑卒中（脑出血）病因之一,而其中80%为颅内动脉瘤破裂所引起。最新一项回顾性研究表明,颅内动脉瘤的大小不是衡量瘤体是否容易破裂的最准确指标,而用瘤体长度与瘤颈宽度的比值（AR值）作为衡量破裂风险的指标更有意义,AR值越大,越容易破裂。     

颅内动脉旁瘤的血液动力学的三维数值模拟

数值模拟颅内动脉瘤的血液动力学。假定血液为牛顿流体和血管壁为刚性壁,采用人工压缩性方法求解三维Navier-Stokes方程。在稳态和脉动的情形下计算了颅内动脉瘤的剪应力和压力等血液动力学因素随空间和时间的变化,以及颅内动脉瘤的几何形状、雷诺数等参数对血液动力学因素的影响。得到的主要结论是：无论在稳态还是脉动条件下,对于生长初期的颅内动脉瘤,瘤的深度越大,远端的壁面剪应力也越大,颅内动脉瘤的生长和破裂一般发生在这里;血液脉动使得远端壁面剪应力随时间的波动更加剧烈,颅内动脉瘤在这一区域更易破裂;此外,管径减小而流速不变,动脉瘤远端壁面剪应力增大,这说明在小血管中比大血管中更容易发生动脉瘤,这一结果与生理实际一致。     

DSA在颅内动脉瘤和脑血管畸形诊疗中的临床应用

目的：探讨DSA（数字减影血管造影）在颅内动脉瘤和脑动静脉畸形诊断和治疗中的应用价值．方法：采用DSA脑血管造影检查疑似颅内动脉瘤和脑动静脉畸形的患者36例，根据造影结果决定下一步治疗方案．结果：共发现28例颅内动脉瘤和脑动静脉畸形，分别采用了血管内治疗、手术夹闭和切除等不同的治疗方案．结论：DSA极大提高了脑血管造影检查的准确性和可靠性，也为颅内动脉瘤和脑动静脉畸形的栓塞治疗、手术夹闭和切除提供了可靠保障．具有准确、安全和操作方便的特点，有很高的临床实用价值．     

显微外科治疗颅内动脉瘤临床探讨

目的：探讨显微外科治疗颅内动脉瘤的方法和效果．方法：采用显微外科经翼点入路颅内动脉瘤夹闭术，手术患者7例，夹闭动脉瘤10例．结果：手术成功率100％，出院时或术后1～3月复诊评定疗效．5例痊愈（工作和生活能力正常），1例部分偏瘫和语言稍有笨拙，1例死亡为术前和术后严重脑血管痉挛致脑缺血死亡．结论：显微外科经翼点入路颅内动脉瘤夹闭术是治疗颅内动脉瘤一种安全、微创、有效的治疗方法．同时．夹闭动脉瘤颈是最理想的方法，应属首选．因它既不阻断载瘤动脉，又完全彻底消除了动脉瘤．     

颅内动脉瘤破裂急诊显微手术的护理

目的：探讨颅内动脉瘤破裂急诊显微手术患者的护理方法.方法：对43例颅内破裂动脉瘤急诊手术治疗患者进行规范、有效的护理,出院时进行GOS评分并结合患者预后进行评价.结果：良好36例（83.7%）,差4例（9.4%）,死亡3例（6.9%）.结论：规范的护理可以有效的配合颅内动脉瘤破裂急诊手术并提升患者的生存质量.     

双向电泳检测技术综述

目前蛋白质组学（proteome）正在成为分析化学的研究热点，双向聚丙烯酰胺凝胶电泳（2-DE）以其高通量和极高的分辨率成为蛋白质组学的核心技术，本文综述了不同类型的双向电泳检测技术的原理，比较分析了各种技术的优势和不足，并对双向电泳技术在蛋白质组学中今后的发展作了展望．     

加拿大C.H.Borchers教授应邀作学术报告

<正>2015年11月6日,加拿大基因与蛋白质组学研究中心主任、加拿大维多利亚大学和麦吉尔大学C.H.Borchers教授应中央民族大学生物成像与系统生物学研究中心及生命与环境科学学院的邀请来校做学术报告.Borchers教授介绍了定量蛋白质组学的重要性,阐述了基于稳定同位素内标定量蛋白质组学技术方法原理、特点及意义,对如何开展高通量定量蛋白质组学研究的技术流程做了说明;详细介绍了基于     

压力容器定期检验中TOFD的应用

为了更好地监测锅炉压力容器定期检验中焊缝质量,在现场无损检测过程中针对壁厚大于12 mm的锅炉压力容器,采用超声波衍射时差法（TOFD）与射线（RT）检测焊缝,并分析对比各类缺陷的特征,总结用TOFD检测技术在锅炉压力容器定期检验中对缺陷定性定量的方法。     

蛋白质组学研究方法及进展

临床蛋白质组学（Clinical Proteomies）是蛋白质组学新近出现的一个分支学科,它将蛋白质组学技术应用于临床医学研究,着眼于与疾病相关的差异表达的蛋白质,围绕疾病的预防、发病机制的研究、疾病的早期诊断和治疗等方面开展研究。本文对蛋白质组学技术在临床研究中的应用与进展做一综述。     

跨膜蛋白超家族TM9 SFI和炎性反应介质在颅内动脉瘤壁形成和破裂中的作用分析

目的探讨跨膜蛋白超家族的TM9SFl和炎性反应介质AZUl在动脉瘤形成和破裂中的作用.方法选取行颅内动脉瘤夹闭术的患者40例,术中取患者头皮撕裂的颞浅动脉为对照组,手术完成后取上端全层血管壁为研究组.应用免疫组化和Wsetern blot法分析TM9SFl和AZUl在破裂动脉瘤组织和颞浅动脉组织的表达和含量.结果免疫组化染色显示:对照组TM9SFl和AZUl呈阴性或弱阳性表达,研究组呈阳性或强阳性表达;研究组TM9SFl,AZUl染色分级为1.90±0.20,2.90±0.30,明显高于对照组的0.70±0.20,0.80±0.10,差异具有统计学意义(P0.05).Wsetern blot显示:研究组TM9SFl表达量为0.95±0.43,明显高于对照组的0.41±0.15,差异具有统计学意义(P0.05);研究组AZUl表达量为1.16±0.48,明显高于对照组的0.39±0.13,差异具有统计学意义(P0.05).结论 TM9SFl和AZUl高表达参与了颅内动脉瘤形成和破裂过程中的血管壁蛋白降解和炎性反应机制.     

嗜水气单胞菌感染暗纹东方鲀脾脏的蛋白质组学分析

为了解暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)受到病原菌感染后参与应答的主要蛋白的功能与调控作用,采用TMT标记、高效液相色谱(HPLC)分级技术以及基于质谱的定量蛋白质组学技术,分析了暗纹东方鲀感染嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)12 h后脾脏组织的蛋白表达水平,鉴定差异表达蛋白,并通过亚细胞定位、GO(Gene Oncology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)对差异表达蛋白进行进一步分析.本次实验共鉴定到306个差异表达蛋白,其中120个上调表达蛋白,186个下调表达蛋白;利用平行反应检测实验(PRM)对4个(1个上调,3个下调)与免疫相关的差异蛋白进行验证,其结果与蛋白质测序结果一致;亚细胞定位结果显示:差异表达蛋白主要定位在细胞质、细胞核和胞外;GO分析发现:差异表达蛋白参与的主要生物进程有代谢过程、细胞进程和单一生物进程,主要的分子功能有结合、催化活性和机构分析活性;KEGG通路分析结果显示:差异表达蛋白主要参与了核糖体、视黄醇代谢、卟啉和叶绿素代谢、ECM受体相互作用、吞噬体、叶酸生物合成、药物代谢、酪氨酸代谢等通路.研究结果为进一步探究病原菌感染暗纹东方鲀的致病机理提供了一定的理论基础.     

Proteomics to study genes and genomes

Proteomics, the large-scale analysis of proteins, will contribute greatly to our understanding of gene function in the post-genomic era. Proteomics can be divided into three main areas: (1) protein micro-characterization for large-scale identification of proteins and their post-translational modifications; (2) 'differential display' proteomics for comparison of protein levels with potential application in a wide range of diseases; and (3) studies of protein-protein interactions using techniques such as mass spectrometry or the yeast two-hybrid system. Because it is often difficult to predict the function of a protein based on homology to other proteins or even their three-dimensional structure, determination of components of a protein complex or of a cellular structure is central in functional analysis. This aspect of proteomic studies is perhaps the area of greatest promise. After the revolution in molecular biology exemplified by the ease of cloning by DNA methods, proteomics will add to our understanding of the biochemistry of proteins, processes and pathways for years to come.     

差异蛋白质组学及其应用

蛋白质组学是后基因组研究中最主要的部分,其研究策略有2种:一种是"完全"蛋白质组学,目的是检测一种细胞类型或一种组织内基因组表达的所有蛋白质; 另一种是"差异"蛋白质组学,主要是筛选和鉴定不同种类或状态下各样本之间蛋白质组的区别与变化.着重介绍了差异蛋白质组学的特点、研究内容和应用前景,简要介绍了适用于差异蛋白质组学研究的相关技术和近期发展概况.     

颅内破裂微小动脉瘤的血管内治疗临床研究

目的探讨颅内微小破裂动脉瘤血管内治疗的技术可行性和临床疗效。方法凹顾性分析我院2007年10月-2012年3月共收治的10例颅内微小动脉瘤性急性蛛网膜下腔出血患者行血管内治疗病例,其中颈内动脉床突上段动脉瘤1例,后交通动脉瘤4例,前交通动脉瘤2例,大脑中动脉瘤1例,椎动脉瘤1例,小脑后下动脉瘤1例;行单纯可脱性微弹簧圈动脉瘤囊内栓塞8例,对其中的宽颈动脉瘤辅以血管支架、球囊辅助的瘤颈成形技术完成治疗2例。结果9例行可脱性微弹簧圈动脉瘤囊内栓塞病例,达完全致密栓塞8例,1例患者瘤颈有很小的部分残留为95％栓塞,在随访期间保持稳定;其中1例置人支架的颈内动脉床突上段动脉瘤,术后半年复查,未发现支架移位;本组病例无1例死亡。结论血管内治疗颅内破裂微小动脉瘤是可行和有效的,是外科颅内动脉瘤夹闭术的…．种有效替代方法。     

Nucleolar proteome dynamics

The nucleolus is a key organelle that coordinates the synthesis and assembly of ribosomal subunits and forms in the nucleus around the repeated ribosomal gene clusters. Because the production of ribosomes is a major metabolic activity, the function of the nucleolus is tightly linked to cell growth and proliferation, and recent data suggest that the nucleolus also plays an important role in cell-cycle regulation, senescence and stress responses. Here, using mass-spectrometry-based organellar proteomics and stable isotope labelling, we perform a quantitative analysis of the proteome of human nucleoli. In vivo fluorescent imaging techniques are directly compared to endogenous protein changes measured by proteomics. We characterize the flux of 489 endogenous nucleolar proteins in response to three different metabolic inhibitors that each affect nucleolar morphology. Proteins that are stably associated, such as RNA polymerase I subunits and small nuclear ribonucleoprotein particle complexes, exit from or accumulate in the nucleolus with similar kinetics, whereas protein components of the large and small ribosomal subunits leave the nucleolus with markedly different kinetics. The data establish a quantitative proteomic approach for the temporal characterization of protein flux through cellular organelles and demonstrate that the nucleolar proteome changes significantly over time in response to changes in cellular growth conditions.     

颅内动脉瘤的血液动力学二维数值模拟

从临床患者的实际医学影像出发,进行颅内动脉瘤的二维CFD模拟．模拟的结果方便形象地给出了计算区域内的流场型态,同时也获得了相关的血液动力学参数,这对于临床上的诊断和治疗有着较好的帮助作用．