2008基因芯片、计算机和作物国际学术会议

2008基因芯片、计算机和作物国际学术会议于2008年9月26～27日在浙江大学紫金港校区生命科学院召开,会议主办方为浙江大学和英国艾塞克斯（Essex）大学。会议共邀请来自英国艾塞克斯大学、诺丁汉（Nottingham）大学、利兹（Leeds）大学、沃里克（Warwick）大学、布里斯托尔（Bristol）大学、伦敦（London）大学,美国伊利诺斯（Illinois）大学,     

新的人羧肽酶A抑制物cDNA的克隆、定位和表达谱分析

从人的胎脑cDNA文库中,克隆到一条全新的人类羧肽酶A抑制物基因,此cDNA序列全长1049bp,包括翻译起始位点附近的Kozak序列,669bp 的开放读框以及3端的加尾信号,共编码222个氨基酸,它编码的蛋白与小鼠Latexin蛋白和大鼠Latexin蛋白分别有高达85％和84％的同源性,因此命名为人类LATEXIN基因,应用辐射杂交方法,将该基因伫位在人3号染色体3q24区段,位于分子标记D3S1605和D3S1553之间,采用基因芯片杂交的方法研究其在某些组织或细胞中的表达情况,发现在前列腺癌中表达量较高。     

用基因芯片的方法对人酪蛋白激酶CK1γ1基因进行表达谱和聚类分析

将人酪蛋白激酶基因CK1γ1的cDNA与4096个胎脑cDNA一起点在玻璃介质的基因芯片上,用16种不同组织或细胞系的mRNA分别杂交该基因芯片,以正常人混合组织mRNA作共同对照,检测CK1γ1基因的表达谱变化,结果显示人CK1γ1基因在15种组织表达没有变化,但在肝癌组织中的表达却显著下调.采集的7例肝癌标本的cDNA与正常肝组织的cDNA重复7次芯片杂交,结果肯定了CK1γ1基因在肝癌组织中表达下调.同时,对芯片杂交结果通过聚类分析,按基因表达谱特征将CK1γ1基因与其他7种基因聚类在一起,提示CK1γ1基因可能在生物学作用方面与这7种基因有某种相关性.     

锌指结构基因HKR1在脑胶质瘤中的表达分析

从人胎脑cDNA文库中筛选到2612nt的锌指蛋白HKR1克隆,C端含有10个C2H2锌指结构,N端含有2个KRAB区域,基因芯片的原位杂交检测显示,HKR1基因表达在脑胶质瘤中明显升高,提示该基因可能是一条潜在的肿瘤相关基因。     

应用表达谱基因芯片筛选植物激活蛋白处理水稻相关差异基因

应用基因表达谱检测植物激活蛋白处理水稻相关差异基因的表达,建立相关基因表达谱。用Cy5和Cy3分别标记激活蛋白处理和对照cDNA,将两种荧光探针混合,与载有10368位点的水稻表达谱cDNA基因芯片进行杂交,并用芯片扫描系统进行扫描,通过Cy5与Cy3信号强度比值的计算研究基因的表达差异。共获得97个差异表达基因,其中上调基因4个,下调基因93个。应用基因表达谱芯片成功筛选了植物激活蛋白处理水稻差异表达的基因,为深入揭示该激活蛋白的作用机制研究提供依据。     

降维近似支持向量机基因芯片数据分类器

基因芯片技术的出现改变了生物医学研究的前景,其产生的海量数据是限制其发展的瓶颈问题。论文针对基因芯片数据量大、样本数低和基因维数高的特点,提出了一种对基因芯片数据进行分类的降维近似支持向量机DRPSVM基因芯片数据分类器。DRPSVM采用降维的二次规划算法,使得该算法的时间复杂度和空间复杂度比传统的PSVM算法均有降低。通过在CAMDA2000、colon 1 dataset和colon 2 dataset等基因芯片数据集上的与BP、Nearest、RBF、SVM分类器的分类性能比较,DRPSVM在数据样本少、数据维数急剧升高时,分类性能稳定、存在唯一的最优解、训练时间快,适合基因芯片数据分类的应用环境。     

基因芯片的信息挖掘

基因芯片是一项急速发展的新技术，该技术大致包含芯片设计、芯片制作和数据分析三个主要环节．该文综合介绍了在基因芯片的数据分析中所采用的信息挖掘方法，特别是一些行之有效的数学模型和算法．当前，基因芯片的信息挖掘已成为生物信息学研究的热点之一，而数学技术的应用将促使基因芯片技术日趋完善．     

电解致酸脱保护DNA在片合成研究

提出了以电解致酸脱保护法为特征的是阻DNA在片合成新方法，在2．0V电解电位下电解水，释放氢离子并富集于阳极极板队近，导致局部酸度增强，使核酸单体分子发生脱保护反应，测定了该合成方法的合成产率与电解时间，支持电解质浓度，水浓度等条件的关系，结果表明，电解时间越长，脱保护效率越高，两者基本呈线性关系；支持电解质浓度与水浓度等条件对脱保护效率基本无影响。     

问：什么是基因芯片？它有什么用？

科学家将基因芯片形象地描写成携带生命之书的掌上电脑。就像电脑芯片一样，基因芯片在一个硬币大小的芯片上，配备有上万条甚至数万条基因，科学家可以用它来对未知的基因样本进行检测。比如说，如果发现一个新的病毒，如果想搞清它的基因结构，就可以用基因芯片来检测。用基因芯片检测要比传统的方法更便捷和准确。     

基因芯片及其应用进展

基因芯片是 2 0世纪 90年代兴起的一项前沿生物技术 基因芯片的原理并不复杂 ,但其类型却较为繁多 基因芯片用途广泛 ,在生命科学研究及实践、医学科研及临床、药物设计、环境保护、农业、军事等各个领域中有着广泛的用武之地