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1.
人类抗砷相关基因hARRG全长cDNA的克隆和在E.coli中表达   总被引:2,自引:0,他引:2  
通过对构建的人胎脑cDNA文库进行大规模测序,发现一条人类新基因,序列与仓鼠asr2序列高度同源,达88%,命名为人类抗砷相关基因(human arsenic resistance related gene.hARRG),hARRG与抗砷基因相关序列ARS2(AF082871)几乎完全全同源,仅比它短253bp,hARRG并不是全长基因而仅是一个cDNA片段,为了获得hARRG全长cDNA,运用Northern blot电子RACE和5-SMART-RACE的方法克隆了一条2999bp 的hARRG全长cDNA,通过Unigene染色体定位于7q21.3,经过生物信息学分析发现,该cDNA有完整的读码框,编码一个788个氨基酸的蛋白,预计分子质量为89.2ku,并在大肠杆菌中获得了成功表达。  相似文献   
2.
肥厚性疤痕成纤维细胞的基因芯片分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
用基因芯片分析肥厚性疤痕与正常皮肤成纤维细胞在静息及TGF-beta3刺激下的表达谱的改变,正常成纤维细胞在TGF-beta3刺激前后的表达谱与肥厚性疤痕成纤维细胞在TGF-beta3刺激前的表达谱正相关(r=0.76037),刺激后2种成纤维细胞的表达差异与肥厚性疤痕成纤维细胞TGF-beta3刺激前后的表达谱差异正相关(r=0.826 762),构成以上差异的基因有620条,涉及细胞骨架蛋白,细胞周期蛋白,细胞因子,受体,转录因子及糖,蛋白质和酸代谢的酶类,未发现胶原蛋白I,III的表达水平的改变,结果提示:1,肥厚性疤痕成纤维细胞在静息状态下表现出与正常细胞受TGF-beta3刺激后相似的反应,其可能处于一种应激状态;2.TGF-beta3刺激后2种细胞的反应差异与肥厚性疤痕细胞的异常反应相关,TGF-beta3的作用背景可能是肥厚性疤痕的分子病理学基因之一,3.基因表达变化涉及细胞因子,细胞周期调控,凋亡等,其具备疾病遗传异质性的分子基础。4.胶原表达无明显上升,提示在肥厚性疤痕发病中,胶原纤维及细胞外基质堆积有复杂的分子生物学基础。  相似文献   
3.
在E.coli M15中表达RBBP10蛋白,经纯化后制备兔抗人RBBP10多克隆抗体,以免疫组织化学法检测RBBP10在15例人乳腺癌组织、5例乳腺小叶增生组织及2例正常乳腺组织中的表达情况结果显示:乳腺癌组织中,癌巢部分呈深棕色,提示RBBP10高表达,癌旁组织未着色;在乳腺增生组织中RBBP10在增生的乳腺上皮细胞中有低水平表达,而在正常乳腺组织中没有检测到RBBP10表达;检测发现RBBP10蛋白弥散分布于乳腺腺上皮细胞.研究结果提示RBBP10可能在乳腺癌发生和乳腺小叶增生中起一定作用.  相似文献   
4.
从人18周胎脑中抽提mRNA,建立cDNA文库,通过大规模测序克隆出一条人类基因,该基因全长1644bp,开放阅读框1146bp,编码一个含372个氨基酸的蛋白,预测分子质量约为46.8ku.经与蛋白数据库比较,发现具有人硫氧还蛋白结构,命名为人的类硫氧还蛋白基因Ⅰ(human Thioredoxin like geneⅠ,hTRXLⅠ).多组织膜Northern blot结果显示在心脏、脑、胎盘、肝、骨骼肌、肾、胰腺等各个组织中均有表达,肺中表达不明显.通过Unigene染色体定位,将hTRXLⅠ定位于11q11,把hTRXLⅠ的读框克隆入经改造的PBV220质粒中,在E.coli中诱导后获得表达.  相似文献   
5.
从人胎脑文库中克隆到一条长为 12 19bp的cDNA ,它编码 2 3.4ku的肽链 .该肽链与葡萄球菌组氨酰tRNA合成酶N端同源 5 8% .利用humangenomicblast可将其定位于 2 0p11.Northern杂交显示胎脑中有一约1.5kb的单一条带 .基因芯片杂交分析表明 ,其在肺癌和前列腺癌组织中表达较高 .绿荧光蛋白亚细胞定位技术显示该蛋白存在于COS7细胞的细胞质中  相似文献   
6.
一条长3446bp 的人类新基因cDNA已从胎脑cDNA文库中被克隆,该cDNA克隆包长2583bp的开放读框,推测编码一条长860个氨基酸残基的蛋白质,预测分子质量为96.8ku,通过同源性比较及profile搜索,预测氨基酸序列显示出DExH-BOX RNA解旋酶基因家族特有的7保守基序及已知RNA解旋酶氨基酸序列的较高同源性,进一步通过蛋白质结构模型同已知RNA解旋酶结构的比较,可以认定其为一条人类RNA解旋酶基因家族新成员,通过基因编码的氨基酸序列中基序II D-E-V-H残基将其命名为DVH(DEVHbox Helicase),生物信息学手段结合DVH基因表达谱分析结果可推定DVH可能在胎儿发育过程中起作用,由于解旋基因家族同人类遗传疾病关系密切,以上结果可指导DVH基因的进一步功能研究并提示该,基因作为疾病侯选基因的可能性。  相似文献   
7.
RBM13 cDNA的克隆及其表达谱分析   总被引:19,自引:19,他引:0  
从人胎脑cDNA文库中克隆到一条长3479bp的cDNA,它含一个长903bp的开放阅读框架,拟编码一个300个氨基酸的蛋白质,其分子质量为35397u,等电点为5.35,与酵母MAK16蛋白的同源性为41%,该编码蛋白有一个双侧核定位信号motif和一个RNA结合motif,将这一新cDNA序列推导的蛋白命名为RNA结合基序蛋白13(RBM13),基因定名为RBM13,用RBM13基因的cDNA探针进行Northern杂交,检测到3.6kb和2.2kb二种长度的转录本。在心脏,骨骼肌,肾脏和肝脏中有较高表达。  相似文献   
8.
从人胎脑cDNA文库中克隆到一种新的酪蛋白激酶的cDNA,全长1754dp,拟编码438个氨基酸残基,该蛋白预测的分子质量为50272u,等电点9.37,经同源分析,该基因在大鼠的CK1γ1蛋白有94%的相似性,为人1型酪蛋白激酶-γ1亚型基因,人CK1γ1基因同时与15号与17号染色体的基因组部分序列完全一致,但RH法却将基因定位于15q22区段的D15S159-D15S125 Marker之间,多组织Northern膜(MTN)杂交分析显示,人CK1γ1基因在肝,结肠,肾和骨骼肌特别在肝组织中有高表达。  相似文献   
9.
通过构建,筛选人18周胎脑cDNA文库,克隆到一条与神经节苷脂诱导分化相关蛋白高度同源的新基因,经HUGO/GDB人类基因命名委员会的同意命名为GDAP1L1,进行新基因的全序列测定,RH定位分析,Blast分析及生物学信息分析,Northern杂交提示GDAP1L1基因在胎脑中高度表达,但在成人脑组织中低表达,新的神经节甙脂诱导分化相关蛋白的表达和功能研究初步提示:全长新神经节苷脂诱导分化相关基因核苷酸序列长1163bp,RH定位分析新基因定位在染色体20q12区,BLASTN,BLASTP,TBLASTN分析新基因的蛋白质序列与人和鼠“神经节甘脂诱导分化相关蛋白1”有58%的同源性,而与人的另一条“类似神经节苷脂诱导分化相关蛋白1”的部分蛋白序列(47-253aa)的同源性达100%,新基因蛋白在3,5端分别多出46aa和114aa的长度,生物学住处分析证实神经节苷脂诱导分化相关基因与神经营养与细胞凋亡有密切关系,全长新神经节苷脂诱导分化相关基因是一个神经营养与发育及细胞周期调控,信号传导有关的基因,可能在肿瘤的发生中具有重要作用,其功能的进一步研究将为肿瘤机理的阐明提供思路。  相似文献   
10.
从人胎脑构建的cDNA文库中,通过大规模测序筛选的方法获得一条新基因,该基因蛋白序列含有1个环指(RING finger)基序及2个进核信号(nuclear localization signal NLS)序列,钭此基因命名为RNF20(RING Finger 20),用放射杂交细胞系(Radial hybrid RH)方法定位此基因在人染色体的9q22上,Northern杂交表明,其mRNA在睾丸组织中高表达,用小鼠睾丸做原位杂交表明,小鼠的同源基因在精原细胞及初级精母细胞中高表达,未成年小鼠睾丸中的精原细胞没有发达,提示RNF20可能参与精子发生的调控作用。  相似文献   
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