大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术．对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究．从30个RAPD引物当中．筛选出11个具有多态性的引物．共扩增出多态性带224条．多态性条带比率为41．18％．从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物．共扩增出多态性带121条．多态性条带比率为50．21％．对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法．计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0．28和0．32．根据这两种标记的结果．采用UPGMA进行聚类分析，得到与生物学分类地位基本一致的结果．结果表明，在实验稳定性上．ISSR优于RAPD．且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异．RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究．     

优质红锥种源遗传多样性的RAPD分析

采用从100个随机引物中筛选出的30个有效引物，利用RAPD技术对不同地区的10个不同生态型优质红锥种源进行遗传多样性研究．结果表明：（1）30个有效引物共扩增出290条清晰谱带，平均每个引物扩增出9．67条带．多态性条带为254条，比率为87．59％；（2）10个不同生态型红锥之间的遗传相似系数介于0．5946～0．7148之间，但不同地区红锥也存在着一定的遗传差异（遗传差异在0．2852～0.4054）；（3）用引物S3扩增出的带谱可在一次实验中区别10种不同生态地区的优质红锥，同时S3也可作为10种优质红锥材料的指纹图谱，鉴定优质红锥的种源；（4）聚类分析表明，10种优质红锥种源可聚成3个独立的类群．本文作者对它们的亲缘关系进行了推测．     

宿州辣椒地方品种分子遗传多样性分析

利用优化的辣椒SRAP—PCR反应体系,研究宿州辣椒地方品种的遗传多样性．从30个引物组合中筛选出条带清晰、多态性好的15个引物组合,共扩增出62条谱带．其中,多态性谱带有40条,多态率为64．5％;不同引物扩增的条带为3～7条,谱带大小范围为100～1000bp．供试品种的遗传相似系数为0．52～1．00之间,当遗传距离D=0．52时,可将27份材料分为两大类．结果表明,宿州辣椒种质资源遗传多样性丰富．     

草鱼RAPD指纹的初步研究

运用２０个随机引物对草鱼进行了随机扩增多态ＤＮＡ分析。结果表明,所用引物都能对草鱼扩增出稳定的ＲＡＰＤ谱带,扩频的谱带数在２￣１１之间,扩增的片段大小在０．１ｋｂ￣３．０ｋｂ之间．其中,ＯＰＭ－９等６个引物能在草鱼个体间扩增出多态性片段,占引物总数的３３．３％,ＯＰＭ－１等１４个引物对草鱼不同个体扩增的谱带是一致的,占引物总数的６６．７％,为草鱼种质资源及遗传多样性的研究奠定了基础。     

不同海拔高度的野古草的遗传多样性分析

采用SRAP（sequence-related amplified polymorphism）标记对3个不同海拔的15个野古草材料进行遗传多样性分析．49个SRAP引物组合共扩增到207个谱带、115个多态性带,多态性带的比例为55．56％．每对引物组合的谱带数和多态性带数分别为4．22个和2．35个．UPMGA聚类分析结果表明：15个野古草材料可分为Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,V5个类群,Ⅱ类又可分为2个亚群,Ⅲ类可分为3个亚群;不同海拔下的3个野古草种群的遗传多样性存在较大差异;低海拔种群内的野古草存在较大的遗传分化,具有更丰富的遗传多样性．     

铁皮石斛不同繁殖代数遗传稳定性RAPD的研究

研究铁皮石斛单蒴果种子内不同无性繁殖代数的遗传稳定性.利用从100个随机引物筛选出23个稳定性较好的10碱基引物,对来自单蒴果的7代无性繁殖种苗进行RAPD检测.发现7代无性繁殖的组培苗内代代之间遗传距离很小,但代数相差越大其遗传距离就越大,在0～0.043 5范围内.其中在1～3代未探查到变异,但从第4代始,有部分引物RAPD带型发生变化,但变化甚微.23个稳定引物只探查到了7个变异位点.铁皮石斛组培过程中种内存在一定的变异,但变异甚微,所以建立铁皮石斛稳定的无性快繁体系是切实可行的.     

长江鳙遗传多样性的研究

运用４０个１０碱基随机引物对长江中游鳙的遗传多样性进行了随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析,所用引物中,有１０个能对鳙不同个体扩增出多态ＤＮＡ带,占总引物数的２５％,据所取长江中游自然繁殖的１８条鳙样品的ＲＡＰＤ谱带的分析结果表明,鳙任意两个体间的遗传相似度在０．９３８６￣０．９８５７之间,平均值为０．９６６１;遗传变异度则在０．０１４３￣０．０６１４之间,平均值为０．０４３９;所分析样本的Ｓｈａ     

龙柚芽变系的RAPD分析鉴定

利用100个10bp的随机引物对龙柚的4个芽变系的基因组DNA进行RAPD扩增分析,探讨芽变系遗传物质的变化．在这100个随机引物中,筛选出能在4个芽变系中扩增出稳定多态性片段的引物11个,一共扩增出了63条片段,其中多态性片段有19个,占30．16％．聚类分析的结果,芽变系2和4的遗传距离最小（0．1001）,相似系数最大（0．9048）．表明了芽变引起的遗传物质的改变能够通过无性繁殖的方式存在,用RAPD的方法来分析不同芽变系的遗传关系是可行的．     

4种木麻黄亲缘关系的RAPD分析

应用RAPD枝术对普通木麻黄(Casuarina equiseti folia)，粗枝木麻黄(C.gluca)，细枝木麻黄(C．cunninghamaina)和滨海木麻黄(Allocasuarina littoralis)的亲缘关系进行分析，从40个引物中筛选出18个重复性好、稳定性高的有效引物．18个有效引物共扩增出690条DNA带，其中多态性条带318条，占总扩增条带的46．09％．对扩增出来的690条DNA带进行聚类分析，结果表明：木麻黄属(Casuarina)的普通木麻黄、粗枝木麻黄和细枝木麻黄的平均遗传距离为0．30，其中细枝木麻黄和粗枝木麻黄的遗传距离特别小，为0．19；而异果木麻黄属(Allocasuarina)的滨海木麻黄与其他3种木麻黄的平均遗传距离为0．65．RAPD聚类分析结果表明，4种木麻黄之间的亲缘关系与血清学和化学分类学的结果一致，说明RAPD分子标记技术适用于木麻黄植物的遗传多样性研究．     

应用RAPD技术探讨苦丁茶冬青种质材料的起源

以15份原产地明确的苦丁茶冬青野生种质材料作为参照,利用RAPD—PCR技术对26份苦丁茶冬青栽培材料的原产地进行了分析．从40个10bp引物中筛选出16个多态性良好的引物,用该16个引物对上述41份苦丁茶冬青种质材料进行PCR扩增,共得到238条DNA谱带,其中多态性带190条,占扩增出的总带数之79．8％．根据扩增结果计算了各份材料之间的Jaccard遗传相似系数,并用UPGMA法构建了聚类树状图．供试的41份种质材料在聚类图中明显地分为两个类群,即海南岛类群和广西南宁类群．26份原产地待查的种质材料有12份归聚于海南岛类群,说明它们的起源地在海南岛境内;另14份原产地待查的种质材料分布归聚于广西南宁类群,说明它们的原产地在广西南宁地区或毗邻区域内．所有供试的41份苦丁茶冬青材料其遗传相似系数在0．5654～0．9813之间,表明这些种质材料具有比较丰富的遗传多样性．不同苦丁茶冬青种质材料其不同的起源地域可以从聚类图中清楚地反映出来．RAPD分子标记的结果可以作为判断苦丁茶冬青起源地域的重要参考依据,并可用于探讨苦丁茶冬青不同种质材料的遗传差异和亲缘关系．     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

RAPD Analysis for Genetic Variation within the Endangered Quillwort Isoetes hypsophila (Isoetaceae)

0　IntroductionI soetes hypsophila, a Chinese endemic species, is a memberof the heterosporous aquatic quillworts, and is a perennialdistributed in shallow zones of plateau lake or plateau marsh ofSichuan and Yunnan Province in China. In recent years, I.hypsophilahas declined rapidly in population quantity (num ber) and has even disappeared from many locations. The spe cies is now considered to be rare and threatened or endangeredin China and is listed among first category of protected wil…     

四川黑山羊品种(群体)的RAPD标记研究

从5组24个随机引物中筛选出16个重复性好的多态引物,对四川9个黑山羊品种(群体)共计572只个体,进行随机扩增多态DNA(RAPD)标记研究.结果表明,16个引物扩增出125条带,其中102条带呈现多态,多态率为81.61%.不同引物扩增出的DNA片段在各品种(群体)中的分布频率不同.9个黑山羊品种(群体)间相似系数为0.7533～0.9642,遗传距离指数为0.0358～0.2467.引物OPQ-06(序列为GAGCGCCTTG)未在乐至黑山羊中扩增出900bpDNA片段,而在其他8个黑山羊品种(群体)中出现率均为1,可作为区分乐至黑山羊和其他8个黑山羊品种(群体)的分子遗传标记.引物OPK-03(序列为CCAGCTTAGG)未在江安黑山羊扩增出550bpDNA片段,在其他8个黑山羊品种(群体)中出现率均为1,可用于区分江安黑山羊和其他8个黑山羊品种(群体)的分子遗传标记.     

基于松材线虫全基因组序列的SSR标记开发

为了研究松材线虫在我国的群体遗传关系及传播路径,获得更为稳定的松材线虫分子标记,使用MISA软件对松材线虫全基因组10 432条DNA片段进行搜索,共获得95个gSSR位点。其中,二核苷酸重复出现频率最高,占全部SSR位点的66.3%。依据所有gSSR位点共设计出36对引物,以1份松材线虫DNA pooling(包含我国46个不同地理来源的松材线虫虫株DNA)为模板进行PCR,产物由QIAxcel全自动凝胶电泳分析系统检测,获得17对可能具有多态性的gSSR引物。进一步对这17对引物的PCR产物进行单克隆试验并测序,BioEdit软件拼接比对结果表明,其中9对确实具有多态性。     

Identification of RAPD marker linked with fertility-restoring gene of cytoplasmic male sterile lines in upland cotton

Bulked segregant analysis was employed to construct two mixed DNA pools to screen the RAPd marker linked with the fertility-restoring gene(Rf _i) of upland cotton. A total of 425 arbitrary 10-mer oligonucleotide primers were screened on two DNA pools, bulked male fertile and sterile DNAs isolated from BC₃ segregating population of (0-613-2R X Simian No. 3). Three primers produced repeatable polymorphisms between the paired bulks and their parents. DNA was extracted and amplified with these three primers for 92 plants of (Zhong 12A-1 × 0-613-2R)F₂. Based on the male fertility scoring and RAPD amplification, it is found that one RAPD marker fragment designated OPV-15₃₀₀ was linked with the fertility-restoring gene (Rf₁) with a recombination value of 13.0±2.57%.     

黑麂粪便DNA的简易提取方法

收集九龙山自然保护区野外自然条件下的黑麂粪便样品,用无水乙醇保存于-70℃冰箱,经十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）裂解液温浴粪便、酚／氯仿抽提及聚合酶链反应（PCR）纯化试剂盒纯化等步骤提取黑麂粪便DNA,并扩增线粒体DNA细胞色素b基因和2个微卫星位点进行检测;同时提取黑麂肌肉和皮毛样品的DNA作为对照．结果显示,该方法可以从粪便中提取到高质量的黑麂DNA,并可进行有效扩增,为黑麂及其他濒危鹿科动物的非损伤取样提供了一种简易方法．     

滩羊体大品系遗传标记的研究

采用RAPD(Rondom Amplified Polymorphic DNA)技术,利用混合基因池(DNA pool)法,对滩羊体大品系、普通品系进行了DNA多态性分析,从100种具有10个碱基的随机引物中,筛选出84种引物在滩羊群体基因组中共扩增出358条带,其中22种引物的扩增产物表现为多态(占22％),且扩增出32条有差异的条带,占总带数的8.94％;62种引物的扩增产物表现为单态(占62％)。滩羊体大品系的特异性条带有5条,而普通品系的特异性条带有7条,这些特异标记可以用来鉴定滩羊的两个品系;滩羊体大品系与普通品系间的遗传距离为0.136±0.087,表明两品系之间的亲缘关系很近。     

RAPD Analysis for Genetic Variation within the Endangered Quillwort Isoetes hypsophila （Isoetaceae）

The genetie variation in the critically endangered species Isoetes hypsophila was investigated using Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD) markers. Thirteen primers were screened from sixty primers, and a total of 104 DNA fragments were scored, of which, 52 were polymorphic loci. Low-level genetic diversity within populations with PPB values ranging from 7.69% to 25.96% was found. An Analysis of Molecular Variance (AMOVA) indicated that the most of variance (78.30%) occurred between Yunnan and Sichuan. The variances among populations within regions and within populations were only 3.89% and 17.82%, respectively.     

不结球白菜SSR引物的高效开发及其通用性研究

利用改进的ISSR-PCR分离不结球白菜基因组微卫星,进行两步PCR,分别设计出SSR两端引物IP2和IP3（即SSR引物对）,SSR引物产率为12%,明显高于传统方法.不结球白菜SSR序列以（GA）n为主,占70%.将69对SSR引物用于芸苔属其它8种作物的扩增,97%引物有显著扩增,扩增率最高的为四倍体白菜和甘蓝（85.5%）,最低的为青花菜（49.3%）.10对为通用引物,在所检测的8种作物中片段大小一致,其余的扩增片段和数目差异较大,表现出较为丰富的多态性.尤其是在C基因组的甘蓝和花椰菜上,最多可检测到5个位点,表明运用lSSR-PCR开发出的引物多态性较高.     

应用聚合酶链式反应检测犬细小病毒

将具有犬细小病毒病典型症状的病犬肠溶物经ＳＤＳ－酚裂解法提取总ＤＮＡ,并以此ＤＮＡ为模板,通过人工合成的两条２０ｍｅｒ引物进行ＰＣＲ扩增,该对引物扩增的片段为犬细小病毒结构蛋白ＶＰ２基因中间１／３区段,ＰＣＲ产物经琼脂糖凝胶电泳,试验结果表明：用ＰＣＲ扩增检测犬细小病毒具有良好的特异性,应用该方法检测的２７份病犬肠溶物样品块获得了预计长度的ＤＮＡ片段（５３１ｂｐ）,而健康犬的肠溶物样品ＰＣＲ结果为