燕麦品种间杂交后代SSR遗传变异分析

采用SSR分子标记技术研究燕麦杂交后代与亲本之间在DNA分子水平上的遗传变异,为杂交亲本选配提供基因组水平理论依据。试验从50对SSR引物中筛选出11对多态性明显、重复性比较好的引物,共扩增出143个DNA片段,其中111个片段呈现多态性,占总扩增片段的63.3%;燕麦杂交后代与亲本的相似性系数范围为0.42~0.77。UPGMA聚类分析结果表明,SSR标记能将这14个杂交后代相互区分开,且品系Ⅱ比品系Ⅰ遗传变异较大。     

杉木EST-SSR与基因组SSR引物开发

利用已经公布的杉木444条EST序列和未公布的杉木基因组文库中1 142条基因序列,进行引物开发效率的比较。去冗余后,利用MISA 搜索SSR 位点,分别得到109个和39个含有SSR的 位点。杉木EST序列中SSR分布密度为964.58个/Mbp,基因组中平均每Mbp出现1 037.24个SSR。在两个独立来源的数据库序列中,六核苷酸重复均为最多的重复类型,且AT-rich的重复类型占较大比例。AGC/CTG是杉木EST序列和基因组库中最多的三碱基重复,通过Primer 3.0分别设计出SSR引物95对和37对。为考察设计引物在杉木不同种源(群体)中的有效性,取12个种源(个体)的优良个体, 利用随机抽取的10个EST-SSR和8个gSSR(基因组SSR)进行引物筛选,结果表明:EST-SSR和gSSR各有4对引物在12个种源(个体)中表现出明显的多态性,多态率分别为40%和50%。8对多态性的SSR引物共扩增出 25 个多态性等位位点,平均每个引物产生 3.125 个多态性等位位点,平均有效的等位位点为2.399 5,PIC平均值为0.519 1; Hot平均为0.307 4。其中gSSR标记在检测群体间存在较大的分化,4个gSSR比4个EST-SSR扩增出更多的等位位点数、平均等位位点数,以及更大的PIC值。     

检疫性杂草假高梁及其近似种SSR分子标记的遗传多样性

利用SSR标记对8个假高粱及其近似种样品的遗传多样性进行研究,结果发现：（1）在11对SSR引物中,有5对扩增出多态性,这5对引物共检测到25个多态性位点,每对引物平均能检测到5个多态性位点;（2）根据Nei’s遗传距离分析的聚类树显示：这8个高粱属物种共可分为2个类群,7个亚类群;假高粱和黑高粱、拟高粱和明福1号间的亲缘关系极近;（3）SSR结果揭示出所测8个群体的Gst为0．0864,说明本文研究的Sorghum属8个物种的群体遗传分化程度属于中度。     

适用于野生软枣猕猴桃遗传多样性分析的SSR引物筛选

为进一步研究野生软枣猕猴桃种质资源的遗传多样性,以软枣猕猴桃基因组DNA为模板,优化了SSR反应体系并确定了反应条件,筛选出了多态性较高的标记.从来自中华猕猴桃基因组的65对SSR引物初步筛选出15对有较好扩增带型、增稳定性好的引物,其中较好多态性的引物有12对.用筛选的引物进一步对四川天全二郎山的野生软枣猕猴桃群体进行了SSR分析,在15个个体中共检测出了141个等位基因,平均每个位点检测到9.4个等位基因,平均PIC值为0.745.     

不同作物间共用SSR引物的初步研究

根据相关报道,利用互联网在GENE BANK中查询油菜的简单重复序列及其两端序列来设计引物,并合成了2对甘蓝型油菜的SSR引物（Bn92A,Bn72A),通过所建立的降温PCR（Touchdown PCR)方法,对来自禾本科,十字花科,芸香科,锦葵科等12种经济作物的DNA进行PCR扩增。结果显示,PCR扩增产物条带清晰。所有12份材料用2对SSR引物扩增出的主带片段大小一致,分别为150bp(Bn92A),250bp(Bn72A）。这与文献报道在甘蓝型油菜中SSR扩增出的片段大小完全一致。本研究说明,各物种基因组间存在着相当大的相似性,这2对甘蓝型油菜的SSR引物可在其它经济作物分子标记的基因组比较作图应用。     

草鱼基因组随机扩增多态性引物及多态性位点的筛选

为了建立草鱼基因组DNA多态性分析的指标体系,应用RAPD技术,从180条10碱基随机引物中筛选出了31条能扩增出多态性DNA片段的引物。用这31条多态性引物共扩增出了327条重复性好、带型清晰、分辨率高的谱带。扩增产物的片段大小范围在400—2000bp之间。单一引物扩增条带为5—14条。用这些多态性引物在草鱼基因组DNA中检测到了93个多态性位点,并对这些多态性位点上的等位基因频率进行了统计分析。这31条多态性引物和所检测到的93个多态性位点初步为草鱼基因组的多态性分析提供了可靠的分析指标体系。     

基于RNA-seq的崇左金花茶EST-SSR标记开发

本研究分析了崇左金花茶(Camellia chuongtsoensis)转录组水平的EST-SSR特征.从崇左金花茶转录组数据组装获得的35 410个Unigene中,共鉴定出2~7不同核苷酸重复类型的SSR位点7 754个,分别分布于6 394条序列中,其中1 121个Unigene具有两个以上的位点.在转录组中SSR位点出现频率为21.90%,分布密度为1/3.6kb;在所有重复单元中,二碱基微卫星占主要优势,占SSR位点总数的61.3%.利用Primer 3.0设计引物,共计3 303条Unigene成功设计出引物.随机选择10对SSR引物,对一个崇左金花茶群体进行扩增多态性分析,8对引物能够扩增出符合预期大小的PCR片段,其中4对引物成功检测出多态.以上结果表明,转录组数据能够提供丰富的SSR位点,用于快速高效地开发SSR引物,所开发的引物可为崇左金花茶遗传多样性的研究以及种质资源的鉴定与保护等方面提供分子基础.     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

微卫星标记在人参和西洋参鉴别中的应用

从GenBank中寻找含有简单重复序列(SSR)位点的人参DNA片段序列,设计SSR引物,挑选PCR扩增条带清晰的引物,对人参和西洋参进行PCR扩增及聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,选择能够区别2个种的引物.共有来自8个SSR位点的9对引物能扩增出可区分人参和西洋参的特异性片段,其中7对SSR引物在西洋参中能稳定地扩增出特异性...     

皖西白鹅遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术对皖西白鹅产区内１１个不同地点的２４只个体一进行遗传多样性分析。从３４个随机引物中筛选出的１２个引物对所有个体的总基因组ＤＮＡ进行了ＰＣＲ扩增。共扩增出８７个ＤＮＡ片段,其中的２２个多态性片段,计算了各多态性片段在群体中分布的频率及各个体间的遗传距离指数。同时根据遗传距离指数对它们进行了聚类分析。作为家养动物的个品种,皖西白鹅的遗传多样性程度较高。     

27个菜心品种遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR技术对27个菜心品种的遗传多样性进行了分析.结果表明,12条引物共检测到103个可重复位点,其中多态位点58个,多态位点百分率(P)为56.31%.平均多样性指数(1)为0.229,遗传相似系数(H)为0.144,观察等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为1.563和1.225,遗传距离(GD)的范围在0.029～0.344之间,表明菜心遗传多样性较低.经UPGMA聚类分析,将27个菜心品种分为六大类群.     

美国花菜的营养成分分析

分析美国花菜的主要营养成分，证明其含有丰富的维生素和微量元素，是一种营养丰富的天然保健食品。     

POD、PPO指纹图谱在芸薹属蔬菜分类上的研究

采用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对芸薹属21个品种根POD同工酶和PPO同工酶进行了研究,并用类平均法(UPGMA)进行了聚类分析。结果表明:大白菜、小白菜、菜心、油菜、壬生菜、京水菜、芜菁属于芸薹种下的亚种或变种,结球甘蓝、紫甘蓝、抱子甘蓝、羽衣甘蓝、花椰菜、青花菜、紫花菜、苤蓝、芥蓝属于甘蓝种下的亚种或变种,雪里蕻、结球芥菜属于芥菜种下的变种。从蛋白质分子水平上分析了芸薹属三大类蔬菜的亲缘关系,并确定了特征指纹图谱。     

从16种蔬菜中筛选凝集素的研究

对福建省常见的16种蔬菜进行了凝集素的筛选实验。研究结果表明,花椰菜(Brassica oleracea var.botrytis L.)的花蕊和分葱(Allium schoenoprasum L.)、韭菜(Allium tuberosurn Rottler.ex Spreng.)的叶片组织中存在着凝集兔红细胞的凝集素。检测了这些蔬菜凝集素的热稳定性、硫酸铵沉淀和糖抑制作用,为它们的分离和纯化提供了一些科学依据。     

六种甘蓝下胚轴和子叶无性系建立的研究

对6种甘蓝不同器官进行了组织培养和无性系建立的研究,成功诱导了紫甘蓝、皱叶甘蓝、羽衣甘蓝、抱子甘蓝、紫苤蓝和芥蓝的茎尖、下胚轴或子叶分化丛生不定芽.诱导6种甘蓝下胚轴和子叶分化的理想培养基是MS 6-BA(0.5~1 mg/L);诱导不定芽生根的理想培养基是MS IAA(0.2~0.5 mg/L);试管苗移栽、扦插的理想基质是炉灰渣.移栽的试管苗生长旺盛.     

DNA分子标记在不结球白菜遗传育种中的应用进展

概述了分子标记的分类和特点,以及在不结球白菜遗传多样性分析、遗传图谱构建、数量性状座位(quantitative trait locus,QTLs)定位和分子标记辅助育种等领域中的最新研究进展.总结了目前分子标记在不结球白菜遗传改良和辅助育种中存在的若干问题,并对该研究领域提出了一些展望和建议.     

中药溪黄草及其药用近缘种的RAPD分析

运用１４个有效的１０ｍｅｒ寡核苷酸引物对中药溪黄草原植物线纹香茶菜Ｉｓｏｄｏｎｌｏｐｈａｎｔｈｏｉｄｅｓ及其药作近缘种基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增,共检出１９４个位点．其中单态位点１４个,占７２％;多态位点１８０个,占９２８％;分类群特有位点１０８个,占５５７％．用ＵＰＧＭＡ法对分类群间的Ｊａｃａｒｄ相似性系数和遗传距离进行聚类分析．结果表明,狭基线纹香茶菜和细花线纹香茶菜与溪黄草的亲缘关系较近,而溪黄草与线纹香茶菜、狭基线纹香茶菜、细花线纹香茶菜之间的亲缘关系远．可用ＲＡＰＤ技术对中药的正本清源、真伪品及质量进行研究．     

不结球白菜种质创新及资源信息管理研究进展

对不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis Makino)抗性育种、细胞质雄性不育、基因克隆和转基因育种、遗传图谱和DNA分子标记辅助育种,以及种质资源信息管理进行了综述,以期为不结球白菜种质创新和管理提供参考和建议.