基于PCR-RFLP梨品种cpDNA遗传多态性的分析

为了研究库尔勒香梨等19个主要梨品种的cpDNA遗传多态性,采用PCR-RFLP进行分析,利用10对通用引物对总DNA进行扩增,并且采用7种限制性内切酶对PCR产物进行酶切,应用DPS v7.05版软件计算Jaccard相异系数,采用非加权类平均法(UPGMA)进行0-1系统聚类分析.结果显示:7对引物(cp01、cp02、cp03、cp04、cp06、cp09、cp10)能在梨属植物上扩增出1条特异性谱带,cp09/MvaI,cp03/Hin6I的酶切位点有显著差异.根据结果分析,库尔勒香梨与鸭梨、砀山梨、苹果梨、早酥、慈梨、金川雪梨、锦丰、新疆句句梨的平均距离系数较小,与其他梨的平均距离系数较大.     

应用RAPD技术对新疆布顿大麦遗传多样性的研究

利用RAPD分子标记，通过40条10碱基随机引流，对32份新疆布顿大麦进行了遗传多样性评价。在40个10碱基随机引物中，有22个引物（占55％）的扩增产物具有多态性，每条多态性引物能产生1－7条多态性DNA带纹。40个引物共扩增227条带，其中95条（占41．9％）具有多态性，平均每条引物能产生1．7条多态性DNA带纹。基于RAPD技术计算了32份布屯大麦间的遗传相似系数（GS）变化值为0．427－0．848，平均值为0．681，利用不完全加权算术平均数（UPGMA），采用1－GS矩阵对其进行遗传聚类，结果表明，RAPD标记将32份参试材料区分为3类（或亚类），来源于新疆北部的20份材料有17份材料（占85％）聚入Ib亚类，而第Ia亚类则主要来自于新疆中部的一些材料。研究表明，RAPD标记揭示的新疆布顿大麦间的遗传多样性与其地理来源紧密相关。     

大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术．对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究．从30个RAPD引物当中．筛选出11个具有多态性的引物．共扩增出多态性带224条．多态性条带比率为41．18％．从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物．共扩增出多态性带121条．多态性条带比率为50．21％．对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法．计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0．28和0．32．根据这两种标记的结果．采用UPGMA进行聚类分析，得到与生物学分类地位基本一致的结果．结果表明，在实验稳定性上．ISSR优于RAPD．且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异．RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究．     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

7个水稻光温敏核不育系品种(系)的RAPD多态性分析

利用RAPD技术，从60个随机引物(10bp)中落选出了31个引物，能在供试的7个水稻光温敏核不育系不同品种(系)间扩增出180条稳定性较好的多态性片段．聚类分析结果显示，7个水稻光温敏核不育系品种(系)明量地聚为三类，其中同属于株1S体细胞诱变来的SV5，SVl0发生了较大的变异，相似系数均小于0．470，而SVl和SVl4变异较小，相似系数均大于0．890．H155与杂交亲本培矮64S的遗传差异较小，与杂交亲本株1S的遗传差异较大．该结果与田间农艺性状相符：另外，从7个水稻光温敏核不育系品种(系)的整体来看，相似系数均较大，说明遗传差异较小，遗传背景单一，从而在很大程度上限制了水稻杂种化势的利用．     

4种木麻黄亲缘关系的RAPD分析

应用RAPD枝术对普通木麻黄(Casuarina equiseti folia)，粗枝木麻黄(C.gluca)，细枝木麻黄(C．cunninghamaina)和滨海木麻黄(Allocasuarina littoralis)的亲缘关系进行分析，从40个引物中筛选出18个重复性好、稳定性高的有效引物．18个有效引物共扩增出690条DNA带，其中多态性条带318条，占总扩增条带的46．09％．对扩增出来的690条DNA带进行聚类分析，结果表明：木麻黄属(Casuarina)的普通木麻黄、粗枝木麻黄和细枝木麻黄的平均遗传距离为0．30，其中细枝木麻黄和粗枝木麻黄的遗传距离特别小，为0．19；而异果木麻黄属(Allocasuarina)的滨海木麻黄与其他3种木麻黄的平均遗传距离为0．65．RAPD聚类分析结果表明，4种木麻黄之间的亲缘关系与血清学和化学分类学的结果一致，说明RAPD分子标记技术适用于木麻黄植物的遗传多样性研究．     

葡萄的随机扩增多态性DNA研究

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)对11个样品进行了研究．这11个品种包含1个欧美杂交种，一个中国野生种(Vitis．piasezkii Var．pagnucii)，9个欧亚种(Vitis．vinifera L)．选择了多态性好的7个10碱基寡聚糖核苷酸作为随机扩增的引物，在琼脂糖凝胶电泳上产生了76条带，其中63条具有多态性．各引物产生的条带从6到13不等，平均为10．86条／模板，其中9条具有多态性，表明葡萄基因的多态性十分丰富．通过遗传相似性分析表明11个葡萄基因的Nei氏相似性系数分布为0．1027-1．1787，平均相似系数为0．459．通过非加权算术平均数聚类法，获得了11个葡萄品种之间的遗传关系树图，欧亚种群，东亚种群和欧美杂种在遗传关系树图上被成功地聚为3组．本实验发现欧亚种和欧美杂种亲缘关系较近，而和中国野生种亲缘关系远．在欧亚种中，520A和S04的遗传距离最近，其次是井川1010和美人指，最大的遗传距离发生在桑无核和其他欧亚种之间．     

优质红锥种源遗传多样性的RAPD分析

采用从100个随机引物中筛选出的30个有效引物，利用RAPD技术对不同地区的10个不同生态型优质红锥种源进行遗传多样性研究．结果表明：（1）30个有效引物共扩增出290条清晰谱带，平均每个引物扩增出9．67条带．多态性条带为254条，比率为87．59％；（2）10个不同生态型红锥之间的遗传相似系数介于0．5946～0．7148之间，但不同地区红锥也存在着一定的遗传差异（遗传差异在0．2852～0.4054）；（3）用引物S3扩增出的带谱可在一次实验中区别10种不同生态地区的优质红锥，同时S3也可作为10种优质红锥材料的指纹图谱，鉴定优质红锥的种源；（4）聚类分析表明，10种优质红锥种源可聚成3个独立的类群．本文作者对它们的亲缘关系进行了推测．     

利用ISSR技术对优质红锥种质资源遗传多样性的分析

利用ISSR分子标记对10个优质红锥品种进行基因组多态性分析．从20条引物中筛选的11条具有扩增多态性的引物共扩增出435条带，其中多态性条带325条，占总扩增条带的74．7％，平均每个引物扩增3．95条．ISSR标记揭示的10个优质红锥品种的遗传相似系数变化范围为0．4737～0．8081，平均值为0．7287．聚类分析可将10个优质红锥品种分为四类．     

番茄属(Lycopersicon)RAPD标记遗传分析

用26条随机引物（10bp)对番茄属9个种的43份材料进行了RAPD分析，共检测到199个位点（稳定的带），平均每条引物检测到7．65个位点；其中多态位点为146个，占总扩增位点数的73．37％；依此将番茄属43份材料划分为4个类群；供试材料间平均遗传距离介于0．041－0．452之间。     

杜氏藻种间关系RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对7株杜氏藻,即：D.salina、D.bardawil、D.minuta、D.bioculata、D.parva、D.peircei和D.primolecta进行了遗传多态性分析。用30个10聚随机引物进行多态性扩增和筛选,其中23个引物（76.67%)可获得清晰的多态性条带。选择其中能够得到清晰、重复性良好的18个引物共扩增产生150条可区分的DNA条带。根据种间Nei遗传相似系数计算分析,构建杜氏藻属部分种的聚类分析图。分析结果表明：D.salina、D.bardawil和D.minuta聚为一类,D.bioculata、D.parva、D.peircei和D.primolecta聚为另一类。由于两类之间存在较远的亲缘关系,把这两类杜氏藻称为两个种可能更合适。     

皖西白鹅遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术对皖西白鹅产区内１１个不同地点的２４只个体一进行遗传多样性分析。从３４个随机引物中筛选出的１２个引物对所有个体的总基因组ＤＮＡ进行了ＰＣＲ扩增。共扩增出８７个ＤＮＡ片段,其中的２２个多态性片段,计算了各多态性片段在群体中分布的频率及各个体间的遗传距离指数。同时根据遗传距离指数对它们进行了聚类分析。作为家养动物的个品种,皖西白鹅的遗传多样性程度较高。     

中国水仙种质资源的遗传多样性分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）标记方法对中国水仙主要栽培品种及不同的生态类型进行了遗传多样性检测。从98个随机引物中筛选出16个有效引物，共扩增出120条DNA带，其中多态位点39个，占32．5％。相对其他作物，中国水仙遗传多样性水平偏低。中国水仙遗传多样性贫乏可能是现有中国水仙品种稀少的重要原因。用UPGMA法对各样品间的Nei氏相似性系数进行聚类分析。结果显示，崇明水仙与漳州水仙亲缘关系十分密切，平潭水仙与漳州水仙亲缘关系相对较远。平潭水仙和崇明水仙各居群内的遗传分化很小，而漳州水仙居群内遗传多样性较为丰富。以栽培品种看，单瓣水仙与重瓣水仙亲缘关系密切，“金三角”与单瓣水仙、重瓣水仙两者的亲缘关系较远。基于研究结果，提出采用新技术引进新种质选育水仙新品种的思路和保护中国水仙资源的重要性。     

中国特有极度濒危植物猪血木的保护遗传学研究

应用RAPD标记分析了广东阳春八甲镇猪血木Euryodendron excelsumH.T.Chang种群全部14个个体的遗传变异和进化关系.23个引物共检测到156个位点,其中多态位点95个,多态位点比率60.90%.根据所得数据求出的观察等位基因数为1.609 0、有效等位基因数为1.347 1、Nei基因多样性为0.199 3、Shannon多样性指数为0.153 4.猪血木还保留有比较丰富的遗传多样性.对Jaccard相似性系数用UPGMA法进行聚类分析表明,猪血木个体明显地分为2个亚群,其中2号个体同其他成员的遗传关系疏远.RAPD谱带表型的主成分分析(PCA)支持聚类分析结果.根据这些结果讨论了种群的管理和保护策略.     

从RAPD看肿节少穗竹的分类地位问题初探

采用ＲＡＰＤ的实验方法，研究了肿节少穗竹（Ｏｌｉｇｏｓｔａｃｈｙｕｍｏｅｄｏｇｏｎａｔｕｍ）与４个近缘竹种的关系。通过对ＲＡＰＤ数据的转换统计和数量分类运算，得到了有关的相似系数表，再根据相似系数表用ＵＰＧＭＡ聚类法构建了亲缘关系树状图。初步结果显示：肿节少穗竹在ＤＮＡ水平上，与本研究所用的同属及其邻属——酸竹属（Ａｃｉｄｏｓａｓａ）的其它物种存在明显差异。此外，文中还对肿节少穗竹的分类地位、少穗竹属（Ｏｌｉｇｏｓｔａｃｈｙｕｍ）和酸竹属的关系作一定的讨论     

ISSR 和 RAPD PCR技术对东北地区主推玉米品种的鉴别

运用现代分子生物学简单重复区间序列扩增多态性（ISSR）和随机扩增片段多态性DNA（RAPD）两种分子标记技术， 对吉林省主推6个玉米杂交种及其父本、 母本共计18份基因图谱进行鉴别. 以ISSR为主要检测方法、 RAPD为验证方法，分别从30条ISSR引物中选出4条、 从30条RAPD引物中筛选出2条扩增效果明显、 特异性高的引物. 结果表明， 运用ISSR和RAPD-PCR技术提高了玉米品种鉴定和纯度鉴定的准确性.     

基于数学形态学的香梨果梗提取方法

果梗是香梨品质分级的重要指标之一。本文在香梨图像经过背景分割和边缘检测获取边缘图像后,提出一种利用数学形态学方法对香梨果梗进行自动提取的新方法。利用MATLAB 7.1软件平台开发了香梨果梗自动提取的计算机视觉检测软件。研究结果表明,该方法对香梨果梗的提取的正确率为90.7%。     

Clones identification of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile by using PCR-RAPDs technique

A protocol of polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNAs (PCR-RAPDs) was established to analyse the gene diversity and genotype identification for clones of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile. Ten (out of 34) clones from introduction trial located in Voipir-Villarrica, Chile, were studied. The PCR-RAPDs technique and a modified hexadecyltrimethylammonium bromide (CTAB) protocol were used for genomic DNA extraction. The PCR tests were carried out employing 10-mer random primers. The amplification products were detected by electrophoresis in agarose gels. Forty nine polymorphic bands were obtained with the selected primers (BG04, BF07, BF12, BF13, and BF14) and were ordered according to their molecular size. The genetic similarity between samples was calculated by the Jaccard index and a dendrogram was constructed using a cluster analysis of unweighted pair group method using arithmetic averages (UPGMA). Of the primers tested, 5 (out of 60) RAPD primers were selected for their reproducibility and high polymorphism. A total of 49 polymorphic RAPD bands were detected out of 252 bands. The genetic similarity analysis demonstrates an extensive genetic variability between the tested clones and the dendrogram depicts the genetic relationships among the clones, suggesting a geographic relationship. The results indicate that the RAPD markers permitted the identification of the assayed clones, although they are derived from the same geographic origin.