大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术,对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究.从30个RAPD引物当中,筛选出11个具有多态性的引物,共扩增出多态性带224条,多态性条带比率为41.18%,从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物,共扩增出多态性带121条,多态性条带比率为50.21%.对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法,计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0.28和0.32.根据这两种标记的结果,采用UPGMA进行聚类分析,得到与生物学分类地位基本一致的结果.结果表明,在实验稳定性上,ISSR优于RAPD,且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异,RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究.     

大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术．对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究．从30个RAPD引物当中．筛选出11个具有多态性的引物．共扩增出多态性带224条．多态性条带比率为41．18％．从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物．共扩增出多态性带121条．多态性条带比率为50．21％．对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法．计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0．28和0．32．根据这两种标记的结果．采用UPGMA进行聚类分析，得到与生物学分类地位基本一致的结果．结果表明，在实验稳定性上．ISSR优于RAPD．且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异．RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究．     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

桂花品种的ISSR-PCR分析

利用ISSR—PCR方法对桂花的54个品种进行了基因组多态性分析,从70个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增,共扩增出90条DNA片段,其中多态性DNA带79条,占总扩增片段的87.8％,平均每个引物扩增的DNA带的数目为6.92条。依据扩增结果,应用RAPD Distans软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果表明:ISSR分析中产生了一些品种特有的指纹图谱,因此ISSR技术在桂花品种和品种群(品系)的鉴定和阐明遗传关系中有很大的应用潜力。利用DNA扩增结果进行聚类分析,把供试桂花的54个品种分为7个大类,并对品种进行了处理及种下品种群的遗传关系进行了探讨。     

桂花品种的ISSR-PCR分析

<正>利用ISSR—PCR方法对桂花的54个品种进行了基因组多态性分析,从70个ISSR引物中筛选出13个多态性引物用于正式扩增,共扩增出90条DNA片段,其中多态性DNA带79条,占总扩增片段的87.8％,平均每个引物扩增的DNA带的数目为6.92条。依据扩增结果,应用RAPD Distans软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果表明:ISSR分析中产生了一些品种特有的指纹图谱,因此ISSR技术在桂花品种和品种群(品系)的鉴定和阐明遗传关系中有很大的应用潜力。利用DNA扩增结果进行聚类分析,把供试桂花的54个品种分为7个大类,并对品种进行了处理及种下品种群的遗传关系进行了探讨。     

RAPD 在油用向日葵自交系鉴定和遗传分析中的应用

利用RAPD标记对8个油用向日葵自交系进行了鉴定和遗传分析。从40个UBC引物中筛选出12个能产生稳定遗传多态性的引物，利用其中3个引物提供的RAPD标记可将8个自交系逐一加以鉴别。12个引物对8个自交系共扩增出41条带，其中39条（占95.1％）具有多态性，每个引物可扩增出1～7条带，平均为3.4条带。不同自交系之间的RAPD遗传距离在0.13～0.85之间，平均为0.42。按UPGMA方法可将8个自交系聚为2大类、4个亚类。     

利用ISSR技术对优质红锥种质资源遗传多样性的分析

利用ISSR分子标记对10个优质红锥品种进行基因组多态性分析.从20条引物中筛选的11条具有扩增多态性的引物共扩增出435条带,其中多态性条带325条,占总扩增条带的74.7%,平均每个引物扩增3.95条.ISSR标记揭示的10个优质红锥品种的遗传相似系数变化范围为0.473 7～0.808 1 ,平均值为0.728 7.聚类分析可将10个优质红锥品种分为四类.     

青花菜种质的ISSR分子标记研究

利用ISSR标记对14份青花菜材料和1份油菜参照材料进行了基因组多态性分析,从60条引物中筛选出12条可扩增出清晰且具多态性条带的引物.共扩增出108条带,其中84条具有多态性,多态性百分率为77.78%,被测材料的ISSR标记多态性较高.其中每条引物可扩增出4~17条多态性带,平均7条.ISSR标记遗传相似性系数(GS)变异范围为0.531 2~0.859 4,平均值为0.744 4±0.073 4.通过UPGMA进行聚类分析,青花菜材料和油菜参照材料彼此间区分明显,14份青花菜材料聚为2类.结果表明,ISSR标记可以有效地评价青花菜遗传分化并为青花菜种类的鉴别提供一定的理论依据.     

辣木植物ISSR分子标记的初步研究

对从7个不同地方采集的7份辣木(Moringa)材料进行了ISSR 标记分析.结果表明,被测材料间ISSR标记多态性较高.从18个ISSR 引物中筛选出6个可扩增出清晰的且具多态性的条带的引物,共扩增出75条带,其中59条具有多态性, 占总扩增带数的78.67 %,其中每个引物可扩增出4～14条多态性带,平均10.17条.ISSR 标记遗传相似性系数(GS) 变异范围为0.557 0～0.836 7,平均值为0.687 6±0.080 9.聚类分析表明,7份辣木材料可以聚为四类,其中MS2为单独一类.ISSR 标记可以有效地评价辣木植物遗传分化并为辣木种类的鉴别提供一定的理论依据.     

利用ISSR技术对优质红锥种质资源遗传多样性的分析

利用ISSR分子标记对10个优质红锥品种进行基因组多态性分析．从20条引物中筛选的11条具有扩增多态性的引物共扩增出435条带，其中多态性条带325条，占总扩增条带的74．7％，平均每个引物扩增3．95条．ISSR标记揭示的10个优质红锥品种的遗传相似系数变化范围为0．4737～0．8081，平均值为0．7287．聚类分析可将10个优质红锥品种分为四类．     

不同纬度野生大豆种群间的遗传变异

选用了经初步筛选的２０个短随机序列引物和２个长随机序列引物对５个不同纯度来源的野生大豆进行了ＤＮＡ随机扩增,其中有１９个引物扩增出多态性片段,区获得７０个ＲＡＰＤ多态性片段,平均每个引物３．６８条,运用自编的计算机程序对扩增进行聚类分析。     

榛子种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术，对来自欧洲、美国和我国北方的共48份榛子品种或品系（包括4个种及种间杂种）的遗传多样性进行了分析．从150条随机引物中筛选出24条引物，共扩增出142条清晰可重复的带，其中多态性带130条，比例为91．5％．聚类分析将48份榛子种质分为5组：欧榛、平榛各自列为1组；杂交榛分成2个组；另外一组包括滇榛和藏榛2份种质．研究结果对榛子的种间亲缘关系进行了验证，且为同种不同品种的亲缘关系提供了更为详细的信息．     

草鱼基因组随机扩增多态性引物及多态性位点的筛选

为了建立草鱼基因组DNA多态性分析的指标体系,应用RAPD技术,从180条10碱基随机引物中筛选出了31条能扩增出多态性DNA片段的引物。用这31条多态性引物共扩增出了327条重复性好、带型清晰、分辨率高的谱带。扩增产物的片段大小范围在400—2000bp之间。单一引物扩增条带为5—14条。用这些多态性引物在草鱼基因组DNA中检测到了93个多态性位点,并对这些多态性位点上的等位基因频率进行了统计分析。这31条多态性引物和所检测到的93个多态性位点初步为草鱼基因组的多态性分析提供了可靠的分析指标体系。     

胡卢巴基因组DNA提取及RAPD引物筛选

以胡卢巴叶片为材料,利用改良CTAB法提取基因组DNA并进行质量检测和含量测定,在优化RAPD反应体系的基础上,对100条RAPD随机引物进行了筛选.结果表明,采用改良CTAB法能从胡卢巴叶片中提取到高质量的DNA,可以用于RAPD分析;从100条随机引物中筛选出了16条显示胡卢巴遗传差异的多态性引物,为胡卢巴遗传多样性研究提供分子依据.     

大鸨的随机扩增多态DNA分析与种内亲缘关系研究

利用随机扩增多态DNA技术对大鸨(Otis tarda)6个个体进行了随机扩增多态DNA分析,共筛选出有效随机引物14条,利用所得的随机引物对每只大鸨的基因组DNA进行扩增,共得到327个扩增片段,其中共有片段150个,根据聚类分析所得到的树状图确定了6只大鸨的亲缘关系.     

Genetic diversity and geographic pattern of wild lotus （Nelumbo nucifera） in Heilongjiang Province

1MATERIALS AND METHODS1.1PLANT MATERIALS FROM AUGUST TO SEPTEMBER IN2004,WE TRAVELED EX-TENSIVELY IN HEILONGJIANG PROVINCE LOOKING FOR THE WILD LOTUS.THE WILD LOTUS WAS FOUND AT40LOCALITIES AND49ACCESSIONS OF SAMPLES WERE COLLECTED AT THESE LOCALITIES(FIG…     

Clones identification of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile by using PCR-RAPDs technique

A protocol of polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNAs (PCR-RAPDs) was established to analyse the gene diversity and genotype identification for clones of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile. Ten (out of 34) clones from introduction trial located in Voipir-Villarrica, Chile, were studied. The PCR-RAPDs technique and a modified hexadecyltrimethylammonium bromide (CTAB) protocol were used for genomic DNA extraction. The PCR tests were carried out employing 10-mer random primers. The amplification products were detected by electrophoresis in agarose gels. Forty nine polymorphic bands were obtained with the selected primers (BG04, BF07, BF12, BF13, and BF14) and were ordered according to their molecular size. The genetic similarity between samples was calculated by the Jaccard index and a dendrogram was constructed using a cluster analysis of unweighted pair group method using arithmetic averages (UPGMA). Of the primers tested, 5 (out of 60) RAPD primers were selected for their reproducibility and high polymorphism. A total of 49 polymorphic RAPD bands were detected out of 252 bands. The genetic similarity analysis demonstrates an extensive genetic variability between the tested clones and the dendrogram depicts the genetic relationships among the clones, suggesting a geographic relationship. The results indicate that the RAPD markers permitted the identification of the assayed clones, although they are derived from the same geographic origin.     

Genetic relationships among Chinese and American isolates of Phytophthora sojae assessed by RAPD markers

The genetic diversity of three geographic populations of Phytophthora sojae from China and the United States was determined using random amplified polymorphic DNA （RAPD）. The purpose was to explore genetic relationships among Chinese and American isolates of the organism. 21 random primers were selected among 200 random primers screened. A total of 223 reproducible RAPD fragments were scored among 111 individuals, of which 199 （89.23%） were polymorphic. Analysis of genetic variation showed that there existed higher genetic variation in the United States population in comparison to the Chinese populations. Nei＇s genetic identity and principal component analysis indicated that the populations of Fujian and United States are closer to each other than to Heilongjiang populations. Shannon-Wiener diversity index revealed that the United States populations have a higher genetic di- versity than that of Chinese populations. These data are in support of the hypothesis that P. sojae in the United States might not have been introduced from China.     

激光诱导沙田柚变异的RAPD研究

选用经初步筛选的２０个短序列引物（１０ｎｔ）和随机抽取的２个随机长序列引物,对激光诱导产生的无核沙田柚（处理组）及未经激光处理的有核沙田柚（对照组）进行了ＲＡＰＤ（随机扩增多态性ＤＮＡ）分析。结果有６个引物扩增出了共２０条多态性片段,从而表明在沙田柚的处理组与对照组之间,存在ＤＮＡ分子水平上差异,也就是说在激光诱导沙田柚无核化的过程中,已经引起了沙田柚后代基因组的显著变异,且这种诱导所引起的性状改