水龙骨科附生蕨类Rubisco大亚基的适应性进化:正向选择位点的鉴定

 核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶（Rubisco,EC 4.1.1.39）在植物光合作用中起重要作用,既负责碳同化又引发光呼吸。催化固定CO₂的活性位点位于Rubisco大亚基,由叶绿体rbc L基因编码。水龙骨科是现存蕨类中最为衍生的类群,多为附生植物。为验证蕨类植物在白垩纪适应被子植物兴起而发生分化的观点,本研究以水龙骨科附生蕨类为对象,利用位点间可变ω（非同义替换率d_N和同义替换率d_S的比值）模型对其rbc L基因的适应性进化进行分析。通过比较模型M1a/M2a 和模型M7/M8,在氨基酸水平上,共鉴定出7个正向选择位点：133L,251M,262A,265V,282Y,326I和362I。其中位点262A,265V,282Y及326I对维持Rubisco功能的重要性也得到已发表实验数据的支持。这些结果一方面显示了基于ω比值检验DNA编码序列分子适应的有效性,另一方面也提示水龙骨类可借助rbcL等功能基因的适应性进化,应对白垩纪被子植物引发的陆地生态系统改变。     

基于trn L-F序列数据利用贝叶斯法推测罗汉松科的系统发育

以黑松和Agathis australis为外类群,基于罗汉松科42种植物的叶绿体trnL-F序列数据通过贝叶斯法对该科的系统发育进行了推测.结果显示:①Phyllocladus为单系分支,位于罗汉松科的基部,是罗汉松科所有其余成员的姊妹群;②Nageia嵌套在罗汉松科内,同罗汉松属、Afrocarpus及Retrophyllum的关系较为密切;③Dacrycarpus为单系群且处于姊妹分支Falcatifolium-陆均松属的基部;④Lagarostrobs franklinii和Manoao colensoi应置于同一属Lagarostrobs内;⑤支持成立Halocarpus和Lepidothamnus属;⑥赞同Microstrobos和Microcachrys两属亲缘密切的观点.     

部分裸子植物的五种同工酶分析

研究了红豆衫科，三尖杉科及罗汉松科植物的５种同工酶酶谱，并且用未加权配群法，对酶谱的相异相系异性系数予以聚类分析。结果表明蓖子三尖杉和其它三尖杉属植物差异较大；红豆杉科内白豆杉属和红豆杉属的关系密切，而穗花杉属同树属的联系更为紧密；竹柏类仍以放在罗汉松科内为宜。     

黄角苔叶绿体rbcL基因编码区的序列分析

测定了黄角苔（Ｐｈａｅｏｃｅｒｏｓｌａｅｖｉｓ（Ｌ．）Ｐｒｏｓｋ）叶绿体ｒｂｃＬ基因编码区的１３９８个核苷酸序列,并且由此推导出对应的氨基酸序列．此基因中密码子的第２和第３位上Ａ／Ｔ所占的比例较高,分别为５３６％和７７５％．黄角苔ｒｂｃＬ基因的编码区与花旗松、菠菜、玉米和雷氏衣藻间在核苷酸序列上的同源性分别为８４０％,８１５％,７９３％和７６３％;在氨基酸序列上的同源性分别为９１．０％,８９．９％,８８．５％和８９．３％．为研究角苔植物的系统发育提供了核苷酸序列方面的资料．     

含笑亚族植物的RAPD分析及其系统学意义

利用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术分析了１４种含笑亚族植物。对Ｏｐｅｒｏｎ公司６０个引物进行筛选,发现１３个引物的带型清晰并呈多态性。该１３个引物在每个样本中扩增的片段总数在６０￣８０个之间。采用ＵＰＧＭＡ法对由ＲＡＰＤ数据求出的遗传距离进行聚类分析,得到的结果显示,植物明显地分为２个亚类群,支持将合果木独立成属与含笑属并列的处理方式;不同意把观光木从含笑属中独立出来独成属的观点。     

巨大的进步

巨大的进步编制出人类基因组全核苷酸序列的计划已使生物学成了一门重大学科吗？一些年前，在这个领域工作的许多人为此感到忧虑（更不用说那些在其它领域工作的人，他们担心支持自己研究工作的经费会被削减）。可以用这样一幅图景来描绘已被证明为正确的设想，画面上有一...     

基于叶绿体基因组全序列分析真叶植物叶绿体基因的适应性进化

 真叶植物包括蕨类、裸子植物和被子植物。迄今已积累有较为丰富的真叶植物叶绿体基因组全序列数据。选取了29种真叶植物的叶绿体基因组全序列,采用PAML 软件基于位点间可变ω模型,分别分析了蕨类、裸子植物和被子植物叶绿体基因的适应性进化。结果显示：① 蕨类、裸子植物和被子植物各有6.5%、7.5%和19.2%的叶绿体基因受正选择作用;被子植物经历正选择的叶绿体基因明显比蕨类和裸子植物为多;② 被正选择作用的叶绿体基因主要是遗传系统和光合系统基因,它们的编码产物涉及叶绿体蛋白质合成、基因转录、能量转化与调节及光合作用等过程。推测叶绿体功能基因可能在真叶植物对陆生生态环境的适应过程中起着重要作用。     

分子生物学的空白

分子生物学的空白生命的本质在于每个细胞中的ＤＮＡ分子，或是真核细胞的细胞核；从解剖学到动物学，生物学中没有哪个方面未被这种认识所改变。生物学成了许多人用力推动着的开放门户，推开它并不需要很大力量。这个研究领域在公众心目中的普遍印象就是如此。脚趾甲长进...     

深圳塘朗山桫椤孑遗种群的遗传分化研究

应用RRPD标记分析了深圳塘朗山桫椤孑遗种群全部57个个体的遗传变异和进化关系。50个引物共检测到171个位点，其中多态位点10个，多态位点比率5．85％。基于基因频率的Shannon多样性指数平均值为0.0165，Nei基因多样度指数平均值为0．0094，表明该种群的遗传多样性水平极低。对Jaccard相似性系数矩阵用UPGMA法进行聚类分析显示，57个个体可分为4个亚群。RAPD谱带表型的主成分分析(PCA)支持聚类分析结果。根据研究结果讨论了种群的管理和保护策略。     

生命力学

生命力学生命力学的法则是其自身的简单性。（１）ＤＮＡ和ＲＮＡ均由串联在一起的四种核苷酸组成。ＤＮＡ决定ＲＮＡ，ＲＮＡ决定蛋白质（尽管有时ＲＮＡ决定ＤＮＡ）．这被称作“中心法则”。（２）遗传密码是三联体密码；ＤＮＡ或ＲＮＡ中的三个核苷酸确定蛋白质中的一...