前沿

我国发现DNA第7种碱基 我国科学家最新研究表明,除A、G、T、C4大碱基及2种与C相关的碱基修饰形式外,基因组DNA中还存在第7种碱基。     

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我国发现DNA第7种碱基 我国科学家最新研究表明,除A、G、T、C4大碱基及2种与C相关的碱基修饰形式外,基因组DNA中还存在第7种碱基。     

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<正>我国发现DNA第7种碱基我国科学家最新研究表明,除A、G、T、C4大碱基及2种与C相关的碱基修饰形式外,基因组DNA中还存在第7种碱基。中国科学院上海生物科学院生化与细胞研究所徐国良研究组及其合作方进行的此项研究     

基因组翻译起始和终止区域碱基分布的信息熵分析

DNA编码区域起始和终止位置的预测是生物信息学中的一个重要问题,对翻译起始和终止区域的序列特性分析是其中的关键.针对基因组翻译起始和终止区域的碱基分布,如保守性、周期性等问题,提出了一种基于信息熵方法的模型进行分析.对编码起始、终止位点附近区域的信息熵分析结果显示:在原核生物中,其编码区域的信息剩余度呈现非常强的周期为...     

基于新三维图形表示及相似度量的DNA序列比较分析

基于DNA序列的混沌游戏表示, 得到了一种新的能够避免信息损失的DNA序列的3维图形表示 同时, 利用特征曲线的几何中心和波动幅度构造4维向量来刻画DNA序列 基于两种新的相似度量, 对11种物种的β球蛋白基因序列进行相似性分析, 所得结果与生物学中的进化关系基本一致而且通过比较分析，提出的方法对较长生物序列的相似分析更有效     

基于中心法则探究碱基突变影响CTPS细胞蛇组装的综合实验

CTPS细胞蛇是一种无膜细胞器，在细胞中以丝状或环状形式存在．将含有RFP标记的CTPS过表达载体转入Hela细胞中，荧光显微镜下观察红色荧光蛋白形成的丝状或环状结构．通过定点突变关键氨基酸，观察CTPS细胞蛇组装的效果，帮助学生理解分子生物学“中心法则”中DNA碱基序列决定蛋白质一级结构进而决定蛋白质的高级结构，同时激发学生的学习兴趣，培养学生的科学思维，提高综合素质．     

利用概念知识的文本分类

针对统计方法不能从语义理解的角度进行文本分类的问题,提出了利用概念层次网络概念知识进行文本分类的方法,包括两部分：依据概念进行特征选取以及根据类别关联度分类. 在特征选取时,通过计算概念与类别的区分度挖掘出类别核心概念,并采用类别核心概念对特征项进行精选. 依据类别核心概念相关的类别语义信息,提出了文档与类别关联度的计算方法,并根据类别关联度来判断文本类别. 实验表明,该方法可有效降低特征空间维数,在提高分类效率的同时保证了分类效果,F1值略有提高. 与SVM、KNN和Bayes分类器对比,当特征项数目较少时,该方法的F1值明显高于其他3种方法,综合分类效果与SVM相当,优于KNN和Bayes.     

日本白鲫生长激素-Ⅱ基因编码区cDNA的克隆及序列分析

采用反转录．聚合酶链式反应(RT-PCR)方法，从日本白鲫脑垂体总RNA中扩增出生长激素-Ⅱ(GHⅡ)编码区cDNA，克隆到Pum-T载体上进行序列测定和分析．结果表明，克隆的cDNA的开放阅读框长度为630bp，其中包括22个氨基酸的信号肽和188个氨基酸的成熟肽．与得到的生长激素-Ⅰ(GHⅠ)的碱基序列和推测的氨基酸序列相比，同源性分别达到96．9％和98．5％．白鲫的GHⅠ的碱基序列和推测的氨基酸序列与国外已发表的金鱼GHⅠ比较，同源性分别为98．7％和100％，白鲫和金鱼的GHⅡ碱基序列和推测的氨基酸序列同源性分别为95．7％和95．2％．     

基于新三维图形表示及相似度量的DNA序列比较分析(英文)

基于DNA序列的混沌游戏表示,得到了一种新的能够避免信息损失的DNA序列的3维图形表示.同时,利用特征曲线的几何中心和波动幅度构造4维向量来刻画DNA序列.基于两种新的相似度量,对11种物种的β球蛋白基因序列进行相似性分析,所得结果与生物学中的进化关系基本一致.而且通过比较分析,提出的方法对较长生物序列的相似分析更有效.     

可见光的Fuzzy分类

应用Ｆｕｚｚｙ数学方法，提出了一种可见光分类的数学模型，即用Ｆｕｚｚｙ向量反映可见光的类别，它能定量地表示某个波长属于某种颜色类别的程度。     

重刑犯人格类型的聚类分析

目的：探讨重刑犯人格类型的划分模型.方法：以福建省四所监狱的678名重刑犯的COPA的测验数据为基础,在12个临床分量表的水平上对重刑犯进行分层聚类.结果：通过对重刑犯人格特征的聚类分析得到独立---怯懦,冲动---激惹,可控---稳定和依赖---退缩四种基本人格类型,四种人格类型的重刑犯在 COPA 各临床分量表上得分除聪敏分量表外,在其它11个临床分量表上均存在显著差异（p〈0.05）.结论：重刑犯人格类型分为独立---怯懦型,冲动---激惹型,可控---稳定型和依赖---退缩型四种,监管人员可根据这一分类模型,针对不同类型的重刑犯进行分类矫治.     

单只不育果蝇未知基因的反向PCR

根据ｐ转位子诱变和ｐｏｘｎ基因双杂合子法检测化学感受器数目的变化,筛选到一系列突变个体,其中一个雄蝇腿部表现出不能形成化学感受器的突变表型;遗憾的是该只雄蝇是不良的,为了克隆该基因,研究出一种微量ＤＮＡ反向ＰＣＲ法,该法可用０．５只果蝇扩增出Ｐ转位子插入点相邻的基因组片断,方法简便可靠。     

短正合列范畴CRM

通过讨论由短正合列及它们之间的态射构成的范畴CRM的相关性质^[1-4]，合理地定义了CRM中的同态核、象、正合列、复形、投射分解等要领，并由此得到环R的一种新维数；正合（左）总体维数。最后得到R的整体维数与正合总体维数相等的结果。     

实体类别信息增强的命名实体识别算法

中文命名实体识别（named entity recognition, NER）字符级别模型会忽略句子中词语的信息,为此提出了一种基于知识图谱中实体类别信息增强的中文NER方法。首先,使用分词工具对训练集进行分词,选出所有可能的词语构建词表;其次,利用通用知识图谱检索词表中实体的类别信息,并以简单有效的方式构建与字符相关的词集,根据词集中实体对应的类别信息生成实体类别信息集合;最后,采用词嵌入的方法将类别信息的集合转换成嵌入与字符嵌入拼接,以此丰富嵌入层生成的特征。所提出的方法可以作为嵌入层扩充特征多样性的模块使用,也可与多种编码器-解码器的模型结合使用。在微软亚洲研究院提出的中文NER数据集上的实验展现了该模型的优越性,相较于双向长短期记忆网络与双向长短期记忆网络+条件随机场模型,在评价指标F1上分别提升了11.00%与3.09%,从而验证了知识图谱中实体的类别信息对中文NER增强的有效性。     

DNA序列的相关维数与Kolmogorv熵

提出了ＤＮＡ序列的时间序列模型，给出了ＤＮＡ序列整数序列的一个映射，作列子计算了某些功能序列的相关维数与与Ｋｏｌｍｏｇｏｒｖ熵，利用这两个指标比较了它们的差异。从这两个指标可以看出：１）对真生物而言，外显子比内含子复杂，但对原核生物刚好相反．２）所考虑的所有功能区都远不是随机序列。     

用基于模糊聚类的Kruskal算法构建进化树

对线粒体DNA序列可通过图形表示及计算曲线的散度均值来构造模糊论中的相似矩阵,基于这些,提出一种新的方法:用模糊聚类图论法中的Kruskal算法来进行系统进化树的重构,并选取了8个物种的线粒体DNA序列来说明此方法.     

样条小波插值在薄板稳定性问题中的应用

小波分析是近四五年才真正产生的新的数学分支,正在蓬勃发展,它在声学,信号分析,图象识别,微分方程数值解,地震勘探,量子场论等方面都有广泛的应用,它的理论发展与应用在各个科学领域正方兴未艾。本文针对γ次样条,给出小波正交基,构造了相应的样条小波插值,研究了它的有关性质,并在弹性薄板稳定性问题中加以应用,得出了可喜的理论结果推导了临界力和挠度的误差估计。     

羊草(Leymus chinensis)psbD基因开放读码框(ORF)的克隆及序列分析

从羊草中提取总RNA,采用简并PCR方法,扩增出编码353个氨基酸的psbD基因开放读码框(Open read ing frame,ORF)cDNA序列,GenBank登陆号为FJ176573,并对其序列进行了分析.同时次基因组DNA为模板对psbD基因开放读码框区域进行了扩增,证明该基因无内含子,为其功能的进一步研究提供基因材料和理论依据.