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一种新的相似性度量及其在DNA序列相似性分析中的应用 总被引：1，自引：0，他引：1
衡量序列之问距离的传统方法是通过局部比对或者全局比对来实现的,其运算的时间复杂度和空间复杂度随着序列长度的增加而急剧上升.本文提出一种新的相似性度量.它是建立在Lempel-Ziv复杂度基础之上的,不需要通过序列之间的比对来实现,其时间和空间复杂度比传统方法降低了很多.用这种新的相似性度量的方法可以算出序列同的相似性矩阵,以此来刻画不同序列之间的距离.为了说明此方法的可靠性,最后对多个物种DNA序列作了相似性分析. 相似文献
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对线粒体DNA序列可通过图形表示及计算曲线的散度均值来构造模糊论中的相似矩阵,基于这些,提出一种新的方法:用模糊聚类图论法中的Kruskal算法来进行系统进化树的重构,并选取了8个物种的线粒体DNA序列来说明此方法. 相似文献
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