StyS激酶自磷酸化对Pseudomonas putida B3中靛蓝生物合成的调节作用

在恶臭假单胞菌Pseudomonas putida B3中,靛蓝生物合成关键酶基因styAB上游存在一个二元调控系统StyS-StyR。StyS蛋白属于激酶家族,是磷酸化信号转导的重要媒介,但激酶StyS的自磷酸化传导机制对靛蓝生物合成的调节作用尚未探明,因此,研究以Pseudomonas putida B3中激酶蛋白StyS作为研究对象,发现了两个磷酸化结合位点,构建了磷酸化位点突变株。通过分析野生菌株P. putida B3、styS基因缺失菌株P. putida B3-ΔstyS、styS基因回补菌株P. putida B3-ΔstyS-8和磷酸化位点突变株P. putida B3-ΔstyS-1之间的靛蓝产量及酶活发现,P. putida B3产量为10.14mg/L,P. putida B3-ΔstyS-8产量为3.63mg/L,磷酸化位点突变菌株无激酶活性且失去了产生靛蓝的能力。结果表明,StyS自磷酸化作用在靛蓝发酵体系中起重要作用。研究结果将为靛蓝生物合成途径的进一步研究提供参考。     

Accurate localization and excision of genomic islands in four strains of <Emphasis Type="Italic">Pseudomonas aeruginosa</Emphasis> and <Emphasis Type="Italic">Pseudomonas fluorescens</Emphasis>

Mobile genomic islands (GIs) can be excised from the chromosome, then form a circular intermediate and be reintegrated into the chromosome by the GI internal integrase. Some mobile GIs can also be transferred into a new receptor cell by transformation, conjugation, or transduction. The action sites of the integrase are usually flanked direct repeats (DRs) of the GIs. Accurate localization of the flanking sequences is a precondition for determining the mobility of the GI. Mobile GIs are generally associated with transfer RNAs (tRNAs). Based on the correlation between flanking sequences and tRNA sequences, the flanking sequences of 11 putative mobile GIs in Pseudomonas aeruginosa PAO1, P. aeruginosa PA14, P. fluorescens Pf-5 and P. fluorescens Pf0-1 were identified. Among the 11 GIs, Pf0-1GI-1 is responsible for benzoate degradation. PAO1GI-1, Pf5GI-2, Pf5GI-3, and Pf5GI-4 were confirmed experimentally to be excised from a chromosome to form a circular intermediate. The action sites of the integrases are these GIs direct repeats. Due to distinct DRs, cutting sites for the internal integrase of PAO1GI-1, Pf5GI-2, Pf5GI-3 and Pf5GI-4 were determined outside the T-loop of the tRNA^Gly gene, outside the anticodon loop of the tRNA^Ser gene and tRNA^Lys gene, and at the asymmetric 3′-end of the tRNA^Leu gene, respectively. PAO1GI-1 and other mobile GIs may be transferred into many different strains that belong to different phyla because of the clear flanking sequences. This study describes basic information about the action sites of the integrases, assesses the mobility of GIs, and can help design and transfer mobile GIs to candidate strains.     

Formation of Polyhydroxyalkanoate Blends by Pseudomonas pseudoalcaligenes M1-2 from Various Carbon Sources

ＩｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎＰｏｌｙｈｙｄｒｏｘｙａｌｋａｎｏａｔｅｓ (ＰＨＡｓ)ａｒｅａｆａｍｉｌｙｏｆｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｄｂｙｍａｎｙｂａｃｔｅｒｉａａｓｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒｃａｒｂｏｎａｎｄｅｎｅｒｇｙｓｔｏｒａｇｅｃｏｍｐｏｕｎｄｓ[1] .ＰＨＡｓｈａｖｅａｗｉｄｅｒａｎｇｅｏｆｐｈｙｓｉｃａｌｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓｒａｎｇｉｎｇｆｒｏｍｂｒｉｔｔｌｅｔｏｆｌｅｘｉｂｌｅｔｏｅｌａｓｔｉｃ ,ｄｅｐｅｎｄｉｎｇｏｎｔｈｅｉｒｍｏｎｏｍｅｒｓｔｒ…     

铜绿假单胞菌注射液对H22小鼠移植瘤的辅助治疗效果

目的 研究铜绿假单胞菌注射液联合化疗对H22小鼠移植瘤的影响。方法 采用H22细胞株,移植53只BALB/c小鼠皮下。取肿块大小相对均匀的48只小鼠随机分成6组：空白对照、铜绿假单胞菌组、联合顺铂组、联合阿霉素组、顺铂组、阿霉素组,8只/组。连续给药14 d。结果 联合顺铂组、顺铂组的抑瘤率为49.2%、46.6%,联合阿霉素组、阿霉素组的抑瘤率为32.1%、19.8%。结论 铜绿假单胞菌注射液对H22小鼠移植瘤的阿霉素化疗有一定的增强效果。     

假单胞杆菌BC001对吡啶和喹啉的生物去除

从首钢焦化厂废水处理系统的活性污泥中分离出1株能在高浓度的吡啶（约400mg/L）和喹啉（约500mg/L）双基质条件下良好生长的细菌,经16S rDNA及生理形态特征鉴定为假单胞杆菌（Pseudomonas sp. BC001）,它对吡啶的去除主要通过生物吸附,而对喹啉的去除包括生物吸附和降解两个阶段。该菌能利用喹啉作为唯一的碳源和氮源代谢生长,适量的外加碳源对喹啉降解具有促进作用,经检测喹啉降解的中间产物主要为2-羟基喹啉和8-羟基香豆素, 氮的主要代谢终产物为NH₄⁺。     

D4S—6菌的生物学特性及种的鉴定

Ｄ４Ｓ－６菌根据常规的一些生物学特性，确定其为假单胞菌属；按照假单胞菌属分节检索表的要求，我们最终鉴定Ｄ４Ｓ－６ 菌为泡囊假单胞菌，它能有效地分解虾塘的有机污染物．     

人工介质富集微生物对藻类和藻毒素降解试验研究

采用人工介质富集微生物的方法对藻类和微囊藻毒素的生物降解进行了试验研究.中试结果表明:在水力停留时间6～7 d,源水叶绿素a为15.3～266.1μg/L条件下,人工介质对叶绿素a的去除率达59.4%.运用高效液相色谱(HPLC)对微囊藻毒素进行了检测,当进水总微囊藻毒素TMC-RR和TMC-LR分别为0.25～8.93,0.15～4.73μg/L,胞外微囊藻毒素EMC-RR和EMC-LR分别为0.13～0.68,0.02～0.11μg/L时,人工介质对TMC-RR,TMC-LR和EMC-RR,EMC-LR平均去除率分别为69.8%,93.7%,42.2%和68.4%.聚合酶链反应(PCR)电泳图谱发现,人工介质上富集有大量的假单胞菌属和芽孢杆菌属等溶藻细菌.通过人工介质富集微生物的方法可有效降解太湖水体中的藻类和微囊藻毒素.     

铜绿假单胞菌医院感染流行病学分子研究及基因分型

目的建立随机扩增多态性DNA（RAPD）基因分型方法检测铜绿假单胞菌（PA）,调查铜绿假单胞菌医院感染流行病学的情况,为控制院内感染提供直接可靠的参考依据。方法对2008—2009年分离的180株铜绿假单胞菌进行统计分析其临床分布;通过抗生素敏感性试验进行抗菌谱分型;再采用PAPD基因分型方法进行分析。结果标本主要来自ICU、烧伤科、呼吸内科等。从痰液标本中分离的铜绿假单胞菌占58．9％,其次伤口分泌物标本占18．9％、中段尿16．7％,其它类型标本占5．5％。抗菌谱分型分为5型。180株铜绿假单胞菌用RAPD分型共得178株,分型率98．9％（178／180）,分为9种类型：Ⅰ～Ⅸ。结论RAPD分型技术对铜绿假单胞菌临床分离株分型率较高;同一抗菌谱型的基因型可能不同,同一基因型的抗菌谱也可能不同。     

铜绿假单胞菌的分布及耐药分析

目的：分析江汉大学附属医院病人铜绿假单胞菌的耐药率,指导临床用药.方法：对2009年1月-2010年12月临床分离的138株铜绿假单胞菌进行回顾性分析,采用WHONET 5.4软件统计耐药率.结果：铜绿假单胞菌在呼吸道标本中的检出率最高,占86.9％;对阿米卡星(87.0％)、头孢哌酮/舒巴坦(83.8％)、头孢吡肟(...     

一株软骨霉状菌的纯化方法

从武夷山的一枯枝上分离得到了一株稀有软骨霉状菌,在培养过程中发现,该株黏细菌在人工培养基上只有在与一种未知的细菌共培养的状态下才能长出典型的子实体并保持菌种的活力.然而要从共培养的菌落中纯化这株黏细菌,使用常规的黏细菌纯化技术几乎是不可能.在这种情况下对伴生细菌进行16SrDNA菌种鉴定,再根据鉴定为施氏假单胞菌(Ps...