信息生物学--关于编码信息量的两个假设

提出并论证了关于编码信息量的两个规律.第一,基因组的编码信息量在进化中随时间增加.第二,基因序列的碱基频数分布决定于多样性的稳定化.此二规律和其他规律一起构成了信息生物学的理论基础.不同于生物信息学,信息生物学将以生命信息的遗传,传输,调节和表达的基本规律为研究中心.     

利用RAPD标记鉴定芥菜(Brasica juncea Cos.)品种(英文)

从６０种１０ｂｐ随机引物中筛选出７种引物,对８个芥菜变种的１６个品种（每个变种有２个品种）进行了随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）鉴定,能快速、灵敏、较为简便获得了１６个芥菜品种的基因组ＤＮＡ指纹图谱．结果表明,不同引物在１６个品种上都有其特征ＤＮＡ带,一般只有１条,少数有２条．在同１个变种的２个品种之间存在着丰富的ＲＡＰＤ标记,通过比较２个品种各自独具的ＲＡＰＤ标记,就可明确地将２个品种区分．在所用的７种引物中,没有１种能同时将８对芥菜品种全部区分开,但用２种或２种以上的引物就完全可以将８对芥菜品种全部区分开．     

渗调修复黄瓜陈种子基因组DNA损伤的RAPD研究

用Vc，CaCl2，PEG及其组合对自然老化的黄瓜种子进行渗调处理，利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对处理前后的种子基因组DNA多态性进行比较分析．结果表明：渗调作用可以修复黄瓜陈种子的DNA损伤．修复效果与种子贮藏时间有关，贮藏半年的种子渗调处理前后RAPD产物差异不明显，贮藏1～2a的陈种子修复的效果好，表现为分子量高的DNA重新合成，RAPD扩增条带增多，亮度增加；贮藏3a的陈种子修复效果不理想。     

基于核糖体DNA大亚基片断序列探讨中国东海海域赤潮原甲藻的分子分类

采用PCR扩增技术对分类上有争议的中国东海赤潮原因种(被称为东海原甲藻．本简称：东海株系)的基因组DNA进行了核糖体DNA大亚基片断(LSU rDNA)的扩增和测序．并与一同扩增的来自美国CCMP的被称为具齿原甲藻(本简称：CCMP株系)的同源序列进行分析比较。结果表明，两710bp的LSUrDNA同源序列中仅存在7个碱基的差异．遗传相似度高达99．01％．遗传差异为0．99％．进一步与Genebank其他3种原甲藻即P．mezicanum、P．mieans和P．minimum的同源序列进行比较，发现其他3种原甲藻两两问的种间遗传相似度在91．1％～95．5％之间．而P.micans和P．minimum种内不同株系的遗传相似度为99．4％～99．9％．均为99％以上．综合这些数据说明东海株系与CCMP株系之间的0．99％的遗传差异应视为种内差异．原甲藻的东海株系与CCMP株系当属异名同种．因此本试验结果从分子水平支持了被称为东海原甲藻的原甲藻与被称为具齿原甲藻(P．deantatum)的原甲藻同为一种的观点。     

RAPD鉴定远缘杂交牧草蔗新品系94-42

应用RAPD技术对远缘杂交牧草蔗新品系94—42，父本PT43—52及母本甘蔗栽培良种C0419进行分子鉴定．67个引物共扩增出284条带，其中l16条为多态性带，占40．85％．计算相似性系数，并对3个品种进行亲缘关系的分析，结果分别为：新品系和母本：0．9138；新品系和父本：0．8009；父本和母本：0．7658．RAPD结果证明，牧草蔗94—42基因组出现多态性，具有父、母本特异DNA带，是两者远缘杂交的后代．提示RAPD技术是一种适合远缘杂交物种分子鉴定的有效方法．     

安徽羽叶报春RAPD分析实验条件优化的研究

采用CTAB法^[1]从珍稀濒危植物安徽羽叶报春(Primula merrilliana)的幼叶中提取DNA，进行随机扩增多态DNA(RAPD)实验，通过Mg^2 、dNTP、Taq酶、模板浓度的优化，确立了RAPD反应的最佳体系(25μ1)范围为：Mg^2 浓度为2．0—2．5mmol／L，模板浓度为每个反应50—150ng，dNTP浓度为200—250μmol／L，Taq酶为1.5—2.0U，按照优化的RAPD条件进行的重复实验，重现性良好。     

水稻花药特异表达基因启动子的扩增及克隆

采用ＤＮＡ聚合酶链式反应扩增技术，以水稻黄化苗总ＤＮＡ为模板成功地扩增到水稻花约特异表达基因扇动２子Ｏｓｇ６Ｂ的７７０ｂｐ和９６０ｂｐ两个片段Ｏｓｇ６Ｂａ和Ｏｓｇ６Ｂｂ。并将其克隆到ｐＵＣ１８上形成完整的Ｏｓｇ６Ｂ，这为通过基因工程方法进行水稻杂种优势利用奠定了基础。     

葡萄的随机扩增多态性DNA研究

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)对11个样品进行了研究．这11个品种包含1个欧美杂交种，一个中国野生种(Vitis．piasezkii Var．pagnucii)，9个欧亚种(Vitis．vinifera L)．选择了多态性好的7个10碱基寡聚糖核苷酸作为随机扩增的引物，在琼脂糖凝胶电泳上产生了76条带，其中63条具有多态性．各引物产生的条带从6到13不等，平均为10．86条／模板，其中9条具有多态性，表明葡萄基因的多态性十分丰富．通过遗传相似性分析表明11个葡萄基因的Nei氏相似性系数分布为0．1027-1．1787，平均相似系数为0．459．通过非加权算术平均数聚类法，获得了11个葡萄品种之间的遗传关系树图，欧亚种群，东亚种群和欧美杂种在遗传关系树图上被成功地聚为3组．本实验发现欧亚种和欧美杂种亲缘关系较近，而和中国野生种亲缘关系远．在欧亚种中，520A和S04的遗传距离最近，其次是井川1010和美人指，最大的遗传距离发生在桑无核和其他欧亚种之间．     

环介导等温扩增技术检测乳粉中肺炎克雷伯菌

以荚膜脂多糖(capsular polysaccharide,CPS)合成调控子resA为靶基因片段,设计了肺炎克雷伯菌特异性引物,建立了环介导恒温扩增技术(Loop-Mediated lsothermal Amplification,LAMP)检测方法.结果表明,3对LAMP引物对肺炎克雷伯菌不仅有菌种专一性,而且,具有相当高的灵敏度(2 CFU/100 g).因此,该方法有利于更快更准确的鉴定食品中肺炎克雷伯氏菌.     

利用环介导恒温扩增法简易诊断松萎蔫病Takuya Aikawa,Natsumi Kanzak,Taisei Kikuch

诊断松萎蔫病的传统方法是从木质组织中分离松材线虫,然后用显微镜进行形态学鉴定。基于DNA分子检测的方法尽管很灵敏,不需要固定发育阶段的松材线虫,但是仍然需要用Baermann 漏斗法分离线虫,并且需要昂贵的仪器。笔者研发了利用环介导恒温扩增法检测松材线虫的存在,该方法包括：(1) 从木块中提取DNA;(2) DNA 扩增;(3) 通过反应溶液的颜色做出诊断。该方法仅使用培养箱且整个过程只需要90 min,比以往方法更加简便和快速。