Internet上的生物信息学资源

生物信息学是２１世纪科学与技术领域重点发展的学科之一。生命科学的所有信息均可由计算机和Ｉｎｔｅｒｎｅｔ来进行储存、传输和分析。Ｉｎｔｅｒｎｅｔ能够为我们提供大量的有关生物大分子序列、结构和功能的数据、软件、工具、文章及相关的资源。对于化学家、物理学家、数学家、医生、生物学家等那些关注生命现象分子机理的科学家，生物信息学的网上资源对他们来说是必需的给养和研究手段。在此，我们介绍了一些生物信息学研究的     

《生物信息学》课程科研教学一体化模式的研究与实践

生物信息学(bioinformatics)是一门新兴学科,由生物学、医学、计算机学、信息管理学、应用数学以及统计学等多门学科交叉所形成,它极大地推动了诸如生命科学、医学等相关学科的发展。随着新一代测序技术和计算机技术的进步,生物信息学在许多领域取得了很大进步,如发现与识别人类疾病基因,研究基因与蛋白质的表达和功能,阐明疾病发生的遗传背景和分子机制,提出相应的复杂疾病的预防措施及开发新的治疗药物等。然而,在我国当前的《生物信息学》课程的教学中,仍然存在教学内容较为落后、教学方法相对单一、科研成果转化教学有待深化等问题。该文提出《生物信息学》课程科研教学一体化教学模式,期望通过该模式完善教学内容,改进教学方法,有效融合教学与科研,进而提高教学质量,增强学生应用理论知识解决实际生物学问题的能力。     

农业院校生物信息学发展现状和建议

生物信息学是在生物学、信息学和统计学等多个传统学科基础上发展起来的新兴交叉学科,在生命科学研究领域受到高度重视。生命科学是农业院校专业设置的主体,农业院校发展生物信息学对其提升学校竞争力具有重要的推动作用。本文分析认为当前农业院校发展生物信息学既有机遇又有挑战,并在形成交叉共识、管理机制改革、人才培养方案以及课程体系建设等方面提出了农业院校生物信息学发展的建议。     

面向学生创新实践能力培养的生物信息学教学改革初探

生物信息学是近些年迅速发展的交叉学科,已是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,生物信息学课程已成为高等院校生命科学相关专业的主要课程之一。生物信息学是一门实践性非常强的学科,其教学与其他学科显示出明显的不同,教学改革的内容应该着重于提高学生的创新实践能力。该文结合在生物信息学教学改革中的教学实践和总结的经验,从教学理念、教学方法、教学内容和考试改革等方面讨论了如何培养学生的创新实践能力。     

《生物信息学》创新教学模式的探讨

《生物信息学》是生物科学中一门新兴的前沿学科。我们在其他学科的成功教学的基础之上,结合信息学当前在我国的教学实际情况,还有结合教学课程的相关特点,笔者提出了崭新的教学模式,以求在生物信息学教学模式上得以创新和发展。     

生物信息专业课程体系的构建及优化

随着社会的不断发展,生物信息学已经在生物学、医学及药学等多个学科表现出了强大的作用,在解决重大科学问题和社会需求方面尤为突出,生物信息学专业的人才培养至关重要。培养具有生物信息学专业技能又适合社会发展的复合型人才,已经成为当务之急。进一步深化生物信息课程的改革,构建并优化生物信息专业课程体系,对于推进基础知识的应用及拓展本科生的视野至关重要。基于全面的生物学、计算机信息科学和生物信息学方面的课程配置,通过优化实验环节和实习环节,构建了合理的实习体系,并优化实习的结构,逐步加强学生对于专业的认知深度,意识到所学专业在国家需求和行业需求中的作用,合理规划自己的职业生涯。     

Internet上的生物信息学资源

生物信息学是 2 1世纪科学与技术领域重点发展的学科之一 .生命科学的所有信息均可由计算机和Internet来进行储存、传输和分析 .Internet能够为我们提供大量的有关生物大分子序列、结构和功能的数据、软件、工具、文章及相关的资源 .对于化学家、物理学家、数学家、医生、生物学家等那些关注生命现象分子机理的科学家 ,生物信息学的网上资源对他们来说是必需的给养和研究手段 .在此 ,我们介绍了一些生物信息学研究的方法 ,并列出了许多相关的网站     

药物化学理论教学方法的探讨

药物化学是一门专业基础课,在药学领域中是一门重要的带头学科,它的特点是与化学、医学、生物学等学科相互交叉,理论性及实践性强,内容复杂,需要记忆的结构和反应多,覆盖面广,各知识点自成体系,教学中表现出内容枯燥、结构及反应难以直观理解等不足。随着现代科技的发展和知识的不断更新以及药物化学及其相关学科在药物开     

水稻基因组学研究概况

重点对水稻的结构基因组学、功能基因组学和蛋白质组学的主要研究内容、研究方法和研究进展三个方面进行了综述，并对与水稻基因组学研究相关的学科，如生物信息学、比较基因组学等方面进行了阐述，最后对水稻基因组学的发展进行了简单展望．     

PBL教学法在硕士研究生生物信息学教学中的应用

生物信息学是21世纪发展较为迅速的一门重要学科,也是多数学校硕士研究生必修课。笔者根据所在学校特点,尝试在硕士生生物信息学教学实践中引入PBL教学法,旨在提高该门课程的教学效果,并为生物信息学教学人员提供参考。     

计算变异学创立背景及其用途

为了克服生物信息学和计算生物学中字母或数字不受序列长度、氨基酸组成和位置、相邻氨基酸影响的缺陷,根据自然界普遍存在的随机性原理,创立计算变异学。计算变异学用氨基酸对可预测性、氨基酸分布概率和变异概率3种方法量化整个蛋白质及每个氨基酸,用活的、动态的测量指标量化分析蛋白质。计算变异学方法可以应用于研究蛋白质进化、遗传病定量诊断,分析蛋白质结构与功能、药物设计和病毒变异预测等领域。     

生物信息学及其在病毒研究中的应用

介绍生物信息学的原理与方法及其在病毒研究中的应用。保守序列承担着极其重要的功能，通过多重序列对齐搜寻保守序列，是生物信息学方法的基础；敏感位点是一种反映蛋白质或核酸功能的特定模式，因此，通过数量关系的优化推导敏感位点，可用于分离病毒蛋白质与核酸相互作用位点；核苷酸和氨基酸序列只有形成了三级或四级结构才能表现功能，通过同源建模预测蛋白质的高级结构，有助于疫苗的研制、抗病毒药物的筛选以及药物的分子设计。预测RNA的三级结构大多从RNA折叠入手．病毒蛋白质三级结构预测比较成功的是日本脑炎病毒包膜糖蛋白的三级结构。     

Advances in G-protein coupled receptor research and related bioinformatics study

G-protein coupled recptor(GPCR) is one of the most important protein families for drug target.GPCR agonists and antagonists occupy approximately one third of the world small molecule drug market,Much effort has been invested in GPCR study by both academic institutions and pharmaceutical industries,With seven-transmembrane domains,GPCR plays significant roles in intercellular signal transduction and is involved in a variety of biological pathways.With the availability of sequence data of human and other mammalian genomes,as well as their expressed sequence tag (EST) data,the bioniformatics and genomics approaches can be applied to identifying novel GPCR in the post genomic era .Deorphanizing GPCR or matching ligands with GPCR greatly faciltiates traget validation process and automatically provides a possible compound screening assay ,Similarly,Bioinformatics data mining approach could also be applied to the indentification of GPCR peptided or protein ligands,Here we give a general review of recent advances in the study of GPCR structure,function ,as well as GPCR and ligand identification with the emphasis on the bioinformatics database mining of GPCR and their peptide of protein ligands.     

生命科学学科发展及其相关性分析

本文简要介绍了生命科学学科发展取得的成就，研究方向和学科热点，从分子生物学，宏观生物学，生物信息学等三个主要方面，阐述了生命科学学科的发展方向和重点研究领域，并做相关性分析。     

生物信息学在直肠癌相关基因分析中的应用

目的,利用生物信息学方法研究直肠癌相关基因的结构与功能。方法:选择一条在直肠癌和正常组织有差异表达的表达序列标签(EST),利用生物信息学方法,对其进行结构与功能的分析。结果:电子克隆了其全长cDNA序列并预测其编码蛋白为SETprotein。结论:利用生物信息学及网络资源可作为克隆研究基因的新方法。     

Analysis of the p42.3 protein structure and regulatory network

p42.3 is a recently discovered gene that may participate in the regulation of gastric cancer cell generation and development. In this research, we analyzed the predicted p42.3 protein structure using bioinformatics tools, established the regulatory network of the protein molecule and found the optimal pathway using a Bayesian network model.     

基于XML的生物信息数据模型

各大研究机构之间生物信息数据是异地、异构和高度自治的，并且信息之间的存放是分散无序的．这给生物信息数据的交换和利用带来了很多困难．因此生物信息检索挖掘更着重于过程中相关信息有序的提取和集成，本文提出了一种新的基于xml表达的有序的层次分形数据模型，更有利于生物信息数据的集成和融合．     

Bioinformatics, robust realm based upon multidisciplinary knowledge of biological data and computational techniques

The accumulation of the large amount of biological data concerning with gene and protein research has proposed that it is necessary to abstract the biological significance from these data. Then the bioinformatics, equipped with the most advanced computational techniques and supported by the latest biological research, has emerged for this purpose. Some recent information on the developing bioinformatics, associated with the uniform resource location addresses of those available resource sites that support hyper-text or general file transfer protocols on the Internet, from points like bioinformation databases of gene sequence or protein structure, general biocomputing softwares for genome analysis or protein structure analysis, online biocomputing servers dedicated for genomic database search or protein steric structure recognition and prediction, artificial life, etc. is reviewed. There are also other various approaches like Usenet, Newsgroup that focus on their specific topics introduced. Finally, the hottest problems and most gifted respects of the bioinformatics are discussed, whereas the bioinformatics has been regarded as an international cooperation in sciences, as well as a new challenge for life scientists in China.     

生物信息学研究进展

本文就目前生物信息学研究的热点问题做了简单的概述.对如何利用生物信息技术进行电子克隆、RNA二级结构的预测做了分析,并对现存的生物信息学问题进行了讨论.