一种梨树组织RNA提取方法

设计了一种RNA提取方法,解决了梨树RNA提取时容易得率低和降解、污染这一关键问题.采用本方法可以实现纯度高、含量大、完整性好的梨树总RNA提取,提高二代测序数据质量.     

梨树ASPV检测试剂盒研制及其应用

以库尔勒香梨为材料，利用SDS法提取总RNA，通过苹果茎痘病毒（apple stem pitting virus，ASPV）的基因组序列设计特异性寡核苷酸引物，利用RT-PCR技术研制梨树ASPV的RT-PCR检测试剂盒。该试剂盒的检出其痕量为2．88pg，整个检测过程只需6～8h。该试剂盒在常温下能保存l周以上，在4℃条件下可保存1年以上。试剂盒扩增ASGV病毒，不能得到特异性带。与用NASH方法检测病毒比较，结果表明，该ASPV试剂盒具有特异、灵敏等优点。利用此试剂盒能很好地对梨树ASPV病毒进行检测。     

山羊干扰素RNA的提取及鉴定

应用Trizol法从山羊子宫内膜中提取RNA,根据已获得的山羊IFN基因序列设计并合成引物,采用RT-PCR技术进行IFN基因的扩增。结果表明,所提取的RNA经琼脂糖凝胶电泳呈现出28S r RNA、18S r RNA 2条清晰的条带,其OD260/OD280值为1.91,RT-PCR得到的条带与目的片断大小一致,说明所提取的RNA纯度高、无降解,可进一步用于干扰素的分子生物学研究。     

苹果茎沟病毒(ASGV)库尔勒香梨分离物的鉴定

库尔勒香梨口感细腻 ,汁多味甜 ,深受国内外消费者的青睐。但近年来其口感降低、品质退化明显加重 ,对这一特有名优水果的生产和发展产生严重影响。除气候、栽培等条件的变化外 ,可能与香梨病毒病的发生存在很大关系。近年国内外对梨树病毒病有了较深入的研究 ,但对于仅产于新疆的库尔勒香梨 ,其病毒病的发生、病毒种类等尚未见有系统的报道。本研究通过广泛的取样 ,分离获得 1个香梨分离物 (KRL 1)。通过草本寄主范围测定 ,KRL 1可侵染昆诺藜、苋色藜、黄瓜共 2科 3种植物。常温接种7～ 10d在昆诺藜接种叶上产生小的褪绿斑 ,后枯死 ;当…     

植物病毒RNA提取方法的研究

病毒RNA提取技术是分子生物学中经常应用的重要技术,是对RNA病毒在分子水平进行研究的必要手段.介绍了一种从染病植物组织中提取病毒RNA的方法,利用此方法提取了马铃薯x病毒(PVX)的RNA基因组,并通过RT-PCR得到其外壳蛋白基因,提取的病毒RNA在纯度和产量上都可满足反转录和PCR扩增等基本分子生物学操作.     

樱桃李属坏死环斑病毒病PCR检测技术研究

通过用2种RNA提取方法提取甜樱桃植株样品总RNA,并对其进行电泳分析.结果表明,用方法A提取的RNA完整性比方法B较好,出现了较为典型的RNA带型.以方法A提取的甜樱桃总RNA为模板,用设计一对特异性引物进行RT-PCR反应,可见其DNA谱带与预期的一对引物应扩增的片断吻合,说明PCR检测是特异的.通过30份样品经RT-PCR扩增有2份表现出清晰、明显的特异带,占总样品数的6.7%.     

枸杞果实总RNA提取方法的比较研究

以枸杞果实为植物材料,比较研究Trizol试剂快速提取法、异硫氰酸胍法、TransZol plant试剂盒法、CTAB法和改良CTAB法提取枸杞果实RNA的可行性.结果表明,改良CTAB法能有效地抑制酚类物质、多糖及皂苷等次级代谢产物对RNA的影响,可从枸杞果实获得质量高、完整性好的总RNA;RT-PCR分析显示提取的...     

白术根茎的总RNA提取方法的比较

探讨提取白术根茎总RNA的最优方案。以新鲜白术的根茎为实验材料,采用三种方法提取其根茎总RNA。用紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳检测RNA样品完整性,用RT-PCR方法验证RNA质量。用多糖多酚植物总RNA提取试剂盒的方法,获得了完整性最好、质量最高的总RNA样品。提取白术根茎总RNA的三种方法中,多糖多酚植物总RNA提取试剂盒的方法最理想。     

白芥叶片总RNA提取方法的比较研究

以白芥为材料,分别采用柱式植物总RNA抽提纯化试剂盒法、RNAisoPlus法和CTAB-异丙醇法3种方法提取白芥叶片总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计及RT-PCR反应进行检测,最后对3种方法得到的结果进行分析比较．结果表明,RNAisoPlus法提取出的总RNA条带与其他方法相比更为清晰,A260／A280比值介于1．9～2．1之间,该方法更适合用于白芥叶片总RNA的提取．     

一种马铃薯病毒RT-PCR诊断新方法

对传统的植物病毒RNA苯酚提取法进行改进;同时设计并优化单管RT-PCR(O ne-tube RT-PCR)方法,使传统的RT-PCR两步反应在一个反应体系中同时进行,依据马铃薯Y病毒和马铃薯S病毒的基因组RNA保守序列设计2套特异性引物,采用上述新建立的检测方法对染病的马铃薯叶片组织进行病毒检测,结果与G eneB ank中报道的这两种马铃薯病毒核苷酸序列进行B last比较,同源性达到96%以上,用这种新型诊断方法对马铃薯病毒核酸进行了浓度检测,实验结果证明,这种新型马铃薯病毒诊断方法具有可靠、快速、简便等特点.     

侵染加工番茄的BBWV2的分子鉴定及田间检测

利用蚕豆病毒属的兼并引物对23个加工番茄病株进行RT—PCR检测,其中19株检测出被该属病毒侵染。从中选取4个病株的RTPCR产物进行克隆和测序,将所得序列经过基因库检索发现,4个序列均与蚕豆萎蔫病毒2（BBWV2）基因组RNA1的序列同源性最高。然后对病毒分离物XJ14-1基因组进行进一步的克隆和测序,获得RNA1组分3659个核苷酸,RNA2组分1300个核苷酸,序列比对结果显示,它们与BBWV2的RNAl和RNA2具有高的序列同源性,分别为76．6％～94％和76．9％～94．1％,而与BBWVl的RNA1和RNA2的序列相似性都很低。因此分子鉴定结果表明,新疆加工番茄受到BBWV2的侵染。利用BBWV2的单克隆抗体对田间不同品种（品系）加工番茄病株进行ELISA检测,结果显示田间病株带毒率达到53．3％,并且供试20品种（品系）均可被BBWV2侵染,该数据表明,BBWV2在田间发生普遍。     

蝴蝶兰花发育相关基因pPI9的克隆与表达分析

为研究具有复杂而特异花型的蝴蝶兰花发育的分子机制,利用RT-PCR方法从蝴蝶兰花瓣总RNA中分离出834 bp长的cDNA片断.序列分析表明,该cDNA片断与拟南芥的PI基因有60%的同源性,命名为pPI9.它包含一个开放阅读框,具有编码24.5 ku蛋白质的能力.推导的氨基酸序列中,N端包含一个完整的MADS盒,C端有明显的PI基序.半定量PCR结果表明该基因只在植株的生殖器官中表达,而在营养器官中不表达,推测其可能参与花形态建成过程的调节.     

高致病性猪链球菌双组分系统Ihk/Irr双基因缺失突变株的构建

目的构建Ⅱ型猪链球菌05ZYH33菌株双组分系统Ihk/Irr的双基因缺失突变株.方法首先对双组分系统Ihk/Irr基因进行序列分析;选取Ihk/Irr基因的相关片段克隆至p ET30a表达载体,进行可溶表达并注射家兔制备抗体;分别将ihk基因上游irr基因下游各1 kb的片段扩增,将两个片段连接起来;克隆至温敏型p JRS233的穿梭质粒中;利用两步同源重组法获得突变体;分别提取突变株的基因组DNA,RNA及菌体总蛋白,利用PCR,RT-PCR,Western-blot方法验证突变体.结果成功制备了双组分系统Ihk/Irr可溶性表达的蛋白,成功构建了重组的温敏型ikr-p JRS233重组质粒,成功将重组质粒转入猪链球菌05ZYH33中并获得突变株,基因组PCR,RTPCR及Western-blot分别证实了双组分系统Ihk/Irr双基因被成功敲除.结论成功构建重组温敏型的穿梭质粒,导入到猪链球菌05ZYH33菌株中经两步同源重组获得突变株,在基因组DNA,RNA及蛋白水平上验证了双组分系统Ihk/Irr双基因缺失株的成功构建.     

水稻黑条矮缩病毒基因组第九组分cDNA的克隆及序列分析

从我国发病的玉米材料中提取水稻黑条矮缩病毒,抽提病毒RNA,利用RT-PCR等手段,获得了病毒基因组第九组分（S9）cDNA克隆。序列分析结果表明：S9全长1900bp,含有2个不重叠的ORF,编码蛋白的分子质量分别为39.9,24.2ku,与日本株S9核苷酸序列同源性为89%,与意大利株MRDV S8同源性为86%。     

Post-transcriptional gene silencing signal could move rapidly and bidirectionally in grafted Arabidopsis thaliana

RNA-MEDIATED GENE SILENCING IS A UNIVERSAL GENE- REGULATION SYSTEM FUNDAMENTAL IN BIOLOGICAL PROCESSESAND PHENOMENA OF THE DOUBLE-STRANDED RNA (DSRNA) TRIGGERED SEQUENCE-SPECIFIC MRNA DEGRADATION[1―3]. RNA SILENCING OCCURS IN A BROAD RANGE OF EUKARYOTIC …     

BMP7基因真核表达载体的构建及荷瘤小鼠制备

目的克隆BMP7基因及构建BMP7基因真核表达载体,稳定转染于H22细胞系,制备荷瘤小鼠。方法应用RT-PCR技术从人胚肾细胞系293T细胞总RNA中成功扩增出1 293 bp包含BMP7基因编码区的cDNA序列,在上下游加上BamHI及HindⅢ双酶切位点后形成带酶切位点的BMP7基因,然后连入含BaraH I及HindⅢ双酶切位点的pEGFP-C1表达质粒上,构建BMP7基因的重组真核表达质粒pEGFP-C1-BMP7。脂质体介导方法转染细胞,RT-PCR、western-blot方法检测其mRNA及蛋白表达,皮下注射制备荷瘤小鼠。结果扩增的cDNA经测序比较与基因文库完全一致;BamHI及HindⅢ双酶切后,质粒形成约4.7 kb和约1.3 kb两条带,与理论计算值完全一致。注射转染BMP7基因后H22细胞小鼠瘤体明显增大。结论成功克隆BMP7基因及构建BMP7基因的真核表达载体。BMP7基因高表达可能是细胞癌变的原因之一。     

葡萄病毒B优化检测体系的建立

为了解决种苗检疫、抗病性早期鉴定等基本问题,为葡萄无毒化栽培的提供基本保障。本实验从感染葡萄病毒B的葡萄皮层中提取总RNA,以其为模板进行一步RT-PCR扩增,并利用此扩增产物为模板进行二次扩增,二者均能获得与预期片段大小一致长约460bp和243bp的扩增产物,在此基础上,建立了萄病毒B的一步RT-PCR、巢式PCR以及斑点杂交优化检测体系。利用本实验所建立的优化检测体系对葡萄样本进行检测,表现出了良好的特异性与稳定性。     

从福尔马林固定的癌组织中提取RNA的方法

目的:寻求从福尔马林固定的癌组织中提取RNA的合理方法.方法:运用Trizol法从福尔马林固定的胃癌组织中提取RNA,用分光光度计测定RNA的产量和纯度;通过RT-PCR对不同长度的管家基因-actin进行扩增.结果:100 bp和300 bp的-actin均能顺利扩增出特异性条带,500 bp的-actin未能扩增.结论:用Trizol法从福尔马林固定的癌组织中提取RNA是可行的;进行RT-PCR时应尽量设计小片段引物(100~300 bp)以获得更好的扩增效果.     

马铃薯卷叶病毒基因组保守序列片段的RT—PCR扩增

从感染马铃薯卷叶病毒的植株中提取马铃薯卷叶病毒总RNA,针对马铃薯卷叶病毒基因组,其中的2个保守序列分别设计并合成了1对寡聚核苷酸引物,用反转录-聚合酶链式反应方法从提取的病毒RNA材料中扩增出符合设计大小的240bp、400bp的特异性产物,对照的健康植株中未扩增出相应产物。     

Analysis on the types of chemokines expressed by the murine thymic epithelial cell line MTEC1

Six kinds of chemokines including SDF-1α, IP-10, KC, RANTES, MCP-1 and Lymphotactin have been amplified using the primers designed by ourselves with RT-PCR from the total RNA of a medullary-type murine thymic epithelial cell line MTEC1 cells. The amplified cDNA fragments of the chemokines have been identified by nucleotide sequencing and Northern blot analysis. The results demonstrate that there are two different splicing forms of SDF-1 mRNA existing in MTEC1. The concentrated culture supernatant of MTEC1 shows an intermediate level of chemotaxis to CD4⁻CD8⁻ thymocytes, which conforms to the biological function of SDF-1.