梨树苹果褪绿叶斑病毒在昆诺藜与梨树上的基因序列比较研究

以已知带苹果褪绿叶斑病毒的梨树叶片和皮层及昆诺藜为实验材料,对两种植物总RNA的提取、RT-PCR、目的片断的克隆及其酶切鉴定、基因序列进行了分析比较.结果表明,从两种植物中均可以获得高纯度的总RNA及RT-PCR特异性产物,序列分析结果表明,从梨树中提取的病毒目的片断基因序列与从昆诺藜中提取的病毒基因序列之间存在着差异,但差异不大.     

萝卜叶片总RNA提取方法比较

获得高质量的RNA是进行RNA相关分子生物学实验和研究的前提.尽管目前已建立了多种真核生物总RNA的提取方法,但这些方法是否适用于提取萝卜(Raphanus sativus L.Var.radiculus Pers.)的总RNA还不清楚.本研究分别采用Trizol法、改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS--酸酚法提取萝卜叶片总RNA,并通过分析所得RNA的电泳图谱、得率和纯度来判断这三种方法的优劣, 确定了提取满身红萝卜总RNA的最适方法.实验结果表明,Trizol法和改进SDS酸酚法提取的总RNA中蛋白质和DNA污染比较严重,不能用于下一步实验;而改进的异硫氰酸胍法提取的总RNA得率高、纯度高、完整性好、少降解,完全适合用于Northern blotting,小RNA分离、cDNA文库的构建等分子生物学实验.     

日本沼虾血淋巴RNA提取方法的改进

介绍了一种提取日本沼虾(Macrobrachium nipponensis)血淋巴RNA的改进方法.针对日本沼虾血淋巴中RNA含量较少,易被降解的问题,比较了常规的血淋巴RNA提取方法和改进后的RNA血淋巴提取方法,并进行了血淋巴酚氧化酶的扩增.结果表明,用改进的方法提取的RNA降解少,含量多,纯度高,可用于进一步分子生物学的操作,有着重要的实际意义.     

运动员骨骼肌组织提取总RNA的新方法

为了寻求一种从微量组织中高效又简便的提取骨骼肌总RNA方法,实验对常用RNA提取方法Trizol法进行了改进和简化,提取的总RNA质量进行了电泳和光密度值检测.实验结果显示,运动员微量骨骼肌组织提取的总 RNA 28S、18S和5S三条带清晰可见, RT-PCR 扩增的β-actin 参照基因条带具有特异性,说明该方法从微量组织可有效、简便地提取骨骼肌总 RNA,提取总 RNA 的得率和纯度均符合分子生物学进一步实验要求,为运动相关基因的分子生物学调控机制等研究提供了一定的方法参考.     

植物病毒RNA提取方法的研究

病毒RNA提取技术是分子生物学中经常应用的重要技术,是对RNA病毒在分子水平进行研究的必要手段.介绍了一种从染病植物组织中提取病毒RNA的方法,利用此方法提取了马铃薯x病毒(PVX)的RNA基因组,并通过RT-PCR得到其外壳蛋白基因,提取的病毒RNA在纯度和产量上都可满足反转录和PCR扩增等基本分子生物学操作.     

蓝莓组织RNA提取方法的研究

为建立蓝莓组织RNA提取方法,以蓝莓幼果为材料,比较了5种RNA提取方法,建立了改良的十六烷基三甲基溴化铵-乙酸钾(CTAB-KAc)提取方法,并比较了CTAB-KAc法对蓝莓根、成熟叶、幼茎、花、幼果和成熟果实组织RNA的提取效果.结果表明:CTAB-KAc法提取RNA的过程只需3 h,蓝莓幼果RNA的A260/A280和A260/A230值分别达到2.02和2.46,且无基因组DNA污染,RNA产量达到143.37μg·g-1;用CTAB-KAc法成功提取了蓝莓成熟叶、幼茎、花、幼果和成熟果实组织的RNA,但是根的RNA提取方法还需优化.把上述RNA反转录成c DNA后进行PCR,扩增出预期大小的目的片段,可满足后续分子生物学实验的要求.     

富含多糖番茄果实组织中总RNA的有效提取方法

本文介绍了一种从富含多糖的番茄果实组织中提取总RNA的有效方法,其产率约为每200 m g组织80μg RNA,并且RNA的吸光值的比值A260/A230在1.5~2.0之间,A260/A280在1.6~1.9之间.提取的RNA能够用于RT-PCR反应.这种方法也能有效地应用于富含次级代谢产物的真菌总RNA提取.     

两种球形棕囊藻细胞总RNA提取方法的比较

不同植物细胞RNA提取的适宜方法各不相同.本实验分析、比较了QIAGEN试剂盒法和西曲溴铵(CTAB)法用于赤潮藻细胞总RNA提取的情况.结果显示,两种方法均可获得高质量的总RNA.比较而言,CTAB法比QIAGEN试剂盒更可取,适合藻细胞RNA的大量提取.     

一种简便高效提取细菌总DNA和RNA的方法

本科实验教学中,细菌总DNA和RNA的提取是一个基础实验.但该实验中经常出现DNA提取不出来、产量低、条带不清晰、RNA降解、蛋白残留多等问题,影响了学生对细菌DNA和RNA的直观认识,降低了实验教学效果.将常规提取方法进行精简优化,摸索出一种简便、稳定、高效、成功率高的DNA和RNA同时提取的方法.所获样品电泳条带清晰,无降解,蛋白残留少;且实验步骤少,基本每个学生都能获得理想结果,明显改善了教学实验效果,值得在本科生物化学实验教学中推广.     

改进TRIzol一步法提取中华绒螯蟹窦腺总RNA

中华绒鳌蟹窦腺组织个体很小,RNA含量较少,利用TRIzol一步法提取其总RNA效果较差,且解剖过程中RNA易降解.本文对TRIzol试剂盒说明书的提取过程进行了适当改进,有效提高了窦腺总RNA的产率,减少了RNA降解量,延长了RNA的储存时间.该方法对于低丰度RNA提取尤为有效.     

湘文一号抗虫棉幼叶总RNA提取技术研究

棉花抗虫Bt基因克隆技术第一步就是从抗虫Bt基因特异性表达的幼叶中提取总RNA,基因的表达可以在RNA产生的不同阶段进行调控,纯化完整的总RNA是进行基因表达研究和从cDNA克隆新基因的基础.对比分析了CTAB-licl法、改良异硫氰酸胍一步法、Trizol一步法和试剂盒提取方法4种RNA提取技术,经琼脂糖凝胶电泳谱带结果检验和紫外分光光度计检测,发现前2种方法很难提取到理想的RNA,而后2种提取的RNA完整性较好,但用RNA Out试剂盒提取的RNA更加适用于反转录cDNA.     

角倍蚜总RNA提取方法的比较及优化

采用Trizol法及试剂盒柱提法提取角倍蚜若虫及成虫总RNA,通过紫外分光光度法(OD260/OD280、OD260/OD230)及琼脂糖凝胶电泳检测,对所提取RNA的纯度、浓度及完整性进行了分析.结果表明,采用常规样品量两种方法提取的RNA均降解严重,分析认为角倍蚜富含内源性RNase.通过大幅降低样品量,优化提取步骤,缩短提取时间,有效消除了RNA降解现象.采用Trizol法获得了纯度高、完整性好的RNA样品,电泳显示清晰的28S、18S及5S三条带;试剂盒柱提法获得的RNA呈现较为特殊的带型,没有常规的5S条带,而在750bp～1 000bp之间有一明显条带.     

樱桃李属坏死环斑病毒病PCR检测技术研究

通过用2种RNA提取方法提取甜樱桃植株样品总RNA,并对其进行电泳分析.结果表明,用方法A提取的RNA完整性比方法B较好,出现了较为典型的RNA带型.以方法A提取的甜樱桃总RNA为模板,用设计一对特异性引物进行RT-PCR反应,可见其DNA谱带与预期的一对引物应扩增的片断吻合,说明PCR检测是特异的.通过30份样品经RT-PCR扩增有2份表现出清晰、明显的特异带,占总样品数的6.7%.     

皂土对RNA的有效分离和保护作用的初步研究

皂土-SDS RNA提取方法,是一种能广泛应用的RNA提取方法,能从富含多糖多酚的麻疯树,富含RNase 的动物肝脏,以及霉菌等多种RNA提取困难的动、植物与微生物材料中,成功提取出高质量的RNA,A260/A280在1.8以上．皂土对RNA酶具有高效吸附效应,与RNAsin比较,发现皂土抑制RNA酶强度比进口的同类产品更佳。同时,实验表明此皂土RNA酶抑制剂对RT-PCR等分子生物学后续实验的并无影响。结论：皂土成本低廉,可作为一种有效的RNA抑制剂.     

红景天属植物叶片RNA高效提取的方法

为建立高效提取几种红景天属植物叶片RNA的方法,试验以采自西藏林芝色季拉山的大花红景天为材料,分析了CTAB法,Trizol法,SDS法,尿素法提取叶片RNA的可行性,并利用Nano Drop 1 000、RTPCR和q RT-PCR等手段分析了该方法获得RNA的质量.结果显示,SDS法和CTAB-异丙醇均可得到完整的RNA条带,但是相比于SDS法,后者所提取的RNA产率较高,质量完整,条带清晰.随后对9种不同产地,不同品种的红景天进行RNA的提取,并用Nano Drop 1 000、RT-PCR分析结果.结果显示,所提取RNA的浓度均在200 ng/μL之上,A260/A280均在2.0-2.2之间,A260/A230均大于1.8.此外利用q RT-PCR获得18S内参基因的标准曲线相关系数为0.983.因此证明所提取的RNA的纯度、完整性和产率较高,蛋白、多糖及多酚类物质去除干净.所以CTAB-异丙醇法可以适用于红景天属叶片RNA的提取,为红景天的分子生物学研究奠定了基础.     

几种提取苔藓植物总RNA方法的比较

将3种RNA提取方法加以比较,以期获得提取不同生境毛尖紫萼藓(Grimmia pilifera P.Beauv)总RNA的最适方法.经比较,改进后的SDS法更适合于毛尖紫萼藓总RNA的提取.此方法简单快捷,所得RNA完整性好,纯度高,试验稳定性好,可用于RT-PCR、基因克隆等进一步分子生物学研究.     

水稻颖果总RNA提取方法的研究

利用TRIZOL试剂快速提取法、异硫氰酸胍法和改良的SDS法提取不同发育时期水稻颖果的总RNA,并通过凝胶电泳、紫外分光光度法检测提取获得的RNA样品的品质.研究结果表明,改良的SDS法提取的RNA具有28SrRNA和18S rRNA 2条清晰的条带,且无降解.其D260/D280为1.84～1.97,具有较高的纯度.其他2种方法获得的RNA品质较差,有降解和弥散现象.将改良的SDS法提取的RNA逆转录成cDNA,作为PCR扩增的模板,可获得清晰的约1.7kb的目的条带.该法提取的RNA用于Northern杂交,可产生特异的杂交信号.这些结果进一步证明了改良的SDS法提取的RNA具有很高的品质与纯度,可以满足下一步分子生物学研究的需要.     

蓖麻总RNA提取

作者借鉴高山红景天总RNA提取方法,成功提取了蓖麻的总RNA,并对出现的问题进行了分析.     

沙葱总RNA的提取与质量分析

以沙葱种子和沙葱幼叶为材料,分别用RNAiso Plus试剂法、RNAiso Plus醋酸钠改进法、CTAB-异丙醇法、CTAB-LiCl法4种不同的方法提取沙葱总RNA,经琼脂糖凝胶电泳,采用紫外分光光度法测定总RNA纯度并进行RT-PCR检测.结果表明,沙葱不同组织总RNA提取的最优方法有所不同.采用CTAB-LiCl法能有效地提取出沙葱种子高质量、完整性好而且无胶状不溶物的RNA,没有明显的蛋白和基因组DNA的污染.采用RNAiso Plus醋酸钠改进法能有效地去除沙葱幼叶中多糖的干扰,所提取的RNA条带清晰,完整性好,是沙葱幼叶总RNA提取的有效方法.     

适用于转录组测序的大蒜花器官总RNA的提取方法

为获得高质量的大蒜花器官RNA以用于后续花发育相关基因的研究,以大蒜中多糖多酚含量高的鳞茎为初步实验材料,采用2种试剂盒方法、CTAB法、Trizol法以及改进酸性异硫氰酸胍法提取总RNA,并对提取效果进行比较,筛选出能够得到高质量RNA的天根试剂盒方法和改进酸性异硫氰酸胍法.将改进酸性异硫氰酸胍法进一步用于提取大蒜花器官总RNA,相较于试剂盒方法,获得了质量更好、收率更高的RNA.对提取的大蒜花器官RNA进行完全测序,得到的clean reads占总raw reads比例大于98%,能够满足转录组测序分析的要求.