酸苯酚萃取总RNA方法的改进

目前提取总ＲＮＡ普遍使用的是酸苯酚萃取法（或称硫氰酸胍法）．此法所提取的ＲＮＡ中存有少量基因组ＤＮＡ的污染．为了克服这一缺点,我们对酸苯酚提取ＲＮＡ的方法进行了改进．即先用酸苯酚萃取,然后用蛋白酶Ｋ消化,再次酸苯酚萃取．用改进的方法提取的ＲＮＡ无基因组ＤＮＡ的污染     

双链RNA技术在果树病毒研究中的应用

含ＲＮＡ基因组的植物病毒在复制时会产生双链ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）。本文介绍了用ＣＦ－１１纤维素粉提取ｄｓＲＮＡ的步骤,并列举了ｄｓＲＮＡ在果树病毒研究中的应用,其主要应用有：１）果树病毒病及病原鉴定;２）病毒分化株系的鉴定;３）以ｄｓＲＮＡ为中介对病毒核酸序列进行测定;４）探针制备和ｃＤＮＡ克隆的获得;５）用于检测病毒卫星ＲＮＡ和亚基因组ＲＮＡ;６）侵染性测定和制备抗血清等方面的研究。     

水分胁迫下不同抗旱性小麦品种核酸代谢的差异

抗旱和不抗旱小麦品种在渗透势为－０．０２５ＭＰａ和－０．０５ＭＰａ ＰＥＧ溶液中根际胁迫３天和５天，叶片的ＤＮＡ、ＲＮＡ含量均呈下降趋势，但抗旱品种７３－１１下降幅度比敏感品种晋２１４８小。ＲＮＡ电泳结果表明：２３ｓＲＮＡ、１８ｓＲＮＡ、１６ｓＲＮＡ以及小分子量ＲＮＡ的含量均下降，２个品种的下降差异不明显，但在峰形上有区别。ＤＮＡ电泳结果表明，ＤＮＡ各组分含量在水分胁迫下也表现为下降趋势，且２个品     

电镜原位杂交对淡水三角头涡虫中期染色体RNA的研究

本文用ＲＮａｓｅ－ｇｏｌｄ标记法定位了淡水三角头涡虫中期染色体内ＲＮＡ，发现ＲＮＡ在染色单体切面内部及边缘均有分布。此外，以玉米１８ｓｒＲＮＡ的ｃＤＮＡ和水稻５ｓｒＲＮＡ的ＤＮＡ为探针，经电镜原位杂交后观察了涡虫１８ｓｒＲＮＡ（也包括４５ｓｐｒｅ－ｒＲＮＡ）及５ｓｒＲＮＡ在中期染色单体切面上的分布特点，证明涡虫染色单体边缘及内部ＲＮＡ的两个来源是核仁核糖体ＲＮＡ和核基质内的５ｓｒＲＮＡ。     

香石竹斑驳病毒（CarMVsh）外壳蛋白基因克隆及原核表达

香石竹斑驳病毒上海分离株是从上海地区栽培的香石竹上分离并鉴定的,以提纯的病毒为材料,ＳＤＳ－酚法纯化的基因组ＲＮＡ作为模板,ＲＴ－ＰＣＲ合成并扩增外壳蛋白基因ｃＤＮＡ,ｃＤＮＡ克隆于ｐＧＥＭ－Ｔ ｅａｓｙ ｖｅｃｔｏｒ,转化为Ｅ．ｃｏｌｉＪＭ１０９。阳笥克隆ｐＴＣａＣＰ经序列分析,证明带有全长ＣＰ基因。     

一种简易的植物核酸提取方法─—从干叶和新鲜叶中快速提取RNA和DNA

本文介绍了一种植物核酸提取的简易方法．该法只需在常温下按常规的分子生物学操作条件从已干燥的和新鲜的植物叶中快速提取总ＲＮＡ和ＤＮＡ．所获得的ＲＮＡ和ＤＮＡ能顺利用于下一步的ＰＣＲ、测序及小分子ＲＮＡ研究等分子生物学实验．     

中蜂囊状幼虫病病毒部分结构蛋白基因的克隆及序列分析

根据小ＲＮＡ 病毒科（ Ｐｉｃｏｒｎａｖｉｒｉｄａｅ） 中病毒ＲＮＡ 所具有的结构特征, 采用ｍＲＮＡｃａｐｔｕｒｅ ｋｉｔ 提取纯化中蜂囊状幼虫病病毒（Ｃｈｉｎｅｓｅｓｃａｂｒｏｏｄ ｖｉｒｕｓ ＣＳＢＶ） 的ＲＮＡ, 并以之为ｃＤＮＡ合成的模板． 依据小ＲＮＡ病毒科中的脊髓灰质炎病毒结构蛋白基因序列设计了一对引物ＶＰ５和ＶＰ３ , 通过ＰＣＲ 扩增获得预期大小约为１ １００ ｂｐ的ＤＮＡ 片段, 将此片段克隆到ｐＧＥＭＴｅａｓｙ载体上并直接测序． 序列分析表明, 该片段为中蜂囊状幼虫病病毒部分结构蛋白基因, 与意蜂幼虫囊状病病毒结构蛋白基因序列的同源性为８６－８ ％ , 与之对应氨基酸序列的同源性高达９３－４ ％ ． 该病毒株为一种新型的蜜蜂囊状幼虫病病毒株     

人锰超氧化物歧化酶cDNA基因的克隆

利用人胚胎肝组织提取总ＲＮＡ,从总ＲＮＡ 中分离纯化出ｍ ＲＮＡ,经逆转录得到ｃＤＮＡ 第一条链,并以之为模板和相应寡聚脱氧核苷酸为引物,进行ＰＣＲ 合成人锰超氧化物歧化酶ｃＤＮＡ 基因,将所得ｃＤＮＡ 克隆到质粒ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ 上,转化大肠杆菌ＤＨ５α细胞,进行诱导表达筛选,将筛选的克隆进行ｃＤＮＡ 全序列测定     

C1 SnoRNA，水稻中一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和ｃＤＮＡ序列分析等方法，在水稻（Ｏｒｙｚａｓａｔｉｖａ）中发现了一种新的核仁小分子ＲＮＡ：Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ．该ＲＮＡ具有ｂｏｘＣ，ｂｏｘＤ和末端碱基配对区等典型的核仁小分子ＲＮＡ结构特征；并有１４个核苷酸与水稻１８ｓｒＲＮＡ中一段保守序列互补．推测Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ可能在１８ｓｒＲＮＡ甲基化过程中起重要作用．编码Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ的基因位于水稻Ｈｓｐ７０基因的第一个内含子中．这是在水稻中发现的第一个由基因内含子编码的ＳｎｏＲＮＡ．     

酿酒酵母中一种新的反义snoRNA分子的鉴定

核仁小分子ＲＮＡ（ｓｎｏＲＮＡ）是一类在真核生物核糖体生物合成过程中起重要作用的小分子ＲＮＡ．通过计算机直接分析国际分子生物学数据库及ＲＮＡ杂交分析、ｃＤＮＡ序列测定等方法,在酿酒酵母（Ｓａｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中发现和鉴定了１个新的ｓｎｏＲＮＡ－Ｚ６ｓｎｏＲＮＡ．该ｓｎｏＲＮＡ长１０９个核苷酸,由位于酿酒酵母第１３号染色体上的１个独立基因编码．Ｚ６ｓｎｏＲＮＡ含有ｂｏｘＣ（ＵＧＡＵＧＡ）、ｂｏｘＤ（ＣＵＧＡ）等保守的结构元素,属于反义ｓｎｏＲＮＡ家族,即分子中有１段１１个核苷酸的片段与２５ＳｒＲＮＡ中１段保守核心序列互补,该ｓｎｏＲＮＡ片段连同其下游的ｂｏｘＤ共同指导与其互补的ｒＲＮＡ序列第２１９５位胞苷酸的２’－氧－核糖的甲基化．     

逆转录聚合酶链式反应快速检测水稻条叶枯病毒

逆转录聚合酶链式反应（Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ,ＲＴ－ＰＣＲ）具有灵敏度高,准确性好的特点,因而被广泛应用于植物病毒检测。在ＲＴ反应中,ＲＮＡ样品的快速制备尤为重要用异丙醇二步沉淀法获得ＲＮＡ,快速检测水地片中ＲＳｔＶ伯ＲＴ－ＰＣＲ方法,可使测定时间缩短至６ｈ,并可从０．０７８ｍｇ感病叶片中检测出ＲＳｔＶ。     

好好芭叶片RNA提取方法和cDNA干旱消减文库的构建

介绍了从好好芭成熟叶片中提取总RNA的方法;用含有SDS的裂解液裂解细胞,用DNase除去可能出现的DNA干扰,再经植物提取试剂盒纯化后,获得了高质量的完整RNA,可用于基因编码序列的克隆和基因表达的mRNA分析等精细研究,并进一步构建了好好芭干旱消减文库.     

拟步甲昆虫基因组DNA提取的比较研究

对拟步甲科8种昆虫的新鲜标本及无水乙醇浸泡标本，分别用SDS-蛋白酶K消化法和乙酸钾抽提法进行基因组总DNA的提取．经5次重复实验，结果表明，用两种方法均能从新鲜标本中获得较完整的DNA，且DNA得率较高；而对于无水乙醇保存的标本，提取出的DNA用琼脂糖凝胶电泳检测不出DNA条带，说明标本在保存过程中DNA可能发生了变化，致使提取出的DNA量太少或未分离出DNA．通过对比实验，分析原因，阐明了两种方法的优缺点，并提出了该类昆虫用于DNA提取的标本的保存方法．     

从福尔马林固定的癌组织中提取RNA的方法

目的:寻求从福尔马林固定的癌组织中提取RNA的合理方法.方法:运用Trizol法从福尔马林固定的胃癌组织中提取RNA,用分光光度计测定RNA的产量和纯度;通过RT-PCR对不同长度的管家基因-actin进行扩增.结果:100 bp和300 bp的-actin均能顺利扩增出特异性条带,500 bp的-actin未能扩增.结论:用Trizol法从福尔马林固定的癌组织中提取RNA是可行的;进行RT-PCR时应尽量设计小片段引物(100~300 bp)以获得更好的扩增效果.     

几种微量DNA定量测定方法的比较

本研究通过对溴乙淀染色、紫外分光光度计和高效液相色谱(HPLC)等方法的比较,找出了适用于不同情况下,微量DNA的最佳测定方法:1.紫外分光光度计,能准确测量纯净的、浓度在1μg/mL以上的DNA浓度;2.在有标准DNA的情况下,溴乙淀染色法能粗略区别1～5ngDNA;3.HPLC能够快速、准确检测0.21ng以上的DNA,此法简便、灵敏、不受杂质干扰,且能同时对多种微量DNA进行分离和定量。     

从动物血液中提取基因组DNA方法的比较研究

从血液中提取基因组DNA的传统方法是先得到淋巴细胞，再用蛋白酶K、SDS消化，然后用酚、氯仿抽提，乙醇沉淀．CTAB法提取基因组DNA多应用于植物和微生物，从全血中提取基因组DNA报道甚少．采用改良的CTAB法从全血中提取基因组DNA，并以传统方法和TAKARA Blood Genome DNA Extraction Kit作对照．结果表明：CTAB法可以得到大量的、较完整的基因组DNA，并且纯度达到1．8～2．0，可以满足PCR扩增和限制酶切等实验的要求．     

红碱淖遗鸥血液基因组DNA提取方法的比较研究

采用酚-氯仿法和改良Miller盐析法从红碱淖遗鸥冷冻血液样品中提取基因组DNA,以筛选遗鸥冷冻血液DNA的最佳提取方法.结果显示：酚-氯仿法琼脂糖凝胶电泳DNA样品亮度和清晰度较高,条带较粗,纯度较高;而改良Miller盐析法提取基因组DNA,获得率较低,并且难以去除杂质;酚-氯仿法提取时,酶解16 h比酶解10 h的DNA提取效果好,说明在一定时间范围内,延长酶解时间可有效地提高DNA提取效果.上述结果提示,酚-氯仿法对遗鸥冷冻血液基因组DNA提取的效果优于改良Miller盐析法.     

菊叶香藜（Chenopodium foetidum）基因组DNA的提取方法研究

文章通过传统CTAB法、改良CTAB法、SDS法、高盐低pH法和试剂盒法等5种方法,对菊叶香藜进行基因组DNA提取,旨在筛选一种菊叶香藜基因组DNA的适宜提取方法。同时用紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对5种方法所提DNA进行检测,并对改良CTAB法提取的DNA进行RAPD-PCR扩增检测。结果表明：改良CTAB法提取速度较快,便于操作,提取的DNA质量较好,进行的RAPD-PCR扩增条带清晰,能满足分子标记的要求。因此,改良CTAB法为菊叶香藜基因组DNA可靠并合适的提取方法。     

RNA-mediated epigenetic programming of a genome-rearrangement pathway

Genome-wide DNA rearrangements occur in many eukaryotes but are most exaggerated in ciliates, making them ideal model systems for epigenetic phenomena. During development of the somatic macronucleus, Oxytricha trifallax destroys 95% of its germ line, severely fragmenting its chromosomes, and then unscrambles hundreds of thousands of remaining fragments by permutation or inversion. Here we demonstrate that DNA or RNA templates can orchestrate these genome rearrangements in Oxytricha, supporting an epigenetic model for sequence-dependent comparison between germline and somatic genomes. A complete RNA cache of the maternal somatic genome may be available at a specific stage during development to provide a template for correct and precise DNA rearrangement. We show the existence of maternal RNA templates that could guide DNA assembly, and that disruption of specific RNA molecules disables rearrangement of the corresponding gene. Injection of artificial templates reprogrammes the DNA rearrangement pathway, suggesting that RNA molecules guide genome rearrangement.     

杂交狼尾草分子标记分析DNA快速提取方法

以杂交狼尾草叶片为材料,用0.05 mol NaOH溶液在沸水浴中加热处理10 min,进而用pH3.0的TE溶液进行中和获得DNA提取液,并用该DNA提取液为模板进行RAPD-PCR和SSR-PCR扩增.结果显示:用该方法提取的DNA与常规CTAB法提取的DNA质量相当,可用于以PCR技术为基础的DNA分子标记分析与96孔板技术相结合,可以实现DNA高通量提取.