Z7 snoRNA：酿酒酵母中一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和分子杂交等方法，在酿酒酵母中发现了一种新的核仁小分子ＲＮＡ：Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ。该ｓｎｏＲＮＡ具有ｂｏｘ Ｃ和ｂｏｘ Ｄ等结构元素，并有１４个核苷酸与１８Ｓ ｒＲＮＡ中的一段保守序列互补，属于典型的以核酸序列指导大分子ｒＲＮＡ甲基化的ｓｎｏＲＮＡ类型。Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ指导酿酒酵母１Ｓ ｒＲＮＡ中第５７８位的尿嘧啶核苷酸的核糖甲基化。Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ长８８个核     

河南西峡恐龙18srDNA片段质疑

按照ｒＤＮＡ的结构特点，将ＤＡ１８Ｓ１，７与其他８种生物的ｒＤＮＡ序列进行排列比较，结果表明这２个序列不是恐龙ｒＤＮＡ片段，ＤＡ１８Ｓ７看来更接近一种植物ｒＤＮＡ片段（与金虎尾的同源性达９４％以上），而ＤＡ１８Ｓ１与２种参与比较的真菌ｒＤＮＡ序列有很高的同源性（８８．３％和８９％），它们与脊椎动物ｒＤＮＡ的同源性分别只在６７．８％～７４．１％之间。     

贾第虫4种新的box H/ACA snoRNA的鉴定及其进化意义

通过构建特异性的cDNA文库, 发现并鉴定了4种新的贾第虫box H/ACA snoRNA, 分别命名为GLsR22, GLsR23, GLsR24和GLsR25. 生物信息学分析表明, 这些snoRNA均可形成典型的box H/ACA snoRNA“双茎环”二级结构; GLsR24和GLsR25可能分别指导贾第虫23S rRNA上U1753和U2396的假尿嘧啶化修饰, 而GLsR22和GLsR23属于功能未知的“orphan” snoRNA. 新鉴定的box H/ACA snoRNA均位于蛋白质基因间隔区中, 并且都是由单拷贝基因编码的. 与古细菌及其他原生生物中已发现的同类分子相比, 贾第虫box H/ACA snoRNA具有很多独特特征, 提示snoRNA在从原核生物向真核生物进化的过程中可能有不同的进化路线.     

两个新的粟酒裂殖酵母box H/ACA snoRNA的鉴定、功能分析及进化意义

通过构建粟酒裂殖酵母核小分子RNA的cDNA文库,发现并鉴定了两个新的非编码RNA,分别命名为Sp15-70和Sp18-61.生物信息学分析揭示这两个RNA均具有典型的box H/ACA snoRNA二级结构特征和与rRNA互补的配对区,推测Sp15-70具有指导25S rRNA中U2401和U2298假尿嘧啶修饰的功能;Sp18-61具有指导18S rRNA中U208和25S rRNA中U2341假尿嘧啶修饰的功能.采用CMC-引物延伸法证实:在粟酒裂殖酵母rRNA中,这4个预测位点确实为假尿嘧啶修饰核苷酸.Sp15-70和Sp18-61均由单拷贝基因编码,分别位于粟酒裂殖酵母染色体工和Ⅲ上蛋白质基因的间隔区,在其5'端上游均发现了典型的TATA box元件,表明它们都是独立转录的基因.比较分析这两个snoRNA在不同生物中的功能性同源分子,发现snoRNA基因在进化的过程中发生了广泛的分子重组和转位.     

“传统”垃圾填埋场渗滤液中古细菌16S rRNA基因的RFLP分析

"传统"垃圾填埋场渗滤液中古细菌群落的多样性通过不依赖于培养的分析而获得.将渗滤液中古细菌的16S rRNA基因片断(16S rDNA)选择性地扩增出来并用于构建16S rDNA克隆文库.文库内古细菌16S rDNA的遗传变异性通过RFLP分析(限制性内切酶Hha Ⅰ和Hae Ⅲ)而得到.80个随机选出的古细菌rDNA克隆子被划分为29个不同的RFLP型(组),其中最大的5个型共占所有被分析克隆子的53%左右,而其余24个型的丰度均处于相对较低的水平,其中16个型更仅含有1个克隆子.有关结果表明,对克隆16S rDNA片断的RFLP分析是评估复杂厌氧系统中微生物群落多样性的有力工具.     

基因组的进化与内含子中的基因的进化

论述了基因组整体进化过程中内含子所含的基因的进化．分析了内含子的起源方式与内含子中的基因种类的关系,并结合基因组在大小、组成等方面进化过程中内含子的演化趋势,探讨了内含子中的基因,特别是核仁小分子ＲＮＡ基因的进化规律．同时,对于内含子中的基因的进化,提出了一些可能的途径．     

酵母snoRNA基因簇启动子的比较分析

报道对酿酒酵母ｓｎｏＲＮＡ基因簇启动子序列的研究结果．通过计算机分析,发现酿酒酵母中Ｚ２Ｚ８和ＳｎＲ１９０Ｕ１４ｓｎｏＲＮＡ基因簇有相似的启动子结构．这两个ｓｎｏＲＮＡ基因簇都是由一个上游的启动子负责整个基因簇的转录,产生多个顺反子ｓｎｏＲＮＡ的前体,然后再加工成熟为各个独立的ｓｎｏＲＮＡ．在启动子保守序列ＴＡＴＡｂｏｘ的上游还发现２个ＲＡＰ１序列,表明ｓｎｏＲＮＡ基因簇的表达可以通过ＲＡＰ１元素与核糖体蛋白基因的表达协同调控．这是在ｓｎｏＲＮＡ基因的启动子中首次发现ＲＡＰ１调控元素．对ｓｎｏＲＮＡ基因簇的进化特点也进行了讨论．     

孑遗动物新疆北鲵的分子特征及其进化生物学研究(Ⅰ)

通过对孑遗两栖动物新疆北鲵（Ｒａｎｏｄｏｎｓｉｂｉｒｉｃｕｓ）核糖体１８ＳＲＮＡ基因全序列的测定与分析,从基因水平揭示北鲵的特征,为进一步探讨孑遗动物的发生及其演化的分子机制研究奠定了基础．首次对新疆北鲵核糖体１８ＳＲＮＡ基因进行报道．     

中国特有植物大血藤的RAPD分析──植物地带性分化的分子差异标准初探

采用随机扩增多态性ＤＮＡ技术对中国特有科特有属植物大血藤（Ｓａｒｇｅｎｔｏｄｏｘａｃｕｎｅａｔａ）进行分析,探讨植物地带性分化的分子差异．从１００个随机引物中筛选出１１个有效的１０碱基对寡聚核糖核苷酸作引物,用于对取自５省区的大血藤植物基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增;用ＵＰＧＭＡ法对各居群间的Ｊａｃａｒｄ相似性系数和遗传距离进行聚类分析．ＲＡＰＤ分析结果表明：分布于各省区（地区）的大血藤居群,尽管其形态特征的变异尺度较为一致,但在分子水平上存在明显差异,这种差异与地理范围的变化相关,表现出一定的地带性分化规律．     

苏铁在种子植物进化中的位置：分子生物学的证据

用大分子rRNA快速测序法测定了苏铁(Cycas revoluta Thunb.)、水松[Glyptos-trobus pensilis(Staunt.)Koch]和南方红豆杉[Taxus mairei(Lemee et Levl)S.Y.Hu]三种裸子植物Ls-rRNA5′端区108个核苷酸的序列。用这些数据构建的rRNA系统树揭示了苏铁与水松和南方红豆杉构成一个关系密切的姐妹群,而所分析的被子植物都为另一自然类群。另以绿藻作为种子植物群外参照物种,表明苏铁这一位置并不是由于一个特异的进化速度所造成的。这一结果支持了苏铁与松杉类为一自然群类,它们的分歧发生在裸子植物与被子植物分歧之后的假说。