甲型H1N1流感病毒流行株基因组进化分析

2009年4月, 北美地区出现甲型H1N1流感疫情, 并且疫情快速扩散至欧亚非三大洲, 风险等级上升至5级. 截止至5月13日, 甲型H1N1流感病毒已扩散至33个国家和地区, 实验室确认病例5728例, 死亡61人. 从NCBI的IRV和GISAID的EpiFluDB数据库下载甲型H1N1流感病毒序列425条, 进行序列比对与进化分析. 分析结果显示: (ⅰ) 当前流行的甲型H1N1流感病毒是一个三重排A型流感病毒: HA, NA, MP, NP和NS来源于猪流感病毒; PB2和PA来源于禽流感病毒; PB1来源于人流感病毒. (ⅱ) 猪流感病毒的来源可细分为: HA, NP和NS来源于H1N1亚型经典猪流感毒株; NA和MP来源于H1N1亚型禽源猪流感毒株. (ⅲ) 甲型H1N1流感病毒在流行扩散过程中没有显著变异, 同时病毒基因组没有发生重排. 本文除了分析美国代表毒株A/California/04/2009(H1N1)外, 还以墨西哥代表毒株A/Mexico/4486/2009(H1N1)为主进行了同源性和进化分析, 地理范围相对较大, 分析结果更具科学性.     

甲型H1N1流感病毒北美毒株的分子特征

以10个甲型流感病毒北美毒株的基因PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, NS和M进行遗传进化分析, 并用不同的软件对PB2, HA, NS1和M2蛋白氨基酸序列、糖基化位点及抗药性位点分析. 结果表明, 甲型流感病毒北美毒株的基因片段是一个来源于不同宿主、不同地域的重组株. HA蛋白氨基酸序列分析表明, 北美毒株HA蛋白的裂解位点氨基酸序列均为IPSIQSR↓G, 不具有高致病性流感病毒的特性, 同时NS1蛋白第92位氨基酸残基由天冬氨酸突变为谷氨酸(Asp→Glu), PB2蛋白氨基酸序列的第627位均为谷氨酸(E), 这些特性表明对人具有明显的亲和性, 但推测对人具有较低的致病力. M2蛋白的同源建模表明了北美毒株M2蛋白的药物敏感位点突变为抗药型位点, 推测北美毒株具有抗金刚烷胺类药物的结构特点, NA蛋白序列分析表明了北美毒株仍然对神经氨酸酶抑制剂类药物敏感. 这些研究结果对于我国预防和控制甲型流感北美毒株具有重要的参考价值.     

甲型H1N1流感病毒HA蛋白结构模建与构象表位分析

最近几个月来, 一种新型流感病毒H1N1在全球流行. 本文运用生物信息技术, 从NCBI发布的新型A H1N1流感病毒基因序列出发, 通过同源模建方法构建了HA蛋白三维结构, 利用自主开发的蛋白抗原空间表位预测程序SEPPA预测了HA蛋白潜在空间表位氨基酸, 并与以往流感病毒HA蛋白潜在构象表位进行了比较. 结果发现HA蛋白中58个氨基酸残基具有较强的免疫原性, 大部分在HA蛋白球状头部表面上聚集成簇, 构成空间抗原表位. 与以往流感病毒HA蛋白潜在空间表位相比, 虽然坐落位置相似, 但新的抗原表位在静电势性质上明显不同于以往流感病毒HA蛋白抗原表位.     

新甲型H1N1流感病毒血凝素基因(HA)突变网络结构

构建了新甲型H1N1流感病毒血凝素基因的变异网络图. 同源性比对表明, 来自墨西哥的一个病毒序列类型为此次新流感病毒的原始序列类型. 通过血凝素基因658A和1408T突变可将此新流感病毒序列分为墨西哥类型、过渡类型和纽约类型3个主要类型. 这3个类型在地理分布上具有明显差别.     

2009年新甲型H1N1流感病毒的来源和去向分析

借助因特网流感病毒数据库平台, 对猪流感病毒的PB1, PB2和PA进行谱系分析, 结果提示, 新近北美出现的甲型H1N1流感病毒新毒株所有的基因都来自猪流感病毒, 但是来自两个不同谱系的猪流感病毒, 其中一个谱系的猪流感病毒约是10年前人、禽、猪流感病毒的杂合体. 依据近期的流行态势, 此病毒将在全球进一步扩散蔓延, 将在人群中长期存在, 也有可能在猪群中流行. 此病毒的扩散可能伴随着人群中原有的某亚型流感病毒的消失.     

Dynamic reassortments model of the human-infecting influenza A （H7N9） virus

With the support by the National Natural Science Foundation of China and the Ministry of Science and Technology of China, Prof. George F. Gao＇s laboratory at the CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, with collaborators reported the genetic heterogeneity of the human-infecting influenza A （H7N9） virus and posed virus dynamic reassortments model, which was published in Nature Communications （2014, 5. 3142）.     

Internal genes of a highly pathogenic H5N1 influenza virus determine high viral replication in myeloid cells and severe outcome of infection in mice

正Collaborating with Prof.Wendy Barclay from the Section of Virology,Department of Medicine,Imperial College London,the research team directed by Prof.Cao Bin (曹彬)from the Department of Respiratory Medicine,Capital Medical University;Center for Respiratory Diseases,Department of Pulmonary and Critical Care Medicine,China-Japan Friendship Hospital,Beijing,China,recently reported     

H7N9 virulent mutants detected in chickens in China pose an increased threat to humans

正Supported by the Science Fund of the Creative Research Group,the research team led by Prof.Chen Hualan(陈化兰)in Harbin Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences found that the low pathogenic H7N9viruses emerging in 2013have mutated to highly pathogenic viruses in chickens and are more dangerous to humans,which was published in Cell Research(2017,doi:10.1038/cr.2017.129).     

Analysis of the LF507-1H engine hot parts damage

文章介绍了LF507-1H型航空发动机的基本构造和特点,重点分析了该发动机在实际工作中常见热部件损伤的原因和预防方法.     

Observation of Reaction Resonances in F + H2→HF + H

Reaction resonance is a transiently trapped transition state along the reaction coordinate in chemical reactions.     

论N对句式"V+的+是+N"歧义的影响和制约

文章认为,句式"V+的+是+N"产生歧义的原因是多种多样的,除了"的"字结构中动词和名词的配价以及出现的其他成分以外,句中出现N的生命度以及N和V的语义特征都可能对其歧义产生影响.通过扩大句中N的内涵可以对句式中"V的"的指称概率进行制约.     

The new rice 57H mutants to explore

谷蛋白是水稻种子储藏蛋白的主要成分本研究采用SDS-PAGE技术,从90份水稻种质中,发掘出1个57KD谷蛋白前体高量表达、其他储藏蛋白性状没有明显变化的新型57H突变体所发掘的突变体,是可用于水稻蛋白质营养品质遗传育种研究的有用素材.     

亨施自述

在我们极其复杂和不断变化的世界里，知悉某些物理量能用很高的精确度来测量和预言，是一件人欣慰的事。精确测量作为物理学中最美的一个方面永远吸引着我。使用更好的测量工具，人们能够看到以前无人见过的地方。不止一次，测量值与理论值之间似乎微不足道的差异导致了基础知识领域里的重要进展。现代科学的诞生本身便是与精确的测量技术密切相关。     

杰出的理论物理学家波波夫的科学成就

本文评述了俄罗斯著名理论物理学家波波夫的科学成就，特别是他在量子场论，规范场论，统计物理和凝聚态理论方面的重要贡献．     

Histamine H3 receptors aggrevate cerebral ischemia in a histamine-independent manner

<正>Prof.Chen Zhong's laboratory at the Department of Pharmacology,College of Pharmaceutical Sciences,Zhejiang University,reported a novel mechanism by which histamine H3 receptors(H3Rs)are involved in cerebral ischemia.This work was published in Nature Communications(2014,5:3334).Cerebral ischemia is one of the leading causes of mortality and disability with few therapy.Although     

利用H2O2提高骨胶透明度的研究

利用过氧化氢溶液对工业骨胶脱色进行实验,增加透明度以提高骨胶的经济价值.     

C2H2锌指蛋白药物递送技术的研发与应用

锌指蛋白是真核生物中广泛存在的转录因子，在基因的表达调控中起着重要作用。近期研究发现，C₂H₂类型的锌指蛋白(通过两个半胱氨酸和两个组氨酸螯合锌离子)可通过巨胞饮进入哺乳动物细胞。进一步的研究发现C₂H₂锌指蛋白可介导多种模式蛋白质及药物蛋白质的高效细胞递送，其细胞穿透效率亦高于传统的细胞穿膜肽。文章介绍了锌指蛋白的基本生物学信息和其细胞穿透特性，并讨论C₂H₂ 锌指蛋白在大分子药物递送中的应用。     

致病性大肠杆菌O157:H7的基本特性与基因组研究进展

大肠杆菌(Escherichia coll)是条件致病菌，在正常惰况下一般不致病。致病性菌株Escherichia coll O157：H7能够引起出血性肠炎，给人类带来严重危害。本简要介绍致病性大肠杆菌O157：H7的基本特性，着重从基因水平上对致病性大肠杆菌Escherichia coll O157：H7和非致病性大肠杆菌Escherichia collK—12的核酸序列比较后得到的有关大肠杆菌O157：H7致病性和毒力功能方面的结果作了简要的综述。