红碱淖遗鸥血液基因组DNA提取方法的比较研究

采用酚-氯仿法和改良Miller盐析法从红碱淖遗鸥冷冻血液样品中提取基因组DNA,以筛选遗鸥冷冻血液DNA的最佳提取方法.结果显示：酚-氯仿法琼脂糖凝胶电泳DNA样品亮度和清晰度较高,条带较粗,纯度较高;而改良Miller盐析法提取基因组DNA,获得率较低,并且难以去除杂质;酚-氯仿法提取时,酶解16 h比酶解10 h的DNA提取效果好,说明在一定时间范围内,延长酶解时间可有效地提高DNA提取效果.上述结果提示,酚-氯仿法对遗鸥冷冻血液基因组DNA提取的效果优于改良Miller盐析法.     

两种提取牛源大肠杆菌内毒素方法的比较研究

对提取牛源大肠杆菌内毒素粗制品的两种方法进行了比较,为获得含量较高的牛源大肠杆菌内毒素免疫原提供了简便方法和切实可靠的理论依据。实验采用热酚-水法和酚-氯仿-石油醚法提取牛源大肠杆菌内毒素,鲎试剂凝集活性和终点显色法测定热酚-水法提取内毒素粗制品含量约为0．16EU／ng。酚-氯仿-石油醚法提取内毒素粗制品含量约为0．31EU／ng。实验结果表明：酚-氯仿-石油醚法提取的内毒素含量比热酚-水法高,此法不需要透析袋透析,因此更适用于内毒素的大量提取。     

不同方法提取水溞基因组DNA的比较

为获取抽提水溞基因组DNA的最适方法,本研究采用酚-氯仿法,CTAB法和试剂盒法3种方法提取水溞基因组DNA,并用琼脂糖凝胶电泳检测DNA提取的效果.结果表明3种DNA提取方法均获得较好的DNA,其中试剂盒方法提取的DNA最为理想,完全可满足后续分子生物学实验.     

山药总RNA不同提取方法的比较研究

为提取高质量的山药总RNA,以铁棍山药茎段为材料,采用Trizol法、RNAiso for Polysacchariderich Plant Tissue法、改良CTAB法和试剂盒法提取总RNA,利用琼脂糖凝胶电泳分析所提取RNA的完整性,并用超微量分光光度计分析RNA的纯度.结果显示采用Trizol法难以提RNA,RNAiso for Polysacchariderich Plant Tissue法提取效果不理想,存在DNA和蛋白质污染,而用改良CTAB法和试剂盒法提取到的总RNA纯度高、完整性好,其中,改良CTAB法较试剂盒法价格便宜,但提取过程较烦琐.因此,应根据实验需要选择CTAB法或试剂盒法提取铁棍山药总RNA.本结果对其他品种山药或富含多糖多酚类物质植物的RNA的提取也具有一定借鉴意义.     

血清miRNA提取方法的优化

利用正交试验法优化血清miRNA的提取方法,为进一步研究血清miRNA作为生物标记物提供方法学基础.本文以hsa-miRNA-223-3p,hsa-miRNA-483-5p和hsa-miRNA-16为检测目标,通过比较Trizol法和Trizol+酚/氯仿法的miRNA提取效率和qPCR检测结果,应用正交试验选择出最优实验方案.结果表明血清miRNA的最优提取方法为:血清用DEPC水4倍稀释,离心条件为4℃,12 000r·min-1,离心时间为10min,Trizol法提取.     

碘化钠法提取牦牛基因组DNA的研究

目的,应用碘化钠法从牦牛全血中快速提取基因组DNA,并检验其效果.方法,使用碘化钠裂解血细胞,氯仿-异戊醇抽提DNA,乙醇沉淀DNA,紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳测定DNA的浓度和纯度.结果,提取DNA纯度的平均值1.58,浓度的平均值58.6 ng/μL,分子量大约23 kb,无RNA污染.结论,NaI法操作方便,所需设备简单,可从牦牛全血中快速抽提得到基因组DNA,但提取DNA的纯度偏低.     

角倍蚜总RNA提取方法的比较及优化

采用Trizol法及试剂盒柱提法提取角倍蚜若虫及成虫总RNA,通过紫外分光光度法(OD260/OD280、OD260/OD230)及琼脂糖凝胶电泳检测,对所提取RNA的纯度、浓度及完整性进行了分析.结果表明,采用常规样品量两种方法提取的RNA均降解严重,分析认为角倍蚜富含内源性RNase.通过大幅降低样品量,优化提取步骤,缩短提取时间,有效消除了RNA降解现象.采用Trizol法获得了纯度高、完整性好的RNA样品,电泳显示清晰的28S、18S及5S三条带;试剂盒柱提法获得的RNA呈现较为特殊的带型,没有常规的5S条带,而在750bp～1 000bp之间有一明显条带.     

3种提取淡水涡虫基因组DNA方法比较

分别用试剂盒法、改良的CTAB法、改良的酚-氯仿抽提法提取活体涡虫和95%酒精固定的涡虫标本的基因组DNA.结果显示:试剂盒法提取的基因组DNA质量最好,主要表现在分子完整,几乎无降解,并且该方法所得DNA的产率也比另外两种方法的产率要高,试剂盒法是最适合涡虫基因组DNA制备的方法.相同起始物质量条件下,3种方法从活体涡虫中提取的DNA量和纯度均高于95%酒精固定的涡虫标本,但试剂盒法提取95%酒精固定半年以上的涡虫标本,所得DNA产率较高、质量较好,可满足PCR扩增等分子生物学实验的要求.     

萝卜叶片总RNA提取方法比较

获得高质量的RNA是进行RNA相关分子生物学实验和研究的前提.尽管目前已建立了多种真核生物总RNA的提取方法,但这些方法是否适用于提取萝卜(Raphanus sativus L.Var.radiculus Pers.)的总RNA还不清楚.本研究分别采用Trizol法、改进的异硫氰酸胍法和改进的SDS--酸酚法提取萝卜叶片总RNA,并通过分析所得RNA的电泳图谱、得率和纯度来判断这三种方法的优劣, 确定了提取满身红萝卜总RNA的最适方法.实验结果表明,Trizol法和改进SDS酸酚法提取的总RNA中蛋白质和DNA污染比较严重,不能用于下一步实验;而改进的异硫氰酸胍法提取的总RNA得率高、纯度高、完整性好、少降解,完全适合用于Northern blotting,小RNA分离、cDNA文库的构建等分子生物学实验.     

不同方法提取鳗鲡病原茵DNA模板的差异分析

利用吸光值、琼脂糖电泳及PCR差异扩增等指标,对酚一氯仿法、水煮法、碱裂解法3种方法制备的鳗鲡病原菌DNA模板进行了差异分析．结果表明：1）不同方法提取的病原菌模板DNA的浓度、纯度及分子质量大小存在差异,但以这3种方法提取的病原菌DNA为模板,均能成功扩增到细菌16SrD．NA和外膜蛋白的保守序列．其中,酚一氯仿提取的模板DNA浓度较低、纯度较高;水煮法和碱裂解法提取的模板DNA浓度较高、纯度较低．2）电泳显示,3种方法获得的模板DNA扩增出的16SrDNA保守序列条带均一,没有显著差异,但在外膜蛋白保守序列的扩增中却因菌种和模板提取方法的不同而存在差异．     

免疫核糖核酸作用机制的研究──免疫核糖核酸传递抗绵羊红血球免疫力

本文用热酚法从 ＳＲＢＣ致敏的豚鼠的牌和淋巴结提取了免疫核糖核酸（简称ｉＲＮＡ）。该ｉＲＮＡ能够传递抗ＳＲＢＣ的体液免疫反应。核糖核酸酶能破坏其活性，但蛋白酶和脱氧核糖核酸酶对其活性没有影响。用抗 ＳＲＢＣ的 ｉＲＮＡ和抗 ＣＲＢＣ（鸡红血球）的 ｉＲＮＡ的实验表明，ｉＲＮＡ的免疫功能传递作用既有抗原特异性也有非抗原特异性。对ｉＲＮＡ作用的特异性进行了讨论。     

油页岩微生物总DNA的提取方法

为建立油页岩微生物总DNA提取方法,以两矿区的6个样品为材料,采用SDS高盐、SDS液氮研磨、SDS反复冻融、SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法分别对总DNA进行提取.结果表明,各方法提取效果差异很大,改进的SDS高盐提取法效果最好,各样品均得到约23kb较完整片段,且产率显著高于其他方法,达9144~38685ng·g-1干样;以未纯化的DNA为模板,对16SrDNA进行PCR-DGGE,得到了相应的扩增产物及DGGE指纹图谱,说明该法适合油页岩样品.SDS液氮研磨和SDS反复冻融提取法仅能得到部分样品总DNA,且产率和纯度较低,而SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法无DNA提出,不适合此类样品.     

三种血液基因组 DNA 提取方法的比较研究

摘要: 目的 比较采用 3 种不同 DNA 提取方法提取豚鼠血液基因组 DNA 之间的差异。方法 分别用新鲜抗凝血 NaI 手提法、血凝块手提法和试剂盒 DNA 提取法提取 20 只豚鼠血液基因组 DNA,用分光光度计测定、琼脂糖凝胶 电泳、PCR 扩增等方法对提取的 DNA 片段的完整性、浓度、纯度和用于 PCR 扩增的效果等方面进行比较研究。结 果 新鲜抗凝血 NaI 手提法提取的 DNA 完整性、浓度和纯度均为最高; 血凝块法提取的 DNA 浓度和抗凝血提取的 DNA 浓度接近但纯度最低,有一定程度的断裂和降解; 试剂盒法提取的 DNA 浓度最低,纯度和完整性处于中间,但 三种方法提取的 DNA 都可用于 PCR 扩增反应。结论 3 种方法都可以提取基因组 DNA 并且所提取的 DNA 均能 满足后续 PCR 扩增实验的要求,但每种方法各有利弊,可根据具体的条件选择适宜的方法。     

H5亚型禽流感病毒HA基因昆虫/杆状病毒系统的表达及对BALB/c小鼠的免疫保护

经RT-PCR扩增了禽流感病毒A/Goose/Guangdong/1／96 H5N1亚型1．7kb HA基因的cDNA,将其克隆到pMD18-T中并测序。亚克隆到杆状病毒转移载体pMelBacA的蜜蜂蜂毒素分泌信号下游中,测序正确后与线性化的杆状病毒DNA(Bac-N-BlueTM DNA)共转染Sf9昆虫细胞。将重组杆状病毒感染HFive细胞,72h左右收获细胞,超声波裂解,SDS—PAGE结果表明HA基因在重组杆状病毒感染的HFive细胞中获得表达。蛋白胶薄层扫描分析显示:表达的HA蛋白占重组杆状病毒感染细胞总蛋白含量的17．1％。Western-blot 及血凝实验结果显示,表达的禽流感H5N1亚型病毒HA蛋白具有生物学活性。表达的H5 HA蛋白定量乳化后,皮下多点注射免疫SPF 级BALB/c雌性小鼠,免疫后产生了H5 HA特异抗体,并在三免前后达到并保持较高水平。用致死剂量的HPAIV H5N1攻击小鼠,免疫组小鼠提供了100％的保护力,而对照组小鼠先后发病且死亡:为研制禽流感H5N1亚型病毒亚单位疫苗,防制禽流感奠定了基础。     

山葵中异硫氰酸酯的提取及其对流感病毒的作用

为了开发山葵的药用价值,采用萃取和蒸溜方法,提取山葵中有效成分异硫氰酸酯,把提取的异硫氰酸酯用血凝试验法和动物试验法对流感病毒的作用进行了试验,以弄清楚山葵中异硫氰酸酯的含量及其作用.研究结果表明,山葵中异硫氰酸酯含量为:须根中0.53mol·mL-1,根茎中0.80mol·mL-1,叶柄中0.27mol·mL-1.山葵中异硫氰酸酯对流感病毒有明显的杀效果,异硫氰酸酯和病毒的比例为0.15mL+0.05mL处理病毒90min,使病毒完全失去活性,不会再引起疾病.这为山葵中异硫氰酸酯的提取及其药用价值提供了科学依据.     

北沙参免疫活性多糖制备方法研究

为了确定北沙参免疫活性多糖的最佳制备方法,采用4种方法制备北沙参多糖样品,并进行体外小鼠脾淋巴细胞增殖实验,对各样品进行免疫活性比较。以提取率及体外小鼠脾淋巴细胞增殖率为指标,分析95%乙醇回流除去小分子、除蛋白及不同浓度醇沉等步骤的必要性,确定北沙参免疫活性多糖最佳制备方法。通过提取率及体外小鼠脾淋巴细胞增殖率比较,经沸水提取、浓缩和干燥后获得的北沙参免疫活性多糖样品提取率最高,达33.15%;且该样品对小鼠脾淋巴细胞的增殖作用最强,在62.5 μg/mL浓度下增殖率达到33.93%。结果显示北沙参免疫活性多糖的最佳制备方法为沸水提取、浓缩并干燥即可,无需进行95%乙醇回流除去小分子、除蛋白及不同浓度醇沉等步骤。     

禽流感与人禽流感

根据禽流感病毒的病原学特点，综述了禽流感和人禽流感流行病学的特征、人禽流感的临床表现和诊断与防治等要点：分析结果表明，禽流感和人禽流感虽对人类的危害较大，但科学地对待是可有效预防的。     

纳米铝佐剂诱导鸡提前产生抗AIVH9体液免疫应答

接种灭活油佐剂疫苗是目前国内防控禽流感主要的措施,为有效防控禽流感的流行发挥了重要的作用,但灭活苗首次接种后需要较长时间抗体才能达到有效保护水平.纳米颗粒具有独特的生物学特性,作为疫苗佐剂能引起机体强烈的免疫应答.本研究用纳米铝颗粒作为AIV H9的佐剂,结果显示,小鸡产生有效免疫保护抗体时间较常规油佐剂疫苗提前4天且无副反应,但抗体峰值和持续时间均低于油佐剂疫苗.氢氧化铝纳米颗粒作为佐剂可能对禽流感等重大传染病的紧急预防接种具有潜在的应用价值.     

Molecular patterns of avian influenza A viruses

Avian influenza A viruses could get across the species barrier and be fatal to humans. Highly pathogenic avian influenza H5N1 virus was an example. The mechanism of interspecies transmission is not clear as yet. In this research, the protein sequences of 237 influenza A viruses with different subtypes were transformed into pseudo-signals. The energy features were extracted by the method of wavelet packet decomposition and used for virus classification by the method of hierarchical clustering. The clustering results showed that five patterns existed in avian influenza A viruses, which associated with the phenotype of interspecies transmission, and that avian viruses with patterns C and E could across species barrier and those with patterns A, B and D might not have the abilities. The results could be used to construct an early warning system to predict the transmissibility of avian influenza A viruses to humans.     

Genomic analysis of increased host immune and cell death responses induced by 1918 influenza virus

The influenza pandemic of 1918-19 was responsible for about 50 million deaths worldwide. Modern histopathological analysis of autopsy samples from human influenza cases from 1918 revealed significant damage to the lungs with acute, focal bronchitis and alveolitis associated with massive pulmonary oedema, haemorrhage and rapid destruction of the respiratory epithelium. The contribution of the host immune response leading to this severe pathology remains largely unknown. Here we show, in a comprehensive analysis of the global host response induced by the 1918 influenza virus, that mice infected with the reconstructed 1918 influenza virus displayed an increased and accelerated activation of host immune response genes associated with severe pulmonary pathology. We found that mice infected with a virus containing all eight genes from the pandemic virus showed marked activation of pro-inflammatory and cell-death pathways by 24 h after infection that remained unabated until death on day 5. This was in contrast with smaller host immune responses as measured at the genomic level, accompanied by less severe disease pathology and delays in death in mice infected with influenza viruses containing only subsets of 1918 genes. The results indicate a cooperative interaction between the 1918 influenza genes and show that study of the virulence of the 1918 influenza virus requires the use of the fully reconstructed virus. With recent concerns about the introduction of highly pathogenic avian influenza viruses into humans and their potential to cause a worldwide pandemic with disastrous health and economic consequences, a comprehensive understanding of the global host response to the 1918 virus is crucial. Moreover, understanding the contribution of host immune responses to virulent influenza virus infections is an important starting point for the identification of prognostic indicators and the development of novel antiviral therapies.