HBK - SPF 鸭 MHC I 区域微卫星标记分析

摘要: 禽主要组织相容性复合体是一组紧密连锁高度多态的基因群,与免疫反应或敏感性密切相关,鸭 MHC I 区域全长 36. 8 kb,由 TAP1、TAP2 和 5 个 MHC I 拷贝基因( UAA-UEA) 组成。HBK-SPF 鸭是中国农业科学院哈尔滨兽医研究所培育的无特定病原体种鸭,分为 B 和 Q 2 个品系,已封闭繁育了 7 个世代。本文在鸭 MHC I 区域筛选了 4个微卫星位点,通过单链构象多态性分析和聚合酶链式反应直接测序,发现 A 位点具有多态性,为( GT) n 的重复结构,第 6 代 HBK-B 和 HBK-Q 的31 个个体和第 7 代 的140 个个体进行聚合酶链式反应,结果直接测序,在重复结构之前的 108bp 中,发现了 4 种纯合单倍型和 6 种杂合单倍型; B 位点未得到目的产物; C 位点位于 MHC I 拷贝基因UDA 和 UEA 之间,扩增结果与 UAA 和 UBA 之间序列高度同源,无法判断基因型; D 位点表现为单态,为( ATA) 15的固定重复结构。本研究为进一步研究鸭 MHC I 基因结构和建立家系提供了依据。     

鸭不同MHC单倍型对禽流感重组疫苗免疫效果的影响

目的不同品系的鸭对禽流感(AI)疫苗诱导的效价有差异,分析这种差异是否与主要组织相容性复合体(MHC)有关。方法用表达H5亚型禽流感HA基因重组鸭瘟活载体疫苗免疫抗原提呈相关转运体TAP基因等位基因型不同的4种SPF鸭,比较其血清HI动态变化。结果免疫后连续观察的9周中,B3群SPF鸭HI抗体效价始终显著高于另外3个群。结论鸭的不同MHC单倍型可能与AI疫苗的不同免疫效力相关。     

无特定病原体麻鸭种群的建立

目的 建立无特定病原体麻鸭种群。方法 以优质培育品种绍兴麻鸭白壳I号和金定鸭种卵为基础,通过疫病监测淘汰抗体抗原阳性个体、灭活疫苗免疫、整个生命周期应用鸭正压隔离器饲养、60Co射线辐照饲料、酸化饮用水、严格控制人流、物流等净化措施,同时开展了多种分子遗传学检测、生物学特性数据测定和疫病敏感性试验,以实现实验动物化。结果 成功建立了无特定病原、遗传学背景清晰、疫病敏感的HBK-SPF和SPF-JD鸭种群。结论 SPF麻鸭种群丰富了我国实验动物资源,为生命科学研究和生物制品研发提供了重要条件支撑。     

川渝黔地区山羊起源于A和B两母系遗传谱系

本研究旨在从DNA水平揭示四川、重庆和贵州地区山羊的母系起源和群体遗传特征.通过对川渝黔地区13个山羊品种(类群)共152个体或序列mtDNA D-loop高变区HVI片段(481 bp)变异的分析,结合13个山羊参考序列(分属于A、B、C、D、F和G单倍群)构建系统进化树和单倍型网络分析以及不同单倍群群体扩张分析,结果表明:152只山羊mtDNA DloopHVI序列被类聚为A和B两个单倍群,其中单倍群B又分化为B1和B2两亚单倍群.从2种单倍群的地理分布特征可以发现,北川白山羊和阿坝藏山羊全部属于单倍群A,而其他山羊品种中单倍群A和B具有不同的分布频率.归并于A和B两个谱系的山羊并没有历经种群扩张.结果提示,川渝黔地区山羊可能起源于A和B两母系遗传谱系,而谱系B虽然分化为B1和B2两支系,但均未历经种群扩张.     

抗原处理相关转运体( TAP) 的结构和功能研究进展

摘要: 抗原处理相关转运体( TAP) 属于 ABC( ATP-binding cassette) 转运体超家族的 B 亚家族,是由主要组织相容性 复合体( Major histocompatibility complex ,MHC) 上 2 个紧密连锁的基因 TAP1 和 TAP2 编码蛋白组成的异二聚体,位 于内质网和顺式高尔基膜上,功能是将抗原肽从细胞质转运进入内质网池,组装到 MHC I 类分子上构成复合体。 TAP 蛋白的缺乏和突变会影响抗原肽的提呈,最终损害免疫应答功能。     

中国恒河猴MHC Ⅰ型部分等位基因的分析

目的对中国恒河猴主要组织相容性复合体（MHC）I型部分基因进行携带情况调查与分析。方法采用序列特异性引物（PCR-SSP）分型方法对华南灵长类动物研究中心繁殖的30只谱系清晰的中国恒河猴（Macacamulatta）的32个MHC I型分子位点进行检测。结果采用的32对引物中,中国恒河猴可检出携带23个MHC I等位基因,但基因携带频率存在很大的差异,由3.57%至82.14%不等。结合遗传谱系分析,判断A1＊21和A2＊05之间以及B＊04和B＊30之间可能就是连锁的。结论中国恒河猴携带能控制病毒复制的MHC I型基因位点的频率较高,其基因携带频率与已发表的印度恒河猴携带频率存在明显差异。本研究为促进中国恒河猴在AIDS研究中的应用,以及为建立携带特定MHC I基因实验猴小种群提供了依据。     

等边浅蛤(Gomphina aequilatera)核糖体DNA第一内转录间隔区序列的特征分析

从浙江和福建沿海潮间带的6个采样点各随机选取2个等边浅蛤(Gomphina aequilatera)样品,以聚合酶链式反应、分子克隆和序列测定等分子生物学实验技术获得了ITS-1序列.通过比对发现,该序列内存在一个长度为17 bp的插入/缺失片段和一个结构为(GA)3(GGGA)2(GA)4~6的微卫星DNA,这2个结构是造成等边浅蛤ITS-1序列在个体基因组内及个体之间长度变化的主要原因.统计分析结果显示,该序列在个体基因组内的变异与相同采样点个体之间的变异无显著差异(P>0.05),而与不同采样点个体之间的变异差异显著(P<0.05),因此在种群水平的研究中是有效的分子标记.系统发生关系重建的结果和单倍型网络结构图均显示等边浅蛤的ITS-1序列各单倍型间的亲缘关系较近.     

白鹭MHCⅡDABⅠ基因第二外显子的多态性与进化

克隆测序白鹭(Egretta garzetta)5个种群138份个体组织样本的主要组织相容性复合体Ⅱ类B基因(MHCⅡDABⅠ)第二外显子(exon2)序列,分析探讨exon2的多态性、进化选择、系统关系和种群遗传结构.主要结果如下:白鹭MHCⅡDABⅠexon2序列长度为270bp,共计定义了139个等位基因;序列分析显示exon2有101个核苷酸变异位点(37.4%)和31个氨基酸变异位点(34.4%);基于贝叶斯法构建的系统树显示白鹭MHCⅡDABⅠexon2有5个高支持率的谱系;肽结合位点(PBR)、非肽结合位点(non-PBR)的非同义替换率(dN)和同义替换率(dS)比值计算显示,PBR的dN/dS为1.99(p0.05),而non-PBR的dN/dS则略小于1(p0.05),表明白鹭MHCⅡDABⅠexon2受到正选择作用;根据等位基因在群体中的分布频率作分子方差分析(AMOVA),得到群体间分化指数(FST)为0.194 1(p0.000 1),提示白鹭MHCⅡDABⅠexon2存在显著的种群遗传结构分化.     

基于cytb基因分析建昌马和安宁果下马的遗传多样性和起源进化

为探索建昌马和安宁果下马的遗传多样性和亲缘关系,试验从建昌马(n =40)和安宁果下马(n =4)的抗凝全血中提取基因组DNA,用PCR扩增线粒体DNA cytb基因全序列并直接测序.结果显示,在44匹马中检测到cytb基因的45个变异位点并鉴定出20种单倍型,其中H1为优势单倍型;建昌马的单倍型多样性(Hd)、核苷酸...     

JAK2基因单倍型46/1对中国人群骨髓增殖性肿瘤易感性的影响

从91例骨髓增殖性肿瘤(MPNs)患者及1 028例健康志愿者(均为中国人)外周血中提取基因组DNA,应用等位基因特异性PCR(ASP)技术,检测作为蛋白质酪氨酸激酶JAK2单倍型46/1标签的rs12343867和rs10974944位点的基因型,并结合临床资料,应用SNPstats软件进行统计学分析.实验结果表明:MPNs患者JAK2单倍型46/1出现的几率明显高于健康志愿者(P0.000 1);MPNs患者的JAK2单倍型46/1更易在JAK2V617F突变阳性MPNs患者(n=70)中出现(P0.000 1);具有JAK2单倍型46/1的中国人群患MPNs的风险增加显著,该结果与测试欧美人群的结果一致.     

我国部分家鸭和野鸭遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析

利用AFLP技术分析我国8种常见家鸭和2种野鸭基因组DNA的多态性，在选取的17对引物中，有9对能得到重复性好的多态性扩增条带．每对引物扩增带数在44-83之间．共得到513个标记位点，其中498个为多态位点，多态位点比率达97．1％；根据AFLP图谱计算了不同样品间的遗传距离（D）和相似性系数（GS）．家鸭品种间的遗传距离在0．331～0．589范围内，绿头鸭、斑嘴鸭与家鸭品种（系）间的遗传距离分别在0．298～0．520和0．316～0．522之间．方差分析表明两组数据不存在显著差异（p〉0．05），由此得知绿头鸭和斑嘴鸭在家鸭品种的形成过程中都作出了贡献．并根据D值绘制了它们的聚类图谱．     

STR扫描技术对融水小型猪群体遗传结构的分析*

目的 应用STR扫描技术分析融水小型猪群体的遗传结构。方法 选用北京市地方标准封闭群实验用小型猪的遗传质量监测提供的25个微卫星位点对广东省医学实验动物中心小型猪研究基地F1代30头融水小型猪基因组DNA进行PCR扩增,对扩增产物进行STR扫描,运用popgene32软件对该融水小型猪进行群体遗传结构分析。结果 融水小型猪F1群体平均观测等位基因数为9.4400,平均有效等位基因数为5.2966,平均香隆指数为1.8085,平均有效杂合度为0.7737。结论 STR扫描技术适用于融水小型猪群体遗传结构分析;初步掌握了融水小型猪遗传结构。     

仙湖3号鸭与同类型肉鸭的对比

仙湖 3号鸭在品系选育至第五世代时 ,以 A,B两系的正反杂交 AB鸭及 BA鸭与国内外同类型商品肉鸭进行对比试验。结果表明 :仙湖 3号商品肉鸭在生长速度、料肉比、胸腿肌率等方面的性能已接近或达到了国内外同类型商品肉鸭的先进水平     

高免蛋黄抗体中和雏鸭肝炎病毒(DHV)的效价测定

用鸭胚测定半数致死量并进行中和试验，测定了用雏鸭肝炎病毒(Ⅰ型)免疫蛋鸭收获的鸭蛋所制成的蛋黄抗体的滴度．结果表明，雏鸭肝炎病毒(Ⅰ型)的半数致死量为3．50，该毒株的高免蛋黄抗体以1：532稀释可保护50％的鸭胚免于死亡；病毒对照组全部死亡；空白对照组全部存活．该雏鸭病毒性肝炎高免蛋黄抗体滴度较高，可用于预防和治疗雏鸭病毒性肝炎。     

Isolation and polymorphic frequency detection of a novel STR on human chromosome 14q24.3

A single copy fragment (FD14-ca 1) cantaining 22 CA repetitive units was isolated with (CA)₁₅ oligonucleotide probe from a human chromosome 14q24.3 probe pool generated by microdissection, and proved to be a new short tandem repeat (STR) sequence through querying in GenBank of NCBI. The STR has 11 alleles in Chinese. and its polymorphic information content (PIC) is 0.85. Mendelian segregation was shown in 2 Chinese pedigrees with two generations; This STR has been accurately relocalized on chromosome 14q24.3 by fluorescencein situ hybridization (FISH). The accession numbers of this STR in GDB and Gnknk database are D14S1435 and G31413 respectively. This STR would be able to be regarded as a novel genetic marker which can increase the genetic map accuracy in this chromosome region and improve the gene diagnosis on some genetic diseases located in chromosome 14q24.3 band.     

Localization of type 1 diabetes susceptibility to the MHC class I genes HLA-B and HLA-A

The major histocompatibility complex (MHC) on chromosome 6 is associated with susceptibility to more common diseases than any other region of the human genome, including almost all disorders classified as autoimmune. In type 1 diabetes the major genetic susceptibility determinants have been mapped to the MHC class II genes HLA-DQB1 and HLA-DRB1 (refs 1-3), but these genes cannot completely explain the association between type 1 diabetes and the MHC region. Owing to the region's extreme gene density, the multiplicity of disease-associated alleles, strong associations between alleles, limited genotyping capability, and inadequate statistical approaches and sample sizes, which, and how many, loci within the MHC determine susceptibility remains unclear. Here, in several large type 1 diabetes data sets, we analyse a combined total of 1,729 polymorphisms, and apply statistical methods-recursive partitioning and regression-to pinpoint disease susceptibility to the MHC class I genes HLA-B and HLA-A (risk ratios >1.5; P(combined) = 2.01 x 10(-19) and 2.35 x 10(-13), respectively) in addition to the established associations of the MHC class II genes. Other loci with smaller and/or rarer effects might also be involved, but to find these, future searches must take into account both the HLA class II and class I genes and use even larger samples. Taken together with previous studies, we conclude that MHC-class-I-mediated events, principally involving HLA-B*39, contribute to the aetiology of type 1 diabetes.     

褪黑激素被动免疫对母鸭卵泡发育和垂体激素水平的影响

在秋冬光照变短季节,选择产蛋量已下降的68周龄仙湖三号母鸭30只,随机分成三组。试验组用效价为1∶3200的兔化褪黑激素血清抗体进行被动免疫,对照组用正常兔血清进行被动免疫。在第三次免疫3h后每组随机选择6只母鸭采集血液,每隔4h采血1次,血样采用化学发光定量免疫分析测定血浆中的FSH,LH的含量,采完血后剖检卵巢,对卵泡进行分级计数。结果表明,经过三次免疫,可提高FSH水平(P>0.05),但对卵泡发育的影响差异不显著。提示在短日照下通过被动免疫可中和母鸭体内MLT,增加母鸭垂体激素水平,对母鸭生殖机能具有一定的激发作用。     

Gln 对鸭瘟感染鸭十二指肠免疫调节相关基因表达量的影响

摘要: 目的 为谷氨酰胺( Glutamine,Gln) 在正常鸭及鸭瘟( Duck plague,DP) 模型中对肠道功能及作用途径的研究提供依据。方法 280 只无特定病原体( Specific pathogen free,SPF) 7 日龄雏鸭随机分为 8 组,四组梯度剂量每天灌喂 Gln( 0、0. 5、1、2 g / kg 饲 料) 6d,及另四组灌喂同等梯度剂量 Gln 6 d,于 第 一 天 灌 喂 30 min 后 攻 0. 2 mL2000TCID50 鸭瘟病毒,观察 Gln 对正常雏鸭的免疫促进作用及攻毒鸭免疫应激的缓解作用。测定 Toll 样受体 4( Toll-like receptor 4,TLＲ4) 通路基因表达量。结果 Gln 显著提高正常组 TLＲ4 通路 mＲNA 表达量( P ＜ 0. 05) ,显著降低攻毒组表达量( P ＜ 0. 05) 。结论 Gln 通过 TLＲ4 通路提高正常雏鸭肠道的免疫力,降低鸭瘟病毒( Duck plague virus,DPV) 造成的肠道免疫损伤。