基于微卫星的喀斯特地区长梗吊石苣苔和吊石苣苔的遗传多样性研究

长梗吊石苣苔Lysionotus longipedunculatus (W.T. Wang) W.T. Wang是我国吊石苣苔属中的一个比较罕见的物种,目前濒危等级被评估为极危CR Blac (ⅰ,ⅱ,ⅴ),而同属的吊石苣苔L. pauciflorus Maxim.分布范围非常广泛、生境变化多样,濒危等级为无危LC。本研究通过筛选出16个微卫星位点对长梗吊石苣苔的两个居群进行遗传多样性研究,并对比相近地区的吊石苣苔居群,比较研究导致长梗吊石苣苔濒危的原因。结果显示二者的遗传多样性都比较低,有较高自交现象,但吊石苣苔具有明显的走茎,可以有效地克隆繁殖,相较之下,长梗吊石苣苔较弱的克隆繁殖能力可能是导致其濒危的原因之一。     

基于微卫星标记的中华蜜蜂5个自然群体遗传多样性分析

【目的】分析中国四川阿坝、黄土高原、海南岛、浙闽丘陵、滇南地区等地的中华蜜蜂(Apis cerana cerana)自然群体遗传多样性。【方法】提取样品基因组DNA后进行PCR扩增,并用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。通过计算15对微卫星标记在5个中华蜜蜂自然群体中的等位基因数、多态信息含量、期望杂合度、观测杂合度、遗传距离、遗传相似系数和遗传分化系数,进而评估各中华蜜蜂种群遗传多样性和各种群间遗传分化。【结果】15个微卫星位点共检测到64个等位基因,每个位点的等位基因数平均为4.266 7个,单个位点的等位基因数为2～6个。各群体平均等位基因数为2.6～3.066 7个,平均观测杂合度为0.550 3～0.664 3,平均期望杂合度为0.524 4～0.566 7,平均多态信息量为0.410 3～0.492 7。四川阿坝群体与黄土高原、海南岛、浙闽丘陵、滇南地区等地群体在Acc001,Acc096,Acc131等3个位点上存在明显分化;黄土高原群体与海南岛、浙闽丘陵、滇南地区等地群体在Acc114,Acc121,Acc132等3个位点上表现出一定程度的遗传分化;海南岛群体与浙闽丘陵、滇南地区两地群体在Acc001,Acc002,Acc004,Acc131,Acc132等5个位点上均表现出较强的遗传分化;浙闽丘陵与滇南地区群体间在Acc002,Acc121,Acc131等3个位点上遗传分化极明显。5个中华蜜蜂自然群体之间的遗传距离在0.160 1～0.491 0之间。【结论】5个中华蜜蜂群体遗传多样性丰富,群体间遗传分化明显。     

用微卫星技术研究珠江流域三个野生大眼鳜群体的遗传多样性

采用微卫星标记技术,探讨了广西右江、左江及红水河三江段野生大眼鳜群体的遗传多样性。采用生物信息学方法,自主开发了4对大眼鳜微卫星DNA引物,此外,还从28对鳜属微卫星通用引物中筛选出15对,19对标记均表现为高度多态性。对32尾右江(YJ)、35尾左江(ZJ)及36尾红水河(HSH)三地理群体野生大眼鳜进行遗传多样性分析,总群体的固定指数Fix范围为0.001 4~1.000,表明19个位点在总群体内表现为杂合子缺失,其对环境的应对能力有所下降。遗传参数统计结果表明,总群体观测等位基因数(Na=19.4737)、香农指数(I=2.399 8)、平均杂合度(Ave Het=0.720 6)、多态信息含量(0.447PIC0.947)均显示:在哈温平衡下,大眼鳜3群体遗传多样性丰富;但3群体遗传多样性存在差异,红水河群体的遗传多样性比左江群体、右江群体的遗传多样性丰富,左江和右江群体的遗传多样性水平较为接近。群体间遗传分化水平较大(0.15群体间近交系数Fst=0.153 90.25),15.39%的遗传变异来自于群体间,84.61%的遗传变异来自于群体内,群体内近交系数Fis为0.576 1,各座位的基因流Nm分布范围较广(0.147 4~8.909 1),平均Nm值为1.374 5,表明3群体间属于中等遗传分化水平,基因流基本顺畅,群体内的近交系数较高,容易引起遗传结构的变化。基于Nei's遗传距离的聚类分析显示左江群体与右江群体首先聚为一支,再与红水河聚为一支,符合其在地理位置上的关系。     

微卫星标记技术在水稻抗病育种中的应用

介绍了微卫星标记在水稻抗病育种中的应用研究进展，分析了目前微卫星标记在应用中所存在的问题，提出相应的解决方法，以期推动该技术在抗病育种研究中的应用，从而加速育种进程。     

Evaluation of genetic diversity and relationships within and between two breeds of duck based on microsatellite markers

The genetic diversity of two natural populations (M, N) of Beijing duck (Anas platyrhynchos) and 11 artificially selected lines of Beijing duck (A, B, E-L, O) from China Gold Star Duck Production Ltd., along with two Cherry Valley duck lines (C and D) from the British Cherry Valley Livestock Division, was evaluated using 18 microsatellite markers covering 16 linkage groups. A phylogenetic tree of the 15 populations of duck, formed of four main branches, was constructed from Nei’s D_A genetic distance. The mean genetic differentiation index (F_ST) in all loci, Nei’s standard genetic distance (Ds), and the genetic distance D_A between the Beijing duck and the Cherry Valley duck were 0.075, 0.143 and 0.142, respectively. These results demonstrated a high degree of genetic similarity between the two breeds and supported the hypothesis that the Cherry Valley duck was derived from the Beijing duck. The F_ST matrix of seven clusters of Beijing duck suggested that the efficiency of selection was not significant to some extent and should be supplemented by marker-assisted selection.     

微卫星DNA在高原型藏山羊亲子鉴定中的应用研究

用BL1038、BM4311、TGLA122、BM143、ILSTS018、OarHH35、BM720、D18S51、McM130和OarCP0034共10个SSR标记座位,对所选择的高原型藏山羊优秀个体及疑似父亲,共11只个体进行亲子鉴定．结果表明,10个分子标记遗传多态性好,累计鉴别力（CDP）为0．999996,复合SSR位点的累计鉴别力（CDP）〉0．99999,累计非父排除率（CPE）为0．998030．鉴定出公羊48号、69号和14号分别是所选择的优秀个体66号、40号和36号的真实父亲．     

封闭群实验用小型猪遗传标准的建立

目的建立封闭群实验用小型猪遗传质量标准和遗传质量检测方法。方法根据群体遗传学理论。参照实 验动物哺乳类实验动物的遗传质量控制(GB 14923-2001),在查阅大量文献资料的基础上,建立封闭群实验用小型 猪遗传标准。检测方法采用微卫星标记分析技术。从GeneBank中挑选出的100个猪微卫星位点进行PCR扩增和 条件优化,通过琼脂糖电泳、聚丙烯酰胺电泳和STR扫描三级筛选．根据位点在染色体分布情况和等位基因数目、 多态性等优化出适于封闭群实验用小型猪遗传检测的微卫星位点组合,建立检测方法。结果初步建立了封闭群 实验用小型猪遗传质量标准和检测方法。     

长白猪微卫星标记的遗传多样性

采用ESTMS20,SW2570和S0002等3个微卫星标记对长白猪进行了遗传多样性的研究。结果发现,3个卫星标记在长白猪中均具有多态性,遗传杂合度分别为0.69,0.70和0.41,多态信息含量分别为0.64,0.68和0.38。以上结果表明,这3个微卫星标记在长白猪群体中属于高度多态性座位,可以用于长白猪遗传多样性的评估。     

3个不同地理日本沼虾天然群体遗传多样性的SSR分析

利用11对微卫星引物对洞庭湖、鄱阳湖、龙感湖的日本沼虾天然群体进行遗传多样性的分析,评价不同地理日本沼虾天然群体的遗传多样性和遗传分化水平.在3个日本沼虾群体中共获得90个等位基因,各位点平均等位基因为8.182个,各群体的平均等位基因数在(A)32~38之间,平均多态信息含量(PIC)介于0.590 7~0.643 0,平均期望杂合度He为0.657 7~0.705 5、平均观测杂合度Ho为0.514 1~0.579 9.群体间各位点Shannon指数均大于1,Fis均为正值,群体间平均近交系数为19%,Fst值显示整个群体分化程度较低,其中遗传变异的5.38%存在于群体之间,94.62%存在于个体之间.结果表明:3个日本沼虾天然群体的遗传多样性较高,分化程度较低,其中鄱阳湖群体遗传多样性最丰富,遗传分化水平最低.     

微卫星分子标记快速鉴定杂交稻种子纯度技术

“微卫星分子标记快速鉴定杂交稻种子纯度技术研究”项目从1995年开始,通过课题组人员十多年来的潜心研究,建立了简单的DNA提取方法、适宜的SSR-PCR的基本操作程序和我国骨干杂交水稻组合的DNA指纹图谱;建立了一套准确、快速、简单、经济的用于杂交水稻品种真实性和纯度鉴定的标准体系,并开展了技术的应用推广。研制的单粒种子和幼苗的简单DNA提取方法,提取100个样品的处理时间只需2．5分钟,提取的DNA不降解,分子量较大,质量好。