生物信息数据库通用数据字典标准化研究

本文首先描述了生物信息学数据库的基本概念,详细分析了生物信息学数据库的产生背景、国内外现状,发展趋势和特点以及标准化的需求,阐述了生物信息数据库通用数据字典的一般内容、结构,功能和编制方法。并且通过对生物信息学的代表性数据库进行详细分析,提出了生物信息学数据库通用数据字典标准化研究的建议和方向。     

生物信息学中的计算智能

生物信息学作为一门利用计算手段来研究分子水平层面的生物学问题,采用了包括计算智能、应用数学、统计学、信息学和现代生物学等方法。目前主要的应用集中在序列分析、基因预测、基因组注释、蛋白质结构分析和预测、基因表达谱分析、蛋白质相互作用和进化模型等领域。计算智能包括神经网络、模糊系统、粗糙集、进化计算、群体智能、概率推理和多智能体系统等技术方法,它的发展趋势是整合不同的方法以达到一个协同的系统。     

埃博拉病毒病:病原学、致病机制、治疗与疫苗研究进展

2013年12月始,埃博拉病毒病在几内亚、利比里亚、塞拉利昂和尼日利亚4国暴发.其病原体——埃博拉病毒(Ebolavirus)于1976年被首次分离,为单股负链、不分节段、有囊膜的RNA病毒,属丝状病毒科,分5种,包括扎伊尔型、苏丹型、本迪布焦型、塔伊森林型和莱斯顿型.其基因顺序为3′端-NP-VP35-VP40-GP-VP30-VP24-L-5′端.埃博拉病毒属于A类病原,致病能力极强,操作活病毒需在生物安全4级实验室进行.其主要靶细胞是血管内皮细胞、肝细胞、巨噬细胞和树突状细胞等,通过抑制天然和获得性免疫应答反应,增加血管通透性,引起肝脏等多脏器损伤,引发发热、出血、多器官功能衰竭和休克等症状.目前尚无批准上市的特异治疗药物和疫苗,处于研发或临床试验阶段的治疗药物包括:(ⅰ)抗流感病毒药物T-705可能阻碍埃博拉病毒在细胞内增殖,从而遏制感染;(ⅱ)ZMapp包含3种人源化的单克隆抗体,属优化的鸡尾酒疗法;(ⅲ)基于RNA干扰的基因治疗药物TKM-Ebola;(ⅳ)凝血调节因子、炎性介质制剂,如源于丝虫的抗凝蛋白rNAPc2等.处于研发阶段的疫苗有:(ⅰ)复制缺陷型疫苗,安全性好,但诱导免疫的时间较长;(ⅱ)减毒复制型疫苗,效果好,但存在安全隐患.开展深入的病原学、免疫病理和致病机制研究,将有利于治疗药物和疫苗的研发.同时,应推进有希望的治疗方案和疫苗进入人体临床试验阶段.     

禽流感研究进展:迁徙鸟的作用与反向遗传技术的贡献

禽流感疫情在世界范围内的频繁暴发不仅给家禽业生产带来了巨大的损失,也给人类的生命安全造成了严重威胁。自2005年青海湖暴发大规模野生鸟类感染高致病性禽流感病毒事件以来,候鸟因作为传播病毒的“载体”而备受关注。与此同时,针对禽流感跨种间传播及致病机制、禽流感防治等研究也取得了重要进展。本文重点综述了候鸟的迁徙在禽流感传播中的作用以及反向遗传技术在禽流感研究中做出的重要贡献。     

动物源性流感病毒与人流感流行

2009年4月.北美地区发生了人感染H1N1"猪流感"疫情,并且疫情呈现暴发漫延的态势.全世界关注的目光继1997年H5N1禽流感病毒感染人事件首次在中国香港发生,以及2003年以来包括15个国家和地区多起H5N1禽流感病毒感染人事件之后,再次聚焦到动物源性流感病毒上.是否动物流感病毒已经具备了引起人类疫情暴发的能力?是否新的一场大的人流感疫情就要暴发?为什么世界卫生组织又于4月30日为本次"猪流感"更名为"甲型H1N1流感"?对于流感暴发脚步的逼近我们是否做好了准备?本文对历史上人流感疫情暴发情况,动物流感病毒感染人事件的发生情况和流行病学特点,以及人流感疫情发生与动物流感病毒之间的关系等进行了总结与分析,以期更好地了解流感病毒在不同宿主之间的传播,为更加从容地面对这场突如其来的疫情,以及为疫情的预防和控制提供理论指导.为了能够准确反映这次流感的情况和国际对流感及流感病毒的统一命名法则,以及更加清晰并易于理解地表述清楚.我们建议将这次流感称作"北美流感"或"墨西哥流感".     

埃博拉病毒病：流行病学、生态学、诊断、治疗及控制

 埃博拉病毒（Ebolavirus）是埃博拉病毒病（Ebola Virus Disease, EVD）的病原体,1976 年首次在非洲发现,目前确认该病毒包括5 个种,其中苏丹型（Sudan ebolavirus）、扎伊尔型（Zaire ebolavirus）、塔伊森林型（Taï Forest ebolavirus）和本迪布焦型（Bundibugyo ebolavirus）均有感染人发病的记录;莱斯顿型（Reston ebolavirus）可致人隐性感染,并与多起猕猴暴发疫情有关,曾在菲律宾的猪中检出。人类埃博拉病毒病的病死率为25%~90%,疫情均发生在非洲,主要集中在10°N-10°S 的非洲地区,本次西非疫情是规模最大的暴发流行,截至2014 年8 月20 日已报告2615 例病例。该病是动物源性传染病,目前证据支持果蝠可能为病毒的自然储存宿主。该病在人群中主要通过接触传播,有症状的病人才具有传染性。未采取正确防护措施的医护人员、家庭护理人员及接触病人血液、体液,或接触病人血液、体液等污染的物品,或接触病例尸体的人是高风险感染人群。本病起病急,早期表现为发热、厌食、虚弱无力等非特异性症状,可通过检测病毒核酸、抗原、抗体等方法确诊。目前尚无批准上市的特效药和疫苗,以对症和支持治疗为主。预防控制策略主要包括早期发现病例、及时调查处置、追踪和密切观察接触者,以及有效的医院内和社区的感染控制。