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1.
2813条全长人类新基因编码蛋白质的功能预测   总被引:5,自引:0,他引:5  
用生物信息学序列分析方法对联合基因科技(集团)公司2813条全长人类新基因编码的蛋白质进行了功能预测,由WU-BLASTP核酸 列相似性分析结果表明P值小于le-20的基因合计有466条,占总分析基因的16.57%,P值在le-10以下的基因合计有565条,占总分析基因的20.09%,由蛋白质结构域分析结果表明,含PROSITE Pattern的基因有520条,代表了107种pattern;含PROSITE profile的基因有333条,代表了200种profile;含PFAM结构域的基因有457条,代表了241个family; 含PRINTS的家族指纹1型(class1)的基因有128条,指纹2型(class2) 的有18条,总数为146条,代表了45种家族指纹,由特殊结构分析表明,跨膜蛋白470条,分泌蛋白677条,Coliled-coil蛋白228条,Helix-turn-helix蛋白73条。  相似文献   
2.
为了探讨枸杞多糖对D-半乳糖致亚急性衰老模型小鼠的药理作用,利用Illumina基因芯片研究使用枸杞多糖灌胃的衰老模型小鼠的基因差异表达情况.实验表明D-半乳糖诱导的亚急性衰老模型是可靠的衰老实验动物模型.通过分析找到了枸杞多糖在延缓衰老、抗氧化、降血糖、调节免疫、抗肿瘤、降血脂等方面有影响的相关基因.  相似文献   
3.
基因芯片技术对肿瘤基因组学的研究提供了一种高效的手段.采用基因芯片技术观察了14例初发急性髓系白血病患者12800条基因的表达谱,找到了一些和白血病发生有密切关系的基因.用表达谱的聚类方法分析难治性白血病的基因表达特征,发现一些与耐药相关的基因在难治性白血病人和易治性白血病人中表达有明显不同,证明难治性白血病与耐药有一定关系。  相似文献   
4.
在人类cDNA序列确定全长基因的过程中,必须判断第一个ATG密码子是真正的起始密码子还是框内的非起始作用的甲硫氨酸密码子,在总结了这二类密码子上下文共有序列特征,周期性,密码子的碱基偏向性,以及编码的氨基酸的疏水性等方面差异的基础上,从模式识别的角度出发,将这二类密码子视为由此构成的多维特征空间中的二个模式类,应用费歇线性判别法进行分类器的设计,并对分类器的错误率进行估计,表明在这些特征下,这二类密码子可以区分,以此分类器的判断真正的起始密码子和非起始甲硫氨酸密码子,其准确率可达75%。  相似文献   
5.
提出了一种新的基于非线性降维算法和统计形状比较的基因选取方法.该方法基于保持芯片数据结构的思想,消除了对于样本类信息的要求.在3组实际肿瘤芯片数据上的应用表明,新方法在维持数据结构和数据挖掘分析中都明显优于基于线性降维的选取方法.与其他成熟的基因选取方法在分类分析中的比较也证明了新方法的成功.  相似文献   
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