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水稻基因组序列中蕴藏着生理、遗传、发育、进化和与重要经济性状相关的许多生物学信息. 籼稻亚种Oryza Sativa ssp. indica在中国和亚洲其他地方广泛种植. 通过全基因组霰弹法, 得到了这一亚种的基因组框架序列. 共完成430万个成功反应, 总读长为2214.9 Mb, 其中籼稻亚种93-11的成功反应有330万个, 总读长1797.4 Mb, 初步拼接得到了409.76 Mb的非冗余序列, 大约覆盖了水稻全基因组的95.29%, 碱基准确率大于99%. 通过与公共数据库中籼稻indica和粳稻japonica亚种的BAC克隆比较, 证实了基因组框架图的覆盖率、序列分布的随机性和拼接软件BIG-ASSEMBLER的准确性. 在框架图中, 鉴定了96.3%的全长cDNA, 96.4%的遗传标记(STS, STR, RFLP), 94.0%的EST和94.9%的单基因簇(unigene). 初步分析表明, 该框架序列已经达到了国际同行所认同的标准. 框架图的公布无疑为水稻生物学研究提供了基因组学和遗传学方面的基本信息.  相似文献   
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高质量的BIBAC载体DNA的制备受到酶切、脱磷等许多因素的影响,是构建BIBAC文库的关键步骤之一.以BIBAC2载体为材料,对其进行了BamHI限制性酶切和CIAP脱磷,制备了可用于进一步构建文库的线性载体.在此基础上确定了适宜的酶量、酶切时间、脱磷酶的用量及失活等步骤的反应条件.  相似文献   
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自我调控延缓叶片衰老基因的亚克隆   总被引:2,自引:0,他引:2  
利用亚克隆技术和反筛选策略,将含有延缓叶片衰老基因的双元载体上的卡那霉素抗性植物筛选标记更换为适合于水稻遗传转化的潮霉素抗性标记,并对新构建物进行了酶切鉴定和接头序列分析。  相似文献   
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