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于军 胡松年 王俊 李松岗 王开书 刘斌 邓亚军 戴理 周雁 张秀清 曹孟良 刘静 孙健冬 唐家斌 陈艳炯 黄小兵 林伟 叶辰 童维 丛丽娟 耿佳宁 韩玉军 李琳 李蔚 胡光强 李涛 黄显刚 李文杰 李健 刘占威 李龙 刘建平 亓秋辉 刘劲松 李黎 王学刚 吕宏 吴婷婷 朱淼 孙永巧 王莹 倪培相 韩华 董伟 任晓宇 冯小黎 崔鹏 李显然 汪浩 徐新 翟文学 徐昭 张劲松 何锶洁 张建国 徐吉臣 张昆林 郑先武 董坚海 曾万勇 陶林 陈学伟 何峻 刘道峰 田薇 田朝光 包其郁 夏红爱 李刚 范红媛 李继红 王辉 张文辉 高辉 李平 陈伟 汪旭东 张勇 胡建飞 王晶 刘松 杨坚 张广宇 段举 熊煜青 黄芳 李志杰 毛龙 周承恕 朱祯 陈润生 郝柏林 郑伟谋 陈受宜 郭为 李国杰 刘斯奇 黄谷扬 陶明 汪建 朱立煌 袁隆平 杨焕明 《科学通报》2001,46(23)
水稻基因组序列中蕴藏着生理、遗传、发育、进化和与重要经济性状相关的许多生物学信息. 籼稻亚种Oryza Sativa ssp. indica在中国和亚洲其他地方广泛种植. 通过全基因组霰弹法, 得到了这一亚种的基因组框架序列. 共完成430万个成功反应, 总读长为2214.9 Mb, 其中籼稻亚种93-11的成功反应有330万个, 总读长1797.4 Mb, 初步拼接得到了409.76 Mb的非冗余序列, 大约覆盖了水稻全基因组的95.29%, 碱基准确率大于99%. 通过与公共数据库中籼稻indica和粳稻japonica亚种的BAC克隆比较, 证实了基因组框架图的覆盖率、序列分布的随机性和拼接软件BIG-ASSEMBLER的准确性. 在框架图中, 鉴定了96.3%的全长cDNA, 96.4%的遗传标记(STS, STR, RFLP), 94.0%的EST和94.9%的单基因簇(unigene). 初步分析表明, 该框架序列已经达到了国际同行所认同的标准. 框架图的公布无疑为水稻生物学研究提供了基因组学和遗传学方面的基本信息. 相似文献
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SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析 总被引：9，自引：9，他引：9
秦鄂德 祝庆余 于曼 范宝昌 常国辉 司炳银 杨保安 彭文明 姜涛 刘伯华 邓永强 刘洪 张雨 王翠娥 李豫川 甘永华 李晓萸 吕富双 谭刚 曹务春 杨瑞馥 汪建 李蔚 徐祖元 李彦 吴清发 林伟 陈维军 唐琳 邓亚军 韩玉军 李昌峰 雷蒙 李国庆 李文杰 吕宏 石建萍 童宗中 张峰 李松岗 刘斌 刘斯奇 董伟 王俊 黄家树 于军 杨焕明 《科学通报》2003,48(11):1127-1134
严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病. 对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定, 并与其他已知病毒进行了比较分析. 该病毒基因组全长为29.725 kb, 含11个可读框(ORFs), 由1个稳定区和1个可变区组成, 其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶, 包括两个ORFs；可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs), 分别编码病毒的4个结构蛋白(S, E, M, N蛋白). 此外, 可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs). 此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致. 通过与已知RNA病毒的序列比对, 可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae). 与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示, 已在30个核苷酸位置上检出序列差异, 总体突变率为0.1%, 其中15个变异位点在编码区, 可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变). S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异, 而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应. 与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化. 进化分析表明, SARS病毒可能不是来源于人类, 但没有证据证明是人为制造的. 为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在, 仍需进行更深入的研究. 相似文献
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