基于蚁群算法的肿瘤驱动通路搜索方法研究

肿瘤的发生和发展主要是由基因突变的累积导致细胞信号通路调控紊乱而引起的.将通路中基因集的两个特性——高覆盖性和高排他性,与基因协变量相结合,提出了一种基于蚁群优化算法的驱动通路搜索方法.旨在基因突变数据及基因协变量数据的基础上,搜索满足高覆盖性和高排他性的通路基因集,从而识别致癌的驱动通路.首先,通过对基因表达水平、复制时间和染色体状态3个基因协变量相互的关联性,以及它们与基因突变频率的相关性进行分析,选择复制时间作为影响基因突变频率的权重协变量.然后,将权重协变量与现有方法结合,构造了一个新的最大权重子矩阵函数作为组合优化问题的目标函数.为克服该优化问题的NP难题,采用蚁群优化算法求解.应用该方法在肺腺癌的突变数据上进行了分析与验证.结果证明,该方法不仅比现有方法找到了更多在已证实通路中的癌基因,而且其中包含多个互斥性显著的基因对,证明了方法的有效性.     

ICAM-1在NF-κB通路中表达的研究进展

细胞间黏附分子(intercellular adhesion molecule-1,ICAM-1),属于免疫球蛋白超家族中的一员,其主要功能是参与白细胞的迁移,来作为T淋巴细胞活化信号和调节炎性因子的表达.因此,ICAM-1表达量的变化与机体多种疾病相关.ICAM-1启动子区域含有大量能与转录因子及协同刺激物结合的基因位点,因而多种信号通路及转录因子参与调节ICAM-1的转录表达.NF-κB通路作为重要的炎症信号通路,同样也是调控ICAM-1表达的一条关键性转录通路.在炎症、病毒及肿瘤等疾病条件下,多种细胞因子能够通过激活NF-κB通路,从而改变ICAM-1的基因及蛋白表达水平.同时,ICAM-1作为疾病治疗中重要的靶点,为疾病的治疗开辟了新的道路.     

基底外侧杏仁核-外侧下丘脑通路对类鸦片诱导的脂肪摄入的作用

研究了大鼠脑横核(Acb)内注入μ-类鸦片受体激活剂DAMGO诱导的脂肪摄入增加与基底外侧杏仁核(BLA)-外侧下丘脑(LH)通路激活的关系.通过立体定位技术将微型不锈钢套管植入大鼠脑的Acb、BLA和LH,通过注射GABAA受体激活剂muscimol的方法暂时失活试验脑区的神经元活性,然后观察失活一侧BLA或对侧LH以及同时失活上述两区对于Acb内注入DAMGO诱导的脂肪摄入增加的影响.单纯Acb内注入DAMGO的人鼠(2组)较生理盐水对照组大鼠(1组)2h脂肪摄入量显著增加[(19.10±1.07) g vs. (8.12±0.80)g,F=1080.74, p<0.001],而失活一侧BLA(3组)、失活对侧LH(4组)、同时失活一侧BLA与对侧LH的大鼠(5组)其2 h脂肪摄入量分别为(18.24±1.04)g、(18.50±0.96) g和(7.59±0.71) g,均分别与2组大鼠进行比较,结果显示只有5组和2组大鼠间的差异有统计学意义(F=1281.07,p<0.001).失活大鼠脑一侧BLA或对侧LH对于Acb内注入DAMGO诱导的脂肪摄入增加无影响,但同时失活上述两区则完全阻断这种摄入增加,提示Acb内注入DAMGO所诱导的脂肪摄入增加依赖于BLA-LH通路内复杂、严格的交互作用.     

拟南芥中一个与谷氨酰tRNA合成酶相互作用蛋白质的初步研究

利用酵母双杂交系统从拟南芥cDNA文库中筛选到一个与谷氨酰tRN合成酶有作用的假定的吡哆醛磷酸结合蛋白PPB.谷氨酰tRNA合成酶是ABA信号通路中正调节因子.在大肠杆菌中表达和纯化了与预测结果一致的PPB蛋白.构建其核正向表达载体和反向表达载体,转化拟南芥后筛选和鉴定出正向转基因植株.现就对其初步的研究做一个报道.     

延髓腹外侧区的神经通路及其功能

延髓腹外侧区有广泛的传入传出联系,在调节血压、呼吸、疼痛以及内脏活动过程中起着重要作用.简要叙述了延髓腹外侧区的传入传出神经纤维联系及其功能的研究进展.     

IGF-PI3K-Akt信号通路在生理性心肌肥大中的作用研究进展

心肌肥大是心肌细胞对多种刺激因素的复杂反应。心肌肥大可以分为三种:心肌的正常生长、运动诱导生理性心肌肥大和病理性心肌肥大。近年来,研究表明心肌的正常生长以及运动诱导的心肌生理性肥大,主要是通过IGF-PI3K-Akt信号通路进行信号转导。本文就IGF-PI3K-Akt信号转导通路的结构特点、调节过程作一综述。     

浅析DVI数字接口

通过论述DVI数字接口的定义,类型,作用,技术指标等,对这种现代信息科学技术有一个全面、概括地了解.帮助读者在用到该方面信息时,有一个前瞻性的评估.     

采用非线性预处理的多通路回波消除算法

非线性预处理是解决多通路回波消除中因输入信号间的强相关性而引起的滤波器不收敛的有效方法．如何确定预处理中的非线性变换系数，以达到既保证语音质量，又去除输入信号间的相关性的目的，是十分值得关注的问题．文中提出了一种应用模糊逻辑来调整非线性变换系数（α）的方法，使得α能随输入信号间的相关性而合理变化，该方法以较小的计算增量为代价，能最大程度地保证通话质量并加快滤波器的收敛速度．仿真结果表明了该方法的可行性和优越性．     

PWM模拟信号光电耦合隔离电路的研制

本文提出一种运用PWM(脉冲调宽)原理设计低价格、低漂移、高线性模拟信号光电耦合隔离电路的方案。这种方案仅用普通的光电耦合器件。实验结果表明,这种隔离电路的非线性度不劣于0.02％,温度漂移低于0.002％/℃。本文还讨论了光电耦合器件的关断时间t_（OFF）对隔离电路动态范围的影响,并着重指出,关断时间温度系数（?）是影响隔离电路温度稳定性的主要因素。