大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术,对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究.从30个RAPD引物当中,筛选出11个具有多态性的引物,共扩增出多态性带224条,多态性条带比率为41.18%,从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物,共扩增出多态性带121条,多态性条带比率为50.21%.对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法,计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0.28和0.32.根据这两种标记的结果,采用UPGMA进行聚类分析,得到与生物学分类地位基本一致的结果.结果表明,在实验稳定性上,ISSR优于RAPD,且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异,RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究.     

蜡梅品种的RAPD分析

从200个随机引物中筛选出16个多态性稳定的引物,对38个蜡梅品种进行遗传多样性和亲缘关系RAPD分析.共扩增出154条DNA片段,其中,多态性DNA带98条,占总扩增片段的63.6%.应用Popgene32软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,并利用UPGMA法构建聚类树状图,把供试的38个蜡梅品种分为7个大类,聚类结果与形态分类结果基本一致.结果表明,RAPD标记可用于蜡梅品种鉴定和亲缘关系探讨.     

贵州马铁菊头蝠群体遗传结构的微卫星分析

利用6对微卫星引物对贵州马铁菊头蝠的等位基因频率、基因杂合度和多态性信息含量进行了遗传检测。结果表明,6对微卫星引物共扩增出18个等位基因。基因频率分布在0.021 0～0.833 0之间。6个微卫星位点的平均杂合度为0.342 7,平均多态性信息含量为0.381 3。分析认为贵州马铁菊头蝠遗传多样性相对较低。     

基于Cyt b基因全序列分析河南7种菊头蝠系统发育关系

采用分子系统发育分析方法对菊头蝠科蝙蝠的系统发育关系和分类地位进行研究,以7种127个蝙蝠为研究对象,测定了mtDNA Cytb基因全序列(1140kb),用最大简约法(maximum parsimony,MP)和最大似然法(maximum likelihood,ML)建系统发育树,对菊头蝠种间亲缘关系及分类地位进行分析,角菊头蝠、菲菊头蝠和大耳菊头蝠属于较原始的种类,且彼此间有较近的亲缘关系;大菊头蝠、皮氏菊头蝠关系较近,为较原始的类群;马铁和中菊头蝠关系较近,为后分化的类群.     

大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术．对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究．从30个RAPD引物当中．筛选出11个具有多态性的引物．共扩增出多态性带224条．多态性条带比率为41．18％．从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物．共扩增出多态性带121条．多态性条带比率为50．21％．对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法．计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0．28和0．32．根据这两种标记的结果．采用UPGMA进行聚类分析，得到与生物学分类地位基本一致的结果．结果表明，在实验稳定性上．ISSR优于RAPD．且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异．RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究．     

应用RAPD和AFLP标记的方法对甜(辣)椒和番茄品种的多态性分析

应用RAPD和AFLP的DNA指纹图谱方法分析25个甜(辣)椒和22个番茄品种的真实性,并进一步比较RAPD和AFLP的DNA指纹图谱在鉴定亲缘关系较近的品种之间的真实性时的有效性。对于甜(辣)椒品种,AFLP方法中,2个引物组合扩增反应的多态性片段即能将25个品种完全分开。虽然,每个样品的AFLP的扩增产物中多态性片段的百分率为9％,低于RAPD的35％多态性片段的百分率。但是,AFLP的信息量远远大于RAPD的信息量,它的每对引物组合扩增的平均多态标记为5．1,而RAPD仅为2．2。所以,在甜(辣)椒的指纹图谱中,AFLP的有效率是RAPD的2倍。对于番茄品种,每个样品的AFLP的扩增产物中多态性片段的百分率为5．5％,大大低于RAPD的单引物61％多态性片段和双引物58％多态性片段的百分率。它的每对引物组合扩增反应的平均多态标记为2．6,而RAPD中,单引物扩增的平均多态标记为4．2,双引物扩增的平均多态标记为4．4。一个单引物和一个双引物的RAPD扩增反应的多态性片段即能将22个番茄品种中的21个完全分开。所以,在番茄的指纹图谱中,RAPD的有效率是AFLP的2倍。因此,在应用分子标记辅助鉴定品种的真实性时,不同的作物所适用的方法是不同的。     

小菊头蝠和单角菊头蝠分类地位的探讨

小菊头蝠、单角菊头蝠和角菊头蝠在形态上甚相似,关于小菊头蝠和单角菊头蝠的分类地位问题存有不同观点.通过分析细胞色素b基因全序列探讨了小菊头蝠和单角菊头蝠的分类地位.应用MEGGA 2软件计算出小菊头蝠与单角菊头蝠之间的未修正序列分歧仅为1.2%～1.4%,二者与角菊头蝠之间的未修正序列分歧分别为2.5%～3.0%和2.1%～2.5%,未达到种间分歧值,因此认为小菊头蝠、单角菊头蝠和角菊头蝠应为同一种,并支持Ellerman(1951)和Koopman(1993)的观点:小菊头蝠和单角菊头蝠是角菊头蝠的两个亚种.同时计算出小菊头蝠和单角菊头蝠最早从角菊头蝠中分化出来的时间大约在136.7万年前.     

川渝部分地区野生黄鳝RAPD引物筛选及其在绵阳群体的验证

采用RAPD技术对产自四川绵阳、内江、雅安和重庆忠县的24尾野生黄鳝基因组DNA进行引物筛选,40条随机引物中有4条引物扩增出片段。选择在4个地区黄鳝个体间多态性较丰富的RAPD引物A10在绵阳黄鳝群体进行扩增分析。RAPD引物A10在6个绵阳黄鳝个体的扩增,产生比较清晰的条带并且呈现一定的多态性,绵阳黄鳝群体内的平均遗传相似率为0.8947,群体内的平均遗传距离为0.1053,从一定程度反映出绵阳地区黄鳝较低的遗传多样性。本研究所筛选引物可为黄鳝分子标记和遗传多样性的分析、亲缘关系和种质的鉴定以及遗传资源的保护利用提供参考。     

福建省6种早熟良种柚的RAPD分子标记研究

采用改良的CTAB法成功提取龙柚等6种福建省早熟良种柚叶片的DNA,并对其进行RAPD分析.从初选的100个随机引物中筛选出12个扩增效果较好的引物,对提取的DNA进行PCR扩增,获得清晰可重复的位点107个,平均每条引物产生的位点为8.9个,其中多态性位点93个,占86.9%;在部分样品中检出了特异性RAPD标记24个,占23.4%;样品问遗传相似系数比较和UPGMA聚类分析表明坪山柚和文柚的亲缘关系最近,度尾蜜柚和四季柚分别与其它5个柚类的亲缘关系较远.     

罗汉果性别相关的RAPD标记

应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术寻找与罗汉果性别相关的分子标记,筛选了130个10 bp的随机引物,发现有4个引物(S60、S90、S100、S343)能在雌、雄株DNA间扩增出5条差异性片段,大小在300~1 300 bp之间,表明这些特异带可被用来作为性别鉴别的特异性分子遗传标记。     

几种番茄品种基因组DNA的相似指数初步分析

用４种随机引物（１０ｂｐ）,对普通番茄５个品种的基因组ＤＮＡ进行了ＰＣＲ扩增,并对其ＲＡＰＤ带谱进行了统计处理,发现不同随机引物扩增出来的ＲＡＰＤ标记所表现的相似指数有所不同,综合考虑,普通番茄种内不同品种同ＤＮＡ多态性保持了较高的稳定性。     

雏蝗属（Chorthippus）六种蝗虫基因组DNA的RAPD比较研究

运用随机扩增多态ＤＮＡ技术对雏蝗属６种蝗虫基因组ＤＮＡ进行了多态性比较研究,共扩增出１２条特异性片段,分子量大小约为７４０－１８１０ｈｐ,并根据各种间片段共享度构建了ＵＰＧ聚类关系图,根据研究结果推测,短翅亚属的小翅雏蝗和北方雏蝗分化较晚,相似性很高它们可能起源于同一祖先;曲隆亚属的４个种之间差异较大。     

基于RAPD标记的我国水青冈属植物的分类研究

应用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)方法,对我国水青冈属(Fagus L.)6种植物,即巴山水青冈(F.pashanica)、长柄水青冈(F.longipetiolata)、米心水青冈(F.engleriana)、亮叶水青冈(F.lucida)、台湾水青冈(F.hayatae)和浙江水青冈(F.hayatae var.zhejiangensis)进行基因组多态性分析,选用80个随机引物进行扩增,其中56个引物扩增出清晰可重复的条带,片段大小在250～3050 bp之间.采用UPGMA法对求出的遗传片段进行聚类分析.结果显示:台湾水青冈、巴山水青冈和浙江水青冈的遗传距离较近,表明它们可归并为一种.这与我国水青冈属的生态解剖学研究结果完全一致.根据结果将我国水青冈植物归并分为4种:长柄水青冈、米心水青冈、亮叶水青冈、台湾水青冈(包括巴山水青冈和浙江水青冈).     

几种鹤性别的分子生物学鉴定

以RAAV01和RAAV02两条随机核苷酸加聚体为引物,通过随机扩增片段多态DNA的方法,在白头鹤,白枕鹤,丹顶鹤等3种4对不同个体中,发现一条约300bp的雌性个性特异带,并应用这一方法成功地鉴别了未知性别的丹顶鹤个体,同时参照已知动物CHD基因序列的设计合成CHD基因引物,采用PCR方法在丹顶鹤雌性个体中扩增出一条206bp的片段,序列分析表明,该序列与已知其他鸟类CHD－W,CHD－Z基因的编码区和内含子区都有较高的同源性。     

山西省雏蝗属部分种类的遗传关系分析

采用RAPD和SSRP-PCR技术分析雏蝗属(Chorth ippus F ieber)白纹雏蝗(C.a lbonem us Cheng et T u)、夏氏雏蝗(C.hsia i Cheng et T u)、小翅雏蝗(C.f a llax(Zub.))和北方雏蝗(C.hamm arstroem i(M ir.))的遗传关系,9条引物对98头个体产生131条清晰、稳定的谱带.Shannon信息指数表明,小翅雏蝗遗传多样性水平较高(0.2542),白纹雏蝗遗传多样性水平较低(0.1911).N e i's遗传距离显示,种群间遗传距离小于种间遗传距离.用N J法对N e i's遗传距离作聚类分析,构建分子系统树,结果显示:白纹雏蝗与夏氏雏蝗聚为一支,小翅雏蝗与北方雏蝗聚为一支,两支再相聚.聚类图所显示的种间亲缘关系的远近程度与形态分类学结果相一致,说明RAPD和SSRP-PCR技术在雏蝗属种间分子系统学研究中具有很好的适用性.     

山羊与岩羊间特异RAPD片段分析

在两组40个随机引物中，筛选出16个重复性好的多态引物，对山羊与岩羊闻RAPD片段分析表明，16个引物扩增出67条带，其中54条带表现多态，多态率80．60％，山羊各群体共有条带为23条，山羊和岩羊共有条带为13条，岩羊有4条特异带，不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同．岩羊特异RAPD片段，OPA-10724的序列与人类全基因组比较，同源的短序列较多，最太长度为86bp，唯有30bp的长度与绵羊ZFZ基因和牛ZFY基因内含子同源。     

六种蝗虫基因组DNA多态性的RAPD标记研究

运用随机扩增多态 DNA技术对斑翅蝗科 Oedipodidae中三属六种蝗虫基因组DNA进行了多态性比较 ,共扩增出 2 2条特异性片断 ,分子量大小为 650～ 1 990 bp之间 ,并根据各种间片段共享度构建了 UPG聚类关系图 .研究结果表明 ,大垫尖翅蝗和甘蒙尖翅蝗的片段共享度为 0 .375;红翅皱膝蝗和鼓翅皱膝蝗的片段共享度为 0 .2 86;亚洲小车蝗和黄胫小车蝗的片段共享度也为 0 .2 86     

5种白蚁基因组DNA随机扩增多态性研究

采用RAPD（Random amplified polymorphic DNA)技术对尖唇异白蚁（Heterotermes aculabialis)、黄肢散白蚁（Reticulitermes flaviceps)、扩头散白蚁（R.ampliceps)、细颚木鼻白蚁（Stylotermes angustignathus)和陇南树白蚁（Glyptotermes longnanensis)等5种白蚁的基因组DNA多态性进行了初步分析。在所用的20个随机引物中有4个引物能扩增出稳定的带型,5种白蚁6个群体共扩增出43条带,均为多态性片段;同一种类不同群体和同一群体不同品级间存在一定程度的多态性,但种间扩增片段差异显著大于种内差异。以UPGMA方法将扩增片段分布和共享度数据矩阵进行聚类分析,所得结果支持我国异白蚁属与散白蚁属合并的观点。     

6种瓢虫的RAPD分析及在分类上应用的研究

利用随机引物分别对6种瓢虫的DNA进行了聚合酶链式反应（RAPD－PCR）的实验。结果显示，用相同引物扩增不同种瓢虫的基因组DNA，扩增产物多态性DNA片段的数目是不同的；两种不同引物的扩增产物中，各自呈现出种、属的特异性片段，其可用于种、属的鉴别；聚类图显示了种、属之间亲缘关系的远近程度，并与形态学分类结果相一致。实验分析还发现：七星瓢虫不同个体间多态性DNA特有带较多，遗传较稳定；龟纹瓢虫与之相比，不同个体间多态性DNA的特有带较少，变异程度较大。     

墨天牛属三个近缘种的RAPD分析

应用ＲＡＰＤ（随机扩增的多态性ＤＮＡ）技术,分析了墨天牛属三个近缘种－松墨天牛、云杉大墨天牛和云杉小墨天牛的ＤＮＡ多态性。通过采用多种引物对同种天牛幼虫的浸渍标本和新鲜标本的ＤＮＡ多态性研究,发现浸渍标本与新鲜标本ＤＮＡ扩增后的电泳指纹图谱完全一致;同种害虫不同虫态间的ＤＮＡ指纹图谱完全一致;三种随机引物可明显鉴别三种天牛幼虫。这为天牛近缘种的鉴定,尤其是天牛幼虫的鉴定提供了一种新方法。