PTEN基因在哈萨克族食管癌组织中的表达及意义

通过观察PTEN在哈萨克族食管癌癌组织及相应正常组织中的表达,探讨PTEN基因在哈萨克族食管癌发生中的作用。采用RT-PCR方法检测PTEN基因mRNA在36例哈萨克族食管癌及相应正常组织标本中的表达,选取mRNA水平差异组织标本,采用Western-bolt方法检测其蛋白水平的表达情况。结果显示,PTEN基因mRNA在36例癌组织中有30例表达,阳性率为83.33%。其中癌组织表达量高于相应正常组织(TN)21例,占70%;癌组织表达量等于相应正常组织(T=N)4例,占13.33%;癌组织表达量低于相应正常组织(TN)5例,占16.67%。PTEN基因mRNA在正常组织中表达仅有9例。癌组织与相应正常组织相比,PTEN基因的表达量明显增高。PTEN蛋白的表达在癌组织与相应正常组织中无明显差异。结果表明,PTEN基因的异常表达主要在转录水平,可能不是哈萨克族食管癌发生发展中的主导基因,其对哈萨克族食管癌发生发展过程中的具体作用有待进一步研究。     

EphB1在结直肠癌中的差异表达及其临床病理学意义

通过检测结肠癌细胞系和结直肠癌组织中EphB1表达及其与临床病理特征之间的关系和启动子区域CpG岛的甲基化情况,探讨EphB1在结直肠癌中的作用及其机制,为结直肠癌的基因治疗寻找新的靶基因.取5株结肠癌细胞系和61例配对液氮冻存及对应石蜡包埋组织,运用实时定量RT-PCR和免疫组织化学方法分别检测EphB1 mRNA和蛋白质表达;同时对mRNA表达下调标本进行启动子区域CpG岛甲基化检测.结果显示,5株结肠癌细胞系中EphB1 mRNA均有表达,并且表达存在差异;61例结直肠癌组织与癌旁正常黏膜相比,EphB1 mRNA和蛋白质表达均存在差异.EphB1 mRNA在31.1%(19/61)的癌组织中下调,52.5%(32/61)上调,EphB1 mRNA低表达和组织分化差异有统计学意义(P=0.008).EphB1蛋白在正常肠黏膜和部分肿瘤细胞中呈阳性表达,下调表达62.3%(38/61),上调表达24.6%(15/61);EphB1蛋白的低表达和组织分化(P=0.033)、浸润深度(P=0.038)、性别(P=0.028)以及部位(P=0.039)间差异都有统计学意义.甲基化特异性PCR检测发现EphB1m...     

MSP58基因在肝癌中的表达分析

探讨MSP58基因在人类肝癌肿瘤组织及肝癌细胞系中的表达情况,应用半定量RT-PCR和Western blot方法分别检测MSP58在肝癌细胞系及肝癌肿瘤组织中的mRNA水平及蛋白水平的表达.两种肝癌细胞系HHCC、HepG2,22例肝癌癌区组织,13例正常肝组织作为对照.结果在两种肝癌细胞系中MSP58 mRNA水平和蛋白水平都有明显表达;在22例肝癌肿瘤组织中,不同级别的人肝癌肿瘤标本中mRNA及蛋白均有MSP58表达,并且MSP58的表达量随着人肝癌肿瘤恶性病理级别的增高而增高;13例正常肝组织无表达.MSP58在肝癌肿瘤组织和肝癌细胞系中均有表达,说明其可能对肝癌肿瘤的发生或发展有重要作用.     

食管鳞癌患者血清可溶性HLA-G分子表达水平及其临床意义

研究可溶性人类白细胞抗原G分子(sHLA-G)在食管鳞癌患者血清中的水平及其临床意义.应用酶联免疫吸附测定(ELISA)法检测60例食管鳞癌患者及28例对照者血清中sHLA-G(sHLA-G1 和 HLA-G5)水平,免疫组化S-P法检测对应的食管鳞瘤患者癌组织及对照组正常食管组织中HLA-G的表达,应用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)法检测组织中HLA-GmRNA及HLA-G5mRNA的表达情况.结果食管鳞癌患者血清sHLA-G平均水平(15.04 u/mL)较对照(6.81 u/mL)升高(P=0.006);血清sHLA-G水平与肿瘤患者临床病理特征无相关性;HLA-G在60例癌组织表达率为70%且与肿瘤的分化程度(P=0.033)及淋巴结转移相关(P=0.035),正常食管组织无HLA-G表达;HLA-GmRNA和HLA-G5mRNA在20例HLA-G表达阳性的食管鳞癌组织中的均有表达,正常食管组织无HLA-GmRNA和HLA-G5mRNA表达.说明食管鳞癌组织可异常表达HLA-G分子,联合检测血清sHLA-G水平及HLA-G分子可作为临床食管癌的诊断和判断预后的指标.     

非小细胞肺癌组织SNORA56基因性状分析及临床样本验证

目的:探讨在非小细胞肺癌(NSCLC)中SNORA56的基因性状及其临床意义.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载NSCLC癌组织及癌旁组织中SNORA56数据及临床信息资料,分析SNORA56表达水平与NSCLC临床病理学参数的相关性及预后的影响.收集广西医科大学第一附属医院的NSCLC患者标本,利用PCR技术检测30例NSCLC患者组织中SNORA56的表达,进一步验证SNORA56在NSCLC中的表达意义.结果:TCGA结果显示:SNORA56在癌组织中的表达量明显高于癌旁组织,具有统计学差异(P0.001);SNORA56表达水平在有淋巴结转移的肺鳞状细胞癌(LUSC)癌组织中明显高于无淋巴结转移的LUSC癌组织(P0.05);基因富集分析结果显示SNORA56可能通过细胞周期凋亡相关通路影响肺癌的发展.临床样本验证结果显示:PCR结果显示,与癌旁组织相比,LUSC与肺腺癌(LUAD)癌组织中SNORA56表达水平均明显升高;SNORA56表达水平在有淋巴结转移的LUSC癌组织中明显高于无淋巴结转移的LUSC癌组织(P0.05);基因富集分析结果显示SNORA56可能通过细胞周期凋亡相关通路影响肺癌的发展.结论:SNORA56在LUSC及LUAD癌组织中的表达明显高于癌旁组织;SNORA56在有淋巴结转移的LUSC癌组织中的表达明显高于无淋巴结转移的LUSC癌组织;SNORA56可能通过细胞凋亡通路影响NSCLC发展.     

转录因子KLF7高表达与前列腺癌发生的相关性及其靶基因预测

目的探讨KLF7高表达与前列腺癌(PCa)发生的相关性,并对其可能的下游靶基因进行筛选。方法比较前列腺增生(BPH)患者(n=22)以及PCa患者(n=30)血糖、血脂及一般资料的差异;调取石蜡包埋的前列腺组织标本,运用免疫组织化学法检测组织中KLF7及其下游因子IL-6,以及肿瘤发生相关因子E-钙粘蛋白、Ki67的表达量。运用统计学方法,比较各因子在BPH和PCa患者前列腺组织中的表达差异,并分析KLF7表达与各因子之间的相关性。运用Cistrome Data Browser数据库对KLF7可能的下游靶基因进行预测。结果 PCa患者血清中总前列腺特异性抗原(TPSA)含量显著高于正常体检及BPH个体(P0.001); PCa患者前列腺组织中KLF7及IL-6表达量显著高于BPH患者前列腺组织(P0.05),肿瘤发生相关因子Ki67表达量显著高于BPH患者前列腺组织(P0.05),E-钙粘蛋白的表达量在两组间无显著差异。相关性分析结果显示:前列腺癌组织中KLF7的表达与患者血清中TPSA含量显著正相关(r=0.465,P=0.001),与癌组织中IL-6的表达显著正相关(r=0.437,P=0.014),与癌组织中Ki67的表达显著正相关(r=0.434,P=0.002),与癌组织中E-钙粘蛋白的表达显著正相关(r=0.473,P=0.009)。生物信息学分析结果显示:转录因子KLF7可能通过调控肿瘤相关基因STAT3,DDX20,ZNF233,ZNF581,ZNF487,ZNF580,ZNF391,ZNF793,HMGB1,DMAP1,CTNNB1,ZBTB45等参与肿瘤的发生发展。结论 KLF7高表达可能是前列腺癌发生的危险因素,前列腺癌组织中KLF7的表达与IL-6、Ki67以及E-钙粘蛋白的表达显著正相关。KLF7可能通过调控一系列肿瘤相关基因的表达参与肿瘤发生发展的过程。     

慢性粒细胞性白血病不同病期bcr-abl基因 P53基因突变研究

探讨 bcr- abl融合基因、P53 基因对 CML不同病期演变的作用 .采取 CML2 6例不同分期共30份标本 ,应用逆转录—聚合酶链反应 (RT- PCR)技术检测 bcr- abl融合基因 ,应用多聚酶变 .结果显示 2 4例 CML慢性期中 2 2例 bcr- abl基因 ( ) ,6例急变期中 5例 bcr- abl基因 ( ) ;CML慢性期未发现 P53 基因突变 (0 / 2 4 ) ,急变期发现 2例突变 (2 / 6 ) .2例 P53 基因突变中 ,1例 bcr- abl基因( ) ,1例 bcr- abl基因 (- ) .由此可得 P53 基因突变在 CML慢性期少见 ;P53 基因突变对部分 CML急变有一定作用     

TGF-β1与Smad4在乳腺导管癌组织中的表达及意义

目的 探讨TGF-β1和Smad4在乳腺导管癌组织中的表达，分析其与乳腺导管癌发生发展的关系及意义.方法 选取50例乳腺导管癌组织标本，应用免疫组织化学SP法检测TGF-β1和Smad4在乳腺导管癌组织中的表达水平，并评估二者的表达与各种临床病理参数间的关系、TGF-β1与Smad4的表达是否具有一致性.结果 TGF-β1和Smad4蛋白表达均与乳腺导管癌TNM分期呈负相关关系(r=-0.402,P=0.004;r=-0.331,P=0.019);而与患者年龄、肿瘤直径、肿瘤组织学级别、是否淋巴结转移、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)以及人表皮生长因子受体-2(HER2)的表达无关(P>0.05).此外，Kappa分析表明，TGF-β1与Smad4的表达具有一致性(κ=0.419,P=0.003).结论 评估乳腺导管癌组织中TGF-β1和Smad4的表达可能有助于预测乳腺导管癌的进展.     

脂代谢相关基因PPARγ2和SCD1与血管内皮生长因子VEGF在肝细胞癌组织的蛋白表达相关性及临床意义

近年来研究发现肿瘤组织有脂代谢异常,但脂代谢异常在肿瘤发生发展中的作用还不清楚.为了探讨脂代谢异常在肿瘤中的作用,本研究对45例肝细胞肝癌患者,用免疫组化方法研究其癌组织中硬脂酰辅酶A去饱和酶1(SCD1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ2(PPARγ2)、血管内皮生长因子(VEGF)的表达情况,并结合ishak评分和患者的病理检查结果,分析和探讨PPARγ2,SCD1及VEGF在肝细胞癌组织中的表达与肿瘤发生发展的关系、它们相互之间的表达相关性及临床意义.本研究发现在肝细胞癌组织中,PPARγ2,SCD1及VEGF在肿瘤组织中高表达,其高表达率分别为40.00%、46.70%、75.50%.相关性分析发现SCD1和VEGF之间存在相关性(r=0.482,p≤0.001),但是PPARγ2和SCD1(r=0.221,p=0.164),以及PPARγ2与VEGF(r=0.219,p=0.169)之间不存在相关性.该研究提示脂代谢相关基因与血管生成相关,但不通过PPARγ2调控SCD1途径;脂代谢相关基因SCD1是抑制血管生成和肿瘤发展的潜在靶点.     

KIF4A mRNA在肺癌组织中表达水平的研究

收集肺癌组织标本和正常肺组织标本,提取组织中的RNA,通过反转录PCR合成cDNA,进行实时定量PCR测定.结果表明:31例肺癌组织中有29例KIF4A mRNA的表达量高于正常组织,其中26例(83.87%)比正常组织高2倍以上,10例(32.30%)比正常组织高4倍以上;KIF4A mRNA的表达量与肿瘤淋巴结转移(TNM)分期的相关性具有统计学意义(F=0.565,P=0.029).由于肺癌组织中KIF4A mRNA的表达量升高与肿瘤的分期分型相关,因此可以作为判断肺癌分期及预后的新分子标志物,对于评估肺癌的发生与发展也可能具有重要意义.     

人源抗菌肽LL-37原核表达载体的构建及表达

为了使人源抗菌肽LL-37在原核表达载体中获得高效表达,在不改变LL-37氨基酸的基础上,根据大肠杆菌偏爱密码子表,替换LL-37部分密码子,设计一段新的LL-37序列.采用DNA Work设计4条互补引物,利用SOE-PCR技术扩增完整的LL-37目的片段,以pET-PPPI为载体,构建原核表达载体pET-PPPIL,并制备表达菌BL21(DE3)(pET-PPPIL),该菌经诱导高效表达LL-37融合蛋白,为后续纯化LL-37奠定了基础.     

人心室肌球蛋白轻链1基因的克隆及其体外的表达与纯化

通过聚合酶链式反应方法扩增人心室肌球蛋白轻链1的基因片段,并将其克隆到pET-22b质粒,构建表达重组体,转化大肠杆菌BL21细胞,转化子细胞经IPTG诱导,目的蛋白在大肠杆菌中得到高效表达,凝胶成像扫描检测,其表达量接近细胞总蛋白的40%,经Ni2+亲和层析使目的蛋白得到纯化。     

新生物活性肽-daintain/AIF-1在乳腺癌中的表达

采用免疫组织化学两步法分析了乳腺癌组织蜡块切片中daintain／AIF-1的表达．93％的乳腺癌中都有该活性肽的分布,癌旁良性组织中则没有阳性染色或染色很浅．Daintain／AIF-1在乳腺病变级别不同组织中的表达差异很大：增生组织免疫后着黄色,重度不典型增生组织着橙黄色,癌组织则染成了棕褐色．进一步用RT-PCR检测发现,乳腺癌新鲜组织中能扩增出daintain／AIF-1的mRNA,而癌旁良性乳腺组织中的daintain／AIF-1 mRNA极微量,几乎看不到扩增的核酸条带．这些研究表明,daintain／AIF-1在乳腺癌中过量表达,可能在乳腺肿瘤的发展过程起到了促进作用．因此,提示daintain／AIF-1可作为乳腺癌病变早期诊断的一个参考指标。     

人乳头瘤病毒11型E7 DNA疫苗质粒的构建和鉴定

目的 构建人乳头瘤病毒11型(HPV11)E7 DNA疫苗质粒．方法 从尖锐湿疣病变组织中提取DNA制备模板，采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增HPV11-E7基因，将E7基因经双酶切后定向克隆到pcDNA3．1( )中，测序鉴定．结果从病变组织中扩增出了全长HPV11-E7基因，并正向插入载体pcDNA3．1( )中，经酶切和测序鉴定无误．结论 HPV11-E7 DNA疫苗质粒构建成功，为今后进行防治尖锐湿疣的动物实验和临床实验奠定了基础．     

人胰岛素原类似物（B-Arg-Arg-A）基因的构建和表达

用聚合酶链反应（PCR）法将C肽为6个氨基酸残基的胰岛素原类似物基因删除突变成C肽仅为2个精氨酸残基的胰岛素原类似物（BArg-Arg-A）基因,即把pUC18BC'A改建为pUC18BR₂A。再将pUC18BR₂A与pJG105重组为表达质粒pJG107,使B-Arg-Arg-A与pJG105编码的一种多肽构成融合蛋白在大肠杆菌体系中表达。融合蛋白占细菌蛋白总量的58%。表达产物具有人胰岛素放射免疫活性。     

Identification of common microRNA-mRNA regulatory biomodules in human epithelial cancer

The complex regulatory network between microRNAs and gene expression remains an unclear domain of active research. We proposed to address in part this complex regulation with a novel approach for the genome-wide identification of biomodules derived from paired microRNA and mRNA profiles, which could reveal correlations associated with a complex network of dys-regulation in human cancer. Two published expression datasets for 68 samples with 11 distinct types of epithelial cancers and 21 samples of normal tissues were used, containing microRNA expression and gene expression profiles, respectively. As results, the microRNA expression used jointly with mRNA expression can provide better classifiers of epithelial cancers against normal epithelial tissue than either dataset alone (P=1×10^–10, F test). We identified a combination of 6 microRNA-mRNA biomodules that optimally classified epithelial cancers from normal epithelial tissue (total accuracy = 93.3%; 95% confidence intervals: 86%–97%), using penalized logistic regression (PLR) algorithm and three-fold cross-validation. Three of these biomodules are individually sufficient to cluster epithelial cancers from normal tissue using mutual information distance. The biomodules contain 10 distinct microRNAs and 98 distinct genes, including well known tumor markers such as miR-15a, miR-30e, IRAK1, TGFBR2, DUSP16, CDC25B and PDCD2. In addition, there is a significant enrichment (Fisher’s exact test P=3×10^–10) between putative microRNA-target gene pairs reported in 5 microRNA target databases and the inversely correlated microRNA-mRNA pairs in the biomodules. Further, microRNAs and genes in the biomodules were found in abstracts mentioning epithelial cancers (Fisher’s Exact test, unadjusted P<0.05). Taken together, these results strongly suggest that the discovered microRNA-mRNA biomodules correspond to regulatory mechanisms common to human epithelial cancer samples. In conclusion, we developed and evaluated a novel comprehensive method to systematically identify, on a genome scale, microRNA-mRNA expression biomodules common to distinct cancers of the same tissue. These biomodules also comprise novel microRNA and genes as well as an imputed regulatory network, which may accelerate the work of cancer biologists as large regulatory maps of cancers can be drawn efficiently for hypothesis generation.     

采用反向PCR技术优化适合毕赤酵母表达的截短型HPV58型L1基因

目的:探讨利用反向聚合酶链反应(反向PCR)技术根据毕赤酵母偏爱密码子优化截短型人乳头瘤病毒58型(HPV58)L1基因的研究.方法:设计PCR引物扩增截短型HPV58L1目的基因,将其克隆入毕赤酵母分泌表达载体pPICZαC;测序并对目的基因进行序列分析;根据毕赤酵母偏爱密码子利用反向PCR技术设计引物对目的基因进行扩增.结果:扩增了截短型HPV58L1基因并将其克隆入毕赤酵母分泌表达载体pPICZαC中;根据毕赤酵母偏爱密码子优化了截短型HPV58L1基因.结论:成功构建经密码子优化截短型HPV58L1基因的毕赤酵母分泌表达载体pPICZαC-HPV58L1.     

Restoration of p53 function leads to tumour regression in vivo

Tumorigenesis is a multi-step process that requires activation of oncogenes and inactivation of tumour suppressor genes. Mouse models of human cancers have recently demonstrated that continuous expression of a dominantly acting oncogene (for example, Hras, Kras and Myc) is often required for tumour maintenance; this phenotype is referred to as oncogene addiction. This concept has received clinical validation by the development of active anticancer drugs that specifically inhibit the function of oncoproteins such as BCR-ABL, c-KIT and EGFR. Identifying additional gene mutations that are required for tumour maintenance may therefore yield clinically useful targets for new cancer therapies. Although loss of p53 function is a common feature of human cancers, it is not known whether sustained inactivation of this or other tumour suppressor pathways is required for tumour maintenance. To explore this issue, we developed a Cre-loxP-based strategy to temporally control tumour suppressor gene expression in vivo. Here we show that restoring endogenous p53 expression leads to regression of autochthonous lymphomas and sarcomas in mice without affecting normal tissues. The mechanism responsible for tumour regression is dependent on the tumour type, with the main consequence of p53 restoration being apoptosis in lymphomas and suppression of cell growth with features of cellular senescence in sarcomas. These results support efforts to treat human cancers by way of pharmacological reactivation of p53.