瑞德西韦对冠状病毒抑制作用的研究进展

冠状病毒(CoV)作为人畜共患病毒,轻可致人出现轻度呼吸道感染症状,重可致高传播性和严重肺部感染等,例如严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)与中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV).2019年底新出现的严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)标志着高致病性冠状病毒在全球的再次流行,目前这种新冠状病毒肺炎被WHO命名为COVID-19.而新型核苷酸类似物抗病毒药瑞德西韦(Remdesivir;GS-5734)作为一种广谱抗病毒药物,对SARS-CoV与MERS-CoV表现出一定的抗病毒活性.本文综述冠状病毒的起源与发展、种类、结构及对人类健康的影响,并针对瑞德西韦的分子结构特点、抗病毒的特点及其治疗人冠状病毒感染的国内外新进展做一系统总结,以期为抗冠状病毒的药物选择提供参考.     

新型冠状病毒主蛋白酶天然产物抑制剂的筛选

为寻找新型冠状病毒主蛋白酶天然产物抑制剂,本文以SARS-CoV-2主蛋白酶为研究对象,通过计算机辅助药物筛选方法初步筛选出16个潜在抑制剂并进行体外酶活测试.其中,野黄岑素对SARS-CoV-2主蛋白酶的IC50为（10.79 ± 2.116 ） μmol/L,没食子儿茶素没食子酸酯抑制SARS-CoV-2主蛋白酶的IC50为（2.104 ± 0.346） μmol/L.最后,将两种天然产物与主蛋白酶进行分子动力学模拟发现没食子儿茶素没食子酸酯和野黄岑素与新型冠状病毒主蛋白酶结合时的复合物RMSD都在0.22 ?附近,说明两个天然产物与新型冠状病毒主蛋白酶结合较为稳定,可以作为新型冠状病毒主蛋白酶的抑制剂或先导化合物.     

基于位点特异性打分矩阵的卷积神经网络预测SARS-CoV-2核衣壳蛋白的蛋白质二级结构

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)有4种关键的结构蛋白,而核衣壳蛋白就是其中的1种.本实验从公开数据库NCBI上选取的SARS-CoV-2核衣壳蛋白质序列数据,分析SARS-CoV-2核衣壳蛋白与SARS-CoV核衣壳蛋白的序列相似性,对SARS-CoV-2核衣壳蛋白的理化性质和疏水性进行分析;在此基础上提出基于位点特异性打分矩阵的卷积神经网络,预测SARS-CoV-2核衣壳蛋白的8类蛋白质二级结构.研究结果表明,核衣壳蛋白的二级结构主要为无规卷曲,此结果可为抗病毒药物的研发与新型冠状病毒肺炎的诊断提供参考.     

冠状病毒感染过程中血管紧张素转换酶2作用的研究进展

冠状病毒可引起人类呼吸道、肠道等多系统感染.严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV,2003年)、人冠状病毒NL63(HCoV-NL63,2004年)以及目前的新型冠状病毒(SARS-CoV-2,2019年)均已被证实通过与黏膜的血管紧张素转换酶2(ACE2)结合感染人体.因此研究冠状病毒感染过程中ACE2的作用有助于了解冠状病毒的致病机制,为新型冠状病毒肺炎的防治提供参考.该文综述了ACE2在3种冠状病毒感染人体过程中作用的研究进展,主要涉及病毒棘突蛋白识别ACE2胞外域顶端,且有跨膜蛋白酶丝氨酸2(TMPRSS2)等因子参与其中.针对冠状病毒与ACE2结合的机制,可以从多个靶点设计防治药物.     

SARS-CoV-2和新型冠状病毒肺炎:发病机制与药物开发研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)是一种新发现的传染性人类冠状病毒,可导致新型冠状病毒肺炎(COVID-19).阐述了SARS-CoV-2的病原性特征,及其导致的新型冠状病毒肺炎的临床症状、致病机理与免疫反应特点;概述了当前针对COVID-19的治疗方案和潜在新疗法,及针对SARS-CoV-2的疫苗开发进展,以期加深人们对SARS-CoV-2和COVID-19的了解,帮助人们制定策略遏制COVID-19大流行.     

分子对接技术筛选沉香中抗新型冠状病毒活性成分

从沉香中筛选潜在的抗新型冠状病毒活性成分,指导以沉香小分子作为SARS-CoV-2潜在阻断剂和抑制剂药物的研发.根据沉香已知的化学成分,采用分子对接的方法,以血管紧张素转化酶-2(ACE2)、SARS-CoV-2的3CL水解酶(3CLpro)为靶标,通过结合打分值以及与靶蛋白受体的相互作用模式,获得沉香中具有潜在抗SA...     

冠状病毒主蛋白酶及其化学抑制剂研究进展

一个新的冠状病毒已经被鉴定为急性呼吸道综合症(SARS)的病原体,控制该病毒复制复合体活性的主蛋白酶(Mpro或3CLpro)将很可能成为开发针对SARS特效治疗药物的靶位点.综述了人冠状病毒株229E(HCoV 229E)和一种在猪体内引发传染性胃肠炎的病毒(TGEV)的Mpro的晶体结构以及以此为基础构建的SARS冠状病毒(SARS-CoV)同源蛋白酶的空间结构模型.通过对这些同源蛋白酶的结构及其与已知的蛋白酶化学抑制剂的结合特征进行分析后发现Mpro的底物结合位点具有惊人的保守性,这种保守性也被重组SARS-CoV Mpro能介导的TGEV Mpro的底物剪切实验所进一步证实.分子模型表明已有的鼻病毒3Cpro抑制剂经过改进后或许能用于SARS的治疗.     

生物碱的提取与分离纯化技术

生物碱是广泛存在于自然界天然植物中的碱性含氮有机化合物。大多数生物碱具有显著的生理活性。是许多药用植物的有效成分。利用现代分离技术把生物碱从天然产物中分离出来并对其进行纯化,对于开发其药用价值,以满足天然药物和天然保健品日益高涨的社会需求,促进中药走向世界,提高天然产物的经济和社会效益均具有非常重要的意义。主要对生物碱的提取、分离纯化及分析检测技术研究进展进行综述。     

天然产物：人类生存不可或缺的重要资源

天然产物是指自然界中生物有机体（植物、动物、微生物等）的代谢产物，通常具有一定的药理学或生物学活性。随着生物分子分离纯化与鉴定技术的发展，有越来越多的天然活性物质被发现，特别是一些药用植物、海洋生物和真菌的代谢产物，具有消炎、抗癌、抗氧化、预防损伤、调节血糖等特殊功效，已成为新药开发与设计的研究热点。     

冠状病毒感染导致急性肺损伤的天然免疫机制研究进展

世界卫生组织在2020年1月31日宣布新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引发的肺炎为国际关注的突发公共卫生事件,目前疫情已在全世界范围蔓延.肺部是SARS-CoV-2作用的主要靶器官,该病毒通过感染肺泡细胞诱发细胞因子风暴,导致组织损伤并最终造成严重急性呼吸综合征,而天然免疫是人体抗病毒的第一道防线.该文综述肺部宿主细胞通过激活其天然免疫应答抵御冠状病毒入侵以及免疫反应过激后导致肺组织损伤的分子机制,以期为SARS-CoV-2引发的肺损伤治疗提供创新的药物靶标,并为预防和治疗方案设计提供免疫学和病理学基础.     

SARS的研究进展

2003年3月,发现SARS病原是一种从未在人类或动物中发现过的新的冠状病毒.其基因组结构与其他的冠状病毒相似,由29727核苷酸组成,有11个开放阅读框.通过多基因分析序列比较说明,SARS冠状病毒与已知的冠状病毒无关.针对SARS冠状病毒的各种特征及研究进展进行了综述.     

SARS相关冠状病毒刺突糖蛋白的研究(综述)

概述了SARS—CoV的S蛋白的结构及功能相关研究。严重急性呼吸综合症相关的冠状病毒(SARS-CoV)引起2003年我国南方非典型肺炎爆发流行，波及多个国家和地区。目前全球许多学对SARS-CoV进行了广泛的研究，发现S蛋白是病毒表面的主要蛋白，它构成冠状病毒科特征性的冠状样结构，在严重急性呼吸综合症的发病机制起着关键性作用，可介导表达相关受体的宿主细胞感染。现已鉴定出SARS-CoV的S蛋白相关受体，同时它在抗病毒感染中是一个关键靶蛋白。     

Genome sequence variation analysis of two SARS coronavirus isolates after passage in Vero cell culture

SARS coronavirus is an RNA virus whose replication is error-prone, which provides possibility for escape of host defenses, and even leads to evolution of new viral strains during the passage or the transmission. Lots of variations have been detected among different SARS-CoV strains. And a study on these variations is helpful for development of efficient vaccine. Moreover, the test of nucleic acid characterization and genetic stability of SARS-CoV is important in the research of inactivated vaccine. The whole genome sequences of two SARS coronavirus strains after passage in Vero cell culture were determined and were compared with those of early passages, respectively. Results showed that both SAPS coronavirus strains have high genetic stability, although nearly 10 generations were passed. Four nucleotide variations were observed between the second passage and the llth passage of Sinol strain for identification of SARS inactivated vaccine. Moreover, only one nucleotide was different between the third passage and the 10th passage of Sino3 strain for SARS inactivated vaccine. Therefore, this study suggested it was possible to develop inactivated vaccine against SARS-CoV in the future.     

Angiotensin-converting enzyme 2 is a functional receptor for the SARS coronavirus

Spike (S) proteins of coronaviruses, including the coronavirus that causes severe acute respiratory syndrome (SARS), associate with cellular receptors to mediate infection of their target cells. Here we identify a metallopeptidase, angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2), isolated from SARS coronavirus (SARS-CoV)-permissive Vero E6 cells, that efficiently binds the S1 domain of the SARS-CoV S protein. We found that a soluble form of ACE2, but not of the related enzyme ACE1, blocked association of the S1 domain with Vero E6 cells. 293T cells transfected with ACE2, but not those transfected with human immunodeficiency virus-1 receptors, formed multinucleated syncytia with cells expressing S protein. Furthermore, SARS-CoV replicated efficiently on ACE2-transfected but not mock-transfected 293T cells. Finally, anti-ACE2 but not anti-ACE1 antibody blocked viral replication on Vero E6 cells. Together our data indicate that ACE2 is a functional receptor for SARS-CoV.     

A Coordination Model of Gene Sequences for SARS-CoV and its Receptor

IntroductionFrom the emergence of SARS CoV, manystudies havebeen done on its biological medicine aspects, such aspathogeny characteristics, mechanisms of causing disease,clinic diagnosis and treatment, bacterin development andthe spreading rules. At the level of molecule biology,studies have been done on its genome sequences characteristics, structures and functions of the translatedproteins, and the evolution relationships in sequences[1 5].The caus…     

Bioinformatical study on the proteomics and evolution of SARS-CoV

A novel coronavirus has been identified as the causative agent of the severe acute respiratory syndrome (SARS). For all the SARS-CoV associated proteins derivated from the SARS-CoV genome, the physiochemical properties such as the molecular weight, isoelectric point and extinction coefficient of each protein were calculated. The transmembrane segments and subeellular localization (SubLoeation) prediction and conserved protein motifs search against database were employed to analyze the function of SARS-CoV proteins. Also, the homology protein sequence alignment and evolutionary distance matrix calculation between SARS-CoV associated proteins and the corresponding proteins of other coronaviruses were employed to identify the classification and phylogenetic relationship between SARS-CoV and other coronaviruses. The results showed that SARS-CoV is a novel coronavirus which is different from any of the three previously known groups of coronviruses, but it is closer to BoCoV and MHV than to other coronaviruses. This study is in aid of experimental determination of SARS-CoV proteomics and the development of antiviral vaccine.     

SARS冠状病毒的起源和进化初探

发展了一种研究基因序列进化的随机替代模型,根据一组从某个最近共同祖先演化而来的若干序列,可以预测此共同祖先序列,并计算随机替代概率矩阵,确定了从祖先序列的各个碱基到进化序列的各个碱基之间的替代概率。将这一模型应用于分析包括SARS冠状病毒在内的4种冠状病毒全基因组的演化规律,确定了在若干较保守的编码蛋白基因序列中同义替代位点的最近共同祖先序列以及分歧进化后的累计同义替代数目。结果表明,SARS病毒和其他几种已知的冠状病毒具有相当的进化历程,但存在不同的进化途径,支持了SARS病毒在造成此次大规模感染人体之前已经历了较长的进化历程的猜测。     

Molecular phylogeny of coronaviruses including human SARS-CoV

The outbreak of SARS sets an urgent task to reveal the origin of human SARS-CoV, i.e. its relation to other known species of coronavirus, and to trace the genetic variation in the spreading process of SARS. Partial answer to the problem may be obtained from phylogenetic analy-sis of available genomes. We call a phylogenetic tree of different species of coronavirus including the human SARS-Cov a CoV Tree and that of different isolates of SARS-CoV a SARS Tree. CoV trees have been c…