模板甲基化水平对鼠肝RNA聚合酶体外转录活性…

利用＾３Ｈ－ＵＴＰ同位素参入法，研究了大鼠肝细胞ＲＮＡ聚合酶在核内外的转录活性。结果表明：在细胞核内的转录活性明显低于在无核抽提物中的转录活性。利用自身的ＤＮ模板，优于利用外加的ＤＮＡ模板。并比较了没ＤＮＡ甲基化水平的模板对ＲＮＡ聚合酶体外转录活性的影响。发现模板的甲基化水平与其体外转录水平呈反相关。     

人锰超氧化物歧化酶cDNA基因的克隆

利用人胚胎肝组织提取总ＲＮＡ,从总ＲＮＡ 中分离纯化出ｍ ＲＮＡ,经逆转录得到ｃＤＮＡ 第一条链,并以之为模板和相应寡聚脱氧核苷酸为引物,进行ＰＣＲ 合成人锰超氧化物歧化酶ｃＤＮＡ 基因,将所得ｃＤＮＡ 克隆到质粒ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ 上,转化大肠杆菌ＤＨ５α细胞,进行诱导表达筛选,将筛选的克隆进行ｃＤＮＡ 全序列测定     

杂交捕获抑制聚腺苷二磷酸核糖聚合酶基因的体外翻译

体外转录载体ｐＳＰ７２—Ｃ１２和ｐＳＰ７２—Ｃ１．４分别经ＸｂａⅠ和ＸｈｏⅠ酶切线性化后，用ＳＰ６ＲＮＡ聚合酶与Ｔ７ＲＮＡ聚合酶进行体外转录得到编码人聚腺苷二磷酸核糖聚合酶基因的ｍＲＮＡ全序列（３．７ｋｂ）及与其５’端编码区的起始密码子ＡＵＧ上游区域互补的反义ＲＮＡ片段（１．４ｋｂ）。等摩尔数的正、反义ＲＮＡ通过酚相乳浊杂交技术进行分子杂交。在网织红细胞裂解物体外翻译系统中，正义ＲＮＡ能正常地翻译出蛋白质；而反义ＲＮＡ与正义ＲＮＡ杂交可阻断翻译的进行。     

真核细胞转录系统启动T7启动子起始的研究

利用氯霉素乙酰转移酶基因（ＣＡＴ）和人低密度脂蛋白受体基因（ＬＤＬＲ）作为报道基因,根据α－鹅膏蕈碱（α－ａｍａｎｉｔｉｎ）对真核生物ＲＮＡ聚合酶的选择性抑制,分析Ｔ７噬菌体启动了为哺乳类动物细胞启动外源基因表达的机制。结果表明：真核生物ＲＮＡ聚合酶Ⅱ可启动Ｔ７启动子的转录;同时应用ＤＮＡ－蛋白质凝胶泳动技术,发现人工合成的Ｔ７启动子能与核蛋白质结合,进上步证明了哺乳类动物细胞妄动Ｔ７启动子的转录     

小麦叶绿体DNA的提取与psbA基因的扩增

利用高离子强度，低ｐＨ值缓冲液匀浆细胞的方法，提取小麦叶绿体ＤＮＡ，并以此为模板，通过聚合酶链反应（ＰＣＲ）对小麦叶绿体ｐｓｂＡ基因进行了特异性扩增。     

抗—DNA免疫复合物性质的研究

用聚乙二醇和硫酸铵从系统性红斑狼疮患血清中分离出免疫复合物和血浆核酸。分析结果表明，ＰＮＡ的主要成分是ＲＮＡ，仅有少量ＤＮＡ存在，并且ＰＮＡ中ＤＮＡ的ｄＧ＋ｄＣ含量（５５％）明显高于正常值（４２％）。一旦经过ＲＮａｓｅ处理，ＰＮＡ抑制抗－ＤＮＡ抗体结合ＤＮＡ的能力降低，说明抗－ＤＮＡ抗体和ＲＮＡ有交叉反应。动力学研究观察到，抗－ＤＮＡ免疫复合物中抗原抗体的分子比是１：１结合能为３７ｋＪ／ｍｏｌ．     

链霉菌基因组提取方法的比较与改进

将链霉菌菌株Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．纯化后,测得其葡萄糖异构酶的比活力为０．４１４ｕ／ｍＬ,使用苯酚氯仿法提取提的基因组ＤＮＡ浓度较低,ＲＮＡ和蛋白较多,但用大量法时仍可得到大量的ＤＮＡ,使用试剂盒法得到的基因组ＤＮＡ浓度较大,但仍有大量ＲＮＡ存在,由亚精胺法得到的基因组ＤＮＡ浓度较好,ＲＮＡ很少,自行设计的改进法得到的基因组ＤＮＡ,量特别大,纯度很高,ＤＮＡ大小集中在３０ｋｂ左右,ＲＮＡ很少,非竽相应的基因工程操作。     

放线菌素D及类似物对荷瘤小鼠生理生化影响

放线菌素Ｄ及类似物对荷瘤小鼠生理生化影响１）董守良２）倪京满１）王勤１）王锐②（兰州大学１）生物系，２）化学系，应用有机化学国家重点实验室，７３００００兰州）放线菌素Ｄ（ＡｃｔｉｎｏｍｙｃｉｎＤ，ＡＭＤ）是一种作用于模板ＤＮＡ（或ＲＮＡ），抑制转录和...     

12种作物种子DNA的提取与纯化

采用黄化苗,按氯仿—异戊醇—ＲＮＡ酶法获得ＤＮＡ粗制品,后经酚—氯仿—乙戊醇纯化得１２种作物新品种的ＰＣＲ反应模板ＤＮＡ。结果测量获得的数据和曲线表明：采用本实验的提取方法,可得到具有一定纯度和数量的ＤＮＡ,完全可以满足ＰＣＲ反应所需。     

真核生物转录起始影响因子的研究进展

转录水平的调控是基因表达调控的主要方式．本文从染色质与转录激活、ＲＮＡ 聚合酶Ⅱ复合体以及转录起始因子等方面综述了目前关于转录起始影响因子的一些研究进展．     

植物基因工程中的转基因沉默机制

植物转基因沉默可以发生在染色体DNA、转录和转录后三种不同的层次上,转录水平基因沉默机制涉及DNA甲基化、位置效应、重复序列、同源序列等作用。转录后水平基因沉默机制常用RNA域值模型、异常RNA模型、双链RNA模型、未成熟翻译终止模型等解释。目前没有一种通用的模型可以解释所有的转基因沉默现象,但不同模型从不同方面解释了转基因机制的某些方面。     

Detection of DNA methylation changes during seed germination in rapeseed （Brassica napus）

DNA methylation is a common yet important modi- fication of DNA in eukaryotic organisms. DNA methy- lation, especially methylation of cytosine (m5C), have both epigenetic and mutagenic effects on various cellu- lar activities such as differential gene exp…     

Aberrant DNA methylation in cloned ovine embryos

By using the approach of immunofluorescence staining with an antibody against 5-methylcytosine （5MeC）, the present study detected the DNA methylation patterns of cloned ovine embryos. The embryos derived from in vitro fertilization were also examined for reference purpose. The results showed that： （1） during the preimplantation development, cloned embryos displayed a similar demethylation profile to the fertilized embryos; that is, the methylation level decreased to the lowest at 8-cell stage, and then increased again at morulae stage. However, methylation level was obviously higher in cloned embryos than in stage-matched fertilized embryos, especially at 8-cell stage and afterwards; （2） at blastocyst stage, the methylation pattern in cloned embryos was different from that in fertilized embryos. In cloned blastocyst, inner cell mass （ICM） exhibited a comparable level to trophectoderm cells （TE）, while in in-vitro fertilized blastocyst the methylation level of ICM was lower than that of TE, which is not consistent with that reported by other authors. These results indicate that DNA methylation is abnormally reprogrammed in cloned embryos, implying that aberrant DNA methylation reprogramming may be one of the factors causing cloned embryos developmental failure.     

Predicted methylation landscape of all CpG islands on the human genome

CpG island methylation plays important role in various biological processes. To investigate methylation landscape of all CpG islands on the human genome, we develop a model for predicting the CpG island methylation status. This model outperforms other existing methods. We apply the model on the whole human genome and predict the landscape of DNA methylation of all CpG islands. Based on the methylation profile, we find that about 31% of CpG islands are methylation-prone and CpG islands located in promoter regions are seldom methylated. There is no significant difference in the CpG island methylation level between R and G bands among the chromosomes. The occupancy of RNA polymerase II is significantly higher in methylation-resistant promoter CpG islands, indicating that genes with such promoter CpG islands tend to be more active.     

RNA对基因表达调控作用的研究进展

RNA可以单独或者通过与其它蛋白因子的相互作用参与基因表达的调控。在转录前水平,RNA分子可以通过介导DNA的甲基化或异染色质的形成来调控基因表达;在转录水平,RNA分子通过直接与转录因子或RNA聚合酶相互作用来调控基因表达;在转录后水平,RNA利用由siRNA和microRNA介导的RNA干扰机制,通过降解目标mRNA或阻碍目标基因的翻译来沉默基因的表达。此外,mRNA还可以通过感知环境中代谢物的浓度,通过形成核糖开关（riboswitch）来调控基因的表达;反义RNA可以从复制、转录和翻译3个水平上调控基因的表达。     

糖尿病大鼠肾、胰基因组DNA甲基化状态的变化

从正常大鼠，糖尿病大鼠，中药糖微康治疗的糖尿病大鼠，西药开搏通治疗的糖尿病大鼠的肾，胰等组织中提取出其基因组DNA，应用对DNA甲基化作用敏感的限制性核酸内切酶HpaⅡ和MspⅠ（为一组同裂酶（进行了限制性酶切图谱分析，结果表明，DNA化作用的主要位点在CpG二核苷酸处，且“糖微康”在关闭患糖尿病后肾组织中被异常活化的基因的同时，还能活化糖尿病动物胰组织中处于静息状态的基因，由此可见糖尿病的发病和治疗都与DNA甲基化作用密切相关。     

低盐刺激下副溶血弧菌基因转录表达分析

目的:应用全基因组DNA芯片技术分析低盐冷刺激作用下副溶血弧菌基因的转录表达变化.方法:分别采用"低盐持续刺激培养(continuous growth,CTG)"和"中间转入低盐环境培养(shift growth,STG)".CTG和STG下.分别采用含NaCl浓度为2%和0.66%的MV-5培养基孵育副溶血弧菌,收集菌体,提取RNA,应用全基因组DNA芯片分别比较两个不同的转录表达谱基因变化特点,分析其作用规律.同时,应用实时定量逆转录多聚酶联反应对芯片结果进行验证.结果:和对照组相比,STG实验中,共有205个基因的转录表达发生显著性变化,上调的基因占优势地位;CTG实验中,总计有298个基因的转录表达发生显著性变化,上、下涮的基因总体基本趋于平衡状态,没有明显差异.实时定量逆转录多聚酶联反应结果证实其和芯片数据结果有很强的相关性.结论:在低盐这一"胁迫环境"下,副溶血弧菌利用其存在的独特而精细的应对机制,能够顽强的生存下来并繁衍生殖,这一过程中,节能调节处于调控的核心地位.