酿酒酵母功能基因组学研究进展

随着各种微生物基因组序列信息的积累和测序工作的不断完成,酿酒酵母基因组学研究的重点已由传统的结构基因组学发展到了功能基因组学,并从单一的基因功能研究转向多个或整个基因组系统地去了解真核生物生命活动的本能。对基因组学水平上酿酒酵母功能基因的生物芯片分析,代谢通路和功能图谱,以及比较基因组学研究进行综述。     

水稻基因组学研究概况

重点对水稻的结构基因组学、功能基因组学和蛋白质组学的主要研究内容、研究方法和研究进展三个方面进行了综述，并对与水稻基因组学研究相关的学科，如生物信息学、比较基因组学等方面进行了阐述，最后对水稻基因组学的发展进行了简单展望．     

上海师范大学“功能基因组学”创新团队

“功能基因组学”创新团队为上海师范大学首批4个学术创新团队之一，该学术创新团队依托生命与环境科学学院，团队负责人杨仲南教授，团队成员有肖明教授、郭水良教授、董彦君教授和杨晓彤副教授，分别负责创新团队的5个学术方向：模式植物功能基因组学、作物功能基因组学、生态与进化功能基因组学、微生物功能基因组学和功能基因产物的立用研究，该创新团队具有以下特点。     

蛋白质组技术的研究进展

基因组学的研究已从结构基因组学转移到功能基因组学上来。以大规模分析蛋白质作为其主要内容的蛋白质组是功能基因组学研究的一个主要内容。综述了蛋白质组研究所使用的主要技术，包括：二维凝胶电泳技术、质谱技术、蛋白质芯片技术、蛋白质复合物纯化技术、酵母双杂交技术、嗜菌体显示技术。     

能源植物高粱基因组研究进展

 回顾了高粱基因组学研究的发展进程, 概述了初期组学数据的积累、参考基因组的破译及新一代测序技术和数据分析方法引领下的组学研究进展;介绍了高粱基因组的结构, 从比较基因组学的角度, 分析了高粱基因组的进化及其特性;探讨了高粱功能基因组的研究方法和研究进展, 总结了已经发掘的高粱关键基因和遗传位点, 对高粱组学数据资源进行了归纳。对高粱基因组学的发展方向进行了展望。     

植物功能基因组学研究进展

本文主要综述植物功能基因组学的研究目的、研究内容、研究方法以及研究进展。     

酿酒酵母基因组的研究进展

酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是第一个完成全基因组测序工作的真核生物,目前在结构基因组学、功能基因组学、模式生物、最小基因组、比较基因组学等方面的研究已经获得了重大的进展,为人类更深入地研究高等生物基因组打下了坚实的基础。本文将从这几个方面着手对酿酒酵母基因组的研究进展进行综述。     

当前人类遗传学研究方向

人类基因组测序研究已将人类遗传学带入了一个信息爆炸的新时代。人类遗传学研究中基因组学、功能基因组学、蛋白质组学和生物信息学的应用使得人们可以在一个极为广泛的范围内研究人类基因疾病。     

后基因组时代的分析利器

2001年2月,和分别发表了人类基因组工作框架图(the draft genome),这是人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)实施以来取得的最重大进展,同时预示着基因组研究已开始从结构基因组学向功能基因组学(Functional Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)过渡和转化,标志着"后基因组时代(postgenomic age)"的到来.在功能基因组学研究中,基因表达分析占有非常重要的地位.     

基因组学与蛋白质组学

介绍了基因组与基因组学、蛋白质与蛋白质组学的概念及功能基因组学和蛋白质组学的研究方法。     

丝状真菌基因组学研究进展

介绍了真菌,尤其是丝状真菌在基因组学(包括比较基因组学)和功能基因组学(包括转录组学、蛋白质组学、代谢物组学)等研究领域的进展情况。     

蛋白质组学核心技术研究进展

人类基因组计划的完成标志着生命科学已进入后基因组时代,蛋白质组学的研究被提升到了前所未有的高度.对蛋白质组学研究中的三大核心技术——双向电泳、生物质谱、生物信息学技术的进展及其应用进行了概述,重点介绍了双向电泳技术和生物质谱技术.     

植物差异表达基因克隆技术及研究进展

随着分子生物学技术的深入发展,植物基因组研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究,目前分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点.近些年来,国内外学者发展了多种分析差异表达基因的技术来研究植物在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,掌握了生命活动过程中的重要信息.文章对建立在RNA水平上克隆植物未知差异表达基因的几种关键技术及其研究进展进行了综述,阐述了各技术的原理、技术路线、优缺点及相应的改进方法,并对它们在植物抗逆研究中的应用现状及前景作了展望.     

结构基因组学综合数据库分析的构建和作用

介绍了结构基因组学综合数据库构建的意义和综合数据库的功能,主要包括Gerstein总结的对有限的蛋白质片段的折叠分类和排列、种系发生信息、蛋白质的功能分类和蛋白质的相互作用信息、基因表达信息和综合数据库对报道结构基因组研究数据和格式的要求。     

海水养殖鱼类抗病分子育种研究进展及前景展望

病害是限制水产养殖业可持续发展的关键因素。而我国目前尚缺乏优良的抗病养殖鱼类品种。鱼类功能基因组和分子标记技术的发展为筛选鱼类抗病相关功能基因和分子标记提供了机遇。基因转移、分子标记和基因标记等分子育种技术是培育抗病优良鱼类新品种的很有潜力的技术手段，已成为国际上的发展趋势，也是我国今后应大力发展的研究领域。本文结合笔者实验室的工作，对某些海水养殖鱼类抗病相关功能基因及抗病分子育种研究的最新进展作一综述介绍；     

Functional genomics in the rice blast fungus to unravel the fungal pathogenicity

A rapidly growing number of successful genome sequencing projects in plant pathogenic fungi greatly increase the demands for tools and methodologies to study fungal pathogenicity at genomic scale. Magnaporthe oryzae is an economically important plant pathogenic fungus whose genome is fully sequenced. Recently we have reported the development and application of functional genomics platform technologies in M. oryzae. This model approach would have many practical ramifications in design and implementation of upcoming functional genomics studies of filamentous fungi aimed at understanding fungal pathogenicity.     

几种常用的基因敲除技术

随着功能基因组学研究的深入发展，基因敲除技术逐渐成为基因功能研究的重要手段，本文就常用的三种基因敲除技术，即同源重组、插入突变、RNA干扰各自的原理、适用的范围和优缺点作简要介绍。