基于ISSR数据探讨节茎曲柄藓(Campylopus umbellatus(Arn.) Paris)遗传多样性和居群遗传结构

选用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)分子标记,对分布于浙江清凉峰国家级自然保护区顺溪坞和凉源、浙江台州临海天台山、浙江舟山嵊泗列岛、江苏苏州天平山、广西上思十万大山、台湾宜兰县马告生态公园和云南西双版纳纳板河流域国家自然保护区8个自然居群的40份节茎曲柄藓(Campylopus umbellatus(Arn.) Par.)的遗传多样性进行了研究.应用筛选出的12条引物,共扩增出172条清晰、重复性高的条带.使用POPGENE 3.2分析发现:其中158条条带的多态性位点百分率(PPB)为91.86%,根井正利基因多样性指数(H)为0.292 2,香农-维纳多样性指数(I)为0.445 9,说明节茎曲柄藓居群遗传多样性水平较高.8个居群的遗传分化系数(G_(st))为0.634 6,居群间的基因流(N_m)为0.287 9,63.33%的遗传变异存在于居群间,36.67%的遗传变异存在于居群内,说明节茎曲柄藓居群间的遗传分化明显.基于ISSR数据的聚类分析表明:以遗传距离65为分组阈值,8个居群可被分为6组,节茎曲柄藓居群间的遗传分化主要由地理因素造成,居群内的遗传分化可能与生境的异质性有关.     

狭边大叶藓(Rhodobryum ontariense)遗传多样性的ISSR分析

狭边大叶藓[Rhodobryum ontariense(Kindb.)Paris]为真藓科大叶藓属植物,具有治疗心血管疾病的功效。本研究选用ISSR分子标记对分布于河北、河南、四川和陕西四省的9个狭边大叶藓自然居群的遗传多样性进行研究,目的在于揭示狭边大叶藓居群的遗传结构和遗传多样性水平,为其保护和合理开发利用提供科学依据。用8个ISSR引物对9个居群共58个样品进行扩增,共获得47条清晰的扩增位点。POPGENE分析表明,狭边大叶藓居群遗传多样性水平较低(多态性位点比率为37.75%,Nei’s基因多样性为0.153 0,Shannon’信息指数为0.222 8,遗传分化指数Gst为0.299 7,居群间的基因流为1.168 2)。AMOVA分析表明,大多数遗传变异(84.07%)存在于居群内,15.93%的遗传变异存在于居群间(Φst=0.159 3)。UPGMA聚类分析表明,狭边大叶藓居群遗传距离和地理距离没有相关性(r=0.404 95,p=0.979 1)。     

冶勒自然保护区垂枝香柏的ISSR遗传多样性研究

利用ISSR分子标记对冶勒自然保护区垂枝香柏（Sabina pingii（Cheng ex Ferré）的6个居群共65个个体进行了遗传多样性的比较分析. 10个引物共扩增出121个多态性位点,物种水平多态性位点百分率（PPB）为98.37%,居群水平的多态性位点百分率相对较低,在37.40%～51.22%间. 居群间遗传分化系数Gst为0.4959,即总遗传变异中有50.41%的变异发生在居群内,49.59%的变异发生在居群间,基因流Nm为0.5083. 居群间及居群内分化均较明显,可能是由于地理隔离     

苗药红禾麻种质资源遗传多样性的ISSR分析

为研究苗药红禾麻种质资源的遗传多样性和亲缘关系,利用ISSR分子标记技术对43个红禾麻居群进行遗传多样性分析和聚类分析。结果显示,10条ISSR引物共扩增出123条带,其中多态性条带114条,占总扩增条带数92.68%,Nei’s基因多样性(H)和Shannon信息指数(I)分别为0.418 5和0.605 2;居群间基因多样性(Dst)和居群内基因多样性(Hs)分别为0.250 7和0.167 6;通过非加权成组配对法(UPGMA)进行聚类分析,43个居群可聚为3组。结果表明,红禾麻种质具有较丰富的的遗传多样性,其遗传结构为居群间遗传多样性高于居群内,本研究从分子水平上揭示红禾麻的遗传变异幅度及其规律,为红禾麻的优良种源选育提供科学依据。     

黑籽重楼种内AFLP遗传多样性及遗传分化研究

以四川瓦屋山、峨眉山和彭州3个地区的黑籽重楼原变种居群及峨眉山、彭州2个地区的无瓣黑籽居群为供试材料,用筛选出的4对引物,对5个群体共计74个个体进行AFLP分析,每对AFLP引物扩增出61～78条多态带,共得到235条多态带.黑籽重楼遗传多样性较高,物种水平的多态带百分率PPB为81.88%,Nei'S基因多样性指数H为0.2490.Shannon多样性指数I为0.3867,居群间基因流为1.6870;在变种水平上,黑籽重楼原变种PPB为78.40%,Nei's基因多样性指数H为0.2849,Shannon多样性指数I为0.4237;无瓣黑籽的PPB为63.07%,Shannon多样性指数I为0.3603,Nei'S基因多样性指数H为0.2439.黑籽重楼种下的两个变种间的遗传分化系数Gst为0.0726,遗传分化指数PHIst为13.33%.聚类结果无瓣黑籽重楼和黑籽重楼原变种分别分成两支.总而言之,黑籽重楼物种水平上有丰富的遗传多样性,居群内遗传分化大于居群问,居群间的相似性系数很大,但种下的两个变种间有一定的遗传分化.     

地黄居群遗传多样性的ISSR分析

采用ISSR分子标记,对地黄（Rehnwmnia glutinosa）14个自然居群、1个栽培居群和属内近缘种5个居群的遗传多样性与遗传结构进行了研究．结果表明：地黄不同居群的平均多态位点百分率（PPB）为40．53％,平均Shannon多样性指数为0．1915,平均Nei’s基因多样性指数h为0．1253,遗传多样性水平较低．AMOVA分析结果和基因分化系数显示遗传变异主要发生在居群内,居群间的遗传分化显著,其遗传分化水平介于异交物种和自交物种之间．地黄居群间的基因交流程度有限（基因流为0．3784）．Mantel检测显示自然居群间遗传距离与地理距离之间没有明显相关性．推断营养繁殖占优势和受人类栽培活动的长期影响可能是导致地黄遗传多样性水平低、居群间遗传分化显著的主要原因．     

小豹斑鹅膏遗传多样性研究

小豹斑鹅膏子实体形态多样,不同地域所采标本有较大差异.作者应用ISSR及ITS分子标记,对采自12个不同地区的小豹斑鹅膏居群进行了遗传多样性及聚类分析.结果表明,12条ISSR引物扩增的多态性条带比例(PPB)为72.84%,居群间的基因分化系数(Gst)为0.426 1,表明小豹斑鹅膏具有丰富的基因多样性,其中57.4%存在于居群内,42.6%存在于地理隔离较远的居群间;12个地区样品的IST序列长度皆为710 bp,有30个碱基位点在ITS1区发生变异.2种方法的遗传距离分析及聚类结果基本相似,都表明小豹斑鹅膏的遗传分化与地域的相关性较大.ISSR揭示遗传分化及遗传变异的能力较ITS强.     

广西药用植物两面针遗传多样性的ISSR分析

【目的】目前两面针（Zanthoxylum nitidum）野生资源逐渐减少,开展对其居群遗传学研究有利于两面针野生资源的保护和可持续利用。【方法】利用ISSR分子标记对11个广西两面针自然居群共138个样本进行DNA多态性分析。【结果】从100个随机引物中筛选出8个有效引物,共扩增出63个DNA片段,都为多态性条带,多态位点百分率（P）为100%。两面针在物种水平上具有较高遗传多样性,Nei’s基因多样性（He）和Shannon信息指数（I）分别为0.227和0.356。两面针11个居群的遗传分化系数（Gst）为0.490,居群内变异占51%,居群间变异占49%,说明居群间和居群内的遗传分化基本持平;居群间基因流（Nm）为0.52,表明居群间基因流动较贫乏。各居群间的遗传距离在0.053~0.334之间,居群间的聚类及Mantel检验（r=0.391,p=0.040）均表明广西两面针居群地理距离与遗传距离之间的相关性不明显。【结论】广西野生两面针种质资源多样性较高,有利于培育高品质的药材品种;就地保护是两面针资源保护的首选,选择个体数量多、居群内变异系数大,自然环境不易受到人为影响的天然居群进行保护。     

基于ISSR西北地区珍珠猪毛菜(Salsola passerina)的遗传多样性(英文)

运片JSSR分子标记的方法,对分布于中国北方7个居群的137个珍珠猪毛菜个体筛选出了15条引物,产生了196条带,其中153条为多态性条带,总的基因多态率为78.06%,多态性在种群水平上较低,平均多态率为45.60%.平均期望杂合度和Shannon信息指数在种间水平上分别为0.1759和0.2811,在居群水平上为0.125l和0.1977,种群内个体间的遗传分化较大,为70.96%,而种群间遗传分化较小,为29.04%,种群间的遗传一致度平均为0.9320.AMOVA分析得到了相似结果.基于Nei's遗传距离的UPGMA聚类分析将7个居群分为3组:德令哈、兰州和其余5个居群(中宁,乌海,民勤,金塔和安西).Mantel检验表明遗传距离与垂直地理分布显著相关(P相似文献   

外来入侵种空心莲子草的RAPD遗传多样性分析

基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法,对8个居群空心莲子草Agasicles hygrophila的遗传多样性及分化程度进行分析。10条随机引物扩增出99个可分析位点,多态位点百分比为36．3％。POPOGENE分析发现,空心莲子草居群平均水平的多态位点百分比为26．2％,Nei’s基因多样度为0．0906,Shannon信息指数为0．1609,具有较高的遗传多样性;居群间遗传分化比例为30．88％,居群内遗传分化占69．12％;居群间基因流为1．1189。结合居群遗传多样性及UPGMA聚类分析表明,镇江及南京地区是空心莲子草遗传变异程度最高的中心区,应该作为外来种空心莲子草防治及根除的重点地带,防治的最有效措施是加强对其无性繁殖体临近传播、蔓延和扩散途径的阻断。     

Genetic relationships among Chinese and American isolates of Phytophthora sojae assessed by RAPD markers

The genetic diversity of three geographic populations of Phytophthora sojae from China and the United States was determined using random amplified polymorphic DNA （RAPD）. The purpose was to explore genetic relationships among Chinese and American isolates of the organism. 21 random primers were selected among 200 random primers screened. A total of 223 reproducible RAPD fragments were scored among 111 individuals, of which 199 （89.23%） were polymorphic. Analysis of genetic variation showed that there existed higher genetic variation in the United States population in comparison to the Chinese populations. Nei＇s genetic identity and principal component analysis indicated that the populations of Fujian and United States are closer to each other than to Heilongjiang populations. Shannon-Wiener diversity index revealed that the United States populations have a higher genetic di- versity than that of Chinese populations. These data are in support of the hypothesis that P. sojae in the United States might not have been introduced from China.     

黄河三角洲柽柳群体遗传多样性RAPD分析

采用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记技术,分析了黄河三角洲主要优势树种之一柽柳(Tamarix chinensis)3个天然群体的遗传多样性及遗传分化。结果表明:26条随机引物扩增出105个可分析位点,多态位点百分比40.07%,Nei的基因多样度(h)为0.4061,Shannon多样性指数(I)为0.5917,基因分化系数(Gst)为0.0507,基因流值为9.3564。分子方差分析(AMOVA)表明,在总遗传变异中,群体间遗传变异占7.17%,群体内占92.83%。说明柽柳物种内存在较高的遗传多样性,群体的遗传变异主要存在于群体内,群体间基因交流频繁,遗传距离与地理距离具有显著相关性。     

野生和人工选育黄河鲤遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术,对采集于长垣天然文岩渠(野生群体)、河南省水产科学研究院(黄河品系Ⅰ群体)、小浪底水库(野生群体)、河南黄河鲤鱼良种场(豫选黄河鲤群体)的4个群体黄河鲤的120个个体的遗传多样性进行了分析.8个ISSR引物共获得64个扩增位点,其中多态位点31个,多态位点比例为48.44%.4个群体的多态位点比例分别为14.06%,32.81%,34.38%和20.31%,遗传距离分别为0.0576、0.1657、0.1674和0.0800,Nei基因多样性分别为0.0538、0.1099、0.1308和0.0723,Shannon信息指数分别为0.0784、0.1669、0.1923和0.1072.文岩渠群体与黄河品系Ⅰ群体遗传距离最远(0.1717),与小浪底水库群体遗传距离最近(0.0558).表明这些群体间发生了较弱的遗传分化.UPGMA聚类结果为文岩渠群体与小浪底群体先聚在一起,其次是与豫选黄河鲤,最后与黄河鲤品系Ⅰ相聚.用AMOVA进行遗传变异方差分析得到遗传变异固定指数(Φst=0.0179,P0.05),显示黄河鲤大部分变异(98.21%)发生在群体内,群体间变异较小(1.79%).说明人工选育群体的遗传结构尚未发生明显变化.     

唐鱼野生与养殖群体遗传多样性的随机扩增多态DNA(RAPD)分析

应用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术对唐鱼野生与养殖群体的遗传多样性进行了分析。从40个10BP引物中选取15个用于群体遗传多样性分析,共检测出93个位点,其中46个(49.46%)呈多态;两群体的多态位点比例分别为43.01%和41.94%;用香农指数量化的遗传多样性指数,野生群体(0.23)略高于养殖群体(0.20),平均遗传多样性指数为0.22,群体内和群体间的遗传变异比例分别为85%和15%;群体的遗传相似度高达0.96,彼此间的遗传距离仅为0.04。研究表明,唐鱼目前的种质资源状况令人堪忧,恢复唐鱼有效种群大小、丰富物种遗传多样性是资源保护的基础。     

山东长岛南4岛狗尾草（Setaira viridis（L.）Beauv）种群遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术研究了山东省长岛县南部4岛90份狗尾草材料的遗传多样性及遗传结构.13个ISSR引物共扩增出148个位点,多态性位点比率为70.30%,Shannon信息指数在物种水平上为0.344 9.根据Gst值,遗传变异有16.53%发生在种群间.遗传距离分析表明,NCS种群与DHS种群遗传一致度最高,遗传距离与地理距离之间没有相关性.     

Influence of long-period pesticide force on genetic polymorphism of wolf spider Pardosa pseudoannulata (Lycosidae: Araneae)

Wolf spiders are predators in large quantities in the fields. How wolf spiders keep their dominant species status under long-period pesticide force? To answer this question, eight geographical populations of Pardosa pseudoannulata were used as materials to test the influence of geographical habitats on their genomic DNA polymorphism. The RAPD pattern showed polymorphic variations among and within different populations. Total 84 bands amplified by 10 random primers, of which 62 (73.81%) are polymorphic, were generated from 55 individuals of eight geographical populations. Meanwhile, Shannon’s index (Ho= 0.5177) showed a rich genetic diversity of P. pseudoannulata, and most of the genetic variation (64.24%) was found within populations. Multiple regression analysis suggested that it is the climatic variation (such as annual average temperature etc.) that results in adaptive eco-geographic differentiation, and it is the long-period pesticide force that speeds up the genetic differentiation of P. pseudoannulata which changed the genetic diversity of the population.     

拟穴青蟹群体遗传多样性的ISSR分析

采用ISSR技术对拟穴青蟹（Scylla paramamosain）3个地理群体：福建群体（FJ）、广西防城港群体（FC）和北海群体（BH）的遗传多样性进行检测。用10对ISSR引物对90个个体进行PCR扩增,用POPGENE32计算遗传参数,并用ARLEQUIN软件进行AMOVA分子变异分析。结果共检测到63个位点,多态位点数为56。福建、防城港和北海群体Nei＇s基因多样性指数（He）分别为0.2670、0.1819和0.2257,Shannon＇s信息指数（I）分别为0.3945、0.2708和0.3371,遗传多样性水平从高到低依次为FJ〉FC〉BH。He和I在群体水平上分别为0.2248和0.3341,在物种水平上分别为0.3186和0.4337。拟穴青触32.34%的变异发生在群体间,67.66%的变异发生在群体内,3个群体间的遗传分化系数为0.1542,产生了一定的遗传分化。     

中国大鲵5个野生种群的AFLP分析

 采用AFLP技术对中国大鲵四川、贵州、湖北、陕西及河南五个野生种群的遗传多样性和遗传分化水平进行了评估。9对引物组合在5个野生种群中共扩增出507条带,其中多态性条带为354。多态位点比例（69.82%）、香农信息指数（0.362 9）和基因多样性指数（0.241 4）等参数均较高,显示中国大鲵遗传多样性水平较为丰富。AMOVA分析发现,中国大鲵遗传多样性绝大部分位于种群内（97.94%）。种群间遗传分化较弱（Фst = 0.021,P<0.001）。根据种群间遗传距离构建的UPGMA树基本依照流域进行聚类,结合化石证据,推测中国大鲵由北向南进行扩散。     

油蒿种群遗传分化的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对油蒿(Artemlsia ordosica Krasch．)的5个种群进行了研究．用15个随机引物扩增出297条清晰谱带，其中285条为多态性谱带．利用POPGENE 32软件对数据进行处理，结果如下：(1)油蒿有着丰富的遗传多态性，多态位点百分率达96％，各种群多态位点百分比在84．6％～90．9％之间．(2)油蒿的种群间分化较小Gat=0．1364，86．36％的遗传变异存在于种群内，各种群的遗传一致度都在96％以上(3)聚类分析显示，地理分布近的种群被聚到了一起，反映了油蒿种群的遗传分化和地理距离有着一定的相关性．