基于表达谱分析筛选肾母细胞瘤关键基因

为探究肾母细胞瘤(Nephroblastoma)发生的关键基因,并筛选出潜在的治疗靶点及生物标志,采用由GEO数据库获取的基因芯片GSE11151和GSE53224,经归一化处理后,通过GO和KEGG分析筛选出差异基因,并通过构建蛋白互作网络获得其中的关键基因.总计获得差异基因404个,其中上调基因385个,下调基因19个.PMCH、CCR5、CCR7、RGS1和KNG1作为关键基因,涉及趋化因子信号通路、G蛋白偶联信号通路,参与肿瘤微环境的形成.这5个关键基因在肾母细胞瘤的发生中有着重要作用,并可能作为潜在治疗靶点及生物标志.     

microRNAs家族间负关联模式挖掘

microRNAs(miRNAs)广泛地存在于动植物的细胞中,它的前体具有发夹结构,并且具有很好的保守性.miRNAs在生物体内对细胞的生长、发育、死亡和病变起着重要作用.研究miRNAs家族间在生物体内的调控关系,对miRNAs在生物组织中的表达进行关联分析和对miRNAs成熟序列、种子区域以及二级结构数据进行相似性比较,从而了解miRNAs家族对生物体的调节机制.为了识别具有高相关性的miRNAs家族负关联模式,引入相关系数来改进传统的挖掘频繁项集算法和用互信息来衡量miRNAs家族间的交互性.     

肿瘤细胞微环境对癌症转移力的影响

过去,科学界普遍关注的是由肿瘤细胞自身性质的改变而引起的恶化现象,如:基因突变的累积效应导致肿瘤恶化成癌。近几年的研究发现,细胞微环境(microenvironment)也对癌细胞转移起着至关重要的作用。本文从微环境的重要性和微环境影响肿瘤细胞转移的机制两方面讨论胞外基质与癌细胞转移的关系。     

肿瘤细胞与微环境的相互作用决定肿瘤转移的最终归宿

近年来,研究肿瘤微环境中各种细胞及分子对肿瘤转移的影响已经成为肿瘤研究领域的热点。本文在回顾了近年来此方面的主要进展的基础上,对主要细胞/分子影响肿瘤转移不同方面的机制及阐明不同成分之间及与肿瘤细胞之间相互作用的分子网络的意义予以论述,并对其可能对临床治疗策略的影响及对治疗效果的改善进行了展望。     

2022年肿瘤免疫研究热点回眸

肿瘤免疫治疗已成为继手术、放疗、化疗之后的第四类肿瘤治疗方法，为当今国际研究的热点领域。在肿瘤免疫治疗新时代，以免疫检查点抑制剂、基因工程化修饰免疫细胞为代表的免疫疗法被认为具有广阔前景。概述了2022年肿瘤免疫治疗领域研究的热点及关键进展，包括嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）在实体瘤治疗中的突破、维持记忆性T细胞生存和功能新机制的发现、改善肿瘤免疫抑制微环境提高免疫治疗疗效的深入探究以及瘤内微生物对抗肿瘤免疫反应的重要影响作用。     

低氧胁迫对日本沼虾呼吸代谢和抗氧化能力的影响

为阐明低氧胁迫对日本沼虾呼吸代谢和氧化代谢的影响,并初步探讨其作用机制及日本沼虾的抗氧化响应机制,将日本沼虾暴露于低氧((2±0.2)mg/L,8 h)而后恢复常氧水平((7±0.2)mg/L,2.5 h).结果显示:与对照组(保持常氧水平)相比,随着低氧暴露时间延长,日本沼虾肝胰腺和肌肉组织细胞色素氧化酶(CCO)和琥珀酸脱氢酶(SDH)活力显著下降(p0.05),延胡索酸还原酶(FRD)和乳酸脱氢酶(LDH)活力显著上升(p0.05);总抗氧化能力(T-AOC)和过氧化氢酶(CAT)活力显著上升(p0.05),超氧化物歧化酶(SOD)活力显著下降(p0.05).恢复常氧阶段,CCO,SDH,FRD,LDH,CAT和SOD活力逐渐恢复到正常水平,T-AOC在恢复常氧1 h时显著降低(p0.05),而后恢复到正常水平.低氧胁迫使得有氧代谢减弱,无氧代谢增强,以维持机体能量需求;T-AOC和CAT活力增加而SOD活力降低,是日本沼虾适应低氧环境所采取的一种抗氧化策略.     

Growth potential of human hepatocarcinoma cells in the liver of neonatal immunocompetent mice and its relation to immunological tolerance

To determine the pathological behavior of human hepatocarcinoma cells in the liver microenvironment of neonatal non-immunode-ficient mice, three human hepatocarcinoma cell lines (Bel7402, HepG2, and SK-Hep-1), traced by DiI, were transplanted into the intrahepatic or subcutaneous tissue of neonatal and adult Kunming mice. Histopathological observations showed that cells in the adult liver induced a severe immune response as early as the second day after the implantation, while the subcutaneous neoplasm underwent extensive necrosis by the end of the study. Only the cells injected into the neonatal liver underwent a delayed immunologic rejection in the organ microenvironment. These cells retained recognizable tumor features over the first seven days, and displayed an intrahepatic invasive pattern. The expression of tumor markers including alpha-fetoprotein and survivin was maintained. The quantitative ELISA for the expression patterns of IL-2 and IL-10 also confirmed that the intrahepatic immunity was non-susceptive during this period. The high serum alpha-fetoprotein level was inversely correlated with the change in immune response. Our study provided a bio-system for the research of immune responses to xenografts in the liver.     

非小细胞肺癌外周血有核细胞miRNA表达特点研究

miRNA在非小细胞肺癌的发生发展中发挥重要作用,为了解非小细胞肺癌患者外周血有核细胞的miRNA表达特征及其作用,采用第二代高通量测序技术对7例非小细胞肺癌患者和7例对照的外周血有核细胞miRNA表达水平进行检测,比较非小细胞肺癌患者与对照的外周血有核细胞miRNA表达特征,分析两者miRNA表达水平差异情况,共鉴定出非小细胞肺癌患者与对照的外周血有核细胞中有显著表达差异的miRNA 209种,其中肺癌样本miRNA表达上调的有138种,表达下调的有71种.研究结果显示非小细胞肺癌患者与对照样本的外周血有核细胞中miRNA表达具有显著差异,其中部分已被证实参与肿瘤发生、发展等过程.     

水稻microRNA及其靶基因的系统鉴定

miRNA在植物生长发育和环境胁迫中发挥着重要的作用.本研究基于49个水稻小RNA 测序数据,系统分析了已知miRNA的表达,并鉴定到了新的水稻miRNA.我们发现,miRBase上注释的水稻miRNA中,只有39％具有可检测的表达. 此外,对水稻降解组数据的分析鉴定到一些新的miRNA靶基因,包括两个新的miR444靶基因,它们分别编码WD40蛋白和热休克因子型DNA结合蛋白.     

影响口腔癌发生潜在MicroRNAs的生物信息学分析

为获得口腔癌组织和正常组织之间差异表达的miRNAs,从分子水平研究相关的miRNAs在肿瘤发生发展中的作用,从GEO数据库筛选并下载口腔癌及正常组织的基因芯片,运用GEO2R工具分析筛选口腔癌与正常组织间的差异表达miRNAs. 采用FunRich软件对将所得差异miRNAs进行GO功能注释、KEGG信号通路分析. 通过对GSE124566和GSE113956两个芯片数据进行分析,分别筛选得到109、1 079个差异表达miRNAs,分别包括41、673个上调基因和68、406个下调基因,筛选得到共同差异表达miRNAs有30个,其中上调16个,参与的生物过程主要有细胞间通讯等,细胞成分主要有细胞核等,分子功能主要有转录因子活性等;下调14个,参与的生物过程主要有信号转导等,细胞成分主要有细胞质等,分子功能主要有转录因子活性等. 通过对口腔癌芯片数据的生物信息学分析,发现30个差异表达miRNAs是口腔癌发生、发展的重要miRNAs,囊泡介导的转运,核苷酸的代谢等过程. 最后预测出了13 796个靶基因,并通过PPI互作分析筛选出了联系最紧密的10个靶基因.     

高压氧疗对脑损伤治疗作用机制的研究进展

脑损伤可引起脑组织的缺血缺氧。脑供血减少,会引起脑缺氧,但脑缺氧也可单独发生。若脑组织缺血缺氧的状态得不到及时纠正,氧参与的细胞内物质能量代谢将发生异常,如生成ATP的三羧酸循环、离子的转运等基本的生命活动都将受到影响,甚至停止。而蛋白质、核酸、脂质等物质的运输及代谢也将受到影响。这种状况持续数分钟,大脑的生理功能将受到影响,时间愈久这种变化愈难逆转。近年来,有研究表明,高压氧疗(HBOT)能改善损伤引起的脑组织缺血缺氧的状态,并对损伤的脑组织有修复的作用。其可能的途径如下:HBOT通过减少内皮素的生成,改善损伤后的脑血管痉挛状态、平衡脑血流以及降低升高的颅内压等,改善脑组织的缺血缺氧状态;并能通过改变MBP、caspases基因家族、Bcl-2/Bcl-xL以及TSPO、Nogo-A及其受体Ng-R等的表达,起到保护受损脑细胞、减少脑细胞凋亡以及促进神经细胞再生的作用;HBOT还可能通过增加胎盘生长因子(PLGF)的生成,起到促进血管生成及损伤脑组织再生的作用;此外,HBOT还能引起受损脑组织内多种炎症因子的改变,这也在一定程度上影响着脑损伤的预后。HBOT引起多种分子表达的改变,起到对损伤脑组织的修复作用...     

低氧条件下巨噬细胞分泌CCL22促进三阴乳腺癌转移

三阴乳腺癌(Triple Negative Breast Cancer, TNBC)是乳腺癌中恶性程度最高的一种亚型，表现为很高的转移潜能。巨噬细胞，即肿瘤相关巨噬细胞(Tumor-Associated Macrophages, TAM)，在促进TNBC转移中起了重要作用。乳腺癌作为一种实体肿瘤，往往处于缺氧环境中。低氧环境能够促进癌细胞的转移，然而低氧环境中巨噬细胞在促进肿瘤转移中的作用仍然不清楚。在该研究中，THP1细胞被诱导成TAM，经过缺氧培养后，通过Transwell实验检测其促进三阴乳腺癌细胞BT-549和MDA-MB-231的细胞迁移能力；通过尾静脉注射，将MDA-MB-231细胞移植于祼鼠体内，CT扫描，分析了TAM促进TNBC细胞的器官转移能力；通过ELISA实验检测低氧对TAM分泌的肿瘤转移相关因子的影响，通过GDSC在线软件分析了CCL22受体CCR4和其他CCR在乳腺癌组织与正常组织中表达的差异。结果表明低氧条件下巨噬细胞通过分泌CCL22的表达来促进三阴乳腺癌细胞迁移:经过缺氧培养后的TAM显著增强了TNBC细胞迁移能力，以及促进癌细胞在体内向肺转移；低氧诱导TAM分泌CCL22；CCL22受体CCR4在乳腺癌组织中的表达显著高于在正常组织中的。     

A pancreatic islet-specific microRNA regulates insulin secretion

MicroRNAs (miRNAs) constitute a growing class of non-coding RNAs that are thought to regulate gene expression by translational repression. Several miRNAs in animals exhibit tissue-specific or developmental-stage-specific expression, indicating that they could play important roles in many biological processes. To study the role of miRNAs in pancreatic endocrine cells we cloned and identified a novel, evolutionarily conserved and islet-specific miRNA (miR-375). Here we show that overexpression of miR-375 suppressed glucose-induced insulin secretion, and conversely, inhibition of endogenous miR-375 function enhanced insulin secretion. The mechanism by which secretion is modified by miR-375 is independent of changes in glucose metabolism or intracellular Ca2+-signalling but correlated with a direct effect on insulin exocytosis. Myotrophin (Mtpn) was predicted to be and validated as a target of miR-375. Inhibition of Mtpn by small interfering (si)RNA mimicked the effects of miR-375 on glucose-stimulated insulin secretion and exocytosis. Thus, miR-375 is a regulator of insulin secretion and may thereby constitute a novel pharmacological target for the treatment of diabetes.     

铜基纳米材料在增强化学动力学治疗上的应用研究

和传统治疗相比,化学动力学治疗(CDT)被认为是一种低副作用且无创的治疗方法,在众多的治疗方法中脱颖而出.CDT通过金属离子介导的芬顿反应或类芬顿反应,将肿瘤中过表达的过氧化氢(H2O2)分解为剧毒的羟基自由基(·OH),从而杀死肿瘤细胞.近年来,铜基纳米材料在CDT中蓬勃发展,极大地提高了CDT的效率.因此,基于铜基纳米材料,归纳了通过调节肿瘤微环境来增强CDT以及其他疗法的协同治疗,为开发新型的类芬顿试剂提供了思路借鉴.     

Application of Spacer Fabric for Protecting Cushion

Spacer fabric is a typical three-dimensional fabric, including upper layer, lower layer, and spacer layer. It is widely applied in protecting cushion products for unique space structure, which attributes good comfortability to infants and the disabled elderly in reducing diseases resulting from hot and humidity under long-time sitting and lying period. It necessitates studying the microenvironment change between body and clothes and corresponding performance. Compressibility. air permeability, heat and moisture permeability, and bending and humiture in microenvlronment of spacer fabric are analyzed and compared with foam cushion and nonwoven cushion. Experimental results show that corresponding performance of spacer fabric is better in protecting cushion than those of foam and nonwoven. Compared with traditional foam cushion and non-woven cushion, spacer fabric is more suitable for protecting cushion, and provides an alternative and optimal cushion material in medical products to protect infants and the disabled elderly from bedsores resulted from long-time sitting and lying.     

基于化学动力学疗法的联合治疗在肿瘤中的研究进展

由于肿瘤微环境（TME）的复杂性,单一的治疗策略难以有效地消除肿瘤,因此需要多种方法以克服单一治疗策略的缺陷.化学动力学疗法（CDT）是一种新兴的癌症治疗策略,通过芬顿或类芬顿反应,将内源性过氧化氢（H₂O₂）转化为羟基自由基（·OH）杀死癌细胞.该治疗方法因其侵袭性小、肿瘤特异性高而受到广泛研究.但是,温和的酸性pH值、低H₂O₂含量,以及TME中过表达的还原物质严重抑制了CDT效率.因此,基于CDT的联合治疗策略得到了广泛的发展.文章对近年来CDT联合治疗策略进行了概述,并对其进行了展望.     

A viral microRNA functions as an orthologue of cellular miR-155

All metazoan eukaryotes express microRNAs (miRNAs), roughly 22-nucleotide regulatory RNAs that can repress the expression of messenger RNAs bearing complementary sequences. Several DNA viruses also express miRNAs in infected cells, suggesting a role in viral replication and pathogenesis. Although specific viral miRNAs have been shown to autoregulate viral mRNAs or downregulate cellular mRNAs, the function of most viral miRNAs remains unknown. Here we report that the miR-K12-11 miRNA encoded by Kaposi's-sarcoma-associated herpes virus (KSHV) shows significant homology to cellular miR-155, including the entire miRNA 'seed' region. Using a range of assays, we show that expression of physiological levels of miR-K12-11 or miR-155 results in the downregulation of an extensive set of common mRNA targets, including genes with known roles in cell growth regulation. Our findings indicate that viral miR-K12-11 functions as an orthologue of cellular miR-155 and probably evolved to exploit a pre-existing gene regulatory pathway in B cells. Moreover, the known aetiological role of miR-155 in B-cell transformation suggests that miR-K12-11 may contribute to the induction of KSHV-positive B-cell tumours in infected patients.     

HMOX1在低氧条件下对胶质瘤干细胞的作用

HMOX1(Heme Oxygenase 1)属于血红素加氧酶家族,作为血红素分解代谢中的必须酶,在恶性胶质瘤中高表达。脑胶质瘤干细胞(Glioma Stem Cell,GSC)是胶质瘤中的一小群肿瘤细胞,具有无限增殖、自我更新、多向分化的能力,被认为是肿瘤发生、复发、转移的根源。本实验通过质谱筛选,发现HMOX1特异性在胶质瘤干细胞中被低氧诱导高表达。目前关于HMOX1蛋白与缺氧环境下GSC的功能相关性未见文献报道。为了研究HMOX1是否在低氧时对GSC有调控作用,我们用慢病毒感染体系在GSC中敲低HMOX1表达,接着对细胞进行1%O_2低氧培养,用Western Blot检测基因干涉效果,用Tumor Sphere形成实验观察GSC细胞表型。实验结果表明,在低氧条件下干涉GSC中HMOX1基因的表达对GSC的生长及存活有明显的抑制。综上所述,HMOX1在GSC中特异性被低氧诱导高表达,且对GSC的生长存活具有调控作用,提示HMOX1有可能是GSC在低氧微环境中的重要调控因子。