菠菜抗霜霉病种质资源表型评价

通过田间观测对菠菜抗霜霉病种质资源的植物学特性、生育周期和抗病性进行了鉴定.结果显示：59份菠菜种质资源的10个质量性状的多样性指数分布在0.25~1.23之间;8个数量性状变异系数在24.25%~42.80%之间,平均29.54%.霜霉病抗性鉴定结果表明：菠菜材料S1~S36为高抗材料,S37~S41为抗病材料,S42~S59为中抗材料.抽薹期性状调查结果表明：81.4%的材料属于抽薹早或中的材料,18.6%的菠菜材料属于抽薹晚的材料.综合考虑,菠菜材料S1株型直立,叶片卵圆、长势好、耐抽薹,试验期无任何霜霉病的病症,且霜霉病病情指数和发病率均为0,是植物学性状优良的抗菠菜抗霜霉病种质资源.     

水稻核心种质育种

从核心种质的概念与核心种质育种、核心种质株型和品质理想模型构建、新型核心种质的创建、核心种质分子育种、特征次生物质标记辅助核心种质育种5个部分,概述了水稻核心种质育种从提出到完善的全过程,并进一步提出了水稻核心种质育种探索的重点.     

基于SSR标记构建广西杉木核心种质

为深入发掘和筛选广西杉木Cunninghamia lanceolata种质资源,本研究采用SSR标记技术检测国家级杉木良种基地864份杉木种质材料的遗传多样性,对比分析不同构建方法的差异,并采用t检验和主坐标分析法验证核心种质的有效性和代表性。结果表明：（1）22对SSR引物共检测到195个等位基因,平均等位基因（Na）为8.86,平均有效等位基因（Ne）为3.13,平均Shannon''s信息指数（I）为1.31,平均无效等位基因频率（Fna）为0.03,平均多态信息含量（PIC）为0.60。（2）相较其他构建方法,采用M策略的Core Finder软件是构建广西杉木核心种质的有效方法,筛选出的80份核心种质具较好的代表性。     

棉花种质资源多样性的ISSR聚类分析及主成分分析

利用ISSR分子标记对48份棉花种质资源的亲缘关系及遗传多样性进行分析,结果显示,筛选出的10个ISSR引物扩增出的112条带中,多态性条带占101条,为总条带的90.18%.每个引物均可扩增4～21个多态性位点,平均10.10个,引物平均多样性信息指数(PIC)和多态性谱带百分率(PPB)分别为0.76和87.88%.利用NT-SYSpc 2.1统计分析软件中的UPMGA法对48份棉花种质资源构建亲缘关系树状图,在遗传相似性系数(GS)为0.66水平上可将所有参试材料聚成两大类,且与主成分分析(PCA)结果基本吻合.ISSR标记揭示出这48份棉花种质资源遗传多样性较小,遗传基础比较狭窄.     

241份菊芋种质资源地上部性状的遗传多样性分析

为丰富我国菊芋种质资源库,拓展菊芋育种的遗传背景,本研究以241份菊芋种质资源为材料,对其地上部农艺性状进行调查,应用相关性分析、主成分分析、聚类分析及隶属函数法进行综合评价与鉴定。结果表明:241份菊芋种质资源的10个农艺性状的变异系数分布在16. 22%～55. 74%,其中叶缘的变异系数最大(55. 74%);相关性分析显示,叶长与叶宽、花朵数与株幅呈显著正相关(r=0. 67,p 0. 05; r=0. 64,p 0. 05);主成分分析将10个农艺性状综合为4个主成分因子,累计方差贡献率为75. 30%;在遗传距离为10处可将241份菊芋种质资源分为2大类群,类群I中包含13份种质资源,其株高、叶长、叶宽等明显较大。类群II中又包含3个亚类群; 241份菊芋种质资源的隶属函数均值在0. 21～0. 72,且隶属函数法评分高的种质资源与聚类分析中第一类群种质资源重合度高,具有一致性。241份菊芋种质资源具有丰富的遗传多样性,共筛选出适合观赏的种质资源4份,适合作为牧草的种质资源13份。本研究为加快我国菊芋种质资源的创新和新品种选育工作进程奠定了基础。     

109份丰产核桃单株坚果表型多样性分析及性状评价

【目的】果实表型分析和评价是良种选育的基础,分析核桃(Julans regia)坚果表型多样性并开展性状综合评价,可筛选出具有优良坚果性状的核桃品系。【方法】以北京农林科学院核桃选种圃109份丰产性较好的核桃单株为研究对象,测定其18个坚果表型性状,分析各性状的变异系数和遗传多样性,并进行方差、相关性、主成分、聚类和综合评价分析。【结果】(1)109份核桃坚果的18个表型性状变异均达到极显著水平,变异系数范围为4.70%～25.00%,遗传多样性指数范围为2.849～3.023,表征坚果大小和干质量的指标在个体间具有较高的离散程度,而坚果形状指标的个体间变异较小;(2)坚果各部分的干质量指标与反映坚果大小的指标均呈极显著正相关,坚果形状指标与坚果三径关系密切,种壳厚度和种壳干质量会显著影响坚果出仁率;(3)坚果大小、形状和外在品质指标能反映坚果表型性状的绝大部分信息,这3个主成分的累计贡献率达91.596%,以这3个主成分共筛选出几何平均直径、坚果体积、单果干质量、核仁干质量、球形度、壳厚、出仁率和体积出仁率等8个重要性状;(4)在欧氏距离9.0处将109份种质资源聚为4大类群,可用于...     

兰属植物遗传资源核心种质构建探讨

兰属植物遗传资源是兰属植物遗传与育种研究的基础材料,由于其存在数量庞大、生境地域复杂、利用效率低、优异基因筛选困难等问题,给兰属资源的收集、保存、研究和利用带来了困难,因此,尝试开展兰属植物遗传资源核心种质研究是十分急迫和必要的.借鉴农作物成功的经验,本文基于形态、农艺性状和SSR分子标记数据对兰属植物核心种质基本内涵、构建核心种质的步骤和检测指标与评价方法等方面进行了阐述,并探讨其存在的问题和发展方向,以期为兰属植物核心种质的构建和种质创新与利用提供理论参考.     

胡卢巴种质资源RAPD遗传多样性分析

在优化随机引物扩增多态性DNA标记（RAPD）反应体系和条件的基础上,利用筛选的多态性引物分析了胡卢巴种质资源的遗传多样性．结果表明,19条RAPD引物显示了40份胡卢巴种质资源的遗传距离为0．02～0．70,来源上变幅从大到小为：宁夏和国外种质间、国外种质间、宁夏种质间、国内其他省份种质间．40份胡卢巴种质资源分为两类,即Ⅰ类包括3份国外种质;Ⅱ类包括37份种质,可大体上分为宁夏、国内其他省份和国外种质3个亚类．     

云南稻核心种质回交后代糙米总黄酮含量分析

为研究云南稻核心种质回交后代糙米总黄酮含量,本实验分别以143份云南籼稻核心种质与滇屯502,241份云南粳稻核心种质与合系35配制的杂种F6,BC2F4,BC3F3,BC4F2为材料,采用比色法对其糙米总黄酮含量进行测定分析.结果表明,籼稻后代黄酮含量高于粳稻后代;有色米高于无色米;不同世代的黄酮含量(mg/100g)情况籼稻后代是轮回亲本(236.26)BC2F4(224.69)BC4F2(222.36)BC3F3(210.19),但差异不显著;粳稻后代是BC4F2(244.42)BC2F4(239.58)轮回亲本(227.21)F6(220.03)BC3F3(190.91),其中BC3F3代极显著低于BC2F4,BC4F2代.筛选出的粳稻后代(白镰刀谷/合系353)是供试材料中含量最高的,达到1267.62±54.79mg/100g.     

三叶木通种质资源形态多样性研究

收集全国三叶木通种质资源73份，测量各种质16个生物学性状，运用SPSS软件对各形态指标进行方差分析和主成分分析，并对各种质进行聚类分析．方差分析结果表明，描述果实的各指标变异幅度最大，各种质间果实差异较大．主成分分析把16种形态学指标归结为果实因子、叶片因子、种子因子、果肉因子4个主成分．聚类分析把73份种质资源分为5大类．为三叶木通种质资源的收集整理以及优良种质的选育提供了重要的形态学依据．     

Genetic diversity and construction of core collection in Chinese wheat genetic resources

Genetic diversity among 5029 accessions representing a proposed Chinese wheat core collection was analyzed using 78 pairs of fluorescent microsatellite （SSR） primers mapped to 21 chromosomes. A stepwise hierarchical sampling strategy with priority based on 4×10^5 SSR data-points was used to construct a core collection from the 23090 initial collections. The core collection consisted of 1160 accessions, including 762 landraces, 348 modern varieties and 50 introduced varieties. The core accounts for 23.1% of the 5029 candidate core accessions and 5% of the 23090 initial collections, but retains 94.9% of alleles from the candidate collections and captures 91.5% of the genetic variation in the initial collections. These data indicate that it is possible to maintain genetic diversity in a core collection while retaining fewer accessions than the accepted standard, i.e., 10% of the initial collections captured more than 70% of their genetic diversity. Estimated genetic representation of the core constructed by preferred sampling （91.5%） is much higher than that by random sampling （79.8%）. Both mean genetic richness and genetic diversity indices of the landraces were higher than those of the modern varieties in the core. Structure and principal coordinate analysis revealed that the landraces and the modern varieties were two relatively independent subpopulaUons. Strong genetic differentiation associated with ecological environments has occurred in the landraces, but was relatively weak in the modern culUvars. In addition, a mini-core collection was constructed, which consisted of 231 accessions with an estimated 70% representation of the genetic variation from the initial collections. The mini-core has been distributed to various research and breeding institutes for detailed phenotyping and breeding of genetic introgression lines.     

白木香群体的表型多样性分析

采集广东、广西、海南和云南4个省9个居群的174个白木香样品,分别测量其10项形态性状,并进行方差、相关和聚类分析.文中还以欧式平均距离10为阈值,采用UPGMA法将白木香聚成了4组.方差分析表明,各性状在白木香居群间和居群内均存在广泛的变异性,居群间F值在6.520~13.867之间,而居群内F值在24.033~94.081之间.居群内平均方差分量为52.62%,说明居群内的变异是白木香表型变异的主要部分.白木香居群间的平均表型分化系数为33.38%,说明居群内的多样性程度大于居群间.多重比较还表明,白木香各居群间的变异系数和相对极差均无显著性差异.另外,各地理因子中,海拔对性状的影响较大,其次是年均气温和年降雨量.     

Quantitative genetic analysis station for the genetic analysis of complex traits

The Quantitative Genetic Analysis Station (QGAStation) is a software package that has been developed to perform statistical analysis for complex traits.It consists of five domains for handling data from diallel crosses,regional trials,core germplasm collections,QTL mapping,and microarray experiments.The first domain contains genetic models for diallel cross analysis,in which genetic variance components and genetic-by-environment interactions can be estimated,and genetic effects can be predicted.The second domain evaluates the performance of varieties in regional trials by implementing a general statistical method that outperforms ANOVA in tackling unbalanced data that arises frequently in trials across multiple locations and over a number of years.The third domain,using predicted genotypic values as proxy,constructs core germplasm collections covering sufficient genetic diversity with lower redundancy.The fourth domain manages genotypic and phenotypic data for QTL mapping.Linkage maps can be constructed and genetic distances can be estimated;the statistical methods that have been implemented apply to both chiasmatic and achiasmatic organisms.Another part of this domain can filter systematic noises in phenotypic data.The fifth domain focuses on the cDNA expression data that is generated by microarray experiments.A two-step strategy has been implemented to detect differentially expressed genes and to estimate their effects.Except in the fourth domain,the major statistical methods that have been used are mixed linear model approaches that have been implemented in the C language.Computational efficiency is further boosted for computers that are equipped with graphics processing units (GPUs).A user friendly graphic interface is provided for Microsoft Windows and Apple Mac operating systems.QGAStation is available at http://ibi.zju.edu.cn/software/qga/.     

越南黄花梨种源家系生长遗传变异及早期选择

【目的】对越南黄花梨幼林阶段生长表现进行研究,为筛选早期生长性状优良的越南黄花梨家系,以及越南黄花梨引种选择提供依据。【方法】对4年生的越南黄花梨10种源46个家系的早期生长性状进行调查,在分析生长性状遗传变异的基础上进行早期优良种源和家系的选择。【结果】越南黄花梨早期生长性状在种源、家系间达到显著以上差异,表型和遗传变异系数分别为10.81%~36.97%和4.20%~10.95%。各性状的种源重复力、家系遗传力和单株遗传力分别为(0.45±0.19)~(0.81±0.06),(0.27±0.16)~(0.59±0.09) 和(0.18±0.13)~(0.35±0.19)。运用综合指数选择,综合生长指标、叶型和冠幅性状选出早期优良种源2个,优良家系6个。优良家系的树高、胸径、地径、叶色值、叶片叶绿素SPAD值以及冠幅的平均遗传增益为6.87%、6.54%、6.77%、2.62%、3.50%和9.43%。【结论】8号(兴安)种源不仅生长优良,而且存在着丰富的遗传变异,可作为越南黄花梨引种栽培的首选种源。     

杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析

杉木的育种群体中,维持合理的遗传多样性和清晰的遗传背景,是长周期、多世代遗传改良采用的核心策略之一。基于基因组分子标记,利用自主开发的52对杉木SSR引物,对国家级杉木种质资源库保存的遗传材料——杉木第1代遗传改良收集的93份种质资源进行了遗传多样性分析。结果表明:52对SSR引物在93份材料中共检测到254个等位变异,等位变异范围为2～8个,平均等位基因数为4.88个,平均有效等位基因数为2.32个,平均观察杂合度为0.43,平均Nei’s多样性指数为0.50,平均Shannon信息指数为0.98,这5个评价遗传多样性水平的指标具有较大程度的一致性。不同引物的等位基因数、有效等位基因数、观察杂合度、多样性指数和Shannon信息指数等均表明杉木育种群体中存在较大的遗传差异,其变异系数分别为24.88%、44.75%、34.20%、34.89%和33.59%。93份种质资源间遗传相似系数的平均值为0.693 3,变化范围为0.490 0～0.919 3; 遗传距离的平均值0.370 3,变化范围为0.086 3～0.713 4。当距离阀值为20时,可将杉木第1代育种群体中的93份种质资源划分为5大类; 当距离阀值为15时,第5大类的77份种质资源可细分为16个亚类。SSR分子标记聚类的结果可为种质资源的管理及提高育种效率提供重要依据。