基于加权距离方法的多瘤病毒系统发育关系分析

多瘤病毒广泛地分布在脊椎动物中,这类病毒会造成肿瘤,有些还会感染人的呼吸系统.因此,研究多瘤病毒的系统发育关系,在生物学和医学上都有着重要的价值.该文基于关联距离和对数关联距离加权的方法构建了70种多瘤病毒完全基因组的系统发育树,与Perez-Losada等的工作以及作者以前的工作获得的结果相比较,系统发育树的结构基本上一致.     

基于rbcL蛋白质序列的石斛属植物系统发育研究

以生物分类的数学模型和生物演化的数学模型为基础,探讨25种石斛属植物rbcL蛋白质序列的系统发育关系．用MATLAB7．1构建NJ系统树和UPGMA系统树,用MEGA4．1构建MP系统树,并进行系统发育分析,为研究石斛属植物的系统发育提供蛋白质序列方面的证据．     

红麻微卫星DNA的分离

分别采用RAPD、锚定PCR和磁珠捕获等3种方法富集含微卫星序列的红麻基因组DNA片段,并连接到pMD18-T载体,构建基因组文库.然后以通用引物M13F,M13R和根据微卫星核心序列所设计的引物[VRV(CT)12或VRV(TG)12],用PCR方法直接对文库筛选,并将获得的阳性克隆进行测序.分别从RAPD,锚定PCR和磁珠捕获3种富集方法构建的基因组文库中获得6,23,19个微卫星位点.     

用MCEM加速算法估计多序列无根树最优分支长度

系统发育树是通过对生物序列的研究来推测物种的进化,其核苷酸替代模型通常假设序列进化为完全数据,但现实中很难满足此假设,针对此事实,该文运用MCEM加速算法对序列长度假设不变,但存在缺失的情形下做出了Jukes-Cantor模型下含缺损数据的DNA序列构建无根树最佳分支长度的参数估计,并说明了MCEM加速算法比EM算法更有效.     

山茱萸药材中总DNA的提取方法

随着分子生物学技术的发展,如限制性酶切片段长度多态性(RFLP),随机扩增多态性DNA(PAPD),扩增片段长度多态性(AFLP)等;分子标记技术已经用于植物种质资源和系统发育的研究.目前,报道的大多从是植物叶片中提取DNA且方法众多,技术较为成熟,但这些方法多采用幼嫩的植物叶片进行总DNA的提取,而适用于成熟果实或市售干品中药材基因组DNA提取方法比较少.     

基于AJAX的Web课件动态目录树的设计与实现

在Web课件中,章节信息通常采用目录树进行管理,常用的目录树设计方法有静态目录树和动态目录树两种,实现效果均不理想.本文分析了AJAX的概念、特点和原理,提出了采用AJAX技术构建Web课件动态目录树的新思路,介绍了目录树结构的构建及设计方法,给出了关键程序代码.     

LSI布线设计中的最优树算法研究

本文讨论了在集成电路的布线设计中所碰到的求无向完全图的最优生成树问题,提出了一种求最优树的上三角阵算法(简称M-算法) .描述了支持这种算法的数据结构.对完全图G(n,e),M-算法的计算复杂性是O(n~3),空间复杂性是O(n~2),在相同的空间复杂性条件下,比直接用Kruskal算法要优越.     

纤维素产生菌汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3全基因组测序分析

为全面了解汉氏葡糖醋杆菌(Komagataeibacter hansenii,K.hansenii)HDM1-3的发酵特性，为提高纤维素产量提供基因组信息，对其基因组数据进行测序分析。采用PacBio RSⅡ平台对该菌株进行全基因组测序，基因组由1个3 659 612 bp染色体和2个质粒组成，编码3 820个蛋白质，含有7个纤维素合成酶基因。基于16S rRNA的系统发育分析表明了K.hansenii HDM1-3相对于醋酸杆菌科菌株的进化地位。在基因组中，共注释到碳水化合物活性酶88个。通过KEGG注释到代谢通路相关基因共3 132个，其中碳水化合物代谢相关基因287个。通过基因组测序获得了K.hansenii HDM1-3完整的基因组信息，为改造该菌株提供了基因组学基础。     

快生型大豆根瘤菌(Rhizobium fredii)15067与褐球固氮菌(Azotobacter chroococcum)10006的16S rDNA分析

分别对快生型大豆根瘤菌(Rhizobium fredii)15067和褐球固氮菌(Azotobacter chroococ-cum)10006两个菌株进行了16S rDNA的全序列测定,将此全序列与已知相关的16S rDNA进行了比较及聚类分析,得到系统发育树状图.在系统发育树中,根瘤菌15067隶属于中华根瘤菌属,与Sinorhizobium xinjiangense IAM 14142,SinoRhizobium fredii SjzZ 4构成一个分支,其中与S.fredii SjzZ4的相似性最高,达99.72%;固氮菌10006处于固氮菌属分支中,其中和Azotobacter chroococcum AM12A,Azotobacter chroococcum的相似性均高达99.93%.为确定两株菌株的分类地位、进一步发掘和利用菌株的优良性状提供了参考依据.     

嗜热硫氧化硫化杆菌一新菌株的分离与鉴定

从云南腾冲酸性热泉富集物中分离到一株适度嗜热喜酸菌YN22.该菌革兰氏染色阳性,直杆状或微弯,长约1.6~2.8μm,直径0.4~0.7μm.该菌能在25~60℃下生长,最适生长温度为53℃;生长pH为1.0~5.0,最适pH为1.5;化能自养型,0.025%(w/V)的酵母提取物对其生长有明显的促进作用,在酵母提取物存在的情况下能快速氧化Fe2 ,但对S0和还原型硫化物的氧化能力较低.16s rDNA系统发育分析表明,该菌与嗜热硫氧化硫化杆菌(Sulfobacillus thermosulfidooxidans)的16s rDNA序列相似性达99%.YN22基因组DNA的G C含量为47.3 mol%,与嗜热硫氧化硫化杆菌模式菌株VKM B-1 269非常接近,后者基因组DNA的G C含量为47.5 mol%.基于形态特征、生理生化特性、系统发育学和G C含量的分析结果,YN22应归于硫化杆菌属(Sulfobacillus),为嗜热硫氧化硫化杆菌(Sb.thermosulfidooxidans)的一新菌株.这是国内首次分离,并经多种方法鉴定、确认的嗜热硫氧化硫化杆菌,从而为我国浸矿微生物的基础和应用研究提供了最典型的适度嗜热菌种.     

迭代函数系统模型在生物序列分析中的应用

介绍了关于完全基因组及蛋白质序列的测度表示，迭代函数系统(IFS)模型在分形理论中已有较长时间的研究,在此我们提出用IFS模型及递归的IFS(RIFS)模型来拟合完全基因组与蛋白质序列的测度表示。我们发现在拟合完全基因组的测度表示时，RIFS模型比IFS模型好，但在拟合蛋白质序列的测度表示时IFS模型比RIFS模型好，从IFS模型或RIFS模型中估计的参数可以用来讨论与生物分类进化及蛋白质结构预测有关的问题。     

具有滑移边界圆管层流减阻的CFD模拟

超疏水表面能够减阻的一个重要原因是在流固界面上存在无剪切空气-水界面.从流体力学的角度来看,这个无剪切界面对应着流体中的滑移边界条件,而与此相关的概念是有效滑移长度.采用计算流体动力学方法,引入速度滑移边界条件来模拟超疏水表面的减阻.计算结果表明,在给定的简单模型中,无量纲压降比最高可达19.2 % .     

一种分布式的选播组管理方案

根据选播组管理的特点,提出了一种安全的分布式解决方案.组成员的加入、退出等操作首先要经过组其他成员的认证,然后由这些成员向各个选播路由器发送相关指令来完成相应的操作.组成员之间的监测采用分组方式进行,成员之间的数据报文以及成员发送到选播服务器的更新报文都采用密文方式进行传输.分析表明,该方案可以满足选播组管理的时延要求.     

线性方程组的广义逆矩阵解法

线性方程组的逆矩阵解法一般只适用于一般特殊情况,即适用于系数矩阵为方阵的时候,对于一般的线性方程组,可以应用矩阵的广义逆来研究并表示它的解。本文探讨了线性方程组的广义逆矩阵解法。     

海南粗榧叶表面扫描电镜观察

采用扫描电镜观察和方差分析研究了不同生境条件下海南粗榧(CephalotarusmanniiHook.f.)成熟叶表面结构,结果表明海南粗榧叶表面气孔为12-15列,多数为14列;气孔结构为完全或不完全的双环型气孔或单环型气孔,其大小变化较大;副卫细胞2-6个(多数为2个),大小变化也较大.     

以工程案例为载体的教学模式探讨

针对当前高校《液压与气压传动》课程讲授模式已不能适应为社会培养创新型、应用型人才的问题,提出了以“工程案例”为载体的创新讲授模式．首先介绍汽车起重机系统的工作任务、动作循环和安全要求并浏览整个液压系统原理图,然后将其分解为七个子系统并详尽分析每个子系统的工作循环、工作原理及油液工作路线,最后对复杂系统子系统间的相互关系进行分析．结果表明,仅一个工程案例就囊括了教材液压基本回路这一章约70％的内容,且这种讲授模式能理论联系实践变枯燥无味的抽象学习为生动形象的趣味学习,与人才培养政策要求相吻合．     

单轴手征媒质电磁带隙结构的色散特性

建立了分析双各向异性媒质电磁带隙结构的平面波展开法普适模型，并对单轴手征媒质电磁带隙结构(以本构参数单轴化了的手征媒质为背景材料并按菱形晶格钻孔)进行了仿真计算．计算结果表明，在横向介电常数相同的条件下，介电常数正单轴化了的手征媒质(其他参数仍为各向同性)电磁带隙结构所具有的全向全极化带隙宽度比各向同性手征媒质的带隙宽度要宽得多，这一发现，为电磁带隙结构的工程应用提供了新的材料选择。     

约束变换型地图概括模式

地图概括是地图的基本特性之一,它本质上是从较大比例尺地图A上的有限点集到较小比例尺地图B上的有限点集之间的变换,变换的约束条件不同,对应着不同的地图概括模式.根据这原理,提出了包括选取、夸大等11种地图概括模式的数学定义,从而使这些地图概括概念获得了精密的数学形式和定量描述.     

黑龙江省十字花科植物叶表皮毛状体扫描电镜观察

本文以十字花科13属18种植物为代表，在电子显微镜下观察了其表皮毛微形态和类型，该科植物的表皮毛分为三种类型，单毛、分枝毛和星状毛，这三种类型在不同属间的分布呈出系统演化意义，并且单毛的存在较为普遍。     

对称算子空间上的保秩1线性映射

设H是一个复Hilbert空间,S(H)为H上对称算子全体所成的集合,用Γ表示S(H)中秩1算子全体所成的集合.设L是S(H)上的映射,如果L(Γ)Γ,则称L是保秩1的.S(H)上保秩1的弱连续线性映射被刻画.