猛禽和夜鹰类的线粒体DNA序列比较和分子进化关系的研究

测定和比对了隼形目、鸮形目、夜鹰目的12SrRNA基因片段,长度为415 bp.使用MEGA2.1软件构建分子系统树并分析其系统进化关系.数据显示,该基因片段的DNA序列变异丰富,转换和颠换数未随着遗传距离的增加而出现饱和现象,反映出较高真实水平的鸟类系统发育关系.重建系统进化树表明:与隼形目隼科相比,隼形目鹰科与鸮形目、夜鹰目的亲缘关系更近,提示了隼形目隼科和鹰科之间可能存在着较大的遗传变异;与夜鹰目相比,鸮形目和隼形目鹰科鸟类的亲缘关系较近,与传统分类观点相同,不支持将鸮形目和夜鹰目合并为鸮形目的观点.     

华北平原地区猛禽观察

人们通常把那些尖喙利爪、勇猛善飞、主要以小型脊椎动物为食的鸟类称为猛禽.在鸟类分类学上,猛禽包括两大类:一类是隼形目鸟类,像我们常说的老鹰、金雕、白头鹞、红隼等都属于这一类群,人们常把它们笼统地称为"鹰";另一类是鸮形目鸟类,它们大都长有一张由许多绒羽组成的面盘,加上一对大眼睛,外貌似猫,故又俗称"猫头鹰".在华北地区常见的猫头鹰有长耳鸮、短耳     

扩增性别基因片段的鹭类性别鉴定方法的研究

以鹳形目5种鹭科鸟类和1种鹮科鸟类的组织为实验材料，采用PCR方法扩增其性别基因相关片段，探讨鹭科鸟类性别的分子鉴定方法．通过测定3对已知性别的白鹭（Egretta garzetta）、岩鹭（Egretta sacra）和黄嘴白鹭（Egretta eulophotes）以及12只未知性别的夜鹭（Nycticorax nycticorax）、池鹭（Ardeola bacchus）、白鹭、牛背鹭（Bubulcus ibis）黑脸琵鹭（Platalea minor）的性别基因CHD或EE0．6上的基因相关片段并进行比较．结果表明，通过扩增EE0．6或CHD基因片段的性别鉴定分子方法都能够适用于鹭科鸟类的性别鉴定，由此能够解决鹭科鸟类雌雄外形同色而难以从外貌上区分其性别的问题．     

特殊病号—猛禽

猛禽两大家族猛禽有两大类:一类是隼形目,包括苍鹰、秃鹫等,另一类是鸮形目,就是我们俗称的猫头鹰,包括灰林鹗、长耳鸮等。这两大家族都以啮齿类、小鸟、昆虫等小动物为食,但一家在白天进食,另一家在晚上捕猎,所以互不影响。它们都是位于食物链顶端的肉食性鸟类,天敌只有一个——人类,如果我们不愿意成为它们的朋友的话。     

封面故事

雪鸮（Bubo scandiacus）又名白鸮、雪猫头鹰、白夜猫子,是鸮形目鸱鸮科的一种大型猫头鹰。最初由瑞典自然学家卡尔·林奈于1758年分类。雪鸮因全身几乎为雪白色而得名,而且它们多为昼行性鸟类,是很有特点的一种猫头鹰。     

攀禽类五种鸟的核型比较研究

本文采用常规空气干燥法制备髓细胞染色体标本,分析了攀禽类褐翅鸦鹃、大杜鹃、白胸翡翠、夜鹰、领角鸮五种鸟类的核型。其中褐翅鸦鹃、白胸翡翠属首次报道,其余三种鸟类的核型在国内已有报道,我们分析的结果与文献报道有一定的差别。特别是领角鸮和夜鹰属留鸟类,各地区有不同的分布类群,核型上有所差别。     

凶猛伟岸的鸟类——隼形目猛禽

隼形目猛禽是鸟类中最重要的类群之一,它们在自然界的种类和数量虽然不算太多,但分布极广,几乎在世界上各个地区、各种生态环境中,到处都可以看到它们搏击长空的身影。我国地大物博,幅员辽阔,有独特的自然条件和丰富的自然资源,也为猛禽的生存提供了多种多样的栖息环境。隼形目鸟类在全世界共有鹰科、隼科、美洲鹫科和蛇鹫科等4科,大约     

安徽省鸟类新纪录——黄嘴角鸮

2022年8月7日晚，笔者在黄山市黄山区汤口镇浮溪村（30.085 1N,118.145 8E，海拔562m）进行生物多样性调查时，观察并记录到鸮形目鸟类2只．通过对其鸣声和形态辨识并查阅资料文献，确定其为黄嘴角鸮（Otus spilocephalus）．该物种为安徽省鸟类新纪录，此记录也是该物种目前分布最北界的记录．     

扩增性别基因片段的鹭类性别鉴定方法的研究

以鹳形目5种鹭科鸟类和1种鹮科鸟类的组织为实验材料,采用PCR方法扩增其性别基因相关片段,探讨鹭科鸟类性别的分子鉴定方法.通过测定3对已知性别的白鹭(Egretta garzetta)、岩鹭(Egretta sacra)和黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)以及12只未知性别的夜鹭(Nycticorax nycticorax)、池鹭(Ardeola bacchus)、白鹭、牛背鹭(Bubulcus ibis) 黑脸琵鹭(Platalea minor)的性别基因CHD或EE0.6上的基因相关片段并进行比较.结果表明,通过扩增EE0.6或CHD基因片段的性别鉴定分子方法都能够适用于鹭科鸟类的性别鉴定,由此能够解决鹭科鸟类雌雄外形同色而难以从外貌上区分其性别的问题.     

内蒙古辉腾锡勒地区鸟类研究

1999年6月对内蒙古辉腾锡勒地区的鸟类区系、生态分布以及风力发电场对鸟类的影响进行了研究．在考察期间共记录到鸟类43种，隶属于12目20科37属．全部为繁殖鸟．其中留鸟13种，夏候鸟30种．该地区大致可分为山地草甸草原、湖泊、人工针叶林、沟谷山地和居民点五种生态环境．风力发电场的高压电线对栖息于山地草甸草原和针叶林的隼形目鸟类造成一定影响．山地草甸草原中几个较大的湖泊周围的风力发电机，对大中型水鸟的迁徙会造成较大的影响．     

皱纹盘鲍杂交群体与自然种群遗传差异的研究

利用RAPD技术对皱纹盘鲍自然种群和杂交养殖群体进行了遗传差异分析,共检测到173个位点．在自然种群和杂交群体之间及两个杂交群体之间都存在差异,并得到一些群体的特异性片段．利用PopGen32软件计算了各个群体的多态位点比例、平均遗传杂合度、Shannon多态性指数和群体问的遗传距离．结果表明,杂交群体的遗传多样性高于自然群体,从遗传多样性角度揭示了皱纹盘鲍杂种优势的存在．     

冰期天文理论的演变

冰期天文理论是运用地球轨道偏心率、地轴倾角和地转轴进动的3种参数的变化幅度与周期来解释上新世——第四纪期间冰期——间冰期交替变化的一种理论．该理论1842年由Adhemar提出, 经过Croll发展到Milankovitch最终完成,经历了整100年的时间。上世纪60年代开始,深海、黄土、冰芯等大量的地质记录都揭示出３种周期变化,从而证实冰期天文理论的正确性,同时也对冰期天文理论带来了一些概念上的修正．但是,Berger计算的天文曲线至少从6 Ma以来展示同一规律的变化,然而地质记录却显示清晰的分段响应模式:41 kyr的地轴倾角周期在5.3～1.4 Ma期间一直是记录曲线的主要特征;北半球冰川作用只是在2.7 Ma BP才开始大规模出现;0.8 Ma开始100 Ka周期转变为主要周期,称之为中更新世转型（MPT）．还有:11阶段和全新世是2个偏心率很低的时期,但记录中却是冰期——间冰期振幅最大的时期,即大的间冰期为何出现于低偏心时期;由间冰期进入冰期比由冰期进入间冰期时来的快,意味大冰盖建造需要很长的时间,而消融则比较迅速．这些都是冰期天文理论本身不能解释的问题,正在由地球响应系统的研究来探索答案．     

Goniurosaurus indet.的有效性及中国睑虎属(Squamata: Sauria: Eublepharidae)种间的亲缘关系

为了解我国睑虎属Goniurosaurus (Squamata: Sauria: Eublepharidae)种间的亲缘关系以及广东新纪录的睑虎属未定种Goniurosaurus indet.的有效性, 我们对睑虎属10个种的线粒体DNA基因片段进行比较和遗传变异分析. 获得12S rRNA (385 bp)和16S rRNA (477 bp)总长度为862 bp的联合序列, 共有核苷酸变异位点388个, 简约信息位点269个. 选取大壁虎Gekko gecko为外类群, 采用贝叶斯演绎法(BI)、最大似然法(ML)、最大简约法(MP)、邻接法(NJ)对两个基因联合序列的分析均显示相同结果, 即广东睑虎属未定种Goniurosaurus indet.与英德睑虎G. yingdeensis以及凭祥睑虎G .luii与蛛纹睑虎G. araneus两两种间的亲缘关系分别较近; 且分布区相邻的Goniurosaurus indet.与G. yingdeensis之间的遗传分化(遗传距离=0.044-0.046)相似于分类地位已经明确的G .luii与G. araneus种间的遗传差异(遗传距离=0.051). 结合前人的形态学研究结果, 我们认为Goniurosaurus indet.和G. yingdeensis之间已发生显著的遗传差异, 前者可能为睑虎属新种. 同时, 系统发育分析表明海南睑虎G. hainanensis与睑虎属其它物种之间的遗传分化较大, 系统发育地位最为特殊. 系统发育分析进一步表明具4条背部横纹是祖征, 具5条背部横纹为衍征. 我们的研究补充了睑虎科的基础资料, 为该属的系统发育研究和物种保护提供了一定的理论依据. 本文首次提出宽阔的河流可能是造成睑虎种群分化和新种形成的重要地理屏障. 这一“河流隔离”观点对全球睑虎属物种的亲缘地理分布格局的解释具有重要的理论意义.     

球状轮藻叶绿体全基因组的组装与特征分析

为揭示球状轮藻叶绿体全基因组的特征以及探究其在轮藻科内的系统发育关系,本研究基于高通量测序技术对其叶绿体全基因组进行组装和序列分析.结果表明:球状轮藻叶绿体基因组全长180 652 bp, GC含量26.6%,具有典型的四分体环状结构,与普生轮藻十分类似;球状轮藻叶绿体基因组共注释出137个基因,其中包括94个蛋白质编码基因、37个tRNA基因和6个rRNA基因,比无色丽藻多2个蛋白质编码基因和3个tRNA基因,与高等植物相比具有rpl12、trnL(gag)、rpl19、ycf20四个特殊基因;球状轮藻叶绿体全基因组共检测出87个SSR位点且绝大部分由A和T构成;此外,球状轮藻共包含24 989个密码子且密码子使用更偏好A和T,亮氨酸(Leu)是编码氨基酸最多的密码子;通过邻近法(NJ)对包括球状轮藻在内的5个种的叶绿体全基因组构建系统发育树显示,球状轮藻的亲缘关系与普生轮藻更为接近.本研究对球状轮藻叶绿体全基因组进行了解析,利用现有数据确立其系统发育学地位.     

中国南方沿海13种石斑鱼类的分子系统进化关系分析

石斑鱼类(Groupers)是世界性海洋经济鱼类,也是中国南方沿海省份重要的海水增养殖对象,其种类繁多,由于缺乏明显的种间外部形态区别特征,石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学的一个难题,存在着较多的争议和混淆。为了从分子水平揭示石斑鱼类的系统进化关系,应用线粒体细胞色素b基因(Cyt b)及两个核糖体RNA基因(16S和12S)序列联合构建系统进化树对中国近海石斑鱼亚科3属13种进行种类鉴定及亲缘关系分析,探讨了石斑鱼类的分子系统进化。结果表明:①线粒体基因序列在石斑鱼类种间存在较大的变异,种内变异极小,是进行石斑鱼类种类鉴定较为适宜的分子标记;②所研究的3属13种石斑鱼类中,石斑鱼属与九棘鲈属的亲缘关系较近,与鳃棘鲈属的较远;③赤点石斑鱼和青石斑鱼、蜂巢石斑鱼与鲑点石斑鱼、斜带石斑鱼与棕斑石斑鱼两两间具有较近的亲缘关系。     

Molecular cloning and polymorphism of major histocompatibility complex class I genes from grass carp (Ctenophayngodon idellus)

In order to clarify the molecular sequences,allelic polymorphism and the tertiary structure of grass carp (Ctenophayngodon idellus) MHC class I,and to further study their relationship with disease resistances,grass carp MHC class I gene (Ctid-MHC I) was cloned from a cDNA library and the allelic polymorphism in the population was investigated.The results showed that most of the variations exist in the peptide-binding domain (PBD) and high polymorphism was identified in the Ctid-MHC I allelic genes from 12 individuals.Based on the genetic distance,Ctid-MHC class I can be classified into 6 types (from Ctid-MHC I-UA to Ctid-MHC I-UF) which were subdivided into 9 lineages (from A to I).Comparison of the Ctid-MHC I among animals and humans showed that the key amino acids of the peptide binding sites are conserved.Analysis of the tertiary structure of the PBD between Grass carp and human crystallographic data of HLA-A2,the variation with insertion or deletion was found in eight regions (A～H).The phylogenetic tree of MHC class I indicates the evolution of MHC class I among grass carp,fish,amphibian,birds,higher vertebrates and humans.     

麂属(Muntiacus)动物12SrRNA基因序列分析及其分子进化关系

对麂属（Muntiacus)中3种动物，赤麂（M.muntjak)(2n=6♀，7♂），小麂（M.reevesi)(2n=46),黑麂（M.crinifrons)(2n 8♀,9♂)线粒体DNA12SrRNA基因450bp左右的片段进行序列分析，并根据序列信息建立分子类聚图，同时探讨了这3种动物的起源，分类地位及进行关系，结果表明黑麂起源最早，赤麂次之，小麂最晚。     

广西5种常见星虫动物的线粒体基因组特征和系统进化分析

为探明广西北部湾星虫动物的线粒体基因组遗传变异和基因序列特征,采用高通量测序测定广西北部湾5种常见星虫动物的线粒体基因组,并对其基因序列特征、遗传变异、系统进化进行分析。结果显示,星虫动物线粒体基因组具有典型的无脊椎动物线粒体基因组的特征,基因排列高度保守,特别是其13个蛋白质编码基因（PCGs）。此外,星虫动物线粒体基因组的基因均编码在H链上,并存在3个高度保守的基因排列区块,与环节动物和螠虫动物线粒体基因组特征较为相似。cox1、cox2和cob等3个基因进化速率最慢、遗传变异水平最低,适合作为星虫动物种属系统进化研究以及不同种间生物条形码构建的分子标记。nad6、nad4、nad5和nad2等4个基因的遗传变异水平较高（大于60%）,变异位点数量较多,适合作为星虫动物种群遗传多样性研究的分子标记。星虫动物线粒体13个蛋白质编码基因的Ka/Ks比值均低于1（0.058 2-0.726 6）,其中cox1、cox3和cob等3个基因的Ka/Ks比值最低（小于0.1）,表明在星虫动物线粒体遗传进化过程中,这3个蛋白质编码基因承受强烈的自然选择压力和功能束缚。基于线粒体基因组蛋白质编码基因系统进化树的研究结果表明,星虫动物可分为方格星虫纲和革囊星虫纲两个进化分支,星虫动物与环节动物的进化地位、亲缘关系较近,而与软体动物的亲缘关系较远。本研究结果不仅为广西北部湾特色星虫动物渔业资源多样性调查和保护提供分子遗传数据,也为星虫动物系统进化研究提供了科学参考。     

黄河故道湿地可培养细菌多样性及产木聚糖酶菌株筛选

研究黄河故道湿地可培养细菌的多样性及其产木聚糖酶的应用潜力.采用稀释平板涂布法从湿地样品中获得119株菌株,形态去重复后对93株进行16SrRNA基因系统发育分析以及利用刚果红染色法进行木聚糖酶活性筛选.结果表明,分离得到的菌株分属于4个门的18个科、21个属,其中优势类群为变形菌门(Proteobacteria)(41株,44%).该地区可培养细菌的Shannon-Wienner多样性指数H′=3.66,Simpson指数D=0.97;Margalef物种丰富度指数dMa=10.59;Shannon物种均匀度指数E=0.94,且样点青龙湖多样性指数高于样点刘寨.93株代表性菌株的木聚糖酶筛选结果显示,11.82%具有木聚糖酶活性,链霉菌和芽孢杆菌在木聚糖酶活性菌株中比例最高.以上结果表明豫北黄河故道湿地蕴含丰富的细菌资源,可为木聚糖酶的研发提供良好的菌种来源.     

Maternal inheritance in polyploid fish inferred from mitochondrial ATPase genes analysis

The sequences of the ATPase8/6 genes for the triploid, tetraploid and pentaploid hybrids as well as for their male parent blunt snout bream were determined. In order to examine mitochondrial maternal inheritance, the sequences were subjected to a comparative sequence analysis with the homologous sequences of red crucian carp, their female parent, and zebrafish as the outgroup. Base composition and variation as well as the divergences based on nucleotide sequences and deduced amino acid sequences were calculated. Phylogenetic trees were also constructed with maximum parsimony (MP), minimum evolution (ME), neighbor joining (NJ) and the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) algorithms in MEGA 3.1. The results showed that most nucleotide substitutions occurred at the third codon position of the two genes and thus represented synonymous mutations. The nucleotide sequence divergences of the ATPase8/6 genes ranged from 0.0% to 21.6% among ingroup samples (three types of polyploids and their parents), and 27.0–28.2% between their ingroup and the outgroup samples. All the polyploids were considerably closer in sequence relationship to the female parent red crucian carp (0.0–3.3%) compared to their male parent blunt snout bream (21.0–21.6%). The phylogenetic trees also showed a similar result. In conclusion, the mitochondrial ATPase8/6 genes of artificial polyploid fish stringently indicated maternal inheritance. Our results also suggested that the ATPase8/6 genes are valuable genetic markers to track genealogies and variations in the progenies of the hybrids.