一种预测膜蛋白结构的新方法

随着人类基因组计划的完成,生命科学已进入后基因组时代,人们越来越注重从整体水平上对生物功能的研究.生物功能的主要体现者是蛋白质,蛋白质的功能与其空间结构有着密切的关系.所以,掌握蛋白质的结构信息对于研究蛋白质的功能及作用机制具有重要意义.     

蛋白质组学及其在神经科学研究中的应用

蛋白质组学是后基因组时代研究中兴起还不到十年的新型学科,但已应用到生命科学与基础医学研究中的各个领域.对蛋白质组进行大规模的分析可使我们更加深入了解生物体的结构与功能.在神经科学研究领域,对于神经突触、受体复合物以及其他的神经元和神经胶质特性的研究因为该学科的渗透,近年来取得了辉煌成就.然而,蛋白质组学相关技术用于神经系统的研究还面临着很多挑战,如脑蛋白样品的准备、脑的复杂性、有限的数据库资源和生物信息学工具等.蛋白质组学技术与其他功能基因组学研究方法,如基因芯片、网络生物学分析技术等相结合,将在基因及其功能、神经生理学与病理学之间架起一道重要的桥梁.     

蛋白质拓扑结构Alignment与相似性打分的算法

蛋白质结构分类是当今“后基因组”研究的热点 ,是探索蛋白质折叠 /功能关系的有效方法 .创立一种新型的分类体系就意味着对复杂的蛋白质结构的有了进一步的理解 .本文基于蛋白质结构域的拓扑结构 ,将拓扑量化 ,以Alignment矩阵方法对结构域进行比较 ,并按拓扑结构相似性对任意 2个蛋白质进行打分 .上述算法已经实现了程序化 .依此算法可将一组蛋白质进行新的分类 ,并可望将结构分类与生物功能的关系进行分析 .     

利用物种的蛋白质系统发生图谱研究物种进化

随着后基因组时代的到来,越来越多的物种基因组序列被测定出来.基因组信息的大量增加,使得从基因组的水平研究物种进化成为可能.文中定义了物种的蛋白质系统发生图谱的概念,将之用于进化分析,并从蛋白质组的水平研究了物种间的进化关系.此方法与目前较流行的分子进化方法相比,具有适用范围广,结果稳定等特点.随着基因组测序工作的迅速发展,用蛋白质系统发生图谱构建进化树的方法将有很大的发展空间.     

差异蛋白质组学及其应用

蛋白质组学是后基因组研究中最主要的部分,其研究策略有2种:一种是"完全"蛋白质组学,目的是检测一种细胞类型或一种组织内基因组表达的所有蛋白质; 另一种是"差异"蛋白质组学,主要是筛选和鉴定不同种类或状态下各样本之间蛋白质组的区别与变化.着重介绍了差异蛋白质组学的特点、研究内容和应用前景,简要介绍了适用于差异蛋白质组学研究的相关技术和近期发展概况.     

生命科学跨入后基因组时代

随着人类基因组面貌进一步被揭示,一个以蛋白质和药物开发为主要研究方向的后基因组时代拉开了序幕,而这标志着生命科学的研究重点出现重大转移,即从基因组测序转向了蛋白质功能和相互作用机理.     

蛋白质组学在绵羊育种中的应用

蛋白质组学作为后基因组时代的主要研究方向和重要研究手段之一,近年来被广泛地应用于生物科学及交叉学科的各个领域.蛋白质组学还衍生出一套在整体水平上或生物动态水平上研究蛋白质及其之间相互作用的方法.日渐成熟的蛋白质组学技术极大地推动了蛋白质组学的研究进程.这些技术不仅包括蛋白质提取和分离,还包括对目的蛋白质进行鉴定和分析,这为蛋白质组学研究提供了技术支持.文章简述了蛋白质组学的基本方法、技术路线,并重点阐述了蛋白质组学在绵羊育种研究中的应用情况.     

蛋白质结构预测的生物信息学方法研究

生物信息学是一门数学、统计、计算机与生物交叉结合的新兴学科。随着人类基因组计划的完成与深入,应用生物信息学方法进行蛋白质结构的预测成为了后基因组时代的一项重要任务。本文重点介绍了生物信息学在蛋白质结构预测中的方法研究,简述了蛋白质结构预测的方法,介绍了蛋白质预测技术的新技术的应用与未来前景。     

系统生物学

随着人类基因组测序计划的完成和后基因组时代的到来,国际上基因组、转录组、蛋白质、代谢组乃至表型组工作的相继开展、随着各种类型功能基因组数据的     

代谢组学在肿瘤研究中的应用

代谢组学是后基因组时代迅速发展起来的新兴学科,是在基因组学、转录组学和蛋白质组学之后,生命科学领域的重要组成部分.与前三者不同的是,代谢组学研究的是生物事件的终点,可以与生物事件建立直接的关系.肿瘤是严重危害人类健康的疾病之一,其发病率与死亡率都比较高,且肿瘤的发生发展过程中必然伴随着代谢的改变.在近些年来的肿瘤治疗当中,代谢组学的应用研究越来越深入.它可以在肿瘤早期进行诊断,并从代谢角度整体对肿瘤疾病进行分析,个体化治疗及预后的判断上有独特的优势.