长蛸ISSR-PCR优化反应体系的建立及优化研究

以长蛸DNA为模板,利用单因子试验分别对影响长蛸ISSR-PCR反应的DNA浓度、Taq DNA聚合酶、Mg2+、dNTPs和引物的浓度进行了优化,并通过梯度PCR确定最适退火温度,最终确定长蛸最佳反应体系和PCR扩增程序为:25μL体系,其中包括Taq DNA聚合酶1.5 U,Mg2+2 mmol/L,dNTPs 0.15 mmol/L,引物0.4μmol/L,DNA模板量约50 ng确立退火温度为52℃。利用所建立的ISSR-PCR反应体系,通过对24份野生长蛸样本的检验,获得了清晰、重复性好、多态性高的条带,研究结果对于把ISSR标记技术引入研究长蛸不同地理群体遗传多样性和遗传结构具有重要意义。     

基于通用交换接口(CSIX)的交换机SOC设计

通用交换接口(CSIX)协议是一种适用于通用交换机设计的接口协议.提出一种可扩展的交换机系统芯片(SOC)设计方案,它是以Cross-bar无阻塞交换结构为核心,结合CSIX接口的特点来实现高速可扩展的通用数据包交换芯片设计.并对其关键部分如收发模块,它的HDL语言设计实现方案进行了重点阐述,利用FPGA设计实现整个系统模块功能,兑现一款8×8的32bits数据线接口的SOC芯片.经测试,该FPGA兑现的SOC芯片可达单片Gbps的数据交换能力.     

浙江海域曼氏无针乌贼资源演变及修复路径探讨

就我国浙江海域曼氏无针乌贼种群分布、生命周期、洄游、近海生长等资源特征以及从20世纪50-60年代的盛产,经历了80-90年代的衰竭,到本世纪初有恢复迹象这段时间内的各种变化及其产生原因展开综述,并探讨了曼氏无针乌贼资源修复路径——加大曼氏无针乌贼增殖放流工作力度;产卵场的修复和保护;洄游路径上禁止捕捞作业;严格控制年捕捞量,以及拟定了资源保护和修复方面相关渔政措施及建议。     

头足类分类鉴定方法研究进展

作为软体动物门中不可或缺的类群,头足类的生物学研究价值和经济效益也日渐突出.如今由于对头足类的捕捞和养殖力度的加大,出现了其种质资源量的严重下降.近年来,随着生化及分子生物学技术的兴起,辅以传统生物学分类手段,可以实现对其资源量的合理利用、恢复头足类种质资源以及其遗传多样性.本文简要描述了传统分类和分子系统学分类的发展现状以及在头足类相关支系分类的研究进展,并对头足类的系统发生学的发展作了展望.     

基于转录组的曼氏无针乌贼SSR与SNP位点信息分析

利用IlluminaHiseq平台对曼氏无针乌贼进行了转录组测序,采用生物信息学方法分析了转录组序列中的SSR、SNP位点信息并设计了SSR引物。利用MISA工具筛选了转录组测序获得的127 575条Unigene序列,共得到分布于50 626条序列中的SSR位点108 685个,SSR发生率39.68%,出现频率为85.19%。平均每949 bp含有1个SSR位点。在50626条含有SSR位点的Unigene序列中,有25 548条Unigene包含SSR位点数目在2个及以上。其中单碱基重复是EST微卫星序列的主要形式(42.84%),其次是二碱基重复(28.73%),三碱基重复(14.93%)和四碱基重复(12.79%)。在所有微卫星序列所包含的重复单元中,优势重复基元类型为A/T(占总SSRs的42.23%),其次为AT/AT (13.33%),AC/GT (9.32%),AAAG/CTTT(10.00%)。运用Primer premier 5软件共设计了46 520对SSR引物。在12 323条Unigene中发掘出SNP位点64 732个,每条Unigene平均含5.25个SNP位点。其中转换(Transition) 45 975个(71.02%),颠换(Transversion) 18 757个(28.98%)。本研究通过第二代高通量测序技术,结合生物信息学方法对曼氏无针乌贼进行了SSR位点与SNP位点的开发,为其遗传多样性分析、分子辅助育种和增殖放流效果评估等提供了有力研究工具。