基于网络药理学研究槐花丸治疗结肠炎机制

通过网络药理学的方法对槐花丸治疗结肠炎的作用机制进行探索和研究.通过TCMSP和ETCM数据库找到槐花丸的主要成分,通过Swiss Target Prediction对成分靶点进行预测;使用OMIM、GeneCards、TTD Database和MalaCards数据库以"colitis"为关键词进行检索,获得结肠炎相关的疾病靶点;将疾病靶点与主要成分靶点进行交集得出药物作用成分;使用Cytoscape软件绘制出药物的主要作用成分-靶点相互关系网络图;使用STRING平台导出药物的蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络图.应用DAVID数据库对核心靶点进行GO分析及KEGG相关通路分析,并对KEGG信号通路进行可视化.得到槐花丸共有54个主要作用成分,其中26个成分活性较好,可能作用于STAT3、TP53、MAPK3、AKT1、TNF、VEGFA等关键靶点,参与91条信号通路.通过绘制药物成分-疾病靶点网络、药物蛋白与蛋白相互作用网络等多条途径,对槐花丸治疗结肠炎的作用机制进行了初探和研究,为其他相关研究提供了依据,为其后续临床疗效评价指标的筛选提供了研究方向.     

网络药理学探究败酱草治疗溃疡性结肠炎机制

通过网络药理学分析和分子对接来探讨败酱草治疗(ulcerative colitis,UC)可能的分子作用机制.通过数据库得到溃疡性结肠炎相关靶点和败酱草主要成分,基于已有数据库文本挖掘和常见成分靶点预测工具获取成分靶点,进行一系列对比.对主要靶点进行GO及KEGG分析,得到核心靶点;对核心靶点进行分子对接.败酱草40种化学成分通过STAT3、TNF、IL6、IL1 B和IL10等共18个关键靶点起到活性作用,通过炎症性肠病信号通路等信号通路发挥疗效;分子对接模拟实验结果表明结合活性良好,可能主要以氢键作用,疏水作用,盐桥作用等形式结合.通过网络药理学和分子对接来揭示败酱草治疗该病可能的分子作用机制,也为不同科研用途使用不同靶点来源工具作出参考和借鉴.     

分子对接和网络药理学探究银翘散治疗COVID-19机制

通过网络药理学分析和分子对接来探究银翘散治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)作用机制.通过TCMSP数据库、PubChem数据库和SymMap数据库获取银翘散的主要成分和其蛋白靶点,对银翘散主要成分与常见抗病毒西药通过PyRx 0.8进行分子对接比对.借助Cytoscpe3.7.2软件构建银翘散的药材-活性成分-靶点网络相互关系网络.通过string平台获取蛋白相互作用关系网络(PPI),基于网络节点拓扑结构分析筛选出银翘散核心靶点.采用DAVID数据库对核心靶点进行GO及KEGG分析,并对KEGG信号通路进行可视化.通过分子对接结果得出银翘散共有121种活性成分,血管紧张素转化酶II(ACE2)和SARS-CoV-2水解酶的可能的结合区域各有4个.通过拓扑结构分析得出核心靶点99个,参与生物过程条目99个、细胞组成条目12个、分子功能条目23个信号通路86条,且多与病毒和肺损伤有关.通过分子对接和网络药理学对银翘散进行了系统研究,为银翘散复方治疗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)和新型冠状病毒肺炎(COVID-19)研发药物和疫情防控等提供了理论参考和指导.     

基于网络药理学卷柏活血通经的作用机制分析

通过网络药理学分析来探讨卷柏活血通经作用可能的分子作用机制.通过查阅文献及在TCMSP数据库中获取卷柏可能的主要活性成分,并对其进行筛选,利用Gene-Cards、OMIM数据库预测活血通经疾病(痛经、经闭、抗血栓、抗凝血)相关基因,构建卷柏活性成分-靶点-通路相互关系网络,对靶点进行GO及KEGG分析,结果显示,卷柏共有12种活性成分可能作用于AKT1,ALB,VEGFA,EGFR,PTGS2和MMP2等靶点,10条信号通路;通过活性成分-蛋白靶点-通路相互网络来揭示卷柏活血作用,为系统阐明卷柏主要成分活血通经的分子机制提供了参考和思路.