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分子对接和网络药理学探究银翘散治疗COVID-19机制
引用本文:陶悦,聂承冬,温静,杨洋,马其华,王冲,阎新佳.分子对接和网络药理学探究银翘散治疗COVID-19机制[J].哈尔滨商业大学学报(自然科学版),2021,37(1):3-10,20.
作者姓名:陶悦  聂承冬  温静  杨洋  马其华  王冲  阎新佳
作者单位:哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,哈尔滨150076;哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,哈尔滨150076;哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,哈尔滨150076;哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,哈尔滨150076;哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,哈尔滨150076;哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,哈尔滨150076;哈尔滨商业大学药学院,哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,哈尔滨150076
基金项目:哈尔滨商业大学研究生科研创新项目;哈尔滨商业大学创新创业项目;2020 年度省自然科学基金优秀青年项目;黑龙江省教育厅青年学术骨干支持计划;2020年度黑龙江省高等教育教学改革研究一般项目
摘    要:通过网络药理学分析和分子对接来探究银翘散治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)作用机制.通过TCMSP数据库、PubChem数据库和SymMap数据库获取银翘散的主要成分和其蛋白靶点,对银翘散主要成分与常见抗病毒西药通过PyRx 0.8进行分子对接比对.借助Cytoscpe3.7.2软件构建银翘散的药材-活性成分-靶点网络相互关系网络.通过string平台获取蛋白相互作用关系网络(PPI),基于网络节点拓扑结构分析筛选出银翘散核心靶点.采用DAVID数据库对核心靶点进行GO及KEGG分析,并对KEGG信号通路进行可视化.通过分子对接结果得出银翘散共有121种活性成分,血管紧张素转化酶II(ACE2)和SARS-CoV-2水解酶的可能的结合区域各有4个.通过拓扑结构分析得出核心靶点99个,参与生物过程条目99个、细胞组成条目12个、分子功能条目23个信号通路86条,且多与病毒和肺损伤有关.通过分子对接和网络药理学对银翘散进行了系统研究,为银翘散复方治疗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)和新型冠状病毒肺炎(COVID-19)研发药物和疫情防控等提供了理论参考和指导.

关 键 词:银翘散  新型冠状病毒  新型冠状病毒肺炎  网络药理学  分子对接  COVID-19  SARS-CoV-2

Study on mechanism of Yin-Qiao-San treatment of COVID-19 based on molecular docking and network pharmacology
TAO Yue,NIE Cheng-dong,WEN Jing,YANG Yang,MA Qi-hua,WANG Chong,YAN Xin-jia.Study on mechanism of Yin-Qiao-San treatment of COVID-19 based on molecular docking and network pharmacology[J].Journal of Harbin University of Commerce :Natural Sciences Edition,2021,37(1):3-10,20.
Authors:TAO Yue  NIE Cheng-dong  WEN Jing  YANG Yang  MA Qi-hua  WANG Chong  YAN Xin-jia
Abstract:
Keywords:
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