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甜菜夜蛾核多角体病毒(Spodoptera exigua multicapsid nucleopolyhedrovirus,SeMNPV)基因组13.7~21.6m.u.区域是SeMNPV的重组热点区。以SeMNPV美国分离株SeUS1为模板,长片段PCR对SeUS1的13.7~21.6m.u.区域扩增,得到11.3kb,2.0kb和0.7kb3个片段。对照已发表的SeMNPV基因组序列,11.3kb片段是具完整SeMNPV序列基因型的产物,2.0kb和0.7kb片段表明SeUS1中还存在两种缺失突变株。对2.0kb和0.7kb片段的序列分析揭示了这两株突变株在缺失部位的DNA一级结构。对三株重组SeMNPV病毒(SeXDl、SeXD2和SeXD3)的分析发现,它们和野生型病毒SeUS1中的一个基因型一样,均缺失了SeMNPV nt 18513~29105之间长10593bp的片段,暗示SeUS1中一株自发形成的缺失突变体在离体细胞中具有复制优势。将该片段基因排列与其它10种基因组序列已测定的杆状病毒比较,发现两个在GroupⅡ NPVs中保守的基因簇。最大简约性法对部分基因的系统发育分析表明,缺失片段中某些基因可能存在于杆状病毒分化之前的病毒基因组中。  相似文献   
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