不同组蛋白修饰以及修饰与修饰酶之间的关系

核小体是染色质的基本结构单位,核小体组蛋白尾部可以发生甲基化、乙酰化等多种共价修饰.以含有组蛋白修饰酶的修饰数据库为基础,借助网络研究了一些修饰之间以及与修饰酶之间的关联关系,同时从相关修饰酶及其复合物的角度分析了这些关联.结果显示部分修饰之间或与相关修饰酶之间存在直接的关联关系.包含修饰酶的酶复合物可以通过自身的蛋白结构域与甲基化或者乙酰化修饰结合,进一步利用自身的修饰酶亚基催化其它组蛋白修饰,从而使得两种组蛋白修饰之间建立关联.     

基于ArcMap与AutoCAD同位对比程序设计

本文主要阐述以ArcMap和AutoCAD软件为基础平台,利用VB6．0开发语言进行两平台间的信息交互,实现了在双屏显示器下两个平台的同位对比,利用此程序对入库前后同一位置的数据进行连动检查,确保入库后数据表达的准确性和一致性。     

组蛋白修饰组合模式研究进展

核小体是染色质的基本结构单位,核小体组蛋白N末端尾部可以发生甲基化、乙酰化等多种共价修饰.组蛋白密码假设多种组蛋白修饰以组合方式发挥作用.自组蛋白密码假设被提出后,组蛋白修饰组合模式成为表观遗传学领域的重要研究内容.在染色质免疫沉淀基因芯片和免疫沉淀高通量测序等相关实验数据的基础上,多种算法被用于研究组蛋白修饰的组合.文章介绍了组蛋白修饰的发生、位点、相关修饰酶以及生物学功能,对组蛋白修饰组合以及与基因表达关系的研究进行了总结,同时对组蛋白修饰组合模式一些适用的研究方法做了概述和分析.     

致癌基因密码子使用频数统计

本文在最新的致癌基因核酸序列数据库的基础上,对各258个致癌基因序列的密码子使用频数进行统计,并且分析统计结果,认为翻译的选择、变异和碱基成分可能是造成致癌基因序列的密码子使用偏好的主要原因。     

拟南芥种子萌发过程中差异表达基因的识别和pre-mRNA可变剪接图谱的构建

种子的萌发是植物新生命的开始,也是决定植物种群更新、物种延续的关键环节和影响粮食作物产量的重要因素.种子萌发事件是一个极其复杂的过程,其调控机制至今仍未完全知晓.本文基于拟南芥种子不同萌发过程的RNA-seq测序数据,分别从基因表达和pre-m RNA可变剪接层面系统地剖析了种子萌发过程中的组学特征和调控机制.首先,通过组学数据分析方法得到拟南芥的基因表达矩阵,系统地识别了种子不同萌发阶段间的差异表达基因,并解析了其生物学功能.结果显示,随着种子的萌发,一方面大量与糖酵解、DNA合成等代谢过程密切相关的基因被激活,保证了种子新陈代谢和基本的细胞活性的重新激活;另一方面,与氧化应激胁迫响应、有毒物质响应、热响应、水响应等相关的基因活性被抑制,保证了种子能够从休眠态顺利活化.其次,使用r MATS系统描绘了种子萌发过程中各阶段的pre-m RNA可变剪接图谱,鉴定了不同萌发阶段间的差异可变剪接事件,并分析了种子萌发过程中的可变剪接特征及差异可变剪接事件的生物学功能.该工作的开展将进一步促进种子萌发过程中的调控机制的阐明,并为相关实验工作的开展提供一定的帮助.     

关于我院大学生课外活动的探析

二年来我院围绕提高增强大学生政治思想水平、公民道德意识、学生创新精神、大学生社会实践、文化艺术素质等方面开展了一系列课外活动,收到了明显的成效。但还受主观认识和客观条件的限制。今后的主要策略从活动观念、活动内容、活动体系及多方支持加强工作。     

酿酒酵母几个组蛋白修饰间的因果组合关系分析

构建了酿酒酵母BY4741的四个组蛋白修饰位点突变菌株H3K14A、H3K9A、H4K5A和H4K12A,基于突变菌株的Western blot实验检测了组蛋白H3和H4的目的位点修饰程度。结果显示,四个变体的所有被研究修饰水平与对照菌株相比差异极显著。变体H3K14A和H4K5A之间的H3K9Ac修饰水平、H3K9A和H4K12A变体之间的H3K4me3修饰水平以及H3K9A和H4K12A之间的H3K36me3修饰水平差异显著。H3K14A和H4K5A之间的H4K12Ac修饰水平、H3K9A和H3K14A变体之间的H3K36me3修饰水平、H3K14A和H4K12A变体之间的H3K36me3修饰水平以及H3K9A和H4K5A变体之间的H3K79me3修饰水平差异不显著。实验结果证实的多个修饰之间的因果关系与前期网络预测吻合。     

隔离子两侧临近基因的共表达研究

染色质隔离子是相邻转录功能区的边界序列,可以发挥增强子阻断和染色质屏障作用.研究结果显示,隔离子两侧临近基因的转录方向相同时,这两个基因表达水平具有显著的正相关,否则表达水平关联不显著.该结果指出隔离子并没有对临近基因表达起到屏障作用,这些隔离子可能发挥了增强子阻断作用.此外,隔离子两侧转录方向相同的两个基因的基因长度呈现正关联.尤其是同时位于"+"链的隔离子两侧临近的基因,关联最强.同时,发现隔离子每一侧基因表达水平和该基因长度呈现显著的负相关,这一关联性与该基因的转录方向和隔离子的存在无关.