药物分子对接网格研究与进展

药物分子对接所涉及的搜索空间非常巨大，需要耗费大量的时间，并且对计算环境也有较高的要求．将网格技术应用于药物分子对接中，能有效解决上述问题．通过应用改进的遗传算法多种群竞争机制的对接演化模型GADock，以信息熵控制设计空间的收缩，增强了进化的有效性，显著地提高了对接效率、利用网格数据传输和网格任务调度等网格技术对分子对接过程进行了优化，有效利用了网格节点资源，并降低了药物分子的对接时间．实例测试表明了药物分子对接与网格技术相结合的合理性及有效性．     

一种基于无网格方式的弹塑性体变形仿真方法

提出了一种对高弹性、高塑性物体变形进行仿真的新方法。该算法利用点采样的方式表现表面,使用采样分裂和聚合以适应仿真中采样密度的变化。将弹性力学中的理论应用到仿真中,使用移动最小二乘法计算应力、张力、弹性体力,使用张力状态变量来描述弹塑性变化,利用向量位移进行了仿真。仿真结果可表现融化、分裂、聚合等弹塑性变形。     

网格计算系统及其安全技术

网格计算是基于Internet的新兴技术,源于分布式计算,用来解决复杂协同计算和应用.介绍了网格计算的概念、特点、基本功能和体系结构,分析了网格面临的安全问题和网格安全关键技术,最后,结合网络安全基础设施(GSI)等相关知识提出网格中的安全鉴别过程模型.     

基于BPEL的颗粒堆积仿真的网格计算服务

提出了颗粒堆积仿真过程的并行计算和并行可视化的实现方法,大大减少了颗粒堆积计算的时间.并通过商业流程执行语言(BPEL)定义的工作流,实现对计算服务的流程控制、事务管理和生命周期控制,使得颗粒堆积仿真计算服务能够平滑地移植到网格计算服务平台上提供服务.     

基于经济模型的网格资源调度算法

建立了基于经济模型的网格作业调度系统,给出了相应的服务质量(QoS)资源调度算法.通过定义资源的多维QoS指标,实现了对计算网格中广域分布和异构资源的统一描述,能很好地适应网格资源的动态性和自治性.采用QoS偏好度排序和欧氏距离的优化策略搜索资源,将用户提出的具有个性化或总体服务需求的作业透明、动态地分配给最适应的资源,优化了资源的统一配置.采用仿真实验比较多种算法的性能,结果说明QoS算法可满足资源的自适应性,较好地实现全局资源调度的目标.     

数据网格中复制式数据的一致性维护方法

由于网格环境动态性的特点,网格延迟的不稳定等问题会严重影响数据的可获得性.针对这个问题,采用复制式的数据模型来给予解决.通过在数据网格中维护多个数据副本,用户可以选择其中任意一个进行访问修改.通过将网格服务与数据分离,将数据模型化为线性数据和树型数据,可以支持用户对网格数据的实时修改,并且可以维持多个数据副本的一致性.提出了一个新的时间戳模型,可以支持一个数据副本上的并发操作.本方法是一个无锁的算法,可以满足网格环境下数据的RIC属性.     

基于WSRF的网格资源信息服务架构

为了满足视频服务网格中资源信息服务的要求,特别是视频信息资源的组织和管理,提出了一种基于WSRF的多副本一致性信息服务架构,并基于MDS4实现.该系统主要包括资源注册、信息采集、信息查询、资源监控和报警处理等五大功能模块.同时,提供了Web页面的形式,便于用户进行资源的查询和监控.据此设计的原型系统已经应用于实践,取得了良好的效果.     

面向生物信息学计算的网格工作流系统

针对生物信息学网格计算需求,提出了一种网格工作流管理系统模型,系统以Web方式为用户提供服务,通过与软件模块的交互实现良好的可定制的人机交互界面,使得不熟悉网格计算和工作流系统的人也可以快捷直观地操作使用.该系统能够自动地对工作流任务进行调度,然后通过网格中间件进行执行,并对任务进行监控和管理.论述了该系统的框架和实现原理,通过一个生物信息学计算实例说明工作流的定义、描述和使用流程;并且,通过与中国教育科研网格公共支撑平台CGSP工作流系统的对比,说明了该系统在可视化、便捷性上更符合生物信息学计算需求的特点.     

高能物理计算网格应用系统

针对在高能物理计算中存在的海量数据存储和计算问题,讨论了高能物理计算网格应用系统的体系结构,并重点讨论了运用元数据模型,通过元数据方式对数据的集成和整合,为用户提供了高能物理异构数据资源统一访问机制,以适应高能物理计算环境下数据密集型应用对数据共享和处理的需要,提高数据共享的利用率,节约了计算和存储硬件资源,加速了高能物理研究的进程.     

基于微观经济学方法的网格资源分配管理模型

提出了一种基于微观经济学方法的网格资源分配管理模型,采用分布自治原则由众多的网格域构成整个网格系统.系统根据用户作业请求发出投标信息,各网格域参考投标信息及自身资源使用情况利用PSP拍卖机制确定中标者,最后系统从中标信息中选择费用最低的完成任务,以一定的周期运用微观经济学供需均衡原理动态调整资源价格,并给出了价格调整算法.相对于别的网格资源管理系统,本模型提出的资源管理方案在管理上比较简单,系统不必掌握全局资源信息,可扩展性较强,易于实现,并且通过引入竞标机制解决了资源提供者的报酬问题.