6个短片段STR基因座复合扩增的法医学初步研究

构建包括6个短片段STR基因座的复合扩增体系,应用于法医学DNA检验。采用荧光标记短片段引物建立复合扩增体系,对DNA样本进行检测,分型结果与DNATyper^TM15试剂盒及AmpFLSTR^S Identifiler试剂盒进行比较。利用该复合扩增体系可从高度降解检材中获得较好的DNA分型,大大提高高度降解检材的检出率。     

DYS19、DYS391、DYS439基因座多态性及其荧光标记复合扩增检测的研究

目的：研究Y-染色体STR基因座多态性,建立Y-STR复合扩增及毛细管电泳检测单倍型的方法。方法：应用荧光标记引物,建立DYS19,DYS391,DYS439三个Y-STR基因座复合PCR扩增体系,并应用毛细管电泳技术检测110名武汉汉族男性无关个体的DYS19,DYS391,DYS439 Y-STR基因座分型。结果：DYS19,DYS391,DYS439三个Y-STR基因座分别被检出6,5,3个等位基因,GD值分别为0．7385,0．4780,0．5747。110名无关个体中发现32种单倍型,其单倍型GD为0．9351。结论：Y-STR多态性及其荧光标记、复合扩增及毛细管电泳的检测方法在法医学应用中具有重要作用。     

西安地区强奸犯(汉族)13个STR基因座遗传多态性

目的：调查西安地区强奸犯人群13个STR基因座多态性分布，为建立法医DNA数据库提供资料。方法：采用多色荧光标记引物，复合扩增13个STR基因座，扩增产物进行Genesean扫描，Genotyper分型。建立该人群13个STR基因座的基因和基因型频率数据。结果：共检测出106种等位基因，其频率分布在0．0083～0．5500；235种基因型，其频率分布在0．0167—0．5000。平均杂合度为0．7648。累积个体识别力为0．9999999。非父排除率为0．9999999。多态信息总量分布在0．5544～0．8679。累积偶合率为10^-14。结论：该13个STR基因座可以很好应用于法医DNA数据库的构建。     

D16S539基因座中检出三带型等位基因及遗传分析

目的:在亲子鉴定案件中检出的D16S539基因座三带型.方法:提取个体不同组织样本DNA,经两种扩增试剂盒检测及DNA测序分析.结果:被检母亲D16S539基因座分型结果为9/10/11,阴阳性对照分型结果准确.结论:D16S539三带型非常罕见,该个体为正常成年女性,推测此三带型突变来源于杂合子局部的染色体重排或非整倍染色体.     

16个基因位点在亲子鉴定和个体识别案例中的应用

将短串联重复序列应用于法医物证学案件中.用PCR复合扩增结合四色荧光检测及聚丙烯酰胺垂直电泳技术对一起碎尸案进行CSF1PO、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、FGA、PentaD、Pen taE、THO1、TPOX、vWA及Amelogenin性别位点的基因型检测,进行法医学亲子鉴定和个体识别.16个基因位点非父排除率为0.99999999999999996,个体识别率为0.99999999999999998.本方法及这些基因位点均实用于法医物证学个体识别.本方法鉴定快速,准确,结果分析标准化,使不同实验室的认定结果有了可比性.     

彭布洛克威尔士柯基犬19个STR基因座的多态性研究

目的 对彭布洛克威尔士柯基犬(以下简称柯基犬)的19个STR基因座进行遗传多态性研究。方法 选用犬荧光标记19个STR基因座复合扩增试剂盒进行PCR扩增，并进行统计学分析。结果 对212只纯种柯基犬的19个基因座的多态性进行统计学分析，经Hardy-Weinberg平衡检验，除PEZ20基因座外，P值均大于0.05,18个基因座的累积非父排除率(CPE)为0.9998289783352165,累积个体识别率(TDP)为0.999999999999998,平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.631和0.604。结论 19个STR基因座中的18个(PEZ20基因座除外)联合应用可以用于柯基犬的个体识别和亲权鉴定。     

犬3个STR基因座遗传多态性研究

目的:研究犬的3个STR基因座PEZ12、VWFX、FH2054的遗传多态性,探讨其法医学应用价值。方法:应用自行建立的犬STR基因座复合扩增荧光检测系统,对90个无关个体犬唾液DNA样本进行复合扩增,用ABI310型遗传分析仪对扩增产物进行检测,并进行统计学分析。结果:90头犬的3个STR基因座遗传多态性研究结果表明,各基因座基因型分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡法则。各基因座杂合度均大于0.7,个体识别率在0.9291以上,非父排除率在0.5776以上,3个STR基因座联合识别率大于0.9999,联合非父排除率为0.9369,具有较高的个体识别率和非父排除率。结论:3个犬STR基因座复合扩增体系具有较强的个体识别能力,在法医学犬的个体识别和亲权鉴定中具有较高的应用价值。     

9个STR位点在126例法医学亲子鉴定中的应用

目的：运用9个短串联重复序列(STR)位点检测分析126例亲子鉴定案例。方法：EDTA抗凝血按Chelex法提取DNA，聚合酶联反应(PCR)扩增。应用ABI377自动荧光测序仪及Profiler plus试剂盒，通过检测9个STR位点的基因分型，完成亲子鉴定126例。其中母-子-假想父三联体鉴定90例，假设父-子二联体鉴定36例。结果：在90例三联体鉴定案例中认定存在亲生关系74例，平均父权相对机率(RCP)为99．98％；排除父子关系15例，排除率为16．67％，平均排除位点数为5．3个；不能认定亲生关系1例。在36例二联体鉴定案例中认定存在血缘关系25例，平均父权相对机率(RCP)为99．82％；排除父子关系6例；5例不能认定亲生关系。结论：9个具有高度多态性STR基因座的联合检测，能使三联体亲子鉴定的排除结论明确无误，是法医亲子鉴定和个体识别应用的理想指标。     

纸张上汗潜指纹粉末显现后粉的量和种类对DNA提取的影响

目的研究金粉、银粉、磁粉显现纸张汗潜指纹后对DNA提取的影响,以及纸张汗潜指纹磁粉显现后粉量对DNA提取的影响,探索对纸张汗潜指纹DNA提取影响最小的粉的种类和粉的量,应用于法庭个体识别和亲权鉴定。方法采用5％ehelex-100提纯纸张上汗潜指纹DNA,Gene Ampsystem9700（ABI公司）进行STR分型复合扩增,3130Genetic Analyzer（ABI公司）进行荧光电泳检验。结果粉末的种类和粉量的多少会影响纸张汗潜指纹STR分型的峰高。结论纸张上汗潜指纹粉末显现后粉的量和种类对DNA提取有影响,对纸张上汗潜指纹STR分型的影响大小不同。     

北京汉族群体中6个Y-STR遗传标记的多态性研究

目的:为了寻求新的适合于法医学应用的Y染色体STR基因座,调查了基因座DYS505、DYS533、DYS549、DYS576、DYS578和DYS641在北京汉族群体中的分布.方法:样本来自于北京地区汉族无血缘关系的个体,通过Chelex法提取样本DNA,利用PCR扩增硝酸银染色方法进行分型.结果:6个基因座均为四核苷酸简单重复基因座,男性样本都出现了谱带,而女性样本则无PCR产物.DYS505、DYS533、DYS549、DYS576、DYS578和DYS(M1基因座变异度分别为0.732、0.7824、0.6344、0.7124、0.7543和0.7314.结论:6个基因座都是非常适合于法医学应用的STR基因座.     

北京地区汉族群体D1S1612 STR基因座的遗传多态性

目的首次调查中国北京地区汉族群体D1S1612基因座的等位基因频率分布.方法采用扩增片段长度多态性(Amp-FLP)分型技术对D1S1612 STR基因座进行检测.结果D1S1612检出9个等位基因,25种基因型.其STR基因座基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.01).个人识别机率(DP)为0.901～0.927.结论D1S1612 STR基因座属高杂合度、高识别能力的遗传标记,可用于法庭科学亲子鉴定和个人识别.     

Minifiler基因座对陈旧骨检测效果及在南阳回族人群中的多态性分布

目的:探讨Minifiler 9个基因座对陈旧骨骼中的检测与分型效果,并调查此9个基因座在南阳回族人群中的多态性分布。方法:用改良酚-氯仿法提取陈旧骨DNA 10份,Chelex-100法提取南阳回族无关个体DNA 440份,Minifiler试剂盒基因座复合扩增,检测,计算样本基因型分型和基因多态性参数。结果:9个基因座在陈旧骨中的检出率为90%~100%。基因座在南阳回族人群分布范围H值在0.7342~0.8844之间,Pm值在0.0425~0.0953之间,PIC值在0.7100~0.8582之间,DP值在0.8973~0.9736之间,PE值在0.4688~0.7282之间。结论:Minifiler试剂盒9个基因座可作为陈旧骨微量DNA的参考检测基因位点,该基因座尤以FGA、D2S1338、D21S11在南阳回族人群中的基因多态性较好,个体识别率高,在法医实践中具有应用价值。     

结核分枝杆菌耐链霉素与rpsL和rrS基因的相关性研究

为探讨新疆地区结核分枝杆菌对链霉素(streptomycin,STR)产生耐药性的分子机制,建立直接快速检测结核杆菌STR药物敏感性的方法.应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)银染分析技术,检测62株结核杆菌临床分离株链霉素耐药性及rpsL和rrS基因变异情况,以结核分枝杆菌标准株(H37Rv)为对照.结果发现62株结核杆菌临床分离株中,32株STR敏感株的rpsL和rrS基因未见SSCP泳动异常,30株STR耐药株中,23株(76.7%)中rpsL(21株)和rrS(5株)基因出现SSCP泳动异常,并且3株出现了rpsL和rrS双基因的SSCP泳动异常.因此,rpsL和rrS基因突变可能是结核分枝杆菌对链霉素产生耐药性的重要分子机制,PCR-SSCP银染技术可作为快速检测结核杆菌STR药物敏感性的方法.     

虎纹蛙Sox基因的PCR扩增及SSCP分析

本文采用PCR技术,以特异扩增人SRY基因HMG－box保守区的一对引物,扩增了虎纹 蛙Sox基因（SRY－box gene）。并对扩增产物进行了SSCP分析。结果雌雄虎纹蛙个体均扩增 出一条带,大小为221 bp,表明虎纹蛙Sox基因在雌雄个性间无性别特异性。SSCP分析结果 显示虎纹蛙Sox基因雌雄个体片段的单链迁移率无差异,而与人的有较大差异。本文为探讨 虎纹蛙的性别决定机制及Sox基因的进行提供了分子资料。     

一种简便的STR重复次数测定方法

 短串联重复（STR）的多态性分析是生物个体识别最有效的一种手段,在法医学鉴定中已被广泛用于身份识别．但目前使用的方法成本太高,以致不便在更广泛的范围推广．针对法医上常选用的4bp重复单位的STR基因座,采用PCR产物小于160bp的迷你STR(Mini STR)和优化聚丙烯酰胺凝胶电泳条件,提高分辨率,使重复单位之间能有效分辨．设计PCR引物,使STR基因座扩增产物的大小为4bp的倍数,应用8bp的DNA Ladder即能精确测定整数倍STR重复单位数．这一方法操作简便,成本低廉,尤其是用于制作人基因身份证,使得人人制作一张基因身份证成为可能．     

宁夏回族和汉族人群15个STR基因座的遗传多态性

对宁夏回族和汉族人群15个STR基因座的遗传多态性进行调查,应用Identifiler Plus试剂盒检测598名宁夏回族、598名宁夏汉族无关个体15个STR基因座的DNA分型,使用Modified-Powerstates统计软件计算等位基因分布频率等法医遗传学数据。实验发现:宁夏回族和汉族人群的15个STR基因座基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05),宁夏回族群体15个基因座的杂合度(H)在0.659~0.858之间,匹配概率(Pm)在0.037~0.147之间,个体识别概率(DP)在0.798~0.963之间,多态信息含量(PIC)在0.570~0.850之间,非父排除概率(PE)值在0.368~0.710之间;宁夏汉族群体15个基因座的杂合度(H)在0.587~0.878之间,匹配概率(Pm)在0.035~0.211之间,个体识别概率(DP)在0.789~0.965之间,多态信息含量(PIC)在0.550~0.850之间,非父排除概率(PE)值在0.342~0.751之间。结果表明,宁夏回族人群和汉族人群15个STR基因座具有较高的遗传多态性分布特征,可为宁夏人口亲权鉴定、个体识别及群体遗传学研究提供基础。     

应用STR基因座基因型频率对阿昌族及其他种族和民族的遗传距离进行比较

目的：对阿昌族和其他种族和民族的遗传进行距离比较,以对阿昌族的起源进行有益的分析。方法：复合扩增9个STR基因座,扩增产物进行基因扫描和基因分型。调查阿昌族9个STR基因座的基因频率分布。对阿昌族和其他种族和民族的遗传距离进行比较和聚类分析。结果：阿昌族与美国黑人、白人和我国其他几个民族遗传距离差异由小到大依次为：藏族(0．0433)→汉族(0．0532)→蒙古族(0．0670)→回族(0．0858)→维吾尔族(0．1075)→白种人(0．1571)→黑种人(0．2542)。结论：表示种族之间差异大于民族之间的差异。阿昌族与藏族、汉族的遗传距离较近而与维吾尔族较远。     

D18S535 STR基因座的遗传多态性研究

调查中国北方地区汉族群体D1 8S535基因座的等位基因频率分布。方法 :采用扩增片段长度多态性 (Amp FLP)分型技术对其STR基因座进行检测。结果 :D1 8S535检出 9个等位基因 ,2 7种基因型。该STR基因座基因型频率分布符合Hardy Weinberg平衡 (P >0 0 2 5)。个人识别机率 (DP)为 0 92 7。结论 :D1 8S535STR基因座属高杂合度、高识别能力的遗传标记 ,可用于法科学亲子鉴定和个人识别     

青鳉DMY基因的克隆及其在性别鉴定中的应用

提取雄性青鳉成鱼基因组DNA为模板,利用特异性引物,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增获得1 908 bp的特异性条带.经测序证明为DMY基因片段,其核苷酸序列由3个外显子和2个内含子组成,可连续编码150个氨基酸.建立准确而有效的鉴定任意发育阶段青鳉个体雌雄性别基因型的方法,即利用管家基因——肌动蛋白基因PCR扩增条带的有无验证DNA样本提取和PCR扩增的有效性,同时利用雄性DMY基因的PCR扩增条带的有无鉴定青鳉个体的雌雄性别.对随机选取的成鱼和新生鱼卵样本,应用该方法可成功地鉴定出青鳉个体的雌雄性别.     

Identifiler体系在三联体亲权鉴定中的突变现象分析

目的：观察Identifiler体系在三联体亲权鉴定中的突变现象及特点.方法：使用ABI-3130XL型遗传分析仪对66个肯定亲权关系的案例进行Identifiler体系的STR分型.结果：在66个案例中共出现5次单等位基因突变,父系突变与母系突变比例为4∶1.结论：STR基因座突变现象较为常见.当出现突变时,应加测基因座或增加其他检测方法,以提高鉴定结论的可靠性.