6种瓢虫的RAPD分析及在分类上应用的研究

利用随机引物分别对6种瓢虫的DNA进行了聚合酶链式反应（RAPD－PCR）的实验。结果显示，用相同引物扩增不同种瓢虫的基因组DNA，扩增产物多态性DNA片段的数目是不同的；两种不同引物的扩增产物中，各自呈现出种、属的特异性片段，其可用于种、属的鉴别；聚类图显示了种、属之间亲缘关系的远近程度，并与形态学分类结果相一致。实验分析还发现：七星瓢虫不同个体间多态性DNA特有带较多，遗传较稳定；龟纹瓢虫与之相比，不同个体间多态性DNA的特有带较少，变异程度较大。     

从"同一性"到"多样性"

人类遗传多样性是生物多样性的重要组成部分。遗传多样性是指生物基因组在长期进化过程中积累起来的遗传变异。这些变异可以是有益的、中性的或有害的;其中一些被保存下来,导致不同种族、群体和个体间基因组的差异,那就是遗传多态性。人类遗传多样性寓于世界民族和各遗     

幽门螺杆菌基因多态性与致病性关系的研究进展

幽门螺杆菌感染是世界上最常见的人类细菌感染之一,其感染病灶主要集中在消化道.由于幽门螺杆菌是一组基因组结构变异很大的细菌,幽门螺杆菌基因碱基突变而产生的基因多态性使其不同基因型对不同消化系疾病的发病和临床结局产生不同影响.所以检测幽门螺杆菌基因多态性对发现幽门螺杆菌相关消化系疾病的易患人群和开展幽门螺杆菌的防治工作具有重要意义.文章综述了幽门螺杆菌基因多态性与消化病感染临床结局关系的研究进展状况.     

水杉自然居群遗传多样性的RAPD研究

用随机扩增多态性方法对四川、湖南、湖北交界处的２７个水杉样本进行了基因组ＤＮＡ多态性分析．１１个随机引物共获得ＲＡＰＤ谱带１２１条,多态性谱带占５３％．聚类分析结果表明：水杉个体间的遗传距离与这些个体的地理分布相关,即相同产地个体间的遗传距离较小,不同产地个体间的遗传距离较大．与松柏目其它类群相比,水杉居群的遗传多样性程度高于银杉（３２％）,而在所处的大类群中则处于中等水平．初步结果表明,尽管孑遗物种水杉的自然种群的目前分布范围和个体数目非常有限,但是它仍然保持着中度的遗传多样性水平．可推测,孑遗植物的遗传多样性水平具有一定的变异范围     

人工合成六倍体小麦（AABBDD）与亲本种之间基因组与基因区域的序列变异分析

为探讨六倍体小麦进化过程中基因组发生的变异,我们以两套不同世代（早代和高代）的人工合成六倍体及其母本（四倍体小麦,AABB）和父本（粗山羊草,DD）为材料,采用DNA—AFLP和SSCP方法分别对基因组与基因区域的序列变化进行了研究．结果发现,人工合成六倍体小麦基因组中来源于父本的条带发生丢失的数目更多,表明倍性较低的亲本（DD）基因组序列在多倍化过程中发生了更明显的变异,这与前人的研究结果一致．与DNA—AFLP结果相比较,采用SSCP方法检测到的变异比例明显较低,说明六倍体小麦进化过程中基因区域发生变异的频率较低,而DNA—AFLP检测到的丢失条带可能主要为非编码序列,特别是重复序列．分析还发现,有4个基因在杂交F1代就发生了变异,这说明这些基因变异是由于杂交引起的．生物信息学分析结果显示,在上述4个基因中,有3个位于2D染色体长臂上,并且位于相近的同一区域．本研究结果显示,在人工合成六倍体小麦进化过程中,基因区域的序列变异具有选择性,而不是随机的．     

杨树泛基因组构建与基因组变异分析

【目的】杨树是重要的速生用材、生态防护和碳汇造林树种,也是林木遗传研究的模式树种。开展杨树泛基因组构建与基因组变异分析,可为杨树精准育种和林木泛基因组研究提供理论先导。【方法】 以公开发表的高质量杨树基因组序列为基础,分析不同类型的序列变异,总结变异特征,并构建基于基因和图形结构的杨树泛基因组。【结果】 本研究收集到8个杨属树种和3个二倍体或三倍体杨树杂交品种的基因组序列,3个杂交品种包含7个单倍型亚基因组序列,较好地代表了杨树4个组派的基因组特征。分析结果表明,杨树基因组间存在较多大的结构变异。在基于基因的泛基因组中,共线核心基因、非共线核心基因、次核心基因、非必需基因、特异基因占比分别为12.5%、34.9%、31.4%、16.5%、4.7%。其中,非必需基因在功能上具有较高的多样性。以基因组序列变异为基础构建杨树图形结构泛基因组,大幅提升2代测序数据的变异检测效果。通过泛基因组变异热点分析,鉴定出2个与物候关联的基因位点。【结论】 杨属基因组中存在大量染色体重排,进而增加了基因调控的多样性。杨树组/派间的基因组结构变异可能与物候适应存在关联。基于林木基因组序列的复杂性,在林木泛基因组研究中应注意基因组整合范围与研究目标相匹配,结合基因泛基因组和图形结构泛基因组结果,综合解析林木的遗传变异规律和物种演化特征。     

水稻配子体细胞质雄性不育基因orf79/orfH79的变异多态性研究

线粒体基因组异常嵌合基因orf79/orfH79被证实为水稻配子体细胞质雄性不育（cytoplasmic male sterility,CMS）基因。为了调查配子体CMS基因orf79/orfH79在水稻资源中的遗传与变异,来自不同国家的31份水稻材料被用于PCR检测。10份水稻材料被检测出具有配子体CMS基因orf79/orfH79,表明配子体CMS基因orf79/orfH79在水稻资源中具有较高的分布频率（32.2%）。DNA序列分析显示水稻配子体CMS基因orf79/orfH79具有非常保守的遗传特性（98.3%）,只有4个多态性碱基位点被检测出,4个碱基位点的变异导致多肽ORF79/ORFH79三个氨基酸位点的改变。基于orf79/orfH79 DNA序列的聚类分析系显示10份水稻材料被分成了3个类群,表明配子体CMS胞质在水稻资源中存在多种变异模式。研究结果为新水稻CMS胞质的发掘与培育提供重要的理论和实验依据。     

单核苷酸多态性的研究进展

随着基因组测序工作的进展,日益发现基因组中存在着数量庞大的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）。SNPs是指染色体基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性,在人群中发生频率大于1％。SNPs有单碱基的转换（transition）、颠换（transversion）、插入、缺失等形式。转换：颠换约为2：1,25％的SNPs发生于CpG位点,发生C-T转换。SNPs在3’表达序列标签（express sequence tags,ESTs）中的分布要比其它基因组区域的少,研究表明,这与表达序列承受更大的选择压力是一致的。     

人类基因组中单核苷酸多态性(SNPs)的研究与应用

多数人类基因组的变异来自于单个核苷酸的置换,被称为单核苷酸多态性（SNPs）,其研究在基因定位,遗传疾病,生物的起源、进化及迁移等方面的理论研究中具有重大意义,本文就SNP的分类、特性、检测方法、应用及最新研究进展等方面的内容进行综述。     

Studies on the isozymic diferentiation in the endangered species Dutzia multiradiata (Hydrangeaceae)

研究了中国南川金佛山特产的濒危物种多辐溲疏（Ｄｅｕｔｚｉａｍｕｌｔｉｒａｄｉａｔａ）５个居群４１个个体叶片过氧化物酶（ＰＯＤ），过氧化氢酶（ＣＡＴ），酯酶（ＥＳ），淀粉酶（ＡＡ），柠檬酸脱氢酶（ＣＤＨ）和谷氨酸脱氢酶（ＧＤＨ）同工酶谱带上的变异式样．对于所得酶谱带编码，构成二态数据矩阵，用Ｊａｃａｒｄ，ＳｏｋａｌＳｒｅａｔｈ和ＳｏｋａＭｉｃｈｅｎｅｒ结合系数计算，分别用组平均法（ＵＰＧＭＡ）和加权平均法（ＷＰＧＭＡ）对上述结合系数聚类．所有居群同工酶谱分布表明只有１３４６％的同工酶谱带在所有个体中是恒定的，８５５４％的同工酶谱带在个体间显示或多或少的变异．对居群而言大约４６％的同工酶谱带是恒定的，５４８６％的同工酶谱带有分化．聚类分析说明来自于同一居群的不同个体表现出极大相似性，而不同居群的个体表现极大趋异性，显示出酶谱带位置与居群生长的生境有显著的相关性．     

皖西白鹅遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术对皖西白鹅产区内１１个不同地点的２４只个体一进行遗传多样性分析。从３４个随机引物中筛选出的１２个引物对所有个体的总基因组ＤＮＡ进行了ＰＣＲ扩增。共扩增出８７个ＤＮＡ片段,其中的２２个多态性片段,计算了各多态性片段在群体中分布的频率及各个体间的遗传距离指数。同时根据遗传距离指数对它们进行了聚类分析。作为家养动物的个品种,皖西白鹅的遗传多样性程度较高。     

云南松居群花粉形态多态性

观察和统计昆明地区４个云南松居群的花粉粒形态,揭示云南松居群内花粉粒形态的多态性及其分布频率,并应用巢式等级方差分析方法,试图探讨云南松花粉粒在居群间、个体间和个体（家系）内形态变异的分化大小．研究表明,云南松花粉粒形态、大小、气囊数目及其大小的变异极其复杂多样,在松属植物中所少见．巢式等级方差分析表明,昆明地区云南松居群具有两个气囊的正常花粉粒,其形态变异有大约２０．２％源于居群间,有７９．８％左右源于居群内个体间和个体（家系）内,其中个体（家系）内花粉粒形态变异方差分量占８８．３％,说明云南松个体（家系）内花粉粒形态的变异较大,环境饰变作用很大．     

50例中国人IX因子基因的限制性片段长度多态性

用IX因子基因内探针F9(VⅢ)对TaqI,BamHI和EcoRI酶切的50例中国人基因组DNA进行杂交分析。结果表明,所有个体经TaqI酶切的杂交片段为4.5kb和1.8kb,BamHI和EcoRI酶切的杂交片段分别为23kb和5.0 kb。基因组DNA样本中未发现限制性片段长度多态性(RFLP),这与欧美国家的民族群体中存在着IX因子基因内TaqI和BamHI的RFLP的结论不同。造成不同种族间DNA水平差异的原因,很可能与长期在不同地理环境中的进化适应有关。     

分子标记及AFLP技术

分子标记类型可以基因表达的结果为基础,对基因的间接反映;分子标记则是DNA分子碱基序列变异的直接反映.早期利用限制性内切酶,酶切生物体DNA后来检测不同遗传位点等位变异(RFLP)和以一个碱基顺序随机排列的寡核苷酸序列为引物,利用对基因组DNA随机扩增来鉴别DNA多态性(RAPDs).真核生物基因组中普遍存在的重复序列产生了微卫星(microsatellites)标记技术.而RFLP与RAPDs有机结合形成了有着更为广阔的应用前景的AFLP技术.SNP标记利用大多数基因位点上都会有若干个等位型(alleles)为DNA芯片技术应用于遗传作图提供了基础.     

活性污泥基因组DNA快速提取新方法及其指纹分析

建立了从活性污泥中快速提取基因组DNA的新方法，过程包括粗提与精制两个步骤，简化了繁琐的提取程序，提高了提取效率．用该方法提取的基因组DNA做模板，进行扩增核糖体限制性酶切片断分析（ARDRA）及核糖体基因间区序列分析（RISA），均获得了理想的多态性指纹图谱；采用两对特异性引物（鞘氨醇单胞菌属和氨加氧酶基因）对所提污泥基因组DNA进行扩增，均获得了正确的PCR产物．该方法提取的污泥基因组DNA不但适用于研究污泥系统中菌群多样性分析，而且还可以对特定基因进行跟踪监测。     

灰胸竹鸡和棕胸竹鸡的线粒体基因组结构分析及比较

竹鸡属包括灰胸竹鸡（Bambusicola thoracica）和棕胸竹鸡（B. fytchii）两种鸟类。两种竹鸡线粒体基因组全长为16726 bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA和1个控制区。基因排列顺序与红原鸡（Gallus gallus）一致,属于典型的鸟类排列顺序;碱基组成存在明显的AT偏向性。两种竹鸡线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的序列长度和终止密码子都完全一样,但部分编码基因的起始位置以及起始密码子存在差异;两种竹鸡的线粒体基因组基因排列紧密;两种竹鸡线粒体全基因组序列之间共有1132个变异位点,其中缺失位点24个,遗传距离为0.071。     

单核苷酸多态性研究进展及其在法庭科学中的应用

单核苷酸多态性(Singlenucleotidepolymorphism,SNP)是人类基因组中单个碱基的变异,其最低基因频率不低于1%,是倍受关注的第三代多态性遗传标记,为法医物证检验提供了新的方向,本文就其研究最新进展、应用及检测手段作一综述.     

β—glucuronidase基因在水稻植株中的表达

采用花粉管通道法，将带β－ｇｌｕｃｕｒｏｎｉｄａｓｅ（ＧＵＳ）基因的ｐＢＩ１２１质粒ＤＮＡ导入栽培稻农垦５８。用荧光法检测ＧＵＳ活性，证明ＧＵＳ基因在水稻转基因植株中得到表达。Ｄｏｔ ｂｌｏｔ和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔ的结果表明经花粉管通道途径导入的外源ＤＮＡ整合到了转基因植株的基因组中，本文还对转基因植株后代的各种变异进行了讨论。     

中国特有植物大血藤的RAPD分析──植物地带性分化的分子差异标准初探

采用随机扩增多态性ＤＮＡ技术对中国特有科特有属植物大血藤（Ｓａｒｇｅｎｔｏｄｏｘａｃｕｎｅａｔａ）进行分析,探讨植物地带性分化的分子差异．从１００个随机引物中筛选出１１个有效的１０碱基对寡聚核糖核苷酸作引物,用于对取自５省区的大血藤植物基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增;用ＵＰＧＭＡ法对各居群间的Ｊａｃａｒｄ相似性系数和遗传距离进行聚类分析．ＲＡＰＤ分析结果表明：分布于各省区（地区）的大血藤居群,尽管其形态特征的变异尺度较为一致,但在分子水平上存在明显差异,这种差异与地理范围的变化相关,表现出一定的地带性分化规律．     

水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析

从公布的水稻两个亚种（籼稻9311和粳稻Nipponbare）基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异：内含子和基因间区中微卫星的多态性较高（分别约为45%和40%）,外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低（约为25%）;两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。