蛋白质等电点的理论计算

蛋白质的等电点 pI 是蛋白质的重要理化性质之一。了解蛋白质的 pI,对蛋白质的分离纯化,鉴定小分子肽或酶的活性位点,预测不同蛋白质之间或蛋白质与其他大分子之间的离子相互作用,判断 pI 值对测定温度的依赖关系,设计由已知顺序的 DNA 合成的肽的纯化程序等都是很有意义的。蛋白质的 pI 值通常采用等电点聚焦或层析聚焦等实验方法测定。由于实验方法的灵     

抗HBsAg单链抗体的等电点测定和结构模拟

应用实验生物学和计算生物学方法对重组人源抗HBsAg单链抗体(HBscFv)的部分理化性质和空间结构进行分析．首先应用蛋白质分析软件包Antheprot预测HBscFv等电点，然后等电聚焦测定HBscFv等电点，在此基础上，用神经网络法预测HBscFv二级结构，然后用同源建模的方法，获得HBscFv三级结构．结果发现，HBscFv等电点理论值为8．51，实验值为7．3～8．1；PHDsec结果表明，HBscFv是一种全β蛋白质；三级结构建模表明，HBscFv的VH结构域由9个片层组成，VL结构域由8个片层组成；由于单链抗体的特殊性，三级结构建模无法给出VH与VL结构域之间进一步折叠后形成的结构。     

曲霉型糖化酶等电点的理论计算

该文介绍了一种根据蛋白质的氨基酸组成,应用计算机数据处理技术从理论上计算蛋白质、酶及多肽的等电点的新方法。和传统的生物化学研究方法相比,该法不仅简单、方便,而且结果可信度较高,除对已知其pI的蛋白质或酶的实测值印证外,还可预测蛋白质或酶的等电点。这在蛋白质化学、酶学等研究领域具有一定应用价值。文中计算了8种曲霉型糖化酶的pI,计算结果和文献报道基本吻合。     

蛋白质静电吸附的可动平衡模型

根据统计热力学推导得到了反映蛋白质离子交换吸附非质量作用本质的可动平衡模型,并用阴离子交换剂吸附牛血清白蛋白的平衡数据进行了拟合分析.结果表明,可动吸附模型可定性分析离子强度及pH值对蛋白质吸附平衡的影响.在离子强度大于60mmol/L时,模型拟合精度较高;当溶液pH值较低并接近蛋白质等电点时,模型的拟合精度并未降低,从而克服了空间质量作用模型在高离子强度及pH接近等电点时预测效果差的缺点.     

用双极性膜电渗析法分离混合氨基酸

为开发新的混合氨基酸分离技术,提出用双极性膜电渗析分离混合氨基酸的方法.在对混合氨基酸溶液中离子成分进行分析的基础上,预测了使用该法的可行性,并通过三室双极性膜电渗析法实验验证了理论计算的结果.对于等电点相差很大的谷氨酸和精氨酸以及等电点相差比较大的谷氨酸和甘氨酸以及精氨酸和甘氨酸两元混合物,可以实现很彻底的分离,得到纯度96%以上的产品,电流密度可以达到5～10 mA·cm-2. 对于等电点相差很小的丝氨酸和脯氨酸,则分离难度较大,电流密度在1 mA·cm-2以下.该法不需使用缓冲溶液,可提高分离过程的效率.     

等电点计算公式使用条件的探讨

提出了一种新的氨基酸和多肽等电点计算公式推导方法,并讨论了等电点计算公式的使用条件。     

同源蛋白质等电点的预测

应用一个依据蛋白质氨基酸组成可预测其等电点(pI)的数学模型,辅以自行设计的计算程序,计算了弹性蛋白酶(Elastase)、牛胰乳蛋白酶原(Bovine chymotrypsinogen)和α-胰凝乳蛋白酶(α-Chymotrypsin)的pI,计算值同实测值基本吻合。应用该模型还给出了4种精氨酸酶(Arginase)同功酶的pI理论预测值。     

氨基酸的等电点与pKa的关系

根据氨基酸的电离平衡，讨论了碱性和酸性氨基酸的等电点与ｐＫａ的关系，得到氨基酸的等电点的计算公式。     

最大泡压法测定明胶等电点的实验设计

该文介绍了一个创新性的物理化学设计实验,尝试利用基础物理化学的实验技术"最大泡压法"来考察明胶溶液在等电点时物理化学性质的变化规律,进而拓展测定明胶溶液等电点的实验方法。实验结果显示,明胶溶液在等电点时表面张力发生了明显的变化,利用最大泡压法测定明胶溶液表面张力的变化趋势可以初步确定明胶的等电点范围。本实验的设计能够提高学生综合运用所学知识和实验技术的能力,丰富基础物理化学实验教学的内容。     

肽的等电点计算方法

肽是两性电解质,肽的等电点和氨基酸一样可根据它各自解离基团的ＰＫ值求得。即肽的等电点为它的两性离子两侧的ＰＫ的平均值。