珍珠黄杨两个天然群体遗传多样性的RAPD分析

以珍珠黄杨为材料,研究了RAPD 分析过程中的模板DNA、Mg2+、随机引物、dNTP、TaqDNA聚合酶等影响因素,建立了适于珍珠黄杨RAPD分析的 PCR 反应体系,并在此基础上对珍珠黄杨两个天然群体的遗传多样性进行了分析。从200个随机引物中筛选出14个引物共检测出个161个位点,其中多态位点137个。用POPGEN32版软件对数据进行了分析,结果表明:多态位点百分率为8509%,Shannon’s信息指数为05492,Nei’s基因多样性为03711,珍珠黄杨具有较高的遗传多样性。     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

太平洋蓝鳍金枪鱼野生群体遗传多样性的初步研究

采用RAPD和微卫星(Simple sequence repeats,SSRs)分子标记技术对太平洋蓝鳍金枪鱼(Thunnus thynnus)野生群体遗传多样性进行了分析.运用18个随机引物进行RAPD分析,共扩增产生96个可统计条带,其中多态性条带32条,多态位点百分率为33.3,Slaannon's遗传多样性指数0.243 0,群体平均杂合度H 0.192 6;在SSRs分析中筛选出10个SSRs引物,多态座位比例为100%,Shannon's遗传多样性指数1.162 2,群体平均杂合度0.648 6.多态微卫星位点的多态信息含量(PIC)为0.357 1～0.818 7.平均0.546 2,分析结果表明太平洋蓝鳍金枪鱼的群体遗传多样性处于较高水平.     

双棘黄姑鱼人工繁育群体遗传多样性的RAPD分析

采用22个随机引物对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行随机扩增多态DNA（RAPD）分析，共检测出248个位点，其中有104个多态位点，平均多态位点百分率P为41．9％；其个体间的平均遗传距离L为0．0657，平均相似系数S为0．9343，Shannon遗传多样性指数H0为0．2829．通过与其他一些鱼类的RAPD研究结果进行对比，对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行了分析评估,文中同时就人工繁育及鱼类种质资源的可持续利用问题进行了初步讨论．     

洞庭青鲫和洞庭青鲫(?)×兴国红鲤(?)杂交F1代的RAPD分析

以鱼的尾鳍为材料,采用苯酚-氯仿法提取鱼的基因组DNA.对提取的结果进行紫外分光光度、琼脂糖凝胶电泳方法的鉴定,筛选出浓度、纯度好的DNA样品进行进一步的RAPD扩增.采用上海生化工程有限公司的80个引物对洞庭青鲫和洞庭青鲫(?)×兴国红鲤(?)杂交F1代(简称"杂交鱼")进行RAPD分析,筛选出9个引物对洞庭青鲫和杂交鱼进行了遗传多样性分析,这9个引物共检出洞庭青鲫89个位点、杂交鱼82个位点.其中多态性位点数:洞庭青鲫76个,杂交鱼71个分别占其总位点数的85.39%、86.58%.据RAPD data analyzer 1.3v.exe ＜RAPD data analyzer v1.3.xls>数据分析程序计算,洞庭青鲫平均遗传相似度为0.653 7;杂交鱼的平均遗传相似度为0.621 8;两种群间的为0.550 5.上述两项指标的初步分析表明,这两种鱼具有较为丰富的遗传多样性.     

中国南部沿海条纹斑竹鲨遗传多样性研究

采用随机引物扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了中国南部沿海闽东(MD)、闽南(MN)、粤西(YX)3个条纹斑竹鲨地理群体遗传多样性和遗传结构.结果表明,34个随机引物在这3个群体中共检测出316个位点,各群体检测出的位点数分别为308、308、303,其中多态位点数分别为49、52、42,多态位点比例分别为15.90%、16.88%、13.86%.3个群体的Shannon多样性指数分别为0.099 8、0.105 5、0.093 6;表明条纹斑竹鲨群体的遗传多样性水平较低.遗传距离和UPGMA聚类分析结果显示条纹斑竹鲨的基因交流模式属于沿海岸线的距离隔离模式,遗传差异大小与地理距离远近相关.进行分子方差分析(AMOVA)得到遗传变异固定指数(FST=0.044 04,p＜0.05),显示大部分变异(95.60%)发生在群体内部,群体间变异较小(4.40%).     

不同巢穴尼科巴弓背蚁的RAPD分析

用RAPD技术对尼科巴弓背蚁5个巢穴的DNA样品进行分析,15个RAPD引物共检测到61个位点,每个引物产生2~7个位点,其中23个为多态位点,占37.70%,Nei's基因多样性指数H为0.1220,Shannon多态性信息指数I为0.1858。地域之间遗传相似性系数S的变化在0.8515~0.9485,遗传距离指数D的变化为0.0516~0.1603,用NTSYSpc 2.10软件包中的UPGMA法进行聚类分析。结果表明,5个不同巢穴间的尼科巴弓背蚁亲缘关系与地理距离相吻合。     

RAPD标记在桂花遗传多样性检测和品种鉴定中的应用

从100个随机引物中筛选出28个多态性稳定的引物,对34个桂花品种、6个桂花野生居群个体、5个木犀属其他种进行了遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析.共检测了231个位点,其中209个位点为多态位点(90.4%).不同品种群的多态性位点频率差异明显,按大小依次排序为银桂品种群＞四季桂品种群、金桂品种群＞丹桂品种群.聚类结果与形态分类结果不完全一致.利用来自引物A11和M18扩增的21条多态性条带构建了桂花品种的DNA指纹图谱,该图谱可以方便地应用于桂花品种的鉴定.不同桂花品种之间存在明显差异.研究结果表明,RAPD技术可用于桂花品种的鉴定和亲缘关系的探讨.     

新吉富罗非鱼选育过程中遗传变异的AFLP分析

为了查明罗非鱼选育过程中发生的遗传变异,采用扩增片段长度多态(AFLP)方法,对吉富品系尼罗罗非鱼选育系基础群体F0、选育群体F6-9进行遗传差异分析.8对EcoR Ⅰ/Mse Ⅰ引物组合共产生308条清晰的DNA带.多态位点比例在群体间呈现出差异性,F0代为51.3%,F6代为48.7%,F7代为47.1%,F8代为46.1%,F9代为43.8%.平均基因多样性指数F0代为0.183 4,F6代为0.176 5,F7代为0.175 4,F8代为0.1620,F9代为0.1560.Shannon多样性指数F0代为0.2684,F6代为0.2626,F7代为0.2614,F8代为0.241 5,F9代为0.231 9.各项遗传多态性指标一致表明,F0代群体遗传多态性水平最高,随选育世代数的累进,选育群体的遗传多态性水平呈现出下降的趋势.吉富品系罗非鱼选育群体间遗传相似性水平(Nei,1972)较高,为0.967 5～0.987 5,群体间遗传距离较小,大小范围为0.012 6～0.033 1.经过偏差校正,Nei(1978)计算得到选育群体间遗传相似性大小为0.972 6～0.992 6,群体间遗传距离为0.007 4～0.027 8.随选育世代数的累进,选育群体与基础群体间的Nei(1972,1978)遗传相似性呈减弱趋势,而Nei(1972,1978)遗传距离逐渐呈现出增大趋势.引物组合E-AAG/M-CTA产生一条大小为502 bp的特异性DNA条带,该条带在不同选育世代间随世代数的累进呈现出频率增高的趋势.     

丁鱼岁遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析

利用RAPD分子标记技术对15个丁鱼岁养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200~3 000 bp之间,其中多态性位点6个,多态位点比例为9.23%.个体间遗传距离在0~0.067 4之间,平均遗传距离为0.028 6.结果显示,丁鱼岁养殖群体的遗传多样性水平较低.