日本绒螯蟹线粒体DNA序列研究：Ⅰ.12SrRNA

参考果民蚤状序列进行了日本绒螯蟹线粒体ＤＮＡ的１２ＳｒＲＮＡ基因片段的引物设计、ＰＣＲ扩增及序列测定,得到４５７ｂｐ的碱基序列,其中Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ含量分别为１５９ｂＰ（３４．７９％）、１７８ｂｐ（３８．９５％）、５０ｂｐ（１０．９４％）、７０ｂｐ（１５．３２％）。     

日本绒螯线粒体DNA序列研究Ⅱ.1.16rRNA

参考果蝇、卤虫与锯缘青蟹的线粒体ＤＮＡ １６ＳｒＲＮＡ基因序列进行了日本绒螯蟹相同基因片段的引物设计、ＰＣＲ扩增及序列测定,得到５６７ｂｐ的咸基序列,其Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ含量分别为１９４ｂｐ（３４．２２％）、２１６ｂｐ（３８．１０％）、９８ｂｐ（１７．２８％）５９ｂｐ（１０．４１％）,与果蝇、卤虫及锯缘青蟹类的１６ＳｒＲＮＡ基因片序列含量相似。     

黑曲霉(Aspergillus niger)三磷酸甘油醛脱氢酶基因(GPD)的序列测定与同源性分析

ｐＡＮＧＰＤ是用构巢曲霉ＧＰＤ基因片段为探针,从黑曲霉基因组文库中筛选到的一个三磷酸甘油醛脱氢酶基因（ＧＰＤ）阳性克隆．作者对该阳性克隆进行了亚克隆和序列测定,结果表明,基因片段总长２４４１个核苷酸（ｎ．ｔ）,其中５’－端非编码区长９８１ｎ．ｔ,编码区（从起始密码子ＡＴＧ到终止密码子ＴＡＧ）长１４４６ｎ．ｔ,３’－端非编码区长２４ｎ．ｔ,基因启动子区含有ｇｐｄ－盒和ＣＴ－盒序列,但无明显的ＣＡＡＴ盒和ＴＡＴＡ盒序列．ＧＰＤ基因由７个外显子和７个内含子构成,外显子全长１００８ｎ．ｔ,编码的蛋白质长３３６个氨基酸残基．通过序列比较分析,发现该基因与构巢曲霉的ＧＰＤ基因有许多相似之处;它们的基因启动子序列都含有ｇｐｄ－盒和ＣＴ－盒,其同源性分别为９６％和６５％;推测的两个ＧＰＤ蛋白的氨基酸同源性高达９０％;两个基因所含内含子数目及位置相同．     

中蜂囊状幼虫病病毒部分结构蛋白基因的克隆及序列分析

根据小ＲＮＡ 病毒科（ Ｐｉｃｏｒｎａｖｉｒｉｄａｅ） 中病毒ＲＮＡ 所具有的结构特征, 采用ｍＲＮＡｃａｐｔｕｒｅ ｋｉｔ 提取纯化中蜂囊状幼虫病病毒（Ｃｈｉｎｅｓｅｓｃａｂｒｏｏｄ ｖｉｒｕｓ ＣＳＢＶ） 的ＲＮＡ, 并以之为ｃＤＮＡ合成的模板． 依据小ＲＮＡ病毒科中的脊髓灰质炎病毒结构蛋白基因序列设计了一对引物ＶＰ５和ＶＰ３ , 通过ＰＣＲ 扩增获得预期大小约为１ １００ ｂｐ的ＤＮＡ 片段, 将此片段克隆到ｐＧＥＭＴｅａｓｙ载体上并直接测序． 序列分析表明, 该片段为中蜂囊状幼虫病病毒部分结构蛋白基因, 与意蜂幼虫囊状病病毒结构蛋白基因序列的同源性为８６－８ ％ , 与之对应氨基酸序列的同源性高达９３－４ ％ ． 该病毒株为一种新型的蜜蜂囊状幼虫病病毒株     

核酸的分子静电势──Ⅳ 自补十二聚合物序列d（Cp Gp Cp Gp Ap AP Tp Tp Cp Gp CP G）的分子静电势

本文介绍了Ｂ－ＤＮＡ自补十二聚合物序列ｄ（ＣｐＧｐＣｐＯｐＡｐＡｐＴｐＴｐＣｐＯｐＣｐＧ）的分子静电势的计算结果．讨论了这种结构对性能的影响．这些结果与其晶体的性质有关．尤其注意到寡核苷酸（ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）的螺旋中心的静电势比其末端要深．这是如此短的螺旋的一般特性，而与碱基序列无关，但与ＤＮＡ寡聚体的反应性有重要关系．     

碘化4′-(ω-羧基壬酰基)苯并15-冠-5合钠的合成及表征

′（ω羧基壬酰基）苯并１５冠５（Ｌ）的丙酮溶液与碘化钠的丙酮溶液作用,得到了配合物Ｎａ＋Ｌ·Ｉ－晶体．配合物的１ＨＮＭＲ与自由配体冠Ｌ的１ＨＮＭＲ谱相比较,ＡｒＨ和ＯＣＨ２的δ向低场移动了０．０１～０．０５ｐｐｍ．比较二者的ＩＲ,配合物冠环上的Ｃ－Ｏ－Ｃ和Ａｒ－Ｏ－Ｃ的振动频率向低波数方向移动了７～４６ｃｍ－１．并对配合物的成键性能进行了初步讨论．     

图形LOTOS和Petri同模型在PC机上的实现

在ＰＣ机上建立了一个由ＤＯＳ系统支持的图形ＬＯＴＯＳ（ＧＬＯＴＯＳ）软件工具．用这个工具，用户可以设计，显示一个ＧＬＯＴＯＳ说明，也可以把它转换成Ｐｅｔｒｉ网．该系统分为三个模块：ＤＲＡＷ，ＲＥＣＯＶＥＲ和ＴＲＡＮＳＦＥＲ．根据ＧＬＯＴＯＳ模型，模块ＤＲＡＷ给出了一个交互式的菜单系统，用这个系统，用户可以在图形窗口的任何位置画出ＧＬＯＴＯＳ的任一成分；模块ＲＥＣＯＶＥＲ可以自动恢复以前画好的ＧＬＯＴＯＳ模型；根据Ｐｅｔｒｉ网的表示，模块ＲＥＣＯＶＥＲ提供了从ＧＬＯＴＯＳ自动转换到Ｐｅｔｒｉ网的功能．     

伏翼DNA指纹谱探针的筛选

以人工合成的向卫星序列（ＧＴＧ）５、（ＧＴ）８、（ＣＡＣ）５和人源上卫星３３．１５做引物,首次随机扩增了伏翼的基因组ＤＮＡ,从多态性ＤＮＡ片段回收８条特异性片段,即（ＧＴＧ）５ａ、（ＧＴＧ）５ｂ、（ＧＴ）８ａ、（ＧＴ）８ｂ、（ＣＡ）５ａ、（ＣＡＣ）５ｂ、３３．１５ａ和３３．１５ｂ。与被标记过的基础组ＤＮＡ做探针斑点杂交结果表明,８个片段中（ＧＴＧ）５ａ、（ＣＡＣ）５ａ和３３．１５ａ产生了阳性信号,     

H2株甲肝减毒活疫苗K7的核苷酸全序列分析

应用ＲＴ－ＰＣＲ获取Ｈ２株甲肝减毒活疫苗（Ｋ７）的ｃＤＮＡ片段，经末端终止测序ＰＣＲ试剂盒和全自动测序仪（ＡＢＩ３７７）作序列测定，用Ｍａｘｔｒｉｇｅｎｅ软件进行计算机分析，Ｋ７疫苗病毒的核苷酸全长含７４４３个碱基．Ｋ７对比其亲代Ｈ２株，减毒的ＨＭ１７５株以及ＨＭ１７５野毒株，同源性分别为９９．７５％，９９．９５％和９９．６１％；彼此间在Ｐ１和Ｐ２连接区１６８个碱基的同源性为９９．４％～１００％，均为ⅠＢ基因亚型．前三者在５’非编码区均有１３１～１３４位和２０３位５个碱基缺失，且结构蛋白基因区序列完全一致．本文用分子病毒学方法证实了Ｋ７疫苗的优异纯毒水平，也为开展甲型肝炎分子流行病学工作提供了基础资料     

磁共振成像诊断听神经瘤的价值

目的：为评价磁共振成像（ＭＲＩ）诊断听神经瘤的价值，本文分析４４例听神经瘤ＭＲＩ表现，探讨该瘤囊性的病理基础及鉴别诊断。方法：采用德国Ｓｉｅｍｅｎｓ１．０Ｔ超导ＭＲ系统，常规ＳＥ序列或快速ＳＥ序列Ｔ１中权，Ｔ２加权成像，层厚３－７ｍｍ，其中３６例静脉内注射Ｇｄ－ＤＴＰＡ增强扫描。结果：本组４６个肿瘤中，有２个（４．３％）地内耳道ＩＡＣ内；６个（１３％）仅限于桥小脑角（ＣＰＡ）；３８个（８２．６％）     

猪色素上皮衍生因子的电子克隆及序列分析

用鼠的色素上皮衍生因子cDNA序列在猪的ESTs库进行BLASTn搜索,得到一系列不同大小的ESTs片段,经拼接得到完整cDNA序列.序列分析显示该cDNA长1 425 bp,有一个1 242 bp的开放阅读框,编码413个氨基酸,5’非编码区长53 bp,3’非编码区长130 bp,有一个加尾序列和多聚腺苷酸尾巴.其核苷酸序列与牛、人和鼠的同源性分别为89%、87%和82%,氨基酸的同源性分别为89%、87%和84%,且有保守的糖基化位点、半胱氨酸位点和serp in基序,说明所克隆的cDNA序列为猪的PEDF全长cDNA.     

人转铁蛋白基因的克隆及序列分析

目的:克隆人转铁蛋白基因并对其编码序列进行分析.方法:以人胎肝cDNA为模板,利用PCR方法克隆人转铁蛋白基因;通过与基因组序列对比分析基因组结构;通过TargetP 1.1和SignalP 3.0预测信号肽;通过Clustal X(1.81)进行蛋白序列联配.结果:PCR扩增了一个长2 160 bp的基因片断,序列分析表明其覆盖了完整编码框,编码由698个氨基酸组成的人转铁蛋白.进一步分析发现人转铁蛋白基因有19个外显子和18个内含子,编码人转铁蛋白N端具有19个氨基酸组成的信号肽序列.人转铁蛋白与猩猩、猴子、兔子和老鼠的转铁蛋白氨基酸相似率分别为94%、91%、78%、73%.生物信息分析表明,人转铁蛋白含有高度保守的参与蛋白二硫键形成的半胱氨酸以及铁离子结合位点,有两个序列较同源的结构域.结论:成功克隆人转铁蛋白基因,人转铁蛋白与其它物种转铁蛋白同源.     

用酵母双杂合系统筛选与人血小板生成素受体c-Mpl相互作用的蛋白质的初报

血小板生成素（ｔｈｒｏｍ ｂｏｐｏｉｅｔｉｎ, ＴＰＯ）是调节血小板生成最主要的细胞因子,其生物学效应由其受体ｃ－Ｍｐｌ介导．利用酵母双杂合系统（ｔｗ ｏ－ｈｙｂｒｉｄ ｓｙｓｔｅｍ ）筛选与ｃ－Ｍｐｌ相互作用的蛋白质因子,以Ｇａｌ４ ＢＤ融合ｃ－Ｍｐｌ膜内部分ｃＤＮＡ 的ｐＡＳＭＭ 为靶蛋白质粒,筛选了人胎盘ｃＤＮＡ 文库,分离到人波形纤维蛋白（ｖｉｍ ｅｎｔｉｎ）的部分编码序列,首次检测到波形纤维蛋白与ＴＰＯ 受体之间的相互作用,这提示细胞骨架蛋白可能在ＴＰＯ 的信号转导过程中起着重要的作用     

人血小板生成因子（TPO）的cDNA克隆及促血小板生成效应

用ＲＴ－ＰＣＲ方法，从人胎肝总ＲＮＡ中扩增得到约１．１ｋｂ人ＴＰＯｃＤＮＡ编码顺序，并进行分子克隆．将其中一个克隆（ｐＴＰＯ４７）亚克隆到Ｍ１３载体，测定全部ＤＮＡ顺序．它的碱基顺序与已报道的顺序完全相同，有一个１０５９ｂＰ的开放阅读框架可编码３５３个氨基酸．ｐＴＰＯ４７亚克隆到哺乳动物表达载体ｐＣＥＰ４，在哺乳动物２９３细胞系瞬时表达后，进行Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交，结果显示有约１．４ｋｂ的转录产物．瞬时表达培养液腹腔注射小鼠后，可提高血小板计数４２．３％．血小板生成因子的克隆对进一步研究血小板生成调节以及该因子作用的分子机理具有重要意义．     

血小板生成素在枯草杆菌中的表达分泌及前肽作用

利用PCR方法扩增得到枯草杆菌本身的表达调控序列SP（含有信号肽）和Pro序列（包含信号肽和前肽）,分别与血小板生成素(TPO)结构基因及枯草杆菌载体片段连接,构建两个重组TPO枯草杆菌表达载体,转化受体菌,得到DB403（SP-TPO）和DB403（Pro-TPO）重组克隆,比较有无前肽对其表达分泌的作用.用ELISA和Western Blot检测TPO的表达分泌,发现DB403（Pro-TPO）能够表达分泌TPO,而DB403（SP-TPO）未发现TPO的分泌.对小鼠腹腔注射DB403（Pro-TPO）发酵浓缩液,发现能够明显增加血小板数目,与自身对照相比增加84.2％,与生理盐水对照比较增加99.7％.以上实验说明Pro-TPO能够表达分泌有明显活性的TPO蛋白,而且前肽对外源蛋白的分泌是必要的.     

厚叶悬蒴苣苔 BcWRKY1 转录因子基因的克隆及初步的功能分析

通过RT-PCR程序,从经过SA诱导的厚叶悬蒴苣苔中获得含WRKY家族保守序列的一条cDNA片段。运用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术获得全长1 803bp的cDNA克隆,名之为 BcWRKY1 。序列分析表明: BcWRKY1 与甘薯SPF1 ［D30038］相似性最高,保守区同源性达到84％。初步的Northern杂交分析表明：干旱、低温、高盐等逆境胁迫和外加SA、MeJA、JA、ABA等信号分子的诱导均能提高 BcWRKY1 基因的表达。但是表达情况各不相同。150 mmol/L NaCl对 BcWRKY1 的诱导作用尤为明显和迅速。2 168 bp的 BcWRKY1 的基因组DNA克隆亦已获得,序列分析表明它含有4个内含子。     

利用聚合酶链反应鉴定重组TPO阳性克隆

报道了利用取合酶链式反应（ＰＣＲ）鉴定重组ＴＰＯ阳性克隆的方法，同时比较了该方法与酶切鉴定的结果。取转化克隆小量提取质粒琼脂糖电泳分析，对怀疑含有重组子的工程菌进行ＰＣＲ鉴定，结果阳性克隆得到了特异性扩增片段。该方法与酶切鉴定结果完全一致，其优点是简便、灵敏、特异。     

中华鳖抗菌肽Hepcidin成熟肽基因的克隆及同源性的初步研究

采用同源克隆的方法,以用于扩增大菱鲆hepcidin成熟肽基因的引物,从中华鳖肝脏cDNA中扩增得到1条长78 bp的基因片段.初步判断其属于Hepcidin家族,与HAMP1具有较高的同源性,分析表明其为Hepcidin成熟肽.根据基因序列推断得到的成熟肽蛋白序列如下:QSHISLCRWCCNCCKANKGCGFCCKF.与其他物种的成熟肽进行比对,发现其与大菱鲆的成熟肽序列同源性达到100 %,并构建了基于各物种Hepcidin前体肽的系统发育树,为研究物种进化提供了证据.     

人血小板生成素在COS－7细胞中的暂时表达

利用反转录ＰＣＲ获得的全长人ＴＰＯｃＤＮＡ克隆入真核表达载体ｐＭＡＭｎｅｏ的Ｎｈｅｌ位点，用ＤＥＡＥ-Ｄｅｘｔｒａｎ法将其导入ＣＯＳ-７细胞中．实验表明，所构建的表达质粒在ＣＯＳ-７细胞中有转录水平表达．ｈＴＰＯ在真核系统中的稳定表达正在研究中．