茶树基因组研究进展

茶树基因组学和遗传学研究的发展,推动了对茶叶品质形成的分子机制和茶树基因组进化的了解.利用44篇参考文献,综述近10年来国内外在茶树基因组和转录组测序、基因挖掘与功能解析、表观遗传学、起源与驯化、代谢组学等方面的研究进展,提出了未来功能基因组研究的前景和可能的挑战.     

植物应答高温和干旱胁迫组学研究进展

 近20多年来,基于高通量分析的系统生物学研究飞速发展,组学研究不断拓展。组学研究涉及核酸、蛋白、代谢物、表型等各个层次,包括基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学等一系列组学技术。非生物环境胁迫严重影响植物的生长发育,植物组学的技术方法有助于研究植物对非生物环境胁迫的应答机制。高温和干旱是全球气候变化的两个重要表征,亦是最可能同时出现的两个因子。本文综述基因组学、蛋白组学与代谢组学等组学技术用于分析植物应答高温和干旱胁迫的研究进展,以期为植物应答高温和干旱胁迫研究的未来发展提供参考。     

酿酒酵母基因组的研究进展

酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是第一个完成全基因组测序工作的真核生物,目前在结构基因组学、功能基因组学、模式生物、最小基因组、比较基因组学等方面的研究已经获得了重大的进展,为人类更深入地研究高等生物基因组打下了坚实的基础。本文将从这几个方面着手对酿酒酵母基因组的研究进展进行综述。     

阿尔茨海默病的基因组学与功能基因组学研究进展

 阿尔茨海默病（AD）是最常见的神经退行性疾病与最主要的痴呆类型,其发病率随着年龄增加而呈指数式增长。随着人口老龄化,AD造成的社会经济负担愈趋严重。AD的遗传力接近80%,其人群易感程度、表型差异等性状特征受机体遗传变异的极大影响。总结了基于家系连锁分析、病例对照全基因组关联分析、全基因组测序等基因组学分析手段鉴定与AD发生发展相关的遗传变异与风险基因,梳理了基于各种组学数据的功能基因组学研究手段,解析遗传变异背后的调控元件、效应基因及其分子过程的研究进展。对风险基因及其转录与蛋白水平改变的揭示,可为AD的发病机制解析、药物开发、精准诊断与早期预测提供直接的靶点。     

基因组学研究中的计算和统计学方法

本书是2002年3月出版的《基因组学研究中的计算和统计学方法》的第二版，主要对用于处理各种基因组、转录组相关数据的计算和统计学方法进行了系统介绍。     

水稻基因组学研究概况

重点对水稻的结构基因组学、功能基因组学和蛋白质组学的主要研究内容、研究方法和研究进展三个方面进行了综述，并对与水稻基因组学研究相关的学科，如生物信息学、比较基因组学等方面进行了阐述，最后对水稻基因组学的发展进行了简单展望．     

酿酒酵母功能基因组学研究进展

随着各种微生物基因组序列信息的积累和测序工作的不断完成,酿酒酵母基因组学研究的重点已由传统的结构基因组学发展到了功能基因组学,并从单一的基因功能研究转向多个或整个基因组系统地去了解真核生物生命活动的本能。对基因组学水平上酿酒酵母功能基因的生物芯片分析,代谢通路和功能图谱,以及比较基因组学研究进行综述。     

高通量测序在蜜蜂基因组中的应用及研究进展

【目的】回顾近些年来在蜜蜂基因组研究领域取得的进展，为后续进一步研究提供参考。【方法】检索蜜蜂高通量测序相关文献并归纳总结，获得高通量测序在蜜蜂基因组中的应用和研究进展。【结果】高通量测序主要应用于蜜蜂线粒体基因组、核基因组和转录组3个方面。目前，蜜蜂属（Apis）下所有9个种的线粒体基因组以及6个种的全基因组已被获得。基于转录组测序分析，一些与蜜蜂重要性状相关的候选基因被靶定。【结论】高通量测序技术的快速发展，使得该技术在蜜蜂基因组学的研究应用范围不断扩大、应用深度不断加深。这为研究蜜蜂分类、系统演化、群体遗传、亲缘关系、群体历史等提供了重要的数据支撑，也为进一步筛选和利用关键基因提供了理论支持。     

营养基因组学的研究

营养基因组学是在人类基因组计划完成后发展起来的新的学科,它实现了营养学,基因组学,蛋白质组学,代谢组学等学科的交叉。营养基因组学应用后基因组时代的技术与方法研究营养素与人类健康的关系。本文将就营养基因组学的概念,营养基因组学所涉及到的主要技术,以及营养基因组学的主要研究内容进行概述。     

微生物生物技术：应用微生物学基础

本书第一版出版于1995年。12年来，成百上千的原核和真核基因组得以测序，为了处理数量巨大的信息，出现了如基因组学、转录组学、蛋白质组学等的新技术。环境DNA文库技术为培养微生物的研究提供了新方法。大量已解释的序列数据库和优秀的计算软件的出现使得解释新序列成为可能。PCR和基因重组技术使得创造新性状的基因或者生物成为可能。基因组学、转录组学、代谢组学成为研究细胞代谢网络调节的重要工具。所有这些发展也改变了传统领域的生物技术。     

Charting a course for genomic medicine from base pairs to bedside

There has been much progress in genomics in the ten years since a draft sequence of the human genome was published. Opportunities for understanding health and disease are now unprecedented, as advances in genomics are harnessed to obtain robust foundational knowledge about the structure and function of the human genome and about the genetic contributions to human health and disease. Here we articulate a 2011 vision for the future of genomics research and describe the path towards an era of genomic medicine.     

利用SSR标记鉴定水稻与高梁远缘杂交的研究

本研究采用了115对水稻引物(RM)对4个母本水稻、父本高梁、4个水稻和高粱远缘杂交的子一代进行了SSR分子标记分析.结果发现:水稻与高粱具有一定的同源性;水稻与高粱杂交后,其杂种一代的分子标记带型大部分与母本同源性较高,也出现了杂种带型、变异带型及高粱带型,说明确实有高粱DNA片段导入水稻基因组中.从分子水平上初步证明了水稻高粱远缘杂交的可行性.     

植物差异表达基因克隆技术及研究进展

随着分子生物学技术的深入发展,植物基因组研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究,目前分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点.近些年来,国内外学者发展了多种分析差异表达基因的技术来研究植物在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,掌握了生命活动过程中的重要信息.文章对建立在RNA水平上克隆植物未知差异表达基因的几种关键技术及其研究进展进行了综述,阐述了各技术的原理、技术路线、优缺点及相应的改进方法,并对它们在植物抗逆研究中的应用现状及前景作了展望.     

Prospects for the Chinese Human Genome Project (HGP)at the beginning of next century

Chinese Human Genome Project (CHGP) as part of the international human genome research has achieved significant progress and created a solid foundation for further development. While participating in the human genome sequencing and gene discovery, the emphasis of CHGP in the next century will be laid on functional genomics. The strategy, resources and some policy issues will be addressed.     

利用基因打靶技术研制人类疾病小鼠模型

宏伟的人类基因组计划的顺利实施使人类真正进入了功能基因组学研究的新时代 ,与日俱增的大量遗传信息正对生物医学的研究方式和医疗模式产生巨大的影响。发展和应用针对全基因组或全系统的高通量、大规模的整体实验手段 ,利用结构基因组学提供的信息和材料研究基因的功能将成为这个时代生物医学研究的主要特征。基因功能是在由细胞组成的多层次的复杂生命体中实现的 ,因此 ,功能基因组学的研究将会在极大程度上依赖于对模式生物的研究。小鼠作为被研究的脊椎动物 ,尤其具备作为哺乳动物的模式生物具有独特的优势 :首先小鼠是具有较短世代周…     

Initial impact of the sequencing of the human genome

The sequence of the human genome has dramatically accelerated biomedical research. Here I explore its impact, in the decade since its publication, on our understanding of the biological functions encoded in the genome, on the biological basis of inherited diseases and cancer, and on the evolution and history of the human species. I also discuss the road ahead in fulfilling the promise of genomics for medicine.     

NaCl和Na2CO3胁迫下的高粱MAPKs基因家族表达模式

通过在全基因组水平上进行NaCl和Na2CO3胁迫下高粱MAPKs基因表达模式的研究, 探索高粱MAPKs基因在胁迫条件下参与信号传导的机理. 结果
表明, 从高粱基因组中鉴定出16个MAPKs基因, 命名为SbMPKs. 这些SbMPKs在NaCl和Na2CO3胁迫下的表达模式明显不同, 表明中性盐胁迫诱导的信号响应不同于碱性盐. 在NaCl胁迫下, 除了SbMPK13的表达量在12 h时达到最大值外, 所有高粱MAPKs基因在24 h内表达持续上调; 在Na2CO3胁迫下, 只有SbMPK3,SbMPK10和SbMPK13表达上调, 表明这3个基因可能与高粱碱性盐胁迫应答反应有关. 系统发育分析表明, SbMPK13属于C组MAPKs基因, 并且与水稻中受脱落酸（ABA）和盐胁迫诱导表达的OsMAPK2亲缘关系较近, 进一步证实了SbMPK13可能是参与高粱盐胁迫应答的重要调控基因.     

Functional genomics in the rice blast fungus to unravel the fungal pathogenicity

A rapidly growing number of successful genome sequencing projects in plant pathogenic fungi greatly increase the demands for tools and methodologies to study fungal pathogenicity at genomic scale. Magnaporthe oryzae is an economically important plant pathogenic fungus whose genome is fully sequenced. Recently we have reported the development and application of functional genomics platform technologies in M. oryzae. This model approach would have many practical ramifications in design and implementation of upcoming functional genomics studies of filamentous fungi aimed at understanding fungal pathogenicity.