含吡啶的二芳醚类化合物的合成及其PDE4B抑制活性

磷酸二酯酶4B(PDE4B)是抗炎药物作用的重要靶标,以三嗪类PDE4B抑制剂A33为先导化合物,设计并合成了20个二芳醚类化合物.用¹H NMR、¹³C NMR等对化合物进行了结构表征,并对这些化合物进行了PDE4B抑制活性测试.结果表明：化合物3和4a表现出较好的PDE4B抑制活性,展现出它们作为进一步优化和开发更有效PDE4B抑制剂的先导化合物的潜力.     

α-氨基酸癸胺衍生物缓蚀性能的理论评价

采用量子化学计算和分子动力学模拟相结合的方法,在液相条件下对2-氨基-N-癸烷-3-(4-羟基苯基)丙酸(A)、2-氨基-N-癸烷-乙酰胺(B)、2-氨基-N-癸烷-丙酸(C)和2-氨基-N-癸烷-3-甲基-丁酰胺(D)4种缓蚀剂分子抑制盐酸对低碳钢腐蚀的性能进行理论分析,考察其前线轨道能量、全局反应活性参数、Fukui指数、重原子对前线轨道的贡献,计算缓蚀剂分子与金属Fe(001)表面的吸附能。结果表明:缓蚀剂分子A具有最强的反应活性;缓蚀剂分子B拥有较高的局部反应活性,C次之,D最小;缓蚀剂分子与金属表面的结合力由强到弱依序为A、B、C、D;4种缓蚀剂分子的缓蚀性能由高到低依次为A、B、C、D,缓蚀性能与实验数据相吻合。     

PDE4/PDE7双重抑制剂的虚拟筛选研究

为了从现有的药物数据库中寻找具有较好抑制活性的新型PDE4/PDE7双重抑制剂结构,联合应用OpenEye及AutoDock程序对自建的小分子数据库进行虚拟筛选,并对筛选出来的分子进行PDE4/PDE7抑制活性测试.结果得到27个有PDE4/PDE7双重抑制活性的化合物分子,其中有些化合物的抑制率能达到100%.其中有两类化合物的活性高且结构新颖,其母体结构可作为先导结构,用于研发新型的PDE4/PDE7双重抑制剂.     

3-取代吲哚-2-酮类化合物异构体的密度泛函理论计算

用B3LYP／6-31G方法对3-取代吲哚酮类化合物异构体进行了计算．计算分四部分进行：初始模型Ⅰ-Ⅳ的计算;模型Ⅰ的4′位置被甲基取代的计算;完全为E构象模型的计算;模型Ⅰ-Ⅳ乙烯基上的氢被甲基取代的计算．结果表明：以Z构象为稳定构象的分子可能与相应激酶结合时有较高的活性,而以E构象为稳定构象的分子则、活性一般不高．     

7LiH分子的基态X1Σ+和激发态A1Σ+、B1Π与b3Π的平衡几何与垂直激发能

使用分子反应静力学的有关原理,推导出了7L iH分子的基态X1Σ 、单重态的第一激发态A1Σ 、第二激发态B1Π以及三重态的第二激发态b3Π的合理离解极限.利用“对称性匹配蔟-组态相互作用”方法,在完全活性空间中计算了这一分子相应于上述各态的平衡核间距.其中,X1Σ 态为0.160 9 nm;A1Σ 和B1Π态分别为0.248 7和0.243 4 nm;b3Π态为0.195 8 nm.在基态的平衡位置处,计算了从基态到A1Σ 、B1Π及b3Π态的垂直激发能,其值分别为3.613、4.612和4.233 eV.将本文获得的计算结果与其它理论方法获得的计算结果及实验结果进行了比较,计算结果与实验结果吻合得很好;同时,本文获得的平衡核间距和垂直激发能与使用很复杂的方法获得的计算结果也相当接近.     

4-酰代吡啶-5-吡唑啉酮类化合物的合成和分子力学、分子动力学计算

从1－苯基－3－甲基－5－吡唑啉酮（PMP）和烟酰氯（异烟酰氯）出发，合成了4－酰代吡啶（－3）吡唑啉－5－酮（化合物A）和4－酰代吡啶（－4）吡唑啉－5－酮（化合物B），利用Sybl6.3软件包分子力学计算程序中的限制性系统搜索，随机搜索和分子动力学计算软件中的模拟退火程序分别对化合物A和B的酮式和烯醇式构象分子（C和D）进行了计算，得到了它们的低能构象集，发现它们具有适宜的配位环境。     

初中化学测试题

一、选择题1.日常生活中下列变化,前者是化学变化后者是物理变化的是()A酒精挥发食物腐烂B煤气爆炸煤燃烧c铁生锈石蜡熔化D灯泡发光水结冰2.有关环境保护认识中的错误是()A大量燃烧含硫的煤不会污染空气B二汽车尾气的排放会污染空气C多植树造林有利于抑制沙尘暴的发生D工业污水应处理后再排放3.金秋十月,人们站在桂花树旁常能闻到怡人的桂花香,这二现象说明(厂A分子大B分子可以再分C分子在不断运动D分子间有间隔4.有关水、氢气、硫酸三种物质的正确说法是()A都含有氢元素B都是含氢的化合物C都含有氢单质D都含有氢分子5.一种元素与另一…     

川党参的化学成分及其与磷酸二酯酶4D2的分子对接研究

采用硅胶柱色谱、葡聚糖凝胶以及反相高效液相色谱法等对川党参的乙酸乙酯和石油醚部位进行分离纯化,并通过¹H NMR和¹³C NMR等波谱技术进行结构鉴定.利用Sybyl X 2.1.1软件,以Total score值为评价标准,评价川党参化学成分与磷酸二酯酶4D2(PDE4D2)的结合作用.利用Pymol和Discovery Studio 2017 R2 Client软件分析PDE4D2与化合物之间的相互作用力.结果从乙酸乙酯和石油醚部位分离出12个化合物,分别鉴定为mangnostellin D(1)、(7S,8S)-3-methoxy-3’,7-epoxy-8,4’-oxyneoligna-4,9,9,’-triol(2)、isolariciresinol(3)、curcasinlignan B(4)、(4E,12Z)-threo-tetradeca-4,12-diene-8,10-diyne-1,6,7,14-tetraol(5)、(-)-(7R,8S,7’E)-3’,4-dihydroxy-3-methoxy-8,4’-oxyneoli...     

龙血竭抗癌成分的虚拟筛选及体外抗癌活性检测验证

应用计算机辅助虚拟筛选技术研究龙血竭抗癌活性成分. 以HER2为靶蛋白受体，对龙血竭149种已知化合物进行了虚拟筛选，对其中具有潜在活性的成分进行了体外HER2影响测定以及SK-Br-3抗癌活性检测验证. 结果表明， HER2靶蛋白分子对接模型具有较强的活性分子富集能力，与HER2受体有效对接、具有抗癌潜力的活性分子主要为二氢查耳酮、黄烷、甾体以及芪类成分，与HER2胞外域和胞内域结合的4种成分及能与HER2胞内域结合的3种成分均能显著的抑制体外HER2活性，其中反式3-甲氧基-4′,5-二羟基二苯乙烯、反式3,4′,5-三羟基二苯乙烯能够抑制SK-Br-3癌细胞增殖、改变细胞周期，引发SK-Br-3极显著凋亡，具有良好的体外抗癌活性，可为龙血竭抗癌药物的研发提供基础数据.      

抗爱滋病药物Calanolide四环香豆素的理论计算与分析

目的从理论上研究具有抗爱滋病作用的Calanolide四环香豆素衍生物的构效关系。方法用HyperChem 7．0半经验量化方法(AM1)计算或优化20个目标分子的分子结构和电性质。结果计算结果分析表明,环结构及其键合基团的差异影响分子构象,B、C环刚性比A、D环要强,呈现不同的空间取向;具有抗爱滋病活性化合物(1、4、6、9和12)的优势构象中,C1和C19在其环平面同侧,其角度约130°,而非抗HIV活性的化合物(7、14、15、16和19)的优势构象中,C1和C19在环平面的上下方;HOMO-1和LUMO 1能级变化幅度不大,而偶极矩差异较大;正电荷主要集中于C6、C7和C9上,负电荷主要集中于05、O14和016。结论具有抗爱滋病药效作用的Calanolide四环香豆素衍生物呈现相似的优势构象。这些结果可能为药物分子设计和相关酶的结构分析提供了某些信息和思路。     

PdY合金氢化反应热力学函数的理论研究

在Pd和Y原子相对论有效原子实势和基函数SDD下,使用密度泛函理论B3LYP方法计算得到PdY和PdYH(D,T)分子的结构、光谱数据、能量E、熵S等性质.计算固体PdY和PdYH(D,T)的能量和熵时,近似以气体分子的电子能和振动能代替固体分子的能量,用电子熵和振动熵代替固体分子的熵.在此近似下,计算了不同温度下PdY合金与氢同位素气体反应的热力学函数,得到氢化反应温度与平衡压力的关系式.     

分子动力学模拟三氯生对烯脂酰-ACP还原酶作用机制研究

本文利用分子动力学模拟分别研究了蛋白sa Fab I体系、sa Fab I-NADP+体系和sa Fab I-NADP+-TCL体系的稳定性、各氨基酸残基随模拟时间的波动情况以及活性位点处关键氨基酸残基构象的变化规律.研究表明,辅酶NADP+及抑制剂三氯生均可在不同程度上促使蛋白构象稳定.辅酶NADP+可以促使活性位点Loop区残基Y147-Y157残基构象变为规则的卷曲构象;抑制剂三氯生可以促使蛋白与底物结合位点Loop I区残基I94-E108和Loop II区残基R194-F204及活性位点Loop区残基Y147-Y157残基构象变为规则的卷曲构象,构象趋于稳定.上述研究发现对认识三氯生作为抗菌药物机制及相关药物设计具有重要指导意义.     

三角代数上的导子

设R是有单位元的交换环,A,B是R上的单式代数,M是非零(A,B)-单式双模,且作为A,B-模都是忠实的.记T=(A M0B)={(a m0b)a∈A,b∈B,m∈}M为A,B,M构成的三角代数.利用三角代数T上导子的性质,给出T上分别满足广义恒等式D([X,Y])=k[X,Y]和D([X,Y])=k[D(X),Y]的导子结构,以及满足广义恒等式D(X。Y)=kX。Y和D(X。Y)=kD(X)。Y的导子结构,其中k为R中单位.     

含喹唑啉结构的VEGFR-2抑制剂的合成、体外抗肿瘤活性与分子对接研究

为了研究新型VEGFR-2抑制剂的合成方法及抗肿瘤活性,合成了9个含喹唑啉结构的VEGFR-2抑制剂,以MTT法测试了目标化合物对人结肠癌HCT-116和HT-29 2个细胞株的抑制活性,结果显示化合物A03、A05、A06、A07和A08比阳性对照索拉非尼的活性更好(IC_(50)10μmol/L).为了阐明目标化合物和VEGFR-2的作用机制,分别将sorafenib和化合物A03与VEGFR-2(PDB:2OH4)的DFG-out构象进行了分子对接,结果表明该系列化合物可能作为Ⅱ型激酶抑制剂发挥抗肿瘤作用.     

氢同位素重水分子D_2O(~1A_1)的结构与分析势能函数

基于群论理论和原子分子反应静力学正确判断了D2O(X1A1)离解极限.使用多体项展式理论方法结合同位素效应,修正Born-Oppenheimer近似下的势能函数,计算了D2O(X1A1)分子的二阶力常数、正则振动频率和零点能.采用密度泛函B3lyp/6-311++g**方法,优化出D2O(X1A1)平衡几何、离解能和振动频率.首次导出基态D2O(X1A1)分子的分析势能函数,然后根据等值势能图讨论了D+OD和O+D2反应的势能面静态特征.结果表明:在D+OD→D2O通道上反应为无阈能反应,而O+DD→D2O存在鞍点,反应具有一定的方向性,以垂直D—D键的方向最为有利.     

新设计的碳纳米锥-碱金属配合物的第一超极化率的理论研究

利用B3 LYP/6 - 31G(d)方法优化了设计的18个碳纳米锥碱金属配合物,通过频率分析证实了它们的稳定性.利用BHandHLYP/6 - 31 G(d)方法计算了分子第一超极化率.研究结果表明,系列C和系列D体系较小的跃迁能和较大的振子强度是它们具有较大第一超极化率的主要原因.系列A,B,C和D体系的分子第一超...     

17β-N-X-4-氮杂甾类衍生物对SRD5A2的抑制活性与结构关系研究

应用分子力学方法MM+和半经验量子化学AM1法得到了16种17β-N-X-4-氮杂甾类衍生物的优势构象,再利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性逐步回归分析法和人工神经网络误差反传算法(BP),将这些参数与17β-N-X-4-氮杂甾类衍生物对5α-还原酶的 型同功酶(SRD5A2)的抑制活性相关联。结果表明,17β-N-X-4-氮杂甾类衍生物对SRD5A2的抑制活性与1号碳原子和2号碳原子之间的双键指示数(I)、分子最高占用轨道能(EHOMO)、8号碳原子和14号碳原子间键长(L)的相关性较好,成功地建立了16种17β-N-X-4-氮杂甾类衍生物的构效关系式。对衍生物的分子最高占用轨道(HOMO)进行了定量分析,用以探讨其主要组成部分。     

多巴胺D3R蛋白同源模建及其应用

以分辨率为2.2的牛视紫红质蛋白的晶体结构为模板,采用同源模建方法,建立D3R模蛋白。对接D3R模蛋白与刺桐属配体分子,在对接的D3R蛋白的结合腔中选定一个以药物分子为质心,以半径为6的空间范围,计算此空间范围内的所有氨基酸残基与配体分子的作用能量,即残基/配体的结合能或排斥能,据此得到配体分子与受体蛋白的活性结合位点。     

真菌Alternaria sp.XZSBG-1的四氢蒽醌类次级代谢产物

采用硅胶、C-18反相硅胶、Sephadex LH-20等柱色谱及高效液相色谱技术对真菌Alternaria sp.XZSBG-1的次级代谢产物进行系统研究;采用波谱分析及与文献比对等方法鉴定化合物结构;采用MTT法和比色法进行抗肿瘤和酶抑制活性筛选。结果从真菌Alternaria sp.XZSBG-1的发酵物中分离得到8个四氢蒽醌类化合物,分别鉴定为Alterporriol F'(1)、Alterporriol G'(2)、Alterporriol F(3)、Alterporriol G(4)、Altersolanol A(5)、Altersolanol F(6)、Tetrahydroaltersolanol B(7)和Tetrahydroaltersolanol D(8);活性测试结果表明仅化合物6对结肠癌细胞株(HCT-116)和子宫癌细胞株(Hela)具有明显抑制活性,IC50值分别为3.026和8.094μmol/L。     

7Li2分子A1Σ+u态的平衡几何、离解能及其谐振频率

利用分子反应静力学的原理,确定了7Li2分子A1Σ 态的离解极限;利用SAC-CI方法、使用6-311G、6-311 G、6-311G(3df,3pd)、6-311 G(3df,3pd)、D95(3df,3pd)、D95、D95V、D95V(d,p)、cc-PVTZ和AUG-cc-PVTZ等基组,对7Li2分子A1Σu 态的平衡几何进行了优化计算,且将计算结果与精细的单点能扫描结果进行了比较.分析表明,由单点能扫描获得的平衡核间距应更为合理.同时也得出了AUG-cc-PVTZ基组为最优基组的结论.在0.14~1.5 nm范围内对该态进行了单点能扫描,并用最小二乘法拟合出了其解析势能函数.从得到的解析势能函数出发,计算了该态的力常数(f2、f3和f4)及谐振频率(ωe),进而计算了其他光谱常数(Be,αe和ωeχe),理论值与实验结果一致.同时为便于分析和比较,对基态X1Σg 也进行了相应的计算.